Enkapsidační signál HBV RNA epsilon - HBV RNA encapsidation signal epsilon
Enkapsidační signál HBV RNA epsilon | |
---|---|
![]() Předpovězeno sekundární struktura a zachování sekvence z HBV_epsilon | |
Identifikátory | |
Symbol | HBV_epsilon |
Alt. Symboly | HBV |
Rfam | RF01047 |
Další údaje | |
RNA typ | Cis-reg |
Domény | Viry |
JÍT | GO termín musí začínat GO: |
TAK | SO: 0005836 |
PDB struktur | PDBe |
The Enkapsidační signál HBV RNA epsilon (HBV_epsilon ) je prvek nezbytný pro HBV replikace viru.
Je to Struktura RNA se nachází v blízkosti 5' konec HBV pregenomová RNA.[1] Struktura se skládá z dolního dříku, vyduté oblasti, horního dříku a tri-smyčky. Struktura byla stanovena a rafinována enzymatickým sondováním a NMR spektroskopie.[2] Uzavření tri smyčky nebylo předpovězeno Predikce struktury RNA programy, ale pozorovány ve struktuře NMR. Oblasti, které se ukázaly jako rozhodující pro enkapsidaci RNA ve virovém životním cyklu, jsou boule, horní kmen a tri-smyčka, které interagují s koncovou proteinovou doménou virové polymerázy HBV.[3][4]
Viz také
- Heron HBV RNA enkapsidační signál epsilon
- Kachní HBV RNA enkapsidační signál epsilon
- Virus hepatitidy B PRE alfa
- Virus hepatitidy B PRE beta
- Virus hepatitidy B PRE 1151–1410
Reference
- ^ Beck J, Nassal M (leden 2007). „Replikace viru hepatitidy B“. Svět J. Gastroenterol. 13 (1): 48–64. doi:10,3748 / wjg.v13.i1,48. PMC 4065876. PMID 17206754. Archivovány od originál dne 2007-03-20.
- ^ Flodell S, Schleucher J, Cromsigt J, Ippel H, Kidd-Ljunggren K, Wijmenga S (listopad 2002). „Apikální kmenová smyčka signálu enkapsidace viru hepatitidy B se skládá do stabilní tri-smyčky se dvěma základními výčnělky pyrimidinu“. Nucleic Acids Res. 30 (21): 4803–4811. doi:10.1093 / nar / gkf603. PMC 135823. PMID 12409471.
- ^ Kramvis A, Kew MC (listopad 1998). "Struktura a funkce enkapsidačního signálu hepadnaviridae". J. Virová Hepat. 5 (6): 357–367. doi:10.1046 / j.1365-2893.1998.00124.x. PMID 9857345.
- ^ Beck, J; Nassal, M (2003). "Efektivní aktivace Hsp90 nezávislá in vitro aktivace reverzní transkriptázy viru kachní hepatitidy B Hsc70 a Hsp40, předpokládaný klientský protein Hsp90". The Journal of Biological Chemistry. 278 (38): 36128–36138. doi:10,1074 / jbc.M301069200. PMID 12851401.
externí odkazy
- Stránka pro enkapsidační signál HBV RNA epsilon v Rfam
- Databáze regulačních sekvencí viru HBVRegDB viru hepatitidy B (HBVRegDB)
![]() | Tento molekulární nebo buněčná biologie článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |