Pořadí větvení bakteriální kmene (Gupta, 2001) - Branching order of bacterial phyla (Gupta, 2001)

Existuje několik modelů Pořadí větvení bakteriální kmeny, jeden z nich navrhl v roce 2001 Gupta na základě konzervovaných indelů nebo proteinu, nazývaných „proteinové podpisy“, což je alternativní přístup k molekulární fylogenezi.[1] U těchto konzervovaných indelů se vyskytují některé problematické výjimky a konflikty, jsou však ve shodě s několika seskupeními tříd a kmenů.[1] Jedním z rysů kladogramu získaného touto metodou je shlukování morfologie buněčné stěny (až na některé výjimky) z monodermů na přechodné a tradiční didermy.[2]

Na níže uvedeném cladogramu žlutá = pseudopeptidoglykanové monodermy (Gramova proměnná), červená = tlusté peptidoglykanové monodermy (Gram pozitivní), modrá = tenké peptidoglykanové monodermy (Gram negativní), zelená = atypické, viz poznámka v závorkách).

Archaea

Firmicutes

Aktinobakterie

Thermotogae (tóga)

Fusobakterie

Skupina Deinococcus-Thermus (tlustý pept. Diderms)

Chloroflexi (tenký pept. Monoderms)

Sinice

Spirochety

Skupina FCB

Fibrobakterie

Chlorobi

Bacteroidetes

Skupina PVC

Planctomycetes (uzavřený nukleoid pirellusome)

Verrucomicrobia (rozčlenění)

Chlamydie

Aquificae

Proteobakterie

Deltaproteobakterie

Epsilonproteobakterie

Alphaproteobacteria

Gammaproteobakterie

Betaproteobakterie

Viz také

Reference

  1. ^ A b Gupta, R. (2001). „Pořadí větvení a fylogenetické umístění druhů z dokončených bakteriálních genomů na základě konzervovaných indelů nalezených v různých proteinech“. Mezinárodní mikrobiologie. 4 (4): 187–202. doi:10.1007 / s10123-001-0037-9. PMID  12051562. S2CID  14017883.
  2. ^ Gupta, R. S. (2011). „Původ didermních (gramnegativních) bakterií: Antibiotický selekční tlak spíše než endosymbióza pravděpodobně vedl k vývoji bakteriálních buněk se dvěma membránami“. Antonie van Leeuwenhoek. 100 (2): 171–182. doi:10.1007 / s10482-011-9616-8. PMC  3133647. PMID  21717204.