Holo- (acyl-nosič-protein) syntáza - Holo-(acyl-carrier-protein) synthase
| fosfopantetheinyltransferáza | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 trimér holo- [acyl-nosič-protein] syntáza, Helicobacter pylori | |||||||||
| Identifikátory | |||||||||
| EC číslo | 2.7.8.7 | ||||||||
| Číslo CAS | 37278-30-1 | ||||||||
| Databáze | |||||||||
| IntEnz | IntEnz pohled | ||||||||
| BRENDA | Vstup BRENDA | ||||||||
| EXPASY | Pohled NiceZyme | ||||||||
| KEGG | Vstup KEGG | ||||||||
| MetaCyc | metabolická cesta | ||||||||
| PRIAM | profil | ||||||||
| PDB struktur | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||||||||
| Genová ontologie | AmiGO / QuickGO | ||||||||
| |||||||||
| ACPS | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 krystalová struktura komplexu 4'-fosfopantetheinyltransferázy sfp-koenzymu | |||||||||
| Identifikátory | |||||||||
| Symbol | ACPS | ||||||||
| Pfam | PF01648 | ||||||||
| InterPro | IPR008278 | ||||||||
| SCOP2 | 1qr0 / Rozsah / SUPFAM | ||||||||
| |||||||||
v enzymologie a molekulární biologie, a holo- [acyl-nosič-protein] syntáza (ACPS, ES 2.7.8.7 ) je enzym že katalyzuje chemická reakce:
- CoA- [4'-fosfopantethein] + apoacylový protein adenosin 3 ', 5'-bisfosfát + holo-acylový protein
Tento enzym patří do rodiny transferázy, konkrétně ty, které přenášejí nestandardní substituované fosfátové skupiny. Je také známý jako 4'-fosfopantetheinyltransferáza po skupině se převádí.
Funkce
Všechny dosud známé enzymy ACPS jsou navzájem evolučně příbuzné v jedné nadrodině bílkoviny. Přenáší 4'-fosfopantethein (4'-PP) skupina z koenzym A (CoA) na invariant serin v acylový protein (ACP), malý protein zodpovědný za aktivaci acylové skupiny v mastné kyseliny biosyntéza. Tento posttranslační modifikace vykresluje holo-ACP acyl skupinová aktivace prostřednictvím thioesterifikace cysteamin thiol 4'-PP.[1] Tato nadčeleď se skládá ze dvou podtypů: trimerního typu ACPS, jako je E-coli ACPS a monomerní typ Sfp (syntetizující PCP), jako je B. subtilis SFP. Struktury z obou rodin jsou nyní známy. The Aktivní stránky ubytuje a hořčík ion. Nejvýše konzervované regiony bílkoviny vazba the hořčík ion.[2][3]
Nomenklatura
The systematické jméno této třídy enzymů je CoA- [4'-fosfopantethein]: apo- [acylový nosičový protein] 4'-pantetheinfosfotransferáza. Další běžně používaná jména, bez ohledu na rozdíl v pravopisu syntetázy / syntázy, zahrnují acylový nosičový protein holoprotein syntetázu, holo-ACP syntetázu, koenzym A: apoenzym syntetické mastné kyseliny 4'-fosfopantethein, acylový proteinový protein syntetáza (ACPS), PPTáza, acylový nosič protein syntáza, P-kalhotová transferáza a CoA: apo- [acyl-nosný protein] pantethein-fosfotransferáza.
Strukturální studie
Ke konci roku 2007, 8 struktur byly pro tuto třídu enzymů vyřešeny pomocí PDB přístupové kódy 1F7L, 1F7T, 1F80, 1 FTE, 1FTF, 1 FTH, 2JBZ, a 2JCA.
Reference
- ^ Lambalot RH, Walsh CT (říjen 1995). „Klonování, nadprodukce a charakterizace holoacylového nosičového proteinu syntázy Escherichia coli“. The Journal of Biological Chemistry. 270 (42): 24658–61. doi:10.1074 / jbc.270.42.24658. PMID 7559576.
- ^ Reuter K, Mofid MR, Marahiel MA, Ficner R (prosinec 1999). „Krystalová struktura enzymu aktivujícího surfaktin syntetázu sfp: prototyp superrodiny 4'-fosfopantetheinyl transferázy“. Časopis EMBO. 18 (23): 6823–31. doi:10.1093 / emboj / 18.23.6823. PMC 1171745. PMID 10581256.
- ^ Marcella AM, Culbertson SJ, Shogren-Knaak MA, Barb AW (24. listopadu 2017). „Struktura, vysoká afinita a negativní kooperativnost Escherichia coli Holo- (Acyl Carrier Protein): Holo- (Acyl Carrier Protein) Synthase Complex“. Journal of Molecular Biology. 429 (23): 3763–3775. doi:10.1016 / j.jmb.2017.10.015. PMID 29054754.
Další čtení
- Elovson J, Vagelos PR (červenec 1968). "Acylový nosičový protein. X. Acylový nosičový protein syntetáza". The Journal of Biological Chemistry. 243 (13): 3603–11. PMID 4872726.
- Prescott DJ, Vagelos PR (1972). "Acylový nosičový protein". Pokroky v enzymologii a souvisejících oblastech molekulární biologie. Pokroky v enzymologii a souvisejících oblastech molekulární biologie. 36. 269–311. doi:10.1002 / 9780470122815.ch8. ISBN 9780470122815. PMID 4561013.
- Lambalot RH, Gehring AM, Flugel RS, Zuber P, LaCelle M, Marahiel MA, Reid R, Khosla C, Walsh CT (listopad 1996). „Nová nadrodina enzymů - fosfopantetheinyltransferázy“. Chemie a biologie. 3 (11): 923–36. doi:10.1016 / S1074-5521 (96) 90181-7. PMID 8939709.
- Walsh CT, Gehring AM, Weinreb PH, Quadri LE, Flugel RS (říjen 1997). "Posttranslační modifikace polyketidových a neribozomálních peptidových syntáz". Aktuální názor na chemickou biologii. 1 (3): 309–15. doi:10.1016 / S1367-5931 (97) 80067-1. PMID 9667867.
- Mootz HD, Finking R, Marahiel MA (říjen 2001). „Přenos 4'-fosfopantetheinu v primárním a sekundárním metabolismu Bacillus subtilis“. The Journal of Biological Chemistry. 276 (40): 37289–98. doi:10,1074 / jbc.M103556200. PMID 11489886.
- Joshi AK, Zhang L, Rangan VS, Smith S (srpen 2003). „Klonování, exprese a charakterizace lidské 4'-fosfopantetheinyltransferázy se širokou substrátovou specificitou“. The Journal of Biological Chemistry. 278 (35): 33142–9. doi:10,1074 / jbc.M305459200. PMID 12815048.
| Tento EC 2.7 enzym související článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |