SLC22A5 - SLC22A5

SLC22A5
Identifikátory
AliasySLC22A5, CDSP, OCTN2, rodina nosičů rozpuštěných látek 22 členů 5
Externí IDOMIM: 603377 MGI: 1329012 HomoloGene: 68295 Genové karty: SLC22A5
Umístění genu (člověk)
Chromozom 5 (lidský)
Chr.Chromozom 5 (lidský)[1]
Chromozom 5 (lidský)
Genomic location for SLC22A5
Genomic location for SLC22A5
Kapela5q31.1Start132,369,752 bp[1]
Konec132,395,614 bp[1]
Exprese RNA vzor
PBB GE SLC22A5 205074 at fs.png
Další údaje o referenčních výrazech
Ortology
DruhČlověkMyš
Entrez

6584

20520

Ensembl

ENSG00000197375

ENSMUSG00000018900

UniProt

O76082

Q9Z0E8

RefSeq (mRNA)

NM_001308122
NM_003060

NM_011396
NM_001362711
NM_001362712

RefSeq (protein)

NP_001295051
NP_003051

NP_035526
NP_001349640
NP_001349641

Místo (UCSC)Chr 5: 132,37 - 132,4 MbChr 11: 53,86 - 53,89 Mb
PubMed Vyhledávání[3][4]
Wikidata
Zobrazit / upravit člověkaZobrazit / upravit myš

SLC22A5 je membránový transportní protein spojený s primární nedostatek karnitinu. Tento protein se účastní aktivního buněčného vychytávání karnitin. Působí a symporter, pohybující se sodíkem ionty a další organické kationty přes membránu spolu s karnitinem. Takové polyspecifické transportéry organických kationtů v játrech, ledvinách, střevech a dalších orgánech jsou rozhodující pro eliminaci mnoha endogenních malých organických kationtů, stejně jako široké škály léků a toxinů v životním prostředí.[5] Mutace v SLC22A5 genová příčina systémový primární nedostatek karnitinu, což může vést k srdeční selhání.[6]

Struktura

The SLC22A5 gen obsahující 10 exonů,[7] se nachází na rameni q chromozom 5 na pozici 31,1 a zabírá 25 910 párů bází.[5] Gen produkuje 63 kDa protein složený z 557 aminokyseliny.[8][9] Protein má 12 domnělých transmembránové domény, s dlouhou extracelulární smyčkou 107 aminokyselin mezi prvními dvěma transmembránovými doménami a intracelulární smyčkou mezi čtvrtou a pátou transmembránovou doménou. Tato dlouhá extracelulární smyčka má tři potenciální stránky N-glykosylace a intracelulární smyčka má ATP / GTP motiv vazby. V domnělých intracelulárních doménách existuje pět potenciálních míst pro závislá na proteinkináze C fosforylace a jeden pro fosforylace závislá na proteinkináze A.[10]

Funkce

The SLC22A5 gen kóduje plazmu integrální membránový protein který funguje jako oba transportér organických kationtů a vysokou afinitu závislou na sodíku karnitin přepravce.[5] Kódovaný protein se účastní aktivního buněčného vychytávání karnitinu a transportuje jej iont sodný s jednou molekulou karnitinu. Organické kationty transportované tímto proteinem zahrnují tetraethylamonium (TEA) bez účasti sodíku. Relativní poměr absorpční aktivity karnitinu k TEA je 11,3.[11]

Klinický význam

Hlavní fenotypový účinek autosomálně recesivních mutací složený heterozygot nebo homozygotní,[6] v SLC22A5 gen je systémový primární nedostatek karnitinu,[7] charakterizováno narušeným transportem karnitinu, plýtváním karnitinem v moči, nízkou hladinou karnitinu v séru, sníženou akumulací intracelulárního karnitinu, narušenou beta oxidace, a cytosolický mastné kyseliny nashromáždění.[6] Pacienti často vykazují metabolickou dekompenzaci, hypoketotická hypoglykemie, jaterní encefalopatie, Reyův syndrom, a náhlá smrt dítěte v prvním roce, po kterém následoval pozdější nástup kardiomyopatie nebo kosterní myopatie, arytmie, svalová slabost a srdeční selhání v raném dětství.[6][12][13] Pacienti mohou být bez příznaků, přičemž asi 70% asymptomatických pacientů mělo a missense mutace nebo vymazání v rámci; nesmyslná mutace frekvence se zvyšuje u symptomatických pacientů.[14] Příznaky a výsledek onemocnění lze drasticky zlepšit substituční terapií L-karnitinem.[15] Odhadovaný výskyt deficitu primárního karnitinu u novorozenců je přibližně 1 ze 40 000.[16]

Interakce

SLC22A5 interaguje s PDZK1.[11]

