Superskupina SAR - SAR supergroup

SAR
Časová řada: 736–0 Ma[1]
Harosa.png
Vědecká klasifikace E
(bez hodnocení):Diaphoretickes
Clade:CAR
Clade:SAR
Burki a kol., 2007
Klady
Synonyma
  • Harosa Cavalier-Smith, 2010

SAR nebo Harosa (neformálně Superskupina SAR) je clade to zahrnuje stramenopiles (heterokonty ), alveoláty, a Rhizaria.[2][3][4][5] Jméno je akronym odvozeno z prvních písmen každé z těchto subtypů; alternativně se píše „RAS“.[6][7]

Termín „Harosa“ (na úrovni subkingdom) byl také použit pro toto seskupení uživatelem Cavalier-Smith (2010).[8] Adl et al. (2012) formalizovali superskupinu SAR jako na uzlu taxon Sar. Definovali to jako:[6]

Sar: nejméně obsáhlý clade obsahující Bigelowiella natans Moestrup & Sengco 2001 (Rhizaria ), Tetrahymena thermophila Nanney & McCoy 1976 (Alveolata ), a Thalassiosira pseudonana Cleve 1873 (Stramenopiles ). Toto je definice založená na uzlech, ve které existují všechny specifikátory.

Všimněte si, že jako formální taxon má "Sar" pouze první písmeno velké, zatímco dřívější zkratka SAR si ponechává všechna velká písmena. Oba názvy odkazují na stejnou skupinu organismů, pokud další taxonomické revize nevyžadují jinak. Členové superskupiny SAR byli kdysi zahrnuti do samostatných superskupin Chromalveolata (Chromista a Alveolata ) a Rhizaria, dokud fylogenetické studie nepotvrdily, že stramenopily a alveoláty se lišily od Rhizaria.[9] To zjevně vyloučeno haptophyty a kryptomonády, vedoucí Okamoto et al. (2009) navrhnout clade Hacrobia ubytovat je.[10]

Fylogeneze

Na základě kompilace následujících prací.[11][12][13][14]

CAR
 

Telonemia

 
SAR/
Rhizaria
 

Phytomyxea Engler & Prantl 1897 em. Cavalier-Smith 1993

 
 
 

Vampyrellida Západ 1901 vychází. Hess a kol. 2012 {Vampyrellidea Cavalier-Smith 2017}

 
 
 

Filosa Leidy 1879 s.s.

 
 
 

Marimyxie Cavalier-Smith 2017

 
 

Retaria Cavalier-Smith 2002 s.s.

 
 
 
 
 
Halvaria
Alveolata
 

Ciliophora Doflein 1901 stat. n. Copeland 1956

 
 

Myzozoa Cavalier-Smith a Chao 2004

 
 
Heterokonta
 

Platysulcidae Shiratori, Nkayama a Ishida 2015

 
 
 

Sagenista Cavalier-Smith 1995 stat. n. 2006

 
 
 

Bikosea Cavalier-Smith 2013

 
 
 

Placidozoa Cavalier-Smith 2013

 
Gyrista
 

Bigyromonadea Cavalier-Smith 1998

 
 
 

Oomycota Arx 1967

 
 
 

Hyphochytriomycota Whittaker 1969

 
 
 

Pirsoniales Cavalier-Smith 1998

 
 

Ochrophyta Cavalier-Smith 1986 (Hnědé, zlaté a žluté řasy)

