CYP3A5 - CYP3A5 - Wikipedia
Cytochrom P450 3A5 je protein že u lidí je kódován CYP3A5 gen.
Distribuce tkání
CYP3A5 zakóduje člena souboru cytochrom P450 nadrodina enzymů. Stejně jako většina cytochromu P450 je CYP3A5 exprimován v prostatě a játrech.[5] Rovněž je exprimován v epitelu tenkého střeva a tlustého střeva pro absorpci a v malém množství v žlučovodu, nosní sliznici, ledvinách, kůře nadledvin, epitelu žaludeční sliznice s intestinální metaplazií, žlučníkem, interkalátovými kanály pankreatu, buňky příštítných tělísek a žlutého tělíska vaječníku (na úrovni bílkovin).[5]
Klinický význam
Proteiny cytochromu P450 jsou monooxygenázy, které katalyzují mnoho reakcí zapojených do metabolismu léčiv a syntézy cholesterolu, steroidů a dalších lipidů. Tento protein se lokalizuje v endoplazmatickém retikulu a jeho exprese je vyvolána glukokortikoidy a některými farmakologickými látkami. Enzym metabolizuje léky, jako je nifedipin a cyklosporin, stejně jako steroidní hormony testosteron, progesteron a androstendion. Tento gen je součástí shluku genů cytochromu P450 na chromozomu 7q21.1. Tento klastr obsahuje pseudogen, CYP3A5P1, což je velmi podobné CYP3A5. Tato podobnost způsobila určité potíže při určování, zda klonované sekvence představují gen nebo pseudogen.[6]
CYP3A4 / 3A5 jsou skupina hem-thiolátmonooxygenáz. V jaterních mikrosomech je tento enzym zapojen do transportní dráhy elektronů závislé na NADPH. Oxiduje řadu strukturně nesouvisejících sloučenin, včetně steroidů, mastných kyselin a xenobiotik.[5] Imunoblotová analýza jaterních mikrozomů ukázala, že CYP3A5 je exprimován jako 52,5-kD protein, zatímco CYP3A4 migruje jako 52,0-kD protein.[7] Lidská podrodina CYP3A, CYP3A4, CYP3A5, CYP3A7 a CYP3A43, je jedním z nejvšestrannějších biotransformačních systémů, které usnadňují vylučování léků (37% z 200 nejčastěji předepisovaných léků v USA[8]).
CYP3A4 a CYP3A5 dohromady tvoří přibližně 30% jaterního cytochromu P450 a přibližně polovina léků, které jsou oxidačně metabolizovány P450, jsou substráty CYP3A.[9] Jak CYP3A4, tak CYP3A5 jsou exprimovány v játrech a střevech, přičemž CYP3A5 je převládající formou exprimovanou v extrahepatálních tkáních.[9]
Distribuce alely
Gen CYP3A5 má několik funkčních variant, které se liší v závislosti na etnickém původu. Alela CYP3A5 * 1 je spojena s normální metabolizací léčby. To je nejčastější u jedinců pocházejících z Subkvatoriální Afrika, ačkoli mutace se vyskytuje také u nízkých frekvencí v jiných populacích. Alela CYP3A5 * 3 je spojena se špatnou metabolizací léků. Je to blízko fixace v Evropa, a také se nachází na vysokých frekvencích v Západní Asie a Střední Asie, stejně jako mezi Afroasijský (Hamitic-Semitic) mluvící populace v Severní Afrika a Africký roh. Mutace se navíc vyskytuje při středních až vysokých frekvencích v Jížní Asie, Jihovýchodní Asie a východní Asie a při nízkých frekvencích v subkvatoriální Africe.[10][11]
Globální distribuce alel CYP3A5:[11]
| Populace | CYP3A5 * 1 | CYP3A5 * 3 | CYP3A5 * 6 | CYP3A5 * 7 |
|---|---|---|---|---|
| Adygei | 12% | 88% | ||
| Zdaleka | 35% | 65% | 18% | 0% |
| afro Američané | 63% | 37% | 12% | 21% |
| Alžířané (Severní) | 19% | 81% | 5% | 1% |
| Amhara | 33% | 67% | 15% | 0% |
| Anatolian Turci | 9% | 91% | 0% | 0% |
| Arméni (Jižní) | 5% | 95% | 0% | 0% |
| Asante | 89% | 11% | 22% | 7% |
| Ashkenazi Židé | 3% | 97% | 0% | 0% |
| Balochi | 20% | 80% | ||
| Bantu (Keňa) | 83% | 17% | ||
| Bantu (Jižní Afrika) | 74% | 26% | 18% | 10% |
| Bantu (Uganda) | 96% | 4% | 22% | 21% |
| Baskové (Francouzština) | 4% | 96% | ||
| beduín (Izrael) | 17% | 83% | ||
| Berbeři (Maroko) | 20% | 80% | 4% | 1% |
| Biaka Pygmejové | 89% | 11% | ||
| Brahui | 12% | 88% | ||
| Britové (Anglie a Skotsko) | 35% | 65% | 0% | |
| Bulsa | 81% | 19% | 16% | 13% |
| Burusho | 22% | 78% | ||
| Kamerunský (Čadské jezero) | 76% | 24% | 32% | 7% |
| Kanadští běloši | 7% | 93% | 0% | 0% |
| Chagga | 74% | 26% | 14% | 9% |
| Chewa | 85% | 15% | 16% | 17% |
| čínština | 25% | 75% | 0% | |
| čínština (Denver, Colorado) | 25% | 75% | ||
| Kolumbijci | 15% | 85% | ||
| Kolumbijci (Medellian) | 48% | 52% | 2% | |
| Konžský (Brazzaville) | 80% | 20% | 12% | 9% |
| Dai | 45% | 55% | ||
| Druze | 8% | 92% | ||
| Daur | 15% | 85% | ||
| východní Asiat | 31% | 69% | 0% | 0% |
| evropský | 2% | 98% | 0% | 0% |
| Finové | 45% | 55% | 0% | |
| francouzština | 8%-9% | 91%-92% | 0% | 0% |
| Gabonština | 79% | 21% | 19% | 19% |
| Gambians | 79% | 21% | 20% | 12% |
| Němci | 7% | 93% | ||
| Gudžarátština (Houston, Texas) | 25% | 75% | ||
| Han | 25% | 75% | ||
| Han (Peking) | 28% | 72% | 0% | |
| Han (Jižní) | 47% | 53% | 0% | |
| Hazara | 25% | 75% | ||
| Hezhen | 15% | 85% | ||
| hispánský | 25% | 75% | 0% | 0% |
| Iberians | 39% | 61% | 0% | |
| Igbo | 87% | 13% | 18% | 9% |
| Indiáni | 41% | 59% | 0% | |
| Italové (Bergamo) | 18% | 82% | ||
| Italové (Sardinie) | 5% | 95% | ||
| Italové (Toskánsko) | 5%-6% | 94%-95% | 0.5% | |
| japonský | 23% | 77% | 0% | |
| japonský (Tokio) | 26% | 74% | 0.004% | |
| Kalash | 24% | 76% | ||
| Karitiana | 23% | 77% | ||
| Kasena | 78% | 22% | 17% | 13% |
| Khmer | 27% | 73% | ||
| Korejci | 19% | 81% | 0% | |
| Kotoko | 73% | 27% | 23% | 5% |
| Lahu | 25% | 75% | ||
| Lemba | 87% | 13% | 25% | 15% |
| Lomwe | 83% | 17% | 22% | 11% |
| Luhya (Webuye, Keňa) | 86% | 14% | 26% | |
| Maale | 51% | 49% | 15% | 1% |
| Masajové (Kinyawa, Keňa) | 51% | 49% | 14% | |
| Makrani | 14% | 86% | ||
| Malajština | 39% | 61% | 0% | |