Viz také

Reference

  1. ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000197375 - Ensembl, Květen 2017
  2. ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000018900 - Ensembl, Květen 2017
  3. ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  4. ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  5. ^ A b C „Entrez Gene: SLC22A5 skupina nosičů rozpuštěných látek 22 (transportér organických kationtů), člen 5“. Citováno 2018-07-25.
  6. ^ A b C d Lahrouchi N, Lodder EM, Mansouri M, Tadros R, Zniber L, Adadi N, Clur SB, van Spaendonck-Zwarts KY, Postma AV, Sefiani A, Ratbi I, Bezzina CR (červen 2017). „Exome sekvenování identifikuje primární nedostatek karnitinu v rodině s kardiomyopatií a náhlou smrtí“. European Journal of Human Genetics. 25 (6): 783–787. doi:10.1038 / ejhg.2017.22. PMC  5477358. PMID  28295041.
  7. ^ A b Online Mendelian Inheritance in Man, OMIM®. Johns Hopkins University, Baltimore, MD. Číslo MIM: {603377}: {04/29/2015}:. Adresa URL webu: https://omim.org/
  8. ^ Zong NC, Li H, Li H, Lam MP, Jimenez RC, Kim CS, Deng N, Kim AK, Choi JH, Zelaya I, Liem D, Meyer D, Odeberg J, Fang C, Lu HJ, Xu T, Weiss J , Duan H, Uhlen M, Yates JR, Apweiler R, Ge J, Hermjakob H, Ping P (říjen 2013). „Integrace biologie a medicíny srdečních proteomů pomocí specializované znalostní databáze“. Výzkum oběhu. 113 (9): 1043–53. doi:10.1161 / CIRCRESAHA.113.301151. PMC  4076475. PMID  23965338.
  9. ^ „SLC22A5 - rodina nosičů solute 22 členů 5“. Srdeční organelární proteinová atlasová znalostní databáze (COPaKB).
  10. ^ Wu X, Prasad PD, Leibach FH, Ganapathy V (květen 1998). "sekvence cDNA, transportní funkce a genomová organizace lidského OCTN2, nový člen rodiny transportérů organických kationtů". Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 246 (3): 589–95. doi:10.1006 / bbrc.1998.8669. PMID  9618255.
  11. ^ A b „SLC22A5 - rodina nosičů rozpuštěných látek 22 členů 5 - Homo sapiens (člověk) - gen a protein SLC22A5“. www.uniprot.org. Citováno 2018-07-25.
  12. ^ Yilmaz TF, Atay M, Toprak H, Guler S, Aralasmak A, Alkan A (2014-03-10). „MRI nálezy v encefalopatii s primárním nedostatkem karnitinu: kazuistika“. Journal of Neuroimaging. 25 (2): 325–328. doi:10.1111 / jon.12102. PMID  24612242. S2CID  35640542.
  13. ^ Mazzini M, Tadros T, Siwik D, Joseph L, Bristow M, Qin F, Cohen R, Monahan K, Klein M, Colucci W (2011). „Primární nedostatek karnitinu a náhlá smrt: in vivo důkazy peroxidace lipidů v myokardu a sulfonylace sarkoendoplazmatického retikula vápenatého ATPázy 2“. Kardiologie. 120 (1): 52–8. doi:10.1159/000333127. PMID  22116472. S2CID  207687571.
  14. ^ Yoon YA, Lee DH, Ki CS, Lee SY, Kim JW, Lee YW, Park HD (2012). „Mutace SLC22A5 u pacienta se systémovým nedostatkem primárního karnitinu: první korejský případ potvrzený biochemickým a molekulárním vyšetřením“. Annals of Clinical and Laboratory Science. 42 (4): 424–8. PMID  23090741.
  15. ^ Agnetti A, Bitton L, Tchana B, Raymond A, Carano N (leden 2013). „Primární nedostatek karnitinu dilatovaná kardiomyopatie: 28leté sledování“. International Journal of Cardiology. 162 (2): e34–5. doi:10.1016 / j.ijcard.2012.05.038. PMID  22658351.
  16. ^ Koizumi A, Nozaki J, Ohura T, Kayo T, Wada Y, Nezu J, Ohashi R, Tamai I, Shoji Y, Takada G, Kibira S, Matsuishi T, Tsuji A (listopad 1999). „Genetická epidemiologie genu OCTN2 pro transportér karnitinu v japonské populaci a fenotypová charakterizace v japonských rodokmenech s primárním systémovým nedostatkem karnitinu“. Lidská molekulární genetika. 8 (12): 2247–54. doi:10,1093 / hmg / 8.12.2247. PMID  10545605.

Další čtení

externí odkazy

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.