Multi-antimikrobiální vytlačovací protein - Multi-antimicrobial extrusion protein

Pro další použití viz Kámo.
Multi antimikrobiální extrudovaný protein
Identifikátory
SymbolMatE
PfamPF01554
Pfam klanCL0222
InterProIPR002528
TCDB2.A.66
OPM nadčeleď220
OPM protein3mkt

Multi-Antimikrobiální Extruzní protein (MATE) také známý jako vytlačování více drog a toxinů nebo vytlačování více drog a toxických sloučenin je rodina bílkoviny které fungují jako lék / sodík nebo proton antiportery.[1][2][3]

Funkce

MATE proteiny v bakterie, archaea a eukaryoty fungují jako základní transportéry metabolických a xenobiotických organických kationtů.[2][3]

Struktura

Předpokládá se, že tyto proteiny mají 12 alfa-šroubovice transmembránový oblasti, některé živočišné proteiny mohou mít další C-terminál spirála.[4] Struktura rentgenového záření NorM byla stanovena na 3,65 Á, což odhalilo konformaci směřující ven se dvěma portály otevřenými k vnějšímu letáku membrány a jedinečnou topologii předpovězených 12 transmembránových šroubovic odlišných od jakéhokoli jiného známého transportéru rezistence vůči více lékům.[5]

Objev

Více léků výtok přepravce Norma z V. parahaemolyticus který zprostředkovává rezistenci na více antimikrobiálních látek (norfloxacin, kanamycin, ethidiumbromid atd.) a jeho homolog z E-coli byly identifikovány v roce 1998.[6] Zdá se, že NorM funguje jako droga / sodík antiporter což je první příklad Na+- vázané více léků výtok transportér objeven.[7] NorM je prototyp nového přepravce rodina a Brown et al. pojmenoval rodinu vytlačování více léků a toxických sloučenin.[1] NorM je přezdíván „Poslední z multidrogových transportérů“, protože je to poslední multidrogový transportér objevený funkčně i strukturálně.[8]

Geny

Následující lidské geny kódují proteiny MATE:

Viz také

Reference

  1. ^ A b Brown MH, Paulsen IT, Skurray RA (leden 1999). „Multidrug efflux protein NorM je prototypem nové rodiny transportérů“. Mol. Microbiol. 31 (1): 394–5. doi:10.1046 / j.1365-2958.1999.01162.x. PMID  9987140.
  2. ^ A b Kuroda T, Tsuchiya T (prosinec 2008). "Víceúčelové efluxní transportéry v rodině MATE". Biochim. Biophys. Acta. 1794 (5): 763–8. doi:10.1016 / j.bbapap.2008.11.012. PMID  19100867.
  3. ^ A b Omote H; et al. (2006). "MATE proteiny jako základní transportéry metabolických a xenobiotických organických kationtů". Trendy ve farmakologických vědách. 27 (11): 587–93. doi:10.1016 / j.tips.2006.09.001. PMID  16996621.
  4. ^ Hvorup RN, Winnen B, Chang AB, Jiang Y, Zhou XF, Saier MH (březen 2003). "Nadrodina exportéru multidrug / oligosacharidyl-lipid / polysacharid (MOP)". Eur. J. Biochem. 270 (5): 799–813. doi:10.1046 / j.1432-1033.2003.03418.x. PMID  12603313.
  5. ^ He X, Szewczyk P, Karykin A, Hong WX, Zhang Q, Chang G (2010). "Struktura kationtově vázaného multidroga a transportéru vytlačování toxických sloučenin". Příroda. 467 (7318): 991–994. Bibcode:2010Natur.467..991H. doi:10.1038 / nature09408. PMC  3152480. PMID  20861838.
  6. ^ Morita Y, Kodama K, Shiota S, Mine T, Kataoka A, Mizushima T, Tsuchiya T (červenec 1998). „NorM, putativní víceúčelový efluxní protein Vibrio parahaemolyticus a jeho homolog v Escherichia coli“. Antimicrob. Agenti Chemother. 42 (7): 1778–82. doi:10.1128 / AAC.42.7.1778. PMC  105682. PMID  9661020.
  7. ^ Morita Y, Kataoka A, Shiota S, Mizushima T, Tsuchiya T (prosinec 2000). „NorM of Vibrio parahaemolyticus is a Na + -Driven Multidrug Efflux Pump“. J. Bacteriol. 182 (23): 6694–7. doi:10.1128 / JB.182.23.6694-6697.2000. PMC  111412. PMID  11073914.
  8. ^ van Veen HW (2010). "Strukturní biologie: poslední z vícelékových transportérů". Příroda. 467 (7318): 926–7. Bibcode:2010Natur.467..926V. doi:10.1038 / 467926a. PMID  20962836. S2CID  4338964.
Tento článek včlení text od public domain Pfam a InterPro: IPR002528