Cercozoa - Cercozoa

Cercozoa
Cercomonas sp.jpg
Cercomonas
Vědecká klasifikace E
Clade:SAR
(bez hodnocení):Rhizaria
Kmen:Cercozoa
Cavalier-Smith 1998[1]
Skupiny[4]

Filosa

Endomyxa

The Cercozoa jsou skupina jednobuněčných eukaryoty. Chybí jim společné morfologické vlastnosti na mikroskopické úrovni,[5] je definován molekulárními fylogeniemi z rRNA a aktin nebo polyubiquitin.[6] Jsou přirozenými predátory mnoha druhů mikrobakterie a Archea.

Vlastnosti

Tato skupina zahrnuje většinu améboidy a bičíky které se krmí pomocí filozovaných pseudopodů. Mohou být omezeny na část povrchu buňky, ale nikdy neexistuje pravda cytostom nebo ústa, jak se vyskytují u mnoha jiných prvoků. Vykazují různé formy[4] a ukázalo se, že je obtížné je definovat z hlediska strukturálních charakteristik, ačkoli jejich jednotu silně podporují genetické studie. Cercozoa jsou úzce spjaty s Foraminifera a Radiolaria, améboidy, které mají obvykle složité granáty a spolu s nimi tvoří superskupinu zvanou Rhizaria.

Typy

Někdy jsou seskupeny podle toho, zda jsou „filose“ nebo „reticulose“.[7]

Filose (poddruh Filosa)

Nejznámější Cercozoa jsou euglyfidy, filose améby se skořápkami křemičitých šupin nebo desek, které se běžně vyskytují v půdách, vodách bohatých na živiny a na vodních rostlinách. Některé další filose améby produkují organické skořápky, včetně tectofilosids a Gromia. Byly dříve klasifikovány s euglyfidy jako Testaceafilosia. Tato skupina není monofyletická, ale téměř všichni studovaní členové spadají do Cercozoa nebo v jeho blízkosti, což souvisí s podobně vyloupanými bičíky. Jiné pozoruhodné filose cercozoans zahrnují cerkomonády, což jsou běžné půdní bičíky.

Retikulóza (poddruh Endomyxa)

Další důležitou skupinou zde umístěnou jsou chlorarachniofyty podivné améby, které tvoří síťovou síť. Jsou odděleny přítomností chloroplasty, který se zjevně vyvinul z požití zelená řasa. Jsou vázány čtyřmi membránami a stále mají zakrnělé jádro, které se říká nukleomorf. Proto je velmi zajímali vědci, kteří studovali endosymbiotický původ organel.

Chlorarachniophytes jsou někdy považovány za Filosa, spíše než Endomyxa, zatímco skupiny jako Gromia jsou považovány za Endomyxa.[8] Filosa je zjevně a monofyletický skupina, ale Endomyxa ano paraphyletic.[9]

Neseskupené

Kromě toho jsou tradičně zvažovány tři skupiny heliozoans patří sem: Heliomonadida, Desmothoracida, a Gymnosphaerida, které byly nedávno seskupeny do nové třídy Granofilosea.[7]

A konečně, cercozoans patří Phaeodarea, mořští prvoky, o kterých se dříve uvažovalo radiolariáni.

Klasifikace

Další informace: wikispecies: Cercozoa

Přesné složení a klasifikace Cercozoa se stále ještě zpracovává. Obecné schéma je:

Třída ChlorarachneaChlorarachniophyta
Třída ProteomyxideaGymnophryida, Heliomonadida, Desmothoracida, Gymnosphaerida, atd.
Třída SarkomonádaCercomonadida
Třída Imbricatea / SilicofiloseaEuglyphida a Thaumatomonadida
Třída ThecofiloseaTectofilosida a Kryomonadida
Třída Phaeodarea
Třída EbrideaEbridea

Kromě toho dvě skupiny parazitů, Phytomyxea a Ascetosporea a améba bez skořápky Gromia může být bazální Cercozoa, i když některé stromy je umisťují blíže k Foraminifera.

The spongomonády zde byly zahrnuty, ale v poslední době byly zváženy Amébozoa.[Citace je zapotřebí ]

Některé další malé skupiny prvoků jsou považovány za Cercozoa, ale mají nejisté umístění a je pravděpodobné, že mnoho obskurních rodů se při dalším studiu ukáže jako cercozoans.

