Virus hepatitidy B. - Hepatitis B virus

Pro nemoc viz Žloutenka typu B.
Virus hepatitidy B.
Mikrograf TEM ukazující viriony viru hepatitidy B.
Transmisní elektronová mikroskopie mikrograf zobrazeno Virus hepatitidy B. viriony
Klasifikace virů E
(bez hodnocení):Virus
Oblast:Riboviria
Království:Pararnavirae
Kmen:Artverviricota
Třída:Revtraviricetes
Objednat:Blubervirales
Rodina:Hepadnaviridae
Rod:Orthohepadnavirus
Druh:
Virus hepatitidy B.

Virus hepatitidy B. (HBV), je částečně dvouvláknová DNA virus,[1] druh rodu Orthohepadnavirus a člen Hepadnaviridae rodina virů.[2] Tento virus způsobuje onemocnění žloutenka typu B.[3]

Choroba

Hlavní článek: Žloutenka typu B

Přestože existuje vakcína k prevenci hepatitidy B, zůstává HBV celosvětovým zdravotním problémem. Hepatitida B může být akutní a později chronická, což vede k dalším chorobám a zdravotním stavům.[4] Kromě způsobení hepatitidy může vést k infekci HBV cirhóza a hepatocelulární karcinom.[5]

Rovněž bylo navrženo, že může zvýšit riziko rakovina slinivky.[3]

Role v nemoci

Virová infekce Virus hepatitidy B. (HBV) způsobuje mnoho hepatocytů změny v důsledku přímého působení proteinu kódovaného virem, HBx, a nepřímým změnám v důsledku velkého nárůstu v intracelulární reaktivní formy kyslíku (ROS) po infekci. Zdá se, že HBx dysreguluje řadu buněčných cest. HBx způsobuje dysregulaci částečně vazbou na genomickou DNA, změna vzorců exprese miRNA, ovlivnění histonmethyltransferáz, vazba na SIRT1 protein aktivovat transkripce a spolupracujeme s histon methylázy a demetylázy ke změně vzorů buněčné exprese.[6] HBx je částečně zodpovědný za přibližně 10 000násobné zvýšení intracelulárního ROS po chronické infekci HBV.[7] Zvýšená ROS může být částečně způsobena lokalizací HBx do mitochondrie kde HBx snižuje potenciál mitochondriální membrány.[8] Kromě toho další HBV protein, HBsAg, také zvyšuje ROS prostřednictvím interakcí s endoplazmatické retikulum.[8]

Nárůst v reaktivní formy kyslíku (ROS) po infekci HBV způsobuje zánět, což vede k dalšímu zvýšení ROS.[7] ROS způsobují více než 20 typů poškození DNA.[9] Oxidační poškození DNA je mutagenní.[10] Kromě toho může oprava poškození DNA během opravy DNA způsobit epigenetické změny v místě poškození.[11] Epigenetické změny a mutace mohou způsobit poruchy buněčného aparátu, které pak přispívají k nemoc jater. V době, kdy se akumulují epigenetické a mutační změny, nakonec způsobí progresi rakovina Zdá se, že v tomto mají větší roli epigenetické změny karcinogeneze než mutace. Pouze jeden nebo dva geny, TP53[12] a možná ARID1A,[13] jsou mutovány ve více než 20% rakoviny jater zatímco každý má 41 genů hypermethylované promotory (potlačující genovou expresi) u více než 20% zhoubných nádorů jater, přičemž sedm z těchto genů je hypermethylováno u více než 75% zhoubných nádorů jater.[12] Kromě změn v místech opravy DNA jsou epigenetické změny způsobeny také náborem HBx DNA methyltransferáza enzymy, DNMT1 a / nebo DNMT3A, ke specifickým genovým lokusům, aby je změnily methylace hladiny a genová exprese.[14] HBx se také mění acetylace histonů které mohou ovlivnit genovou expresi.[14]

Zdá se, že několik tisíc genů kódujících proteiny má vazebná místa pro HBx.[6][15] Kromě genů kódujících proteiny asi 15 mikroRNA a 16 Dlouhé nekódující RNA jsou také ovlivněny vazbou HBx na jejich promotory.[15] Každá pozměněná mikroRNA může ovlivnit expresi několika stovek messengerových RNA (viz mikroRNA ).

Klasifikace

Virus hepatitidy B. je klasifikován jako druh druhu z Orthohepadnavirus, který obsahuje dalších osm druhů.[16] Rod je klasifikován jako součást Hepadnaviridae rodina, která obsahuje jeden další rod, Avihepadnavirus.[16] Tato skupina virů nebyla přiřazena virové objednávce.[17] Viry podobné hepatitidě B byly nalezeny u všech lidoopi (orangutani, gibony, gorily a šimpanzi ), v Opice starého světa,[18] a v Nový svět vlněné opice (dále jen virus hepatitidy B. ), což naznačuje starodávný původ tohoto viru u primátů.

Virus je rozdělen do čtyř hlavních sérotypy (adr, adw, ayr, ayw) na základě antigenu epitopy přítomný na jeho obalové proteiny. Tyto sérotypy jsou založeny na společném determinantu (a) a dvou vzájemně se vylučujících dvojicích determinantů (d / y a w / r). Virové kmeny byly také rozděleny do deseti genotypů (A – J) a čtyřiceti subgenotypů podle celkové variace nukleotidové sekvence genomu.[19] Genotypy mají odlišnou geografickou distribuci a používají se ke sledování vývoje a přenosu viru. Rozdíly mezi genotypy ovlivňují závažnost onemocnění, průběh a pravděpodobnost komplikací a reakci na léčbu a případně očkování.[20][21] Sérotypy a genotypy nemusí nutně odpovídat.

Genotyp D má 10 subgenotypů.[22][19]

Nezařazené druhy

Z netopýrů byla izolována řada dosud nezařazených druhů podobných hepatitidě B.[23]

Morfologie

Struktura

Struktura Virus hepatitidy B.

Virus hepatitidy B. je členem Rodina hepadnavirů.[24] Virová částice, nazývaná Daneova částice[25] (virion ), se skládá z vnější lipid obálka a icosahedral nukleokapsid jádro složené z protein. Nukleokapsid obklopuje virovou DNA a DNA polymerázu, která má reverzní transkriptáza aktivita podobná retrovirům.[26] Vnější obal obsahuje vložené proteiny, které se účastní virové vazby a vstupu do citlivých buněk. Virus je jedním z nejmenších obalených zvířecích virů s průměrem virionu 42 nm, ale pleomorfní formy existují, včetně vláknitých a sférických těles postrádajících jádro. Tyto částice nejsou infekční a jsou složeny z lipidů a bílkovin, které tvoří část povrchu virionu, který se nazývá povrchový antigen (HBsAg ), a je produkován v přebytku během životního cyklu viru.[27]

Součásti

Skládá se z:

  • HBsAg - Povrch hepatitidy B. antigen (HBsAg) byl prvním objeveným proteinem viru hepatitidy B.[28] Skládá se z malého (S), středního (M) a velkého (L) proteinu.[29]
  • HBcAg (HBeAg je varianta sestřihu) - HBcAg je hlavní strukturní protein HBV icosahedral nukleokapsid a má funkci v replikace z virus.[30] Hlavním faktorem je tvorba kapsidy antigenu HBV (HBcAg) infekce buňky.[31] HBcAg přispívá k clearance HBV in vivo, ale není známo, zda HBcAg musí být ve formě kapsidy, aby přispělo k virové clearance.[32]
  • DNA polymeráza viru hepatitidy B
  • HBx. Protein viru hepatitidy B HBx je malý,[33] 154 aminokyselina dlouhá, nestrukturální a hraje důležitou roli při onemocnění jater spojeném s HBV a při HBV replikace v HepG2 buňky. Mnoho aktivit bylo spojeno s expresí HBx. Avšak molekulární mechanismy, mnoho z těchto aktivit není známo.[34] Tento protein je multifunkční a aktivuje buněčné signální dráhy a je nezbytný pro viry infekce.[35]

Virus hepatitidy D. vyžaduje, aby se částice obálky HBV staly virulentní.[36]

Vývoj

Časný vývoj hepatitidy B, stejně jako u všech virů, je obtížné stanovit.

Divergence orthohepadnavirus a avihepadnavirus došlo ~ před 125 000 lety (95% interval 78 297–313 500).[37] Viry Avihepadnavirus a Orthohepadna se začaly diverzifikovat asi před 25 000 lety.[37] Větvení v tomto okamžiku vedlo ke vzniku genotypů Orthohepadna A – H. Lidské kmeny mají nejnovějšího společného předka, který se datuje před 7 000 (95% interval: 5 287–9 270) až 10 000 (95% interval: 6 305–16 681) lety.

Avihepadnavirus postrádá X protein, ale v genomu kachního hepadnaviru je přítomen zakrnělý čtecí rámec X.[38] X protein se mohl vyvinout z a DNA glykosyláza.

Míra nesynonymních mutací v tomto viru byla odhadnuta na přibližně 2 × 10−5 aminokyselinové náhrady na místo za rok.[39] Průměrný počet substitucí nukleotidů / místo / rok je ~ 7,9×10−5.

Druhý odhad původu tohoto viru naznačuje, že poslední společný předek lidských kmenů se vyvinul před 1500 lety.[40] Poslední společný předek ptačích kmenů byl umístěn před 6000 lety. Rychlost mutace byla odhadnuta na ~ 10−6 náhrady / místo / rok.

Další analýza s větším souborem údajů naznačuje, že lidé infikovaní hepatitidou B před 33 600 lety (o 95% vyšší zadní hustota před 22 000–47 100 lety).[41] Odhadovaná míra substituce byla 2,2 × 10−6 náhrady / místo / rok. Během posledních 5 000 let byl zaznamenán výrazný nárůst populace. Mezidruhová infekce k orangutanům a gibonům se vyskytla za posledních 6100 let.

