TBL1X - TBL1X