Anaerococcus - Anaerococcus

Anaerococcus
Vědecká klasifikace
Doména:
Bakterie
Kmen:
Firmicutes
Třída:
Clostridia
Objednat:
Clostridiales
Rod:
Anaerococcus

Anaerococcus je rod bakterií. Jeho druh je Anaerococcus prevotii.[1] Tyto bakterie jsou grampozitivní a přísně anaerobní.[2][3][4] Rod Anaerococcus byl navržen v roce 2001.[2][4] Jeho genom byl sekvenován v srpnu 2009. Rod Anaerococcus je jedním ze šesti rodů zařazených do skupiny GPAC (grampozitivní anaerobní koky).[5] Těchto šest rodů (Peptostreptococcus, Peptoniphilus, Parvimonas, Finegoldia, Anaerococcus a Murdochiella) se nacházejí v lidském těle jako součást komenzální lidské mikrobioty.[6][7][5]

Může způsobit infekci a je běžnou součástí lidského mikrobiomu.[8] Většina druhů tohoto rodu se vyskytuje jako součást normální flóry kůže, lidské pochvy, nosní dutiny, ústní dutiny a výkalů.[2] Je to lidský patogen nacházející se v ovariální abscesy, chronické rány a vaginální výtok.[9] Kromě toho lze z některých druhů izolovat vředy na nohy a kolenní artirtida.[2] Může být přítomen v infekce močového ústrojí, chronické vředy, pleurální empyém, infekce krve a měkké tkáně infekce. Podílí se na polymikrobiálních infekcích.[10] Dále byly v podpaží mikrobiotě nalezeny kmeny Anaerococcus, což naznačuje, že některé druhy tohoto rodu mohou hrát roli v axilárním zápachu.[10][11]

Fyziologie

Rod Anaerococcus jsou nepohyblivé bakterie, které nemohou tvořit spory a.[4][12][2] Uspořádání se může lišit v závislosti na druhu. Nejběžnější uspořádání v tomto rodu jsou páry, tetrady, krátké řetězce a nepravidelné formace.[10][4] Jejich velikost buněk se může lišit od 0,6 μm do 0,9 μm.[10] Pokud se však pěstují na obohaceném krevním agaru, jejich velikost se může pohybovat od 0,5 μm do 2 μm.[10] V tomto rodu existuje více než jedna hlavní buněčná mastná kyselina: C18: 1, C16: 1, C18 a C16.[12] Většina druhů v tomto rodu je indol-negativní a koaguáza-negativní.[10] Obecně je druh Anaerococcus náchylný k penicilinům, ale je vůči němu rezistentní tetracyklin, erythromycin a klindamycin.[9]

Metabolismus

Rod Anaerococcus je klasifikován jako sacharolytický bakterie.[2][13] Jeho druhy mohou být uspořádány ze slabě sacharolytických (např. A. prevotii, A. lactolyticus) na silně sacharolytické (např. A. hydrogenalis).[13] Tento rod může slabě fermentovat sacharidy.[6] Hlavními zdroji využití energie v metabolismu Anaerococcus jsou peptony a aminokyseliny.[4][10] Tři hlavní cukry fermentované v tomto rodu jsou glukóza, manóza, fruktóza a sacharóza.[12][4] Po fermentaci cukrů produkuje Anaerococcus slabé kyseliny jako svůj metabolický konečný produkt.[13] V rámci těchto metabolických konečných produktů tento rod produkuje kyselinu máselnou, kyselinu mléčnou a určitou kyselinu propionovou a jantarovou.[12] Hlavním metabolitem produkovaným Anaerococcus je nicméně butyrát.[13][10][2]

Druh

Donedávna má rod Anaerococcus 14 známých druhů.[14][9] Šest druhů bylo původně klasifikováno do rodu Peptostreptococcus, ale poté bylo na základě jejich charakteristik znovu zařazeno do nového rodu Anaerococcus: A. hydrogenalis, A. lactolyticus, A. octavius, A. prevotii, A. tetradius, a A. vaginalis.[5][2] V průběhu let se v těle tohoto rodu nacházel druh, který se více těšil A. prevotii.[9]