Viz také: Auranticordis

Fylogeneze

Fylogeneze založená na Bassovi a kol. 2009,[7] Howe etal. 2011[10] a Silar 2016.[11]

Rhizaria
 

Phytomyxea

 
 
 

Vampyrellidea

 
 
Filosa
 

Skiomonadea

 
 
 

Chlorarachniophyceae

 
 
 

Granofilosea

 
Monadofilosa
 

Metromonadea

 
 
 

Cercomonadida

 
 
 

Glissomonadida -Sainourida clade

 
Ventrifilosa
 

Silicofilosea

 
 

Thecofilosea

 
 
 
 
 
 
 
 
 
Marimyxie
 

Reticulosida

 
 
 

Gromiidea

 
 

Ascetosporea

 
 
 
Retaria
 

Sticholonchea

 
 
 

Polycystinea

 
 
 

Acantharea

 
 

Foraminifera

 
 
 
 
 
 
 
 
Cercozoa

V roce 2019 byla Cercozoa uznána jako sestra Retaria v Rhizaria.[12]

Taxonomie

Kmen Cercozoa[10][11][13][14][15]

  • Rodina ?Gymnophrydiidae
  • Rodina ?Gymnophryidae Mikrjukov a Mylnikov 1996
  • Rodina ?Rhizoplasmidae Cavalier-Smith & Bass 2009
  • Objednat ?Gymnosphaerida Poche 1913 emend. Mikrjukov 2000 [Axoplasthelida]
    • Rodina Gymnosphaeridae Poche 1913 [Hedraiophryidae; Gymnidae; Wagnerellidae Poche 1913]
  • Clade Marimyxie Cavalier-Smith 2017
    • Objednat Reticulosida Vydává Cavalier-Smith 2003. Bass a kol. 2009
    • Třída Gromiidea Cavalier-Smith 2003
      • Objednat Gromiida Claparède & Lachmann 1856 s.s.
    • Třída Ascetosporea Vychází Desportes & Ginsburger-Vogel, 1977. Cavalier-Smith 2009 [Aplosporidie Caullery & Mesnil, 1899; Stellatosporea; Ascetospora Sprague 1979]
      • Objednat Claustrosporida Cavalier-Smith 2003
      • Objednat Paradiniida Cavalier-Smith 2009
      • Objednat Mikrocytida Hartikainen a kol. 2014
      • Objednat Paramyxida Chatton 1911 [Paramyxea Chatton 1911; Paramyxidea Chatton 1911; Paramyxa]
      • Objednat Haplosporida Caullery & Mesnil 1899 [Balanosporida Sprague, 1979; Haplosporidie Hall, 1953; Haplosporea Caullery 1953; Haplospora Margulis & Schwartz, 1998; Haplosporidiidea Poche, 1913; Haplosporidie Caullery and Mesnil, 1905]
  • Třída Phytomyxea Engler & Prantl 1897 em. Cavalier-Smith 1993 [Phytomyxinae Engler & Prantl, 1897; Phytomyxinea Poche, 1913]
  • Třída Vampyrellidea Cavalier-Smith 2017 [Cristivesiculatia Strana 1987 stat. listopad. Cavalier-Smith 1993]
    • Objednat Vampyrellida Západ 1901 vychází. Hess a kol. 2012 [Aconchulinida de Saedeleer 1934 emend. Bass a kol. 2009; Cristivesiculatida Strana 1987]
  • Podkmen Filosa Leidy 1879 emend. Cavalier-Smith 2003
    • Třída Skiomonadea Cavalier-Smith 2012
      • Objednat Tremulida Cavalier-Smith & Howe 2011
    • Třída Chlorarachnea Hibberd a Norris 1984 [Chlorarachniophyceae Hibberd a Norris 1984; Chlorarachniophyta Hibberd a Norris 1984; Chlorarachnia Cavalier-Smith 1993]
    • Třída Granofilosea Cavalier-Smith & Bass 2009
    • Infraphylum Monadofilosa Cavalier-Smith 1997 [Eoglissa Cavalier-Smiths 2012]
      • Rodina ?Katabiidae Cavalier-Smith 2012
      • Rodina ?Krakenidae Dumack, Mylnikov a Bonkowski 2017
      • Objednat ?Pseudodimorphida
      • Třída Helkesea Cavalier-Smith 2017
      • Objednat Cercomonadida Poche 1913 emend. Karpov a kol. 2006
      • Třída Metromonadea Cavalier-Smith 2007 s.s.
      • Clade Glissomonadida-Pansomonadida
      • Třída Silicofilosea Adl a kol. 2005 vychází. Adl a kol. 2012 [Imbricatea Cavalier-Smith 2011]
      • Třída Thecofilosea Vydává Cavalier-Smith 2003. Cavalier-Smith 2011 [Tripylea Hertwig 1879]
        • Objednat Hemimastigida Foissner, Blatterer & Foissner 1988 [Hemimastigophora Foissner, Blatterer & Foissner 1988 sensu Cavalier-Smith 1993; Hemimastigea Foissner, Blatterer & Foissner 1988; Hemimastigidea]}
        • Objednat Matazida Cavalier-Smith 2012
        • Objednat Ebriida Poche [Ebriidea Lemmermann 1901 emend. Deflandre 1936; Ebiophyta; Ebriacea Lemmermann 1901; Ebriophyceae Loeblich 1970; Ebriales Honigsberg 1964; Stereotestales]
        • Objednat Kryomonadida Cavalier-Smith 1993 [Kryothecomonadea; Cryothecomonadida]
        • Objednat Tectofilosida
        • Objednat Eodarida Cavalier-Smith 2012 [Phaeodinia]
        • Objednat Opaloconchida Cavalier-Smith 2012