| Malawians | 79% | 21% | 14% | 14% |
| Mandenka | 69% | 31% | ||
| Manjak | 79% | 21% | 23% | 7% |
| Maya | 29% | 71% | ||
| Mayo Darle | 73% | 27% | 25% | 6% |
| Mbuti Pygmejové | 93% | 7% | ||
| Melanésané | 18% | 82% | ||
| Mestizo (Salvador a Nikaragua) | 24% | 76% | ||
| Mestizo (Ekvádor) | 12% | 88% | ||
| Mexičané (Los Angeles) | 25% | 75% | 2% | |
| Miaozu | 35% | 65% | ||
| Mongola | 35% | 65% | ||
| Mozabit | 16% | 84% | ||
| Naxi | 28% | 72% | ||
| Ngoni | 89% | 11% | 33% | 6% |
| Severoameričtí běloši | 9% | 90% | ||
| Orogen | 10% | 90% | ||
| Orcadians | 16% | 84% | ||
| Oromo | 35% | 65% | 14% | 0% |
| Papuánci | 21% | 79% | ||
| Palestinci | 18% | 82% | ||
| Pathane | 12% | 88% | ||
| Pima | 54% | 46% | ||
| Portoričané | 56% | 44% | 5% | |
| Rusové | 8% | 92% | ||
| San (Namibie) | 93% | 7% | ||
| Sena | 84% | 16% | 23% | 16% |
| Sefardští Židé | 11% | 89% | 0% | 0% |
| Ona | 45% | 55% | ||
| Shewa Arabové | 60% | 40% | 22% | 7% |
| Shona | 22% | 78% | 22% | 10% |
| Sindhi | 18% | 82% | ||
| Somie (Kamerunská travnatá pole) | 77% | 23% | 18% | 10% |
| Jižní Súdán | 76% | 24% | 33% | 3% |
| Španěl | 9% | 91% | ||
| súdánský (Severní) | 40% | 60% | 11% | 0% |
| súdánský (Kordofan) | 55% | 45% | 20% | 2% |
| Surui | 17% | 83% | ||
| Švédové | 7% | 93% | 0% | 0% |
| Tanzanie | 81% | 19% | 19% | 12% |
| Tu | 10% | 90% | ||
| Tujia | 35% | 65% | ||
| Tuniský | 19% | 81% | 1% | 0% |
| Ujgur | 5% | 95% | ||
| Wolof | 73% | 27% | 18% | 9% |
| Xibo | 22% | 78% | ||
| Yao | 82% | 18% | 13% | 9% |
| Jakuti | 10% | 90% | ||
| Jemenský (Hadramaut) | 15% | 85% | 3% | 1% |
| Jemenský (Sena a Msila) | 42% | 58% | 12% | 3% |
| Yizu | 20% | 80% | ||
| Yoruba | 83%-94% | 6%-17% | 17%-75% | 0% |
| Zimbabwe (Mposi) | 84% | 16% | 16% | 19% |
Interaktivní mapa cest
Kliknutím na geny, proteiny a metabolity níže můžete odkazovat na příslušné články. [§ 1]
- ^ Interaktivní mapu cest lze upravit na WikiPathways: „IrinotecanPathway_WP46359“.
Viz také
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000106258 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000038656 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ A b C „P08684-CP3A4_Human“. UniProt. UniProt. Vyvolány November 2014. Zkontrolujte hodnoty data v:
| accessdate =(Pomoc) - ^ „Entrez Gene: CYP3A5 cytochrom P450, rodina 3, podčeleď A, polypeptid 5“.
- ^ „CYTOCHROME P450, SUBFAMILY IIIA, POLYPEPTIDE 5; CYP3A5“. OMIM. Vyvolány November 2014. Zkontrolujte hodnoty data v:
| accessdate =(Pomoc) - ^ Zanger UM, Turpeinen M, Klein K, Schwab M (2008). „Funkční farmakogenetika / genomika lidských cytochromů P450 zapojených do biotransformace léčiva“. Analytická a bioanalytická chemie. 392 (6): 1093–108. doi:10.1007 / s00216-008-2291-6. PMID 18695978. S2CID 33827704.
