Pořadí větvení bakteriální kmene (Woese, 1987) - Branching order of bacterial phyla (Woese, 1987)

Existuje několik modelů Pořadí větvení bakteriální kmeny, jeden z nich byl navržen v článku 1987 od Carl Woese.^[1]

Pořadí větvení navržené Carlem Woeseem bylo založeno na molekulární fylogeneze, který byl považován za revoluční, protože všechny předchozí modely byly založeny na diskusích o morfologii. (proti. Monera ).^[2] Od té doby bylo navrženo několik modelů a v současné době není dosaženo konsensu, pokud jde o pořadí větvení hlavních bakteriálních linií.^[3]

Použitý gen byl 16S ribozomální DNA.

Strom

Názvy byly změněny tak, aby odrážely aktuální názvosloví používané molekulárními fylogenisty.

Archaea + eukaryote

Bakterie

	Firmicutes

	Aktinobakterie

	Planctomycetes

	Chlamydie

Spirochety

	Bacteroidetes

	Chlorobi

Poznámka k jménům

Přes dopad článku na klasifikaci bakterií se nejednalo o návrh na změnu taxonomie. V důsledku toho dostalo mnoho kladů oficiální jména. K tomu došlo až následně: například byly přejmenovány „fialové bakterie a příbuzní“ Proteobakterie.^[4]

Diskuse

Poslední univerzální společný předek

Kořen stromu, tj. uzel poslední univerzální společný předek, je umístěn mezi doménou Bakterie (nebo království Eubakterie jak se tehdy vědělo) a clade tvořené doménami Archaea (dříve království Archeobakterie) a Eukaryoty. To je v souladu se všemi následujícími studiemi, pokud studii zablokovat Thomas Cavalier-Smith v letech 2002 a 2004, která nebyla založena na molekulární fylogenezi.^[5]

Eukaryoty jsou mozaikou různých linií:

Genom v jádru sestupuje z prvního eukaryotu bez organel, „urkaryotu“, sesterského druhu k rodovému archeonu
The mitochondrie jsou organely, které pocházejí z proto-mitochondrie, druh Rickettsiales (Alphaproteobacteria) (proti. Reclinomonas a retortamonády ).
The chloroplasty jsou organely cyanobakteriálního původu.

V důsledku toho je ve Woese (1987) skupina označována jako urkaryote.

Klad složený z Archaea a jaderného genomu eukaryot se T. Cavalier-Smith nazývá Neomura^[5]

Viz také

Poznámky pod čarou

Reference

^ Woese, ČR (1987). "Bakteriální evoluce". Mikrobiologické recenze. 51 (2): 221–71. doi:10.1128 / MMBR.51.2.221-271.1987. PMC 373105. PMID 2439888.
^ Olsen GJ, Woese CR, Overbeek R (1994). „Větry (evolučních) změn: vdechnutí nového života mikrobiologii“. Journal of Bacteriology. 176 (1): 1–6. doi:10.2172/205047. PMC 205007. PMID 8282683.
^ Pace, N. R. (2009). „Mapování stromu života: pokrok a vyhlídky“. Recenze mikrobiologie a molekulární biologie. 73 (4): 565–576. doi:10.1128 / MMBR.00033-09. PMC 2786576. PMID 19946133.
^ Stackebrandt; et al. (1988). „Proteobacteria classis nov., Název fylogenetického taxonu, který zahrnuje„ fialové bakterie a jejich příbuzné “"". Int. J. Syst. Bacteriol. 38 (3): 321–325. doi:10.1099/00207713-38-3-321.
^ ^A ^b Cavalier-Smith, T (2002). „Neomuranský původ archebakterií, negibakteriální kořen univerzálního stromu a bakteriální megaklasifikace“. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 52 (Pt 1): 7–76. doi:10.1099/00207713-52-1-7. PMID 11837318.

[woese87-1] Woese, ČR (1987). "Bakteriální evoluce". Mikrobiologické recenze. 51 (2): 221–71. doi:10.1128 / MMBR.51.2.221-271.1987. PMC 373105. PMID 2439888.

[2] Olsen GJ, Woese CR, Overbeek R (1994). „Větry (evolučních) změn: vdechnutí nového života mikrobiologii“. Journal of Bacteriology. 176 (1): 1–6. doi:10.2172/205047. PMC 205007. PMID 8282683.

[pace09-3] Pace, N. R. (2009). „Mapování stromu života: pokrok a vyhlídky“. Recenze mikrobiologie a molekulární biologie. 73 (4): 565–576. doi:10.1128 / MMBR.00033-09. PMC 2786576. PMID 19946133.

[Stackebrandt_et_al._1988_321–325-4] Stackebrandt; et al. (1988). „Proteobacteria classis nov., Název fylogenetického taxonu, který zahrnuje„ fialové bakterie a jejich příbuzné “"". Int. J. Syst. Bacteriol. 38 (3): 321–325. doi:10.1099/00207713-38-3-321.

[CS02-5] A ^b Cavalier-Smith, T (2002). „Neomuranský původ archebakterií, negibakteriální kořen univerzálního stromu a bakteriální megaklasifikace“. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 52 (Pt 1): 7–76. doi:10.1099/00207713-52-1-7. PMID 11837318.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]