V poslední době si sirotčí protistka Quadricilia rotundata konečně najde fylogenetický domov v Cercozoa.[16]

Reference

  1. ^ Cavalier-Smith, T. (1998). „Revidovaný systém života se šesti královstvími“. Biologické recenze Cambridge Philosophical Society. 73 (3): 203–266. doi:10.1111 / j.1469-185X.1998.tb00030.x. PMID  9809012.
  2. ^ Nikolaev SI, Berney C, Fahrni JF, et al. (Květen 2004). „Soumrak Heliozoa a vzestup Rhizaria, vznikající superskupiny améboidních eukaryot“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 101 (21): 8066–71. doi:10.1073 / pnas.0308602101. PMC  419558. PMID  15148395.
  3. ^ Hoppenrath, M .; Leander B.S. (2006). "Ebriidská fylogeneze a expanze Cercozoa". Protist. 157 (3): 279–90. doi:10.1016 / j.protis.2006.03.002. PMID  16730229.
  4. ^ A b Cavalier-Smith T, Chao EE (říjen 2003). "Fylogeneze a klasifikace kmene Cercozoa (Protozoa)" (PDF). Protist. 154 (3–4): 341–58. doi:10.1078/143446103322454112. PMID  14658494.
  5. ^ Chantangsi, C. (2009). Srovnávací morfologie a molekulární vývoj mořských intersticiálních cercozoanů. Disertační práce. University of British Columbia.
  6. ^ „SYSTEMATIC BIOLOGY: CERCOZOA“. Citováno 2009-03-28.
  7. ^ A b C Bass D, Chao EE, Nikolaev S a kol. (Únor 2009). „Fylogeneze nové nahé filosy a retikulózy Cercozoa: Granofilosea cl. N. A Proteomyxidea revidovány“. Protist. 160 (1): 75–109. doi:10.1016 / j.protis.2008.07.002. PMID  18952499.
  8. ^ "Cercozoa". Citováno 2009-05-21.
  9. ^ Nakamura, Yasuhide; Imai, Ichiro; Yamaguchi, Atsushi; Tuji, Akihiro; Ne, Fabrice; Suzuki, Noritoshi (2015). „Molekulární fylogeneze široce distribuovaných mořských protistů, Phaeodaria (Rhizaria, Cercozoa)“. Protist. 166 (3): 363–373. doi:10.1016 / j.protis.2015.05.004.
  10. ^ A b Howe; et al. (2011), „Noví kultivovaní protisté identifikují hluboce se rozvětvující environmentální DNA clades z Cercozoa: New Genera Tremula, Micrometopion, Minimassisteria, Nudifila, Peregrinia“, Protist, 162 (2): 332–372, doi:10.1016 / j.protis.2010.10.002, PMID  21295519
  11. ^ A b Silar, Philippe (2016), „Protistes Eucaryotes: Origine, Evolution et Biologie des Microbes Eucaryotes“, Archivy HAL - převody: 1–462
  12. ^ Irwin, Nicholas A.T .; Tichonenkov, Denis V .; Hehenberger, Elisabeth; Mylnikov, Alexander P .; Burki, Fabien; Keeling, Patrick J. (01.01.2019). „Fylogenomika podporuje monofyii Cercozoa“. Molekulární fylogenetika a evoluce. 130: 416–423. doi:10.1016 / j.ympev.2018.09.004. ISSN  1055-7903. PMID  30318266.
  13. ^ Adl; et al. (28. září 2012), „Revidovaná klasifikace eukaryot“ (PDF), Journal of Eukaryotic Microbiology, 59 (5): 429–493, doi:10.1111 / j.1550-7408.2012.00644.x, PMC  3483872, PMID  23020233
  14. ^ Ruggiero; et al. (2015), „Vyšší klasifikace všech živých organismů“, PLOS ONE, 10 (4): e0119248, Bibcode:2015PLoSO..1019248R, doi:10.1371 / journal.pone.0119248, PMC  4418965, PMID  25923521
  15. ^ Cavalier-Smith, Thomas (5. září 2017). „Kingdom Chromista a jeho osm kmenů: nová syntéza s důrazem na cílení periplastidových proteinů, vývoj cytoskeletů a periplastidů a starověké divergence“. Protoplasma. 255 (1): 297–357. doi:10.1007 / s00709-017-1147-3. PMC  5756292. PMID  28875267.
  16. ^ Sirotčí protista Quadricilia rotundata konečně nachází svůj fylogenetický domov v Cercozoa Článek v časopise Eukaryotic Microbiology · Leden 2018 DOI: 10.1111 / jeu.12502 Akinori Yabuki z Japonské agentury pro technologii vědy o mořské Zemi

externí odkazy