- ^ A b „CYP3A5“. PharmGKB. Vyvolány November 2014. Zkontrolujte hodnoty data v:
| accessdate =(Pomoc) - ^ Valente C, Alvarez L, Marks SJ, Lopez-Parra AM, Parson W, Oosthuizen O, Oosthuizen E, Amorim A, Capelli C, Arroyo-Pardo E, Gusmão L, Prata MJ (28. května 2015). „Zkoumání vztahu mezi životním stylem, stravou a genetickými adaptacemi u lidí“. Genetika BMC. 16 (55): 55. doi:10.1186 / s12863-015-0212-1. PMC 4445807. PMID 26018448.
- ^ A b Bains, Ripudaman Kaur. „Molekulární diverzita a struktura populace v genu CYP3A5 v Africe“ (PDF). University College v Londýně. Citováno 13. června 2016.
Další čtení
- Smith G, Stubbins MJ, Harries LW, Wolf CR (prosinec 1998). "Molekulární genetika lidské nadrodiny cytochromu P450 monooxygenázy". Xenobiotica. 28 (12): 1129–65. doi:10.1080/004982598238868. PMID 9890157.
- Lee SJ, Goldstein JA (červen 2005). „Funkčně defektní nebo pozměněné jednonukleotidové polymorfismy CYP3A4 a CYP3A5 a jejich detekce pomocí genotypových testů“. Farmakogenomika. 6 (4): 357–71. doi:10.1517/14622416.6.4.357. PMID 16004554.
- Aoyama T, Yamano S, Waxman DJ, Lapenson DP, Meyer UA, Fischer V, Tyndale R, Inaba T, Kalow W, Gelboin HV (červen 1989). „Cytochrom P-450 hPCN3, nový produkt genu pro cytochrom P-450 IIIA, který je rozdílně exprimován v játrech dospělých lidí. CDNA a odvozená sekvence aminokyselin a odlišné specificity hPCN1 a hPCN3 exprimované v cDNA pro metabolismus steroidních hormonů a cyklosporinu“ . The Journal of Biological Chemistry. 264 (18): 10388–95. PMID 2732228.
- Schuetz JD, Molowa DT, Guzelian PS (listopad 1989). „Charakterizace cDNA kódující nový člen cytochromů P450 reagujících na glukokortikoidy v lidských játrech“. Archivy biochemie a biofyziky. 274 (2): 355–65. doi:10.1016/0003-9861(89)90449-9. PMID 2802615.
- Murray GI, Pritchard S, Melvin WT, Burke MD (květen 1995). „Cytochrom P450 CYP3A5 v lidské přední hypofýze“. FEBS Dopisy. 364 (1): 79–82. doi:10.1016 / 0014-5793 (95) 00367-I. PMID 7750548. S2CID 28711803.
- Jounaïdi Y, Guzelian PS, Maurel P, Vilarem MJ (prosinec 1994). "Pořadí 5'-ohraničující oblasti CYP3A5: srovnávací analýza s CYP3A4 a CYP3A7". Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 205 (3): 1741–7. doi:10.1006 / bbrc.1994.2870. PMID 7811260.
- McKinnon RA, Burgess WM, Hall PM, Roberts-Thomson SJ, Gonzalez FJ, McManus ME (únor 1995). "Charakterizace exprese podrodiny genu CYP3A v lidských gastrointestinálních tkáních". Střevo. 36 (2): 259–67. doi:10,1136 / střeva. 36.2.259. PMC 1382414. PMID 7883227.
- Kolars JC, Lown KS, Schmiedlin-Ren P, Ghosh M, Fang C, Wrighton SA, Merion RM, Watkins PB (říjen 1994). "Exprese genu CYP3A v lidském střevním epitelu". Farmakogenetika. 4 (5): 247–59. doi:10.1097/00008571-199410000-00003. PMID 7894497.
- Lown KS, Kolars JC, Thummel KE, Barnett JL, Kunze KL, Wrighton SA, Watkins PB (1995). "Heterogenita mezi pacienty v expresi CYP3A4 a CYP3A5 v tenkém střevě. Nedostatek predikce dechovým testem erytromycinu." Metabolismus a dispozice léků. 22 (6): 947–55. PMID 7895614.
