Pořadí větvení bakteriální kmene (Ciccarelli et al., 2006) - Branching order of bacterial phyla (Ciccarelli et al., 2006)

Existuje několik modelů Pořadí větvení bakteriální kmeny, jeden z nich navrhl v roce 2006 Ciccarelli et al. pro svůj projekt iTOL.^[1]

Tento strom je založen na zřetězené sadě konzervovaného proteinu a nikoli 16S rRNA (srov. Pořadí větvení bakteriální kmene (Woese, 1987) ).

Uspořádání různých kmenů se liší od uspořádání 16S, ale může být způsobeno přitažlivost dlouhé větve a kvůli omezenému odběru vzorků (mnoho kmenů má jediného zástupce v pořadí, zatímco Firmicutes a Proteobacteria jsou nadměrně zastoupeny). Proteobakterie nejsou na tomto fylogramu monofyletické, ale vzhledem k velkému množství literatury ve prospěch bazálních kyselinobakterií to může být chybné. Na rozdíl od 16S stromů je nejhlubší větvící se clade Firmicutes. Poslední společný předek byl nicméně mezi bakteriemi a Archaea + Eukarya.

Viz také

• Pořadí větvení bakteriální kmene (Woese, 1987)
• Pořadí větvení bakteriální kmene (Rappe a Giovanoni, 2003)
• Pořadí větvení bakteriální kmene po ARB Silva Living Tree
• Pořadí větvení bakteriální kmene (Ciccarelli et al., 2006)
• Pořadí větvení bakteriální kmene (Battistuzzi et al., 2004)
• Pořadí větvení bakteriální kmene (Gupta, 2001)
• Pořadí větvení bakteriální kmene (Cavalier-Smith, 2002)

Reference