Auxilin - Auxilin

DNAJC6
Identifikátory
Aliasy	DNAJC6, DJC6, PARK19, Auxilin, DnaJ rodina proteinu tepelného šoku (Hsp40), člen C6
Externí ID	OMIM: 608375 MGI: 1919935 HomoloGene: 8865 Genové karty: DNAJC6
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 1 (lidský)
Konec	65,415,871 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 4 (myš)
Konec	101,642,799 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita protein tyrosin fosfatázy; • Vazba domény SH3; • aktivita fosfoprotein fosfatázy; • aktivita hydrolázy; • clathrinová vazba;
Buněčná složka	• cytosol; • synapse; • váček; • GO: 0097483, GO: 0097481 postsynaptická hustota; • cytoplazma; • intracelulární membránou vázaná organela; • presynapse;
Biologický proces	• peptidyl-tyrosin defosforylace; • regulace endocytózy závislé na klatrinu; • defosforylace bílkovin; • demontáž klatrinového pláště; • receptorem zprostředkovaná endocytóza; • membránová organizace; • synaptické vezikuly bez povlaku; • na klatrinu závislá endocytóza;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	9829
	72685
	ENSG00000116675
	ENSMUSG00000028528
	O75061
	Q80TZ3
	NM_001256864; NM_001256865; NM_014787
NM_001164583; NM_001164584; NM_001164585; NM_198412; NM_001355179;
	NM_001355180
	NP_001243793; NP_001243794; NP_055602
NP_001158055; NP_001158056; NP_001158057; NP_940804; NP_001342108;
	NP_001342109
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Předpokládaný tyrosin-protein fosfatáza auxilin je enzym že u lidí je kódován DNAJC6 gen.^[5]^[6]^[7]

Funkce

DNAJC6 patří do evolučně konzervované rodiny proteinů DNAJ / HSP40, které regulují aktivitu molekulárních chaperonů stimulací aktivity ATPázy. Proteiny DNAJ mohou mít až 3 odlišné domény: konzervativní J doména se 70 aminokyselinami, obvykle na N konci, oblast bohatá na glycin / fenylalanin (G / F) a doména bohatá na cystein obsahující 4 motivy připomínající zinek -prstová doména (Ohtsuka a Hata, 2000).^[7]

Struktura

The protein tyrosin fosfatáza doména a Doména C2 pár auxilinu, umístěný blízko N-konce polypeptidu, tvoří superdoménu, tandemové uspořádání dvou nebo více nominálně nesouvisejících domén, které tvoří jednu dědičnou jednotku.^[8] Fosfatázová doména patří do auxilinová podrodina lipidových fosfatáz a předpokládá se, že bude katalyticky neaktivní.^[9]^[10]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000116675 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000028528 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Seki N, Ohira M, Nagase T, Ishikawa K, Miyajima N, Nakajima D, Nomura N, Ohara O (říjen 1997). "Charakterizace cDNA klonů v knihovnách cDNA s frakcionací podle velikosti z lidského mozku". Výzkum DNA. 4 (5): 345–9. doi:10.1093 / dnares / 4.5.345. PMID 9455484.
^ Ohtsuka K, Hata M (duben 2000). „Savčí homology HSP40 / DNAJ: klonování nových cDNA a návrh na jejich klasifikaci a nomenklaturu“. Stres buněk a chaperony. 5 (2): 98–112. doi:10.1379 / 1466-1268 (2000) 005 <0098: MHDHCO> 2.0.CO; 2. PMC 312896. PMID 11147971.
^ ^A ^b „Entrez Gene: DNAJC6 DnaJ (Hsp40) homolog, podčeleď C, člen 6“.
^ Haynie DT, Xue B (květen 2015). „Superdomény v hierarchii proteinové struktury: Případ PTP-C2“. Věda o bílkovinách. 24 (5): 874–82. doi:10.1002 / pro.2664. PMC 4420535. PMID 25694109.
^ "Phosphatase Subfamily Auxilin - PhosphataseWiki". fosfatome.net.
^ Chen MJ, Dixon JE, Manning G (duben 2017). "Genomika a vývoj proteinových fosfatáz". Vědecká signalizace. 10 (474): eaag1796. doi:10.1126 / scisignal.aag1796. PMID 28400531.

externí odkazy

Člověk DNAJC6 umístění genomu a DNAJC6 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

Další čtení

Suzuki Y, Yamashita R, Shirota M, Sakakibara Y, Chiba J, Mizushima-Sugano J, Nakai K, Sugano S (září 2004). „Porovnání sekvencí lidských a myších genů odhaluje homologní blokovou strukturu v promotorových oblastech“. Výzkum genomu. 14 (9): 1711–8. doi:10,1101 / gr. 2435604. PMC 515316. PMID 15342556.
Scheele U, Alves J, Frank R, Duwel M, Kalthoff C, Ungewickell E (červenec 2003). "Molekulární a funkční charakterizace determinantů vázajících klatrin a AP-2 v neuspořádané doméně auxilinu". The Journal of Biological Chemistry. 278 (28): 25357–68. doi:10,1074 / jbc.M303738200. PMID 12732633.
Scheele U, Kalthoff C, Ungewickell E (září 2001). „Několik interakcí auxilinu 1 s klatrinem a komplexem adaptéru AP-2“. The Journal of Biological Chemistry. 276 (39): 36131–8. doi:10,1074 / jbc.M106511200. PMID 11470803.
Ishikawa K, Nagase T, Nakajima D, Seki N, Ohira M, Miyajima N, Tanaka A, Kotani H, Nomura N, Ohara O (říjen 1997). „Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. VIII. 78 nových klonů cDNA z mozku, které kódují velké proteiny in vitro“. Výzkum DNA. 4 (5): 307–13. doi:10.1093 / dnares / 4.5.307. PMID 9455477.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000116675 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000028528 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9455484-5] Seki N, Ohira M, Nagase T, Ishikawa K, Miyajima N, Nakajima D, Nomura N, Ohara O (říjen 1997). "Charakterizace cDNA klonů v knihovnách cDNA s frakcionací podle velikosti z lidského mozku". Výzkum DNA. 4 (5): 345–9. doi:10.1093 / dnares / 4.5.345. PMID 9455484.

[pmid11147971-6] Ohtsuka K, Hata M (duben 2000). „Savčí homology HSP40 / DNAJ: klonování nových cDNA a návrh na jejich klasifikaci a nomenklaturu“. Stres buněk a chaperony. 5 (2): 98–112. doi:10.1379 / 1466-1268 (2000) 005 <0098: MHDHCO> 2.0.CO; 2. PMC 312896. PMID 11147971.

[entrez-7] A ^b „Entrez Gene: DNAJC6 DnaJ (Hsp40) homolog, podčeleď C, člen 6“.

[8] Haynie DT, Xue B (květen 2015). „Superdomény v hierarchii proteinové struktury: Případ PTP-C2“. Věda o bílkovinách. 24 (5): 874–82. doi:10.1002 / pro.2664. PMC 4420535. PMID 25694109.

[9] "Phosphatase Subfamily Auxilin - PhosphataseWiki". fosfatome.net.

[10] Chen MJ, Dixon JE, Manning G (duben 2017). "Genomika a vývoj proteinových fosfatáz". Vědecká signalizace. 10 (474): eaag1796. doi:10.1126 / scisignal.aag1796. PMID 28400531.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]