- Schuetz JD, Beach DL, Guzelian PS (únor 1994). "Selektivní exprese mRNA cytochromu P450 CYP3A v embryonálních a dospělých lidských játrech". Farmakogenetika. 4 (1): 11–20. doi:10.1097/00008571-199402000-00002. PMID 8004129.
- Maruyama K, Sugano S (leden 1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
- Schuetz JD, Schuetz EG, Thottassery JV, Guzelian PS, Strom S, Sun D (leden 1996). "Identifikace nového dexamethasonu reagujícího zesilovače v lidském genu CYP3A5 a jeho aktivace v lidských a krysích jaterních buňkách". Molekulární farmakologie. 49 (1): 63–72. PMID 8569713.
- Jounaïdi Y, Hyrailles V, Gervot L, Maurel P (duben 1996). „Detekce alelické varianty CYP3A5: kandidát na polymorfní expresi proteinu?“. Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 221 (2): 466–70. doi:10.1006 / bbrc.1996.0618. PMID 8619878.
- Hakkola J, Pasanen M, Hukkanen J, Pelkonen O, Mäenpää J, Edwards RJ, Boobis AR, Raunio H (únor 1996). "Exprese xenobiotik metabolizujících forem cytochromu P450 v lidské donosné placentě". Biochemická farmakologie. 51 (4): 403–11. doi:10.1016/0006-2952(95)02184-1. PMID 8619884.
- Hakkola J, Raunio H, Purkunen R, Pelkonen O, Saarikoski S, Cresteil T, Pasanen M (červenec 1996). "Detekce exprese genu cytochromu P450 v lidské placentě v prvním trimestru těhotenství". Biochemická farmakologie. 52 (2): 379–83. doi:10.1016 / 0006-2952 (96) 00216-X. PMID 8694864.
- Huang Z, Fasco MJ, Figge HL, Keyomarsi K, Kaminsky LS (srpen 1996). "Exprese cytochromů P450 v lidské prsní tkáni a nádorech". Metabolismus a dispozice léků. 24 (8): 899–905. PMID 8869826.
- Kivistö KT, Bookjans G, Fromm MF, Griese EU, Münzel P, Kroemer HK (září 1996). "Exprese CYP3A4, CYP3A5 a CYP3A7 v lidské duodenální tkáni". British Journal of Clinical Pharmacology. 42 (3): 387–9. doi:10.1046 / j.1365-2125.1996.42615.x. PMC 2042681. PMID 8877031.
- Janardan SK, Lown KS, Schmiedlin-Ren P, Thummel KE, Watkins PB (říjen 1996). "Selektivní exprese CYP3A5, nikoli CYP3A4 v lidské krvi". Farmakogenetika. 6 (5): 379–85. doi:10.1097/00008571-199610000-00001. PMID 8946469.
- Anttila S, Hukkanen J, Hakkola J, Stjernvall T, Beaune P, Edwards RJ, Boobis AR, Pelkonen O, Raunio H (březen 1997). "Exprese a lokalizace CYP3A4 a CYP3A5 v lidských plicích". American Journal of Respiratory Cell and Molecular Biology. 16 (3): 242–9. doi:10.1165 / ajrcmb.16.3.9070608. PMID 9070608.
- Hukkanen J, Hakkola J, Anttila S, Piipari R, Karjalainen A, Pelkonen O, Raunio H (říjen 1997). „Detekce mRNA kódující xenobioticky metabolizující cytochrom P450 v lidských bronchoalveolárních makrofágech a lymfocytech periferní krve“. Molekulární karcinogeneze. 20 (2): 224–30. doi:10.1002 / (SICI) 1098-2744 (199710) 20: 2 <224 :: AID-MC9> 3.0.CO; 2-M. PMID 9364212.
externí odkazy
- Člověk CYP3A5 umístění genomu a CYP3A5 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.