 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
Harosa
 

Viz také

Reference

  1. ^ Parfrey, Laura Wegener; Lahr, Daniel J. G .; Knoll, Andrew H .; Katz, Laura A. (16. srpna 2011). „Odhad načasování časné eukaryotické diverzifikace pomocí multigenových molekulárních hodin“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 108 (33): 13624–13629. Bibcode:2011PNAS..10813624P. doi:10.1073 / pnas.1110633108. PMC  3158185. PMID  21810989.
  2. ^ Archibald JM (leden 2009). "Puzzle vývoje plastidů". Curr. Biol. 19 (2): R81–8. doi:10.1016 / j.cub.2008.11.067. PMID  19174147. S2CID  51989.
  3. ^ Burki F, Shalchian-Tabrizi K, Minge M a kol. (2007). Butler G (ed.). „Fylogenomika mění strukturu eukaryotických superskupin“. PLOS ONE. 2 (8): e790. Bibcode:2007PLoSO ... 2..790B. doi:10.1371 / journal.pone.0000790. PMC  1949142. PMID  17726520.
  4. ^ Hampl V, Hug L, Leigh JW a kol. (Březen 2009). „Fylogenomické analýzy podporují monofylii Excavata a řeší vztahy mezi eukaryotickými“ superskupinami"". Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 106 (10): 3859–64. Bibcode:2009PNAS..106.3859H. doi:10.1073 / pnas.0807880106. PMC  2656170. PMID  19237557.
  5. ^ Frommolt R, Werner S, Paulsen H a kol. (Prosinec 2008). „Starověký nábor chromistů genů zelených řas kódujících enzymy pro biosyntézu karotenoidů“. Mol. Biol. Evol. 25 (12): 2653–67. doi:10.1093 / molbev / msn206. PMID  18799712.
  6. ^ A b Sina M. Adl; Alastair G.B. Simpson; Christopher E. Lane; Julius Lukeš; David Bass; Samuel S. Bowser; Matthew W. Brown; Fabien Burki; Micah Dunthorn; Vladimír Hampl; Aaron Heiss; Mona Hoppenrath; Enrique Lara; Line Le Gall; Denis H. Lynn; Hilary McManus; Edward A.D. Mitchell; Sharon E. Mozley-Stanridge; Laura W. Parfrey; Jan Pawlowski; Sonja Rueckert; Laura Shadwicková; Conrad L. Schoch; Alexey Smirnov a Frederick W. Spiegel (2012). „Revidovaná klasifikace eukaryot“. Journal of Eukaryotic Microbiology. 59 (5): 429–493. doi:10.1111 / j.1550-7408.2012.00644.x. PMC  3483872. PMID  23020233.
  7. ^ Sandra L. Baldauf (2008). „Přehled fylogeneze a rozmanitosti eukaryot“ (PDF). Journal of Systematics and Evolution. 46 (3): 263–273. doi:10.3724 / SP.J.1002.2008.08060 (neaktivní 9. 9. 2020). S2CID  512766.CS1 maint: DOI neaktivní od září 2020 (odkaz)
  8. ^ T. Cavalier-Smith (červen 2010). „Kingdom Protozoa and Chromista and the eozoan root of the eukaryotic tree“. Biol. Lett. 6 (3): 342–5. doi:10.1098 / rsbl.2009.0948. PMC  2880060. PMID  20031978.
  9. ^ Dawkins, Richard; Wong, Yan (2016). Příběh předků. 573–577. ISBN  978-0544859937.
  10. ^ Fabien Burki (2014). „Eukaryotický strom života z globální fylogenomické perspektivy“. Perspektivy Cold Spring Harbor v biologii. 6 (5): 1–17. doi:10.1101 / cshperspect.a016147. PMC  3996474. PMID  24789819.
  11. ^ Ruggiero; et al. (2015), „Vyšší klasifikace všech živých organismů“, PLOS ONE, 10 (4): e0119248, Bibcode:2015PLoSO..1019248R, doi:10.1371 / journal.pone.0119248, PMC  4418965, PMID  25923521
  12. ^ Silar, Philippe (2016), „Protistes Eucaryotes: Origine, Evolution et Biologie des Microbes Eucaryotes“, Archivy HAL - převody: 1–462
  13. ^ Cavalier-Smith, Thomas (5. září 2017). „Kingdom Chromista a jeho osm kmenů: nová syntéza zdůrazňující cílení periplastidových proteinů, vývoj cytoskeletů a periplastidů a starověké divergence“. Protoplasma. 255 (1): 297–357. doi:10.1007 / s00709-017-1147-3. PMC  5756292. PMID  28875267.
  14. ^ Strassert, Jürgen F. H .; Jamy, Mahwash; Mylnikov, Alexander P .; Tichonenkov, Denis V .; Burki, Fabien (2018-08-30). „Nová fylogenomická analýza záhadného kmene Telonemia dále řeší eukaryotický strom života“. Molekulární biologie a evoluce. 36 (4): 757–765. doi:10.1093 / molbev / msz012. PMC  6844682. PMID  30668767.