Zkoumání sekvencí v zebří pěnkavě posunulo původ tohoto rodu minimálně zpět 40 před miliony let a možná i 80 před miliony let.[42] Šimpanz, gorila, orangutan a gibonové druhy se shlukují s lidskými izoláty. Mezi druhy, které nebyly primáty, patřil virus hepatitidy svízelné, virus hepatitidy sysel a virus hepatitidy veverky polární. Byla také popsána řada druhů infikujících netopýry. Bylo navrženo, že původem primátů může být druh netopýra nového světa.[43]

Studie izolátů z cirkumpolární arktické lidské populace navrhla, že předchůdce subgenotypu B5 ( endemický typ zjištěno v této populaci), že virus předků pocházel z Asie asi před 2000 lety (95% HPD 900 př. n. l. - 830 n. l.).[44] K koalescenci došlo kolem roku 1000 n. Tento subgenotyp se původně rozšířil z Asie Grónsko a poté se za posledních 400 let rozšířil na západ.

Nejstarší důkazy infekce hepatitidou B se datují do Doba bronzová.[45][46] Důkazy byly získány od 4 500 let starých lidských ostatků.[46] Podle studie z roku 2018 je virová genomy získané sekvenování brokovnice se stal nejstarším, který se kdy získal ze vzorků obratlovců.[46] Bylo také zjištěno, že některé starověké hepatitidy virové kmeny stále infikují lidi, zatímco ostatní vyhynuli.[46] To vyvrátilo přesvědčení, že hepatitida B pocházela z Nového světa a rozšířila se do Evropy kolem 16. století.[46]

Genom

Organizace genomu HBV. Geny se překrývají.

Velikost

The genom HBV je vyroben z kruhu DNA, ale je to neobvyklé, protože DNA není zcela dvouvláknová. Jeden konec řetězce o celé délce je spojen s virem DNA polymeráza. Genom je 3020–3320 nukleotidy dlouhý (pro vlákno plné délky) a 1700–2800 nukleotidů dlouhý (pro vlákno krátké délky).[47]

Kódování

Negativní (nekódující) vlákno je komplementární k virové mRNA. Virová DNA se nachází v jádře brzy po infekci buňky. Částečně dvouvláknová DNA je poskytnuta plně dvouvláknovou dokončením (+) sense řetězce buňkou DNA polymerázy (virová DNA polymeráza se použije pro pozdější fázi) a odstranění virového polymerázového proteinu (P) z (-) sense řetězce a krátké sekvence RNA z (+) sense řetězce. Nekódující báze se odstraní z konců řetězce (-) sense a konce se spojí.

Virové geny jsou přepsány buňkou RNA polymeráza II v buněčném jádru z kovalentně uzavřené šablony kruhové DNA (cccDNA). V genomu HBV byly identifikovány dva zesilovače označené enhancer I (EnhI) a enhancer II (EnhII). Oba zesilovače vykazují větší aktivitu v buňkách jaterního původu a společně řídí a regulují expresi úplných virových transkriptů.[48][49][50] Existují čtyři známé geny kódované genomem zvaným C, P, S a X. Jádrový protein je kódován genem C (HBcAg) a jeho startovnímu kodonu předchází upstream in-frame AUG start kodon ze kterého se vyrábí pre-core protein. HBeAg se vyrábí proteolytickým zpracováním pre-core proteinu. DNA polymeráza je kódována genem P. Gen S je gen, který kóduje povrchový antigen (HBsAg). Gen HBsAg je jeden dlouhý otevřený čtecí rámec, ale obsahuje tři kodony „start“ (ATG) v rámci, které dělí gen na tři části, pre-S1, pre-S2 a S. Kvůli mnohonásobným start kodonům jsou polypeptidy tří vyrábějí se různé velikosti zvané velké, střední a malé (pre-S1 + pre-S2 + S, pre-S2 + S nebo S).[51] Funkce proteinu kódovaného genem X není plně objasněna,[52] ale některé důkazy naznačují, že může fungovat jako transkripční transaktivátor.

Několik nekódující RNA prvky byly identifikovány v genomu HBV. Tyto zahrnují: HBV PREalfa, HBV PREbeta a Enkapsidační signál HBV RNA epsilon.[53][54]

Genotypy

Genotypy se liší nejméně o 8% sekvence a mají odlišné geografické distribuce, což je spojováno s antropologickou historií. V rámci genotypů byly popsány podtypy: liší se o 4–8% genomu.

Je jich osm známých genotypy označené A až H.[20]

Byl popsán možný nový genotyp „I“,[55] přijetí této notace však není univerzální.[56]

Od té doby byly rozpoznány dva další genotypy.[57] V aktuálním (2014) seznamu nyní běží A ačkoli J. Je rozpoznáno také několik podtypů.

Existuje nejméně 24 podtypů.

Různé genotypy mohou reagovat na léčbu různými způsoby.[58][59]

Jednotlivé genotypy

Typ F, který se odchyluje od ostatních genomů o 14%, je nejvíce odlišným známým typem. Typ A převládá v Evropa, Afrika a Jihovýchodní Asie, včetně Filipíny. Typ B a C převládají v Asie; typ D je běžný v oblasti Středomoří, střední východ a Indie; typ E je lokalizován v subsaharské Africe; typ F (nebo H) je omezen na centrální a Jižní Amerika. Typ G byl nalezen v Francie a Německo. Genotypy A, D a F převládají v Brazílie a všechny genotypy se vyskytují v Spojené státy s četností závislou na etnickém původu.

Zdá se, že kmeny E a F pocházejí z domorodých populací Afriky a Nového světa.

Typ A má dva podtypy: Aa (A1) v Africe / Asii a na Filipínách a Ae (A2) v Evropě / Spojených státech.

Typ B má dvě odlišná geografická rozdělení: Bj / B1 („j“ - Japonsko) a Ba / B2 („a“ - Asie). Typ Ba byl dále rozdělen na čtyři subtypy (B2 – B4).

Typ C má dva geograficky podtypy: C (C1) v jihovýchodní Asii a Ce (C2) ve východní Asii. Podtypy C byly rozděleny do pěti subtypů (C1 – C5). Šestý clade (C6) byl popsán na Filipínách, ale zatím pouze v jednom izolátu.[60] Typ C1 je spojen s Vietnam, Myanmar a Thajsko; typ C2 s Japonsko, Korea a Čína; typ C3 s Nová Kaledonie a Polynésie; C4 s Austrálie; a C5 s Filipíny. Další podtyp byl popsán v Papua, Indonésie.[61]

Typ D byl rozdělen do 7 podtypů (D1 – D7).

Typ F byl rozdělen na 4 podtypy (F1 – F4). F1 byla dále rozdělena na 1a a 1b. v Venezuela podtypy F1, F2 a F3 se nacházejí ve východních a západních indiánech. Mezi jihoamerickými Indiány byl nalezen pouze F3. Podtypy Ia, III a IV vykazují omezené zeměpisné rozšíření (Střední Amerika, Severní a Jižní Jižní Amerika), zatímco subtypy Ib a II se vyskytují ve všech Amerikách s výjimkou Severní Jižní Ameriky a Severní Ameriky.

Životní cyklus

Virus hepatitidy B. replikace

Životní cyklus Virus hepatitidy B. je komplexní. Hepatitida B je jednou z mála známých neretrovirový viry, které používají reverzní transkripce jako součást procesu replikace.

Příloha
Virus získává vstup do buňky vazbou na receptory na povrchu buňky a vstupuje do ní endocytóza zprostředkovaný kterýmkoli z nich Clathrin nebo Caveolin-1.[62] HBV se zpočátku váže na heparinsulfát proteoglykan. Segment pre-S1 proteinu HBV L se poté pevně váže na buněčný povrchový receptor taurokolát sodný kotransportující polypeptid (NTCP), kódováno Gen SLC10A1.[63] NTCP se většinou nachází v sinusová membrána z jaterní buňky. Přítomnost NTCP v jaterních buňkách koreluje s tkáňovou specificitou infekce HBV.[62]
Penetrace
Po endocytóze se virová membrána spojí s membránou hostitelské buňky a uvolní nukleokapsid do cytoplazmy.[64]
Bez nátěru
Protože se virus množí prostřednictvím RNA vytvořené hostitelským enzymem, musí být virová genomová DNA přenesena do buněčného jádra. Předpokládá se, že kapsida je transportována na mikrotubuly do jaderný pór. Jádrové proteiny disociují z částečně dvouřetězcové virové DNA, která je poté plně dvouřetězcová (hostitelskými DNA polymerázami) a transformována na kovalentně uzavřenou kruhovou DNA (cccDNA ), který slouží jako šablona pro transkripci čtyř virů mRNA.
Replikace
Největší mRNA (která je delší než virový genom) se používá k vytváření nových kopií genomu ak tvorbě kapsid jádrový protein a závislá na virové RNADNA-polymeráza.
Shromáždění
Tyto čtyři virové transkripty procházejí dalším zpracováním a dále vytvářejí potomstvo virionů, které se uvolňují z buňky nebo se vracejí do jádra a znovu se cyklují za vzniku ještě více kopií.[51][65]
Uvolnění
Dlouhá mRNA je poté transportována zpět do cytoplazmy, kde virionový protein P syntetizuje DNA prostřednictvím své aktivity reverzní transkriptázy.

Transaktivované geny

HBV má schopnost transaktivace FAM46A.[66]

Viz také

Reference

  1. ^ Ryu W (2017). Molekulární virologie lidských patogenních virů. Akademický tisk. 247–260. ISBN  978-0-12-800838-6.
  2. ^ Hunt R (21. listopadu 2007). „Viry hepatitidy“. University of Southern California, Department of Pathology and Microbiology. Citováno 13. března 2008.
  3. ^ A b Hassan MM, Li D, El-Deeb AS, Wolff RA, Bondy ML, Davila M, Abbruzzese JL (říjen 2008). „Souvislost mezi virem hepatitidy B a rakovinou pankreatu“. Journal of Clinical Oncology. 26 (28): 4557–62. doi:10.1200 / JCO.2008.17.3526. PMC  2562875. PMID  18824707.
  4. ^ „Přehodnocení viru hepatitidy B: Výzvy léčebných terapií“.
  5. ^ Schwalbe M, Ohlenschläger O, Marchanka A, Ramachandran R, Häfner S, Heise T, Görlach M (březen 2008). "Struktura řešení post-transkripčního regulačního prvku viru hepatitidy B alfa kmenové smyčky". Výzkum nukleových kyselin. 36 (5): 1681–9. doi:10.1093 / nar / gkn006. PMC  2275152. PMID  18263618.
  6. ^ A b Balakrishnan L, Milavetz B (listopad 2017). „Epigenetická regulace virových biologických procesů“. Viry. 9 (11): 346. doi:10,3390 / v9110346. PMC  5707553. PMID  29149060.
  7. ^ A b Ivanov AV, Valuev-Elliston VT, Tyurina DA, Ivanova ON, Kochetkov SN, Bartosch B, Isaguliants MG (leden 2017). „Oxidační stres, spouštěč karcinogeneze jater vyvolané virem hepatitidy C a B“. Cílový cíl. 8 (3): 3895–3932. doi:10.18632 / oncotarget.13904. PMC  5354803. PMID  27965466.
  8. ^ A b Higgs MR, Chouteau P, Lerat H (květen 2014). "'Játra nechají zemřít: oxidační poškození DNA a hepatotropní viry “ (PDF). The Journal of General Virology. 95 (Pt 5): 991–1004. doi:10.1099 / vir.0.059485-0. PMID  24496828.
  9. ^ Yu Y, Cui Y, Niedernhofer LJ, Wang Y (prosinec 2016). „Výskyt, biologické důsledky a význam poškození zdraví DNA oxidačním stresem pro lidské zdraví“. Chemický výzkum v toxikologii. 29 (12): 2008–2039. doi:10.1021 / acs.chemrestox.6b00265. PMC  5614522. PMID  27989142.
  10. ^ Dizdaroglu M (prosinec 2012). "Oxidačně indukované poškození DNA: mechanismy, oprava a nemoc". Dopisy o rakovině. 327 (1–2): 26–47. doi:10.1016 / j.canlet.2012.01.016. PMID  22293091.
  11. ^ Nishida N, Kudo M (2013). „Oxidační stres a epigenetická nestabilita v lidské hepatokarcinogenezi“. Nemoci zažívacího ústrojí. 31 (5–6): 447–53. doi:10.1159/000355243. PMID  24281019.
  12. ^ A b Ozen C, Yildiz G, Dagcan AT, Cevik D, Ors A, Keles U a kol. (Květen 2013). "Genetika a epigenetika rakoviny jater". Nová biotechnologie. 30 (4): 381–4. doi:10.1016 / j.nbt.2013.01.007. hdl:11693/20956. PMID  23392071.
  13. ^ Shibata T, Aburatani H (červen 2014). "Průzkum genomů rakoviny jater". Recenze přírody. Gastroenterologie a hepatologie. 11 (6): 340–9. doi:10.1038 / nrgastro.2014.6. PMID  24473361.
  14. ^ A b Tian Y, Yang W, Song J, Wu Y, Ni B (srpen 2013). „Aberantní epigenetické modifikace vyvolané proteinem X viru hepatitidy B přispívající k patogenezi lidského hepatocelulárního karcinomu“. Molekulární a buněčná biologie. 33 (15): 2810–6. doi:10.1128 / MCB.00205-13. PMC  3719687. PMID  23716588.
  15. ^ A b Guerrieri F, Belloni L, D'Andrea D, Pediconi N, Le Pera L, Testoni B a kol. (Únor 2017). „Identifikace přímých genomových cílů HBx v celém genomu“. BMC Genomics. 18 (1): 184. doi:10.1186 / s12864-017-3561-5. PMC  5316204. PMID  28212627.
  16. ^ A b „Virus Taxonomy: 2018b Release“. Mezinárodní výbor pro taxonomii virů (ICTV). Února 2019. Citováno 14. března 2019.
  17. ^ Mason, W.S .; et al. (8. července 2008). "00.030. Hepadnaviridae". ICTVdB Index virů. Mezinárodní výbor pro taxonomii virů. Citováno 13. března 2009.
  18. ^ Dupinay T a kol. (Listopad 2013). „Objev přirozeně se vyskytující přenosné chronické infekce virem hepatitidy B mezi Macaca fascicularis z ostrova Mauritius“. Hepatologie. 58 (5). 1610–1620. doi:10.1002 / hep.26428. PMID  23536484.
