SLC25A46 - SLC25A46
SLC25A46 | |||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Identifikátory | |||||||||||||||||||||||||
Aliasy | SLC25A46, HMSN6B, rodina nosičů rozpuštěných látek 25 členů 46 | ||||||||||||||||||||||||
Externí ID | OMIM: 610826 MGI: 1914703 HomoloGene: 14518 Genové karty: SLC25A46 | ||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
Ortology | |||||||||||||||||||||||||
Druh | Člověk | Myš | |||||||||||||||||||||||
Entrez | |||||||||||||||||||||||||
Ensembl | |||||||||||||||||||||||||
UniProt | |||||||||||||||||||||||||
RefSeq (mRNA) | |||||||||||||||||||||||||
RefSeq (protein) | |||||||||||||||||||||||||
Místo (UCSC) | Chr 5: 110,74 - 110,77 Mb | Chr 18: 31,56 - 31,61 Mb | |||||||||||||||||||||||
PubMed Vyhledávání | [3] | [4] | |||||||||||||||||||||||
Wikidata | |||||||||||||||||||||||||
|
Rodina nosičů solute 25 členů 46 je protein že u lidí je kódován SLC25A46 gen. Tento protein je členem Nosič mitochondriální rozpuštěné látky SLC25 rodina. Je to transmembránový protein nachází se v mitochondriální vnější membrána zahrnutý do něčeho, zůčastnit se čeho lipid převod z endoplazmatické retikulum (ER) do mitochondrie.[5][6] Mutace v tomto genu vedou k neuropatie a optická atrofie.[7]
Struktura
The SLC25A46 gen se nachází na rameni q chromozom 5 na pozici 22,1 a rozpětí 27 039 párů bází.[7] Gen produkuje 46,2 kDa protein složený z 418 aminokyseliny.[8][9] Tento gen má 8 exony a kóduje a víceprůchodový integrální membránový protein lokalizovaný na mitochondriální vnější membránu.[10][11][12]
Funkce
Kódovaný protein je osiřelý transportér zapojený do přenosu lipidů z endoplazmatického retikula do mitochondrií.[13][6] Podporuje to mitochondriální štěpení a zabraňuje tvorbě hyperfilamentózních mitochondrií. Tento protein tvoří a komplex s mitofilinem (IMMT ) na vnitřní mitochondriální membráně, nezávisle na MFN2.[5]
Klinický význam
Mutace v SLC25A46 gen, zděděný v autozomálně recesivní způsobem způsobí typ 6B dědičná motorická a senzorická neuropatie. Mezi příznaky patří optická atrofie s časným nástupem, progresivní ztráta zraku a periferní senzomotorická neuropatie projevující se jako axonální Charcot-Marie-Tooth nemoc s různým věkem při nástupu a závažnosti.[11][12]
Nadměrná exprese tohoto proteinu způsobuje mitochondriální fragmentaci, zatímco srazit tohoto proteinu způsobuje mitochondriální hyperfúze a hyperfilamentózní mitochondrie v důsledku sníženého štěpení mitochondrií.[5] Ztráta tohoto genu má také mnoho dalších účinků: předčasné buněčná stárnutí, postižený buněčné dýchání, destabilizace komplexu MICOS (mitochondriální kontaktní místo a organizační systém cristae), ztráta a zkrácení cristae, změněno ER morfologie, postižený migrace buněk a změny v mitochondriích fosfolipid složení.[6]
Interakce
Tento protein interaguje s IMMT, součást komplexu MICOS, spolu s dalšími složkami tohoto komplexu a složkami komplexu membránových proteinů ER podílejících se na přenosu lipidů do mitochondrií.[11][12][6] Navíc tento protein interaguje s SLC7A8, SLC10A1, SLC10A6, FHL3, FUNDC1, linc01142, LEPROTL1, ODF4, VMA21, MFSD14B, PQLC1, HSD17B11, REEP2, REEP4, a TOMM22.[14] Tento protein pravděpodobně interaguje s OPA1 a MFN2.[6]
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000164209 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000024259 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ A b C Abrams AJ, Hufnagel RB, Rebelo A, Zanna C, Patel N, Gonzalez MA a kol. (Srpen 2015). „Mutace v SLC25A46 kódující protein podobný UGO1 způsobují poruchu spektra optické atrofie“. Genetika přírody. 47 (8): 926–32. doi:10,1038 / ng.3354. PMC 4520737. PMID 26168012.
- ^ A b C d E Janer A, Prudent J, Paupe V, Fahiminiya S, Majewski J, Sgarioto N, Des Rosiers C, Forest A, Lin ZY, Gingras AC, Mitchell G, McBride HM, Shoubridge EA (září 2016). „SLC25A46 je vyžadován pro homeostázu mitochondriálních lipidů a údržbu cristae a je zodpovědný za Leighův syndrom“. EMBO Molekulární medicína. 8 (9): 1019–38. doi:10,15252 / emmm.201506159. PMC 5009808. PMID 27390132.
- ^ A b "Entrez Gene: Rodina nosičů solute 25 členů 46". Citováno 2018-08-17. Tento článek včlení text z tohoto zdroje, který je v veřejná doména.
- ^ Zong NC, Li H, Li H, Lam MP, Jimenez RC, Kim CS a kol. (Říjen 2013). „Integrace biologie a medicíny srdečního proteomu pomocí specializované znalostní databáze“. Výzkum oběhu. 113 (9): 1043–53. doi:10.1161 / CIRCRESAHA.113.301151. PMC 4076475. PMID 23965338.
- ^ "SLC25A46 - rodina nosičů solute 25 členů 46". Znalostní databáze Atlas srdečních organelárních proteinů (COPaKB).
- ^ Online Mendelian Inheritance in Man (OMIM): rodina nosičů rozpuštěných látek 25, člen 46; SLC25A46 - 610826
- ^ A b C „SLC25A46 - rodina nosičů rozpuštěných látek 25 členů 46 - Homo sapiens (člověk) - gen a protein SLC25A46“. www.uniprot.org. Citováno 2018-08-16. Tento článek včlení text dostupný pod CC BY 4.0 licence.
- ^ A b C „UniProt: univerzální znalostní databáze proteinů“. Výzkum nukleových kyselin. 45 (D1): D158 – D169. Ledna 2017. doi:10.1093 / nar / gkw1099. PMC 5210571. PMID 27899622.
- ^ Palmieri F (duben 2013). "Rodina mitochondriálních transportérů SLC25: identifikace, vlastnosti a fyziopatologie". Molekulární aspekty medicíny. 34 (2–3): 465–84. doi:10.1016 / j.mam.2012.05.005. PMID 23266187.
- ^ „Byly nalezeny binární interakce SLC25A46 pro hledaný výraz SLC25A46“. Databáze molekulárních interakcí IntAct. EMBL-EBI. Citováno 2018-08-18.
Další čtení
- Hendrickson SL, Lautenberger JA, Chinn LW, Malasky M, Sezgin E, Kingsley LA, Goedert JJ, Kirk GD, Gomperts ED, Buchbinder SP, Troyer JL, O'Brien SJ (září 2010). „Genetické varianty v jaderně kódovaných mitochondriálních genech ovlivňují progresi AIDS“. PLOS ONE. 5 (9): e12862. doi:10.1371 / journal.pone.0012862. PMC 2943476. PMID 20877624.
- Palmieri F (2013). "Rodina mitochondriálních transportérů SLC25: identifikace, vlastnosti a fyziopatologie". Molekulární aspekty medicíny. 34 (2–3): 465–84. doi:10.1016 / j.mam.2012.05.005. PMID 23266187.
- Parry HM, Donnelly LA, Van Zuydam N, Doney AS, Elder DH, Morris AD, Struthers AD, Palmer CN, Lang CC (červenec 2013). „Genetické varianty předpovídající hypertrofii levé komory u diabetické populace: studie Go-DARTS zahrnující metaanalýzu“. Kardiovaskulární diabetologie. 12: 109. doi:10.1186/1475-2840-12-109. PMC 3729417. PMID 23879873.
- Gao J, Ma Y, Sheng Y, Zuo X, Wang W, Zheng X, Tang H, Tang X, Zhou F, Yang S, Zhang X, Sun L (prosinec 2015). „Asociační analýza míst citlivosti na alergickou senzibilizaci s atopickou dermatitidou v čínské populaci“. Journal of Dermatological Science. 80 (3): 217–20. doi:10.1016 / j.jdermsci.2015.09.009. PMID 26464032.
- Janer A, Prudent J, Paupe V, Fahiminiya S, Majewski J, Sgarioto N, Des Rosiers C, Forest A, Lin ZY, Gingras AC, Mitchell G, McBride HM, Shoubridge EA (září 2016). „SLC25A46 je vyžadován pro homeostázu mitochondriálních lipidů a údržbu cristae a je zodpovědný za Leighův syndrom“. EMBO Molekulární medicína. 8 (9): 1019–38. doi:10,15252 / emmm.201506159. PMC 5009808. PMID 27390132.
- Wan J, Steffen J, Yourshaw M, Mamsa H, Andersen E, Rudnik-Schöneborn S, Pope K, Howell KB, McLean CA, Kornberg AJ, Joseph J, Lockhart PJ, Zerres K, Ryan MM, Nelson SF, Koehler CM, Jen JC (listopad 2016). „Ztráta funkce SLC25A46 způsobuje smrtelnou vrozenou pontocerebelární hypoplázii“. Mozek. 139 (11): 2877–2890. doi:10.1093 / mozek / aww212. PMC 5840878. PMID 27543974.
- Steffen J, Vashisht AA, Wan J, Jen JC, Claypool SM, Wohlschlegel JA, Koehler CM (březen 2017). „Rychlá degradace mutantního SLC25A46 systémem ubikvitin-proteazom vede k hyperfúzi mitochondrií zprostředkované MFN1 / 2“. Molekulární biologie buňky. 28 (5): 600–612. doi:10,1091 / mbc.E16-07-0545. PMC 5328619. PMID 28057766.
Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.