Anaerococcus hydrogenalis

A. hydrogenalis je přítomen ve vaginálních výtokech a abscesech vaječníků.[4] Přítomnost Anaerococcus hydrogenalis ve střevním metabolismu a jejich spotřeba kolinů byla spojena s kardiovaskulárními chorobami.[15] Na rozdíl od většiny druhů tohoto rodu Anaerococcus hydrogenalis je indol pozitivní.[4] Některé kmeny v tomto druhu mohou také produkovat ureáza.[4]

Anaerococcus lactolyticus

Anaerococcus lactolyticus[10] je jedním ze dvou druhů rodu Anaerococcus, z nichž byly nalezeny diabetická noha.[9] Navíc, A. lactolyticus lze extrahovat z dekubity.[9]

Anaerococcus octavius

Na rozdíl od většiny druhů rodu, Anaerococcus octavius nesouvisel s lidskými infekcemi.[9] Nicméně nedávno byl odhalen nový případ A. octavius může způsobit bakteremie.[9] I když je to neobvyklé, Anaerococcus octavius může být příčinou lidských infekcí.[9] Byly nalezeny další studie A. octavius jako součást nosní dutiny, normální flóry kůže a pochvy.[9][4] Tato bakterie může fermentovat ribózu, glukózu a manózu.[4]

Anaerococcus prevotii

A. prevotii se běžně vyskytuje ve vaginálních výtokech, lidské plazmě a některých typech abscesů, jako jsou vaječníkové, peritoneální sakrální a / nebo plicní abscesy.[9][6] Ještě více, Anaerococcus prevotii je součástí normální flóry v kůži, ústní dutině a ve střevech.[6] Studie ukázaly Anaerococcus prevotii představuje odpor vůči Ceftazidim, Klindamycin, Levofloxacin.[9] Na rozdíl od ostatních druhů A. prevotii nemůže fermentovat glukózu.[16]

Anaerococcus tetradius

A. tetradius byl nejprve izolován z vaginálních výtoků a vaječníkových abscesů.[4] Tato bakterie může kvasit glukóza a manóza.[4]

Anaerococcus vaginalis

A. vaginalis byl poprvé získán z vaginálních výtoků a vaječníkových abscesů, i když tuto bakterii lze nalézt také u dekubitů a diabetické nohy.[4][9] Některé kmeny z tohoto druhu mohou být indol-pozitivní.[4]

Anaerococcus murdochii

A. murdochii představuje rezistenci proti antiobiotikům klindamycin a kanamycin.[9] Studie také zjistily, že tento druh má meziproduktovou rezistenci penciliny.[9]

Anaerococcus degenerii

A. degenerii

Anaerococcus provencensis

A. provencensis byl izolován z cervikálního abscesu.[17] Tento druh může na rozdíl od fermentovat laktózu A. tetradius, A. prevotii, a A. octavius.[17] První provedená analýza Anaerococcus provencensis ukázal, že je citlivý na penicilin G., imipenem, amoxilin, metronidazol, cefotetan a vankomycin.[17]

Anaerococcus senegalensis

A. senegalensis je jedním z mála druhů v Anerococcus, jehož genom byl sekvenován.[2] Genom má velikost 1790835 bp.[2] Provedená analýza neukázala přítomnost plazmidu.[2] Zpočátku, Anaerococcus senegalensis byl nalezen ve fekální flóře zdravého člověka.[2]

Anaerococcus rubiinfantis

A. rubiinfantis byl objeven ze vzorku stolice odebraného kojenci s těžkou akutní podvýživou v Senegalu.[18] Na základě genomické analýzy Anaerococcus rubiinfantis má vysokou citlivost na antibiotika.[18] Z tohoto důvodu lze tuto bakterii léčit běžnými perorálními antibiotiky.[18] A. rubiinfantis mají katalázovou aktivitu, která není běžná u anaerobních bakterií.[18]

Anaerococcus marasmi

A. marasmi byl poprvé nalezen v roce 2016 ze vzorku stolice u dítěte s marasmus.[14] Stejně jako A. rubiinfantis, Anaerococcus marasmi je katalse pozitivní.[14] A. marasmi může růst v rozmezí pH mezi 6,5 až 8.[14] Navíc, A. marasmi má vysokou podobnost sekvence (97,6%) s A. prevotii na základě jejich 16S rRNA.[14]

Anaerococcus urinomassiliensis

A. urinomassiliensis byl izolován ze vzorku moči dospívajícího muže s membranoproliferativní glomerulonefritida a autoinmuní hepatitida.[19] Sledování růstu z této bakterie trvalo 10 dní anaerobní inkubace.[19]Anaerococcus urinomassiliensis nemá ani oxidázovou, ani katalázovou aktivitu.[19]

Anaerococcus nagyae

A. nagyae byl poprvé nalezen v krevní kultuře od pacienta s ischemie a chřipka.[5] Buňky Anaerococcus nagyae jsou uspořádány ve dvojicích.[5] Ačkoli to může slabě fermentovat manózu, studie ukázaly, že tyto anaerobní bakterie nemohou fermentovat glukózu a rafinózu.[5] A. nagyae je odolný vůči kolistin, ale je citlivý na vankomycin a kanamycin.[5]

Reference

  1. ^ Parte, A.C. "Anaerococcus". Citováno 27. března 2017.
  2. ^ A b C d E F G h i j k l Lagier JC, El Karkouri K, Nguyen TT, Armougom F, Raoult D, Fournier PE (březen 2012). "Nesousedící hotová sekvence genomu a popis Anaerococcus senegalensis sp. Nov". Standardy v genomických vědách. 6 (1): 116–25. doi:10,4056 / sigs. 2415480. PMC  3359877. PMID  22675604.
  3. ^ Versalovic J, Carroll KC, Funke G, Jorgensen JH, Landry ML, Warnock DW, eds. (01.01.2011). „Peptostreptococcus, Finegoldia, Anaerococcus, Peptoniphilus, Veillonella a další anaerobní koky“. Manuál klinické mikrobiologie (10. vydání). Americká mikrobiologická společnost. 803–816. doi:10.1128 / 9781555816728.ch48. ISBN  978-1-55581-463-2. Citováno 2020-08-02.
  4. ^ A b C d E F G h i j k l m n Ó Ezaki T, Kawamura Y, Li N, Li ZY, Zhao L, Shu S (červenec 2001). „Návrh rodů Anaerococcus gen. Nov., Peptoniphilus gen. Nov. A Gallicola gen. Nov. Pro členy rodu Peptostreptococcus“. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 51 (Pt 4): 1521–1528. doi:10.1099/00207713-51-4-1521. PMID  11491354.
  5. ^ A b C d E F G Veloo AC, de Vries ED, Jean-Pierre H, van Winkelhoff AJ (duben 2016). „Anaerococcus nagyae sp. Nov., Izolovaný z lidských klinických vzorků“. Anaerobe. 38: 111–115. doi:10.1016 / j.anaerobe.2015.11.009. PMID  26639871.
  6. ^ A b C d Labutti K, Pukall R, Steenblock K, Glavina Del Rio T, Tice H, Copeland A a kol. (Září 2009). "Kompletní sekvence genomu kmene typu Anaerococcus prevotii (PC1)". Standardy v genomických vědách. 1 (2): 159–65. doi:10,4056 / sigs.24194. PMC  3035230. PMID  21304652.
  7. ^ Veloo AC, Elgersma PE, van Winkelhoff AJ (červen 2015). „Anaerococcus degenerii sp. Nov., Izolovaný z lidských klinických vzorků“. Anaerobe. 33: 71–5. doi:10.1016 / j.anaerobe.2015.02.002. PMID  25680238.
  8. ^ „BacMap“. Citováno 27. března 2017.
  9. ^ A b C d E F G h i j k l m n Ó Cobo F, Navarro-Marí JM (únor 2020). "První popis Anaerococcus octavius ​​jako příčiny bakteremie". Anaerobe. 61: 102130. doi:10.1016 / j.anaerobe.2019.102130. PMID  31765706.
  10. ^ A b C d E F G h i Murphy EC, Frick IM (červenec 2013). „Grampozitivní anaerobní koky - komenzály a oportunní patogeny“. Recenze mikrobiologie FEMS. 37 (4): 520–53. doi:10.1111/1574-6976.12005. PMID  23030831.
  11. ^ Fujii, Takayoshi; Shinozaki, Junko; Kajiura, Takayuki; Iwasaki, Keiji; Fudou, Ryosuke (červenec 2014). „Nově objevený kmen Anaerococcus zodpovědný za axilární zápach a nový inhibitor axilárního zápachu, pentagalloyl glukóza“. Ekologie mikrobiologie FEMS. 89 (1): 198–207. doi:10.1111/1574-6941.12347. PMID  24784923.
  12. ^ A b C d Ezaki, Takayuki; Ohkusu, Kiyofumi (2015), "Anaerococcus", Bergey's Manual of Systematics of Archaea and Bacteria, American Cancer Society, s. 1–5, doi:10.1002 / 9781118960608.gbm00712, ISBN  978-1-118-96060-8
  13. ^ A b C d Ezaki, Takayuki; Li, Na; Kawamura, Yoshiaki (2006), Dworkin, Martin; Falkow, Stanley; Rosenberg, Eugene; Schleifer, Karl-Heinz (eds.), "Anaerobní grampozitivní koky", Prokaryotes: Svazek 4: Bakterie: Firmicutes, Sinice, New York, NY: Springer USA, str. 795–808, doi:10.1007/0-387-30744-3_26, ISBN  978-0-387-30744-2
  14. ^ A b C d E Tall ML, Pham TP, Bellali S, Ngom II, Delerce J, Lo CI a kol. (Květen 2020). „marasmi sp. nov., nová bakterie izolovaná z lidské střevní mikrobioty“. Nové mikroby a nové infekce. 35: 100655. doi:10.1016 / j.nmni.2020.100655. PMC  7082211. PMID  32211195.
  15. ^ Yadav M, Verma MK, Chauhan NS (březen 2018). "Přehled metabolického potenciálu lidského střevního mikrobiomu ve výživě člověka". Archiv mikrobiologie. 200 (2): 203–217. doi:10.1007 / s00203-017-1459-x. PMID  29188341. S2CID  3464103.
  16. ^ Song Y, Liu C, Finegold SM (červen 2007). „Peptoniphilus gorbachii sp. Nov., Peptoniphilus olsenii sp. Nov. A Anaerococcus murdochii sp. Nov. Izolované z klinických vzorků lidského původu“. Journal of Clinical Microbiology. 45 (6): 1746–52. doi:10.1128 / JCM.00213-07. PMC  1933094. PMID  17428937.
  17. ^ A b C Pagnier I, Croce O, Robert C, Raoult D, La Scola B (červen 2014). "Nesousedící hotová sekvence genomu a popis Anaerococcus provenciensis sp. Nov". Standardy v genomických vědách. 9 (3): 1198–210. doi:10 4056 / sigs. 550 1035. PMC  4149013. PMID  25197492.
  18. ^ A b C d Tidjani Alou M, Khelaifia S, Michelle C, Andrieu C, Armstrong N, Bittar F a kol. (Srpen 2016). „Anaerococcus rubiinfantis sp. Nov., Izolovaný ze střevní mikrobioty senegalského kojence s těžkou akutní podvýživou“. Anaerobe. 40: 85–94. doi:10.1016 / j.anaerobe.2016.06.007. PMID  27328611.
  19. ^ A b C Morand A, Cornu F, Tsimaratos M, Lagier JC, Cadoret F, Fournier PE, Raoult D (září 2016). „Anaerococcus urinomassiliensis sp. Nov., Izolovaný ze vzorku moči 17letého chlapce postiženého autoimunitní hepatitidou a membranoproliferativní glomerulonefritidou“. Nové mikroby a nové infekce. 13: 56–8. doi:10.1016 / j.nmni.2016.06.001. PMC  4933030. PMID  27408746.