  19. ^ A b Hundie GB, Stalin Raj V, Gebre Michael D, Pas SD, Koopmans MP, Osterhaus AD a kol. (Únor 2017). „Nový subgenotyp viru hepatitidy B D10 cirkulující v Etiopii“. Journal of Viral Hepatitis. 24 (2): 163–173. doi:10.1111 / jvh.12631. PMID  27808472.
  20. ^ A b Kramvis A, Kew M, François G (březen 2005). "Genotypy viru hepatitidy B". Vakcína. 23 (19): 2409–23. doi:10.1016 / j.vaccine.2004.10.045. PMID  15752827.
  21. ^ Magnius LO, Norder H (1995). "Subtypy, genotypy a molekulární epidemiologie viru hepatitidy B, jak se odráží v variabilitě sekvencí S-genu". Intervirologie. 38 (1–2): 24–34. doi:10.1159/000150411. PMID  8666521.
  22. ^ Ghosh S, Banerjee P, Deny P, Mondal RK, Nandi M, Roychoudhury A a kol. (Březen 2013). „Nový HBV subgenotyp D9, nový D / C rekombinantní, identifikovaný u pacientů s chronickou HBeAg-negativní infekcí ve východní Indii“. Journal of Viral Hepatitis. 20 (3): 209–18. doi:10.1111 / j.1365-2893.2012.01655.x. PMID  23383660.
  23. ^ Drexler JF, Geipel A, König A, Corman VM, van Riel D, Leijten LM a kol. (Říjen 2013). „Netopýři přenášejí patogenní hepadnaviry, které jsou antigenně příbuzné s virem hepatitidy B a jsou schopné infikovat lidské hepatocyty“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 110 (40): 16151–6. Bibcode:2013PNAS..11016151D. doi:10.1073 / pnas.1308049110. PMC  3791787. PMID  24043818.
  24. ^ Zuckerman AJ (1996). „Kapitola 70: Viry hepatitidy“. V Baron S; et al. (eds.). Baronova lékařská mikrobiologie (4. vydání). Univ of Texas Medical Branch. ISBN  978-0-9631172-1-2. Citováno 11. dubna 2018.
  25. ^ "KDO | Hepatitida B". www.who.int. Archivovány od originál dne 10. července 2015. Citováno 12. července 2015.
  26. ^ Locarnini S (2004). "Molekulární virologie viru hepatitidy B". Semináře o onemocnění jater. 24 Suppl 1 (Suppl 1): 3–10. CiteSeerX  10.1.1.618.7033. doi:10.1055 / s-2004-828672. PMID  15192795.
  27. ^ Howard CR (červenec 1986). „Biologie hepadnavirů“. The Journal of General Virology. 67 (7): 1215–35. doi:10.1099/0022-1317-67-7-1215. PMID  3014045.
  28. ^ Jaroszewicz J, Calle Serrano B, Wursthorn K, Deterding K, Schlue J, Raupach R a kol. (Duben 2010). „Hladiny povrchového antigenu hepatitidy B (HBsAg) v přirozené historii infekce virem hepatitidy B (HBV): evropská perspektiva“. Journal of Hepatology. 52 (4): 514–22. doi:10.1016 / j.jhep.2010.01.014. PMID  20207438.
  29. ^ Seeger C, Mason WS (březen 2000). "Biologie viru hepatitidy B". Recenze mikrobiologie a molekulární biologie. 64 (1): 51–68. doi:10.1128 / mmbr.64.1.51-68.2000. PMC  98986. PMID  10704474.
  30. ^ Lin YJ, Wu HL, Chen DS, Chen PJ (září 2012). „Nukleokapsid viru hepatitidy B, ale ne antigen volného jádra, řídí virovou clearance u myší“. Journal of Virology. 86 (17): 9266–73. doi:10.1128 / JVI.00608-12. PMC  3416136. PMID  22718814.
  31. ^ Lin YJ, Huang LR, Yang HC, Tzeng HT, Hsu PN, Wu HL a kol. (Květen 2010). „Základní antigen viru hepatitidy B určuje persistenci viru v myším modelu C57BL / 6“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 107 (20): 9340–5. doi:10.1073 / pnas.1004762107. PMC  2889105. PMID  20439715.
  32. ^ Bourne CR, Katen SP, Fulz MR, Packianathan C, Zlotnick A (březen 2009). „Mutantní jádrový protein viru hepatitidy B napodobuje inhibitory ikosahedrální kapsidy.“. Biochemie. 48 (8): 1736–42. doi:10.1021 / bi801814y. PMC  2880625. PMID  19196007.
  33. ^ Tang H, Oishi N, Kaneko S, Murakami S (říjen 2006). "Molekulární funkce a biologické role viru hepatitidy B x protein". Cancer Science. 97 (10): 977–83. doi:10.1111 / j.1349-7006.2006.00299.x. PMID  16984372.
  34. ^ McClain SL, Clippinger AJ, Lizzano R, Bouchard MJ (listopad 2007). „Replikace viru hepatitidy B je spojena se zvýšením hladin cytosolického vápníku závislým na mitochondriích závislým na HBx“. Journal of Virology. 81 (21): 12061–5. doi:10.1128 / JVI.00740-07. PMC  2168786. PMID  17699583.
  35. ^ Bouchard MJ, Puro RJ, Wang L, Schneider RJ (červenec 2003). „Aktivace a inhibice buněčných signálních drah vápníku a tyrosinkinázy identifikuje cíle proteinu HBx podílejícího se na replikaci viru hepatitidy B“. Journal of Virology. 77 (14): 7713–9. doi:10.1128 / JVI.77.14.7713-7719.2003. PMC  161925. PMID  12829810.
  36. ^ Chai N, Chang HE, Nicolas E, Han Z, Jarnik M, Taylor J (srpen 2008). "Vlastnosti subvirových částic viru hepatitidy B". Journal of Virology. 82 (16): 7812–7. doi:10.1128 / JVI.00561-08. PMC  2519590. PMID  18524834.
  37. ^ A b van Hemert FJ, van de Klundert MA, Lukashov VV, Kootstra NA, Berkhout B, Zaaijer HL (2011). „Protein X viru hepatitidy B: podobnost původu a struktury s centrální doménou DNA glykosylázy“. PLOS ONE. 6 (8): e23392. Bibcode:2011PLoSO ... 623392V. doi:10.1371 / journal.pone.0023392. PMC  3153941. PMID  21850270.
  38. ^ Lin B, Anderson DA (2000). "Zbytkový X otevřený čtecí rámec u kachního viru hepatitidy B". Intervirologie. 43 (3): 185–90. doi:10.1159/000025037. PMID  11044813.
  39. ^ Osiowy C, Giles E, Tanaka Y, Mizokami M, Minuk GY (listopad 2006). „Molekulární vývoj viru hepatitidy B za 25 let“. Journal of Virology. 80 (21): 10307–14. doi:10.1128 / JVI.00996-06. PMC  1641782. PMID  17041211.
  40. ^ Zhou Y, Holmes EC (srpen 2007). „Bayesovské odhady evoluční rychlosti a stáří viru hepatitidy B“. Journal of Molecular Evolution. 65 (2): 197–205. Bibcode:2007JMolE..65..197Z. doi:10.1007 / s00239-007-0054-1. PMID  17684696.
  41. ^ Paraskevis D, Magiorkinis G, Magiorkinis E, Ho SY, Belshaw R, Allain JP, Hatzakis A (březen 2013). „Datování vzniku a šíření infekce virem hepatitidy B u lidí a primátů“. Hepatologie. 57 (3): 908–16. doi:10,1002 / hep. 26079. PMID  22987324.
  42. ^ Littlejohn M, Locarnini S, Yuen L (leden 2016). „Počátky a vývoj viru hepatitidy B a viru hepatitidy D“. Perspektivy Cold Spring Harbor v medicíně. 6 (1): a021360. doi:10.1101 / cshperspect.a021360. PMC  4691804. PMID  26729756.
  43. ^ Rasche A, Souza BF, Drexler JF (únor 2016). „Netopýr hepadnaviry a původ virů hepatitidy B primátů“. Aktuální názor na virologii. 16: 86–94. doi:10.1016 / j.coviro.2016.01.015. PMID  26897577.
  44. ^ Bouckaert R, Simons BC, Krarup H, Friesen TM, Osiowy C (2017). „Sledování evoluční historie viru hepatitidy B (HBV) genotypu B5 (dříve B6) v cirkumpolární Arktidě prostřednictvím fylogeografického modelování“. PeerJ. 5: e3757. doi:10,7717 / peerj.3757. PMC  5581946. PMID  28875087.
  45. ^ Mühlemann B, Jones TC, Damgaard PB, Allentoft ME, Shevnina I, Logvin A, et al. (Květen 2018). „Starověké viry hepatitidy B od doby bronzové po středověké období“. Příroda. 557 (7705): 418–423. Bibcode:2018Natur.557..418M. doi:10.1038 / s41586-018-0097-z. PMID  29743673.
  46. ^ A b C d E Ben Guarino (9. května 2018). „Nové kmeny viru hepatitidy B objevené ve starověkých lidských pozůstatcích“. The Washington Post. Citováno 9. ledna 2018.
  47. ^ Kay A, Zoulim F (srpen 2007). „Genetická variabilita a vývoj viru hepatitidy B“. Virový výzkum. 127 (2): 164–76. doi:10.1016 / j.virusres.2007.02.021. PMID  17383765.
  48. ^ Doitsh G, Shaul Y (únor 2004). „Převaha Enhancer I v genové expresi viru hepatitidy B“. Molekulární a buněčná biologie. 24 (4): 1799–808. doi:10.1128 / mcb.24.4.1799-1808.2004. PMC  344184. PMID  14749394.
  49. ^ Antonucci TK, Rutter WJ (únor 1989). „Promotory viru hepatitidy B (HBV) jsou regulovány zesilovačem HBV tkáňově specifickým způsobem“. Journal of Virology. 63 (2): 579–83. PMC  247726. PMID  2536093.
  50. ^ Huan B, Siddiqui A (1993). "Regulace genové exprese viru hepatitidy B". Journal of Hepatology. 17 Suppl 3: S20-3. doi:10.1016 / s0168-8278 (05) 80419-2. PMID  8509635.
  51. ^ A b Beck J, Nassal M (leden 2007). „Replikace viru hepatitidy B“. World Journal of Gastroenterology. 13 (1): 48–64. doi:10,3748 / wjg.v13.i1,48. PMC  4065876. PMID  17206754.
  52. ^ Bouchard MJ, Schneider RJ (prosinec 2004). „Tajemný gen X viru hepatitidy B“. Journal of Virology. 78 (23): 12725–34. doi:10.1128 / JVI.78.23.12725-12734.2004. PMC  524990. PMID  15542625.
  53. ^ Smith GJ, Donello JE, Lück R, Steger G, Hope TJ (listopad 1998). „Posttranskripční regulační prvek viru hepatitidy B obsahuje dvě konzervované kmenové smyčky RNA, které jsou nutné pro funkci“. Výzkum nukleových kyselin. 26 (21): 4818–27. doi:10.1093 / nar / 26.21.4818. PMC  147918. PMID  9776740.
  54. ^ Flodell S, Schleucher J, Cromsigt J, Ippel H, Kidd-Ljunggren K, Wijmenga S (listopad 2002). „Apikální kmenová smyčka signálu enkapsidace viru hepatitidy B se skládá do stabilní tri-smyčky se dvěma základními výčnělky pyrimidinu“. Výzkum nukleových kyselin. 30 (21): 4803–11. doi:10.1093 / nar / gkf603. PMC  135823. PMID  12409471.
  55. ^ Olinger CM, Jutavijittum P, Hübschen JM, Yousukh A, Samountry B, Thammavong T a kol. (Listopad 2008). „Možný nový genotyp viru hepatitidy B, jihovýchodní Asie“. Vznikající infekční nemoci. 14 (11): 1777–80. doi:10.3201 / eid1411.080437. PMC  2630741. PMID  18976569.
  56. ^ Kurbanov F, Tanaka Y, Kramvis A, Simmonds P, Mizokami M (srpen 2008). „Kdy bych měl„ já “uvažovat o novém genotypu viru hepatitidy B?“. Journal of Virology. 82 (16): 8241–2. doi:10.1128 / JVI.00793-08. PMC  2519592. PMID  18663008.
  57. ^ Hernández S, Venegas M, Brahm J, Villanueva RA (říjen 2014). "Full-genomová sekvence klonu viru hepatitidy B genotypu f1b od chronicky infikovaného chilského pacienta". Oznámení o genomu. 2 (5): e01075–14. doi:10.1128 / genomA.01075-14. PMC  4208329. PMID  25342685.
  58. ^ Palumbo E (2007). „Genotypy hepatitidy B a reakce na antivirovou terapii: přehled“. American Journal of Therapeutics. 14 (3): 306–9. doi:10.1097 / 01.pap.0000249927.67907.eb. PMID  17515708.
  59. ^ Mahtab MA, Rahman S, Khan M, Karim F (říjen 2008). „Genotypy viru hepatitidy B: přehled“. Hepatobiliární a pankreatické nemoci mezinárodní. 7 (5): 457–64. PMID  18842489.
  60. ^ Cavinta L, Sun J, May A, Yin J, von Meltzer M, Radtke M, et al. (Červen 2009). „Nový izolát viru hepatitidy B z Filipín, který pravděpodobně představuje nový subgenotyp C6“. Journal of Medical Virology. 81 (6): 983–7. doi:10.1002 / jmv.21475. PMID  19382274.
  61. ^ Lusida MI, Nugrahaputra VE, Handajani R, Nagano-Fujii M, Sasayama M, Utsumi T, Hotta H (červenec 2008). "Nové subgenotypy genotypů viru hepatitidy B C a D v Papui v Indonésii". Journal of Clinical Microbiology. 46 (7): 2160–6. doi:10.1128 / JCM.01681-07. PMC  2446895. PMID  18463220.
  62. ^ A b Zhang Z, Zehnder B, Damrau C, Urban S (červenec 2016). „Vizualizace vstupu viru hepatitidy B - nové nástroje a přístupy k přímému sledování vstupu viru do hepatocytů“. FEBS Dopisy. 590 (13): 1915–26. doi:10.1002/1873-3468.12202. PMID  27149321.
  63. ^ Yan H, Liu Y, Sui J, Li W (září 2015). „NTCP otevírá dveře pro infekci virem hepatitidy B“. Antivirový výzkum. 121: 24–30. doi:10.1016 / j.antiviral.2015.06.002. PMID  26071008.
  64. ^ Watashi K, Wakita T (srpen 2015). „Virus hepatitidy B a viru hepatitidy D, druhová specificita a tkáňový tropismus“. Perspektivy Cold Spring Harbor v medicíně. 5 (8): a021378. doi:10.1101 / cshperspect.a021378. PMC  4526719. PMID  26238794.
  65. ^ Bruss V (leden 2007). „Morfogeneze viru hepatitidy B“. World Journal of Gastroenterology. 13 (1): 65–73. doi:10,3748 / wjg.v13.i1.65. PMC  4065877. PMID  17206755.
  66. ^ „Fam46A (kódování bílkovin)“. Genové karty. Genové karty. Citováno 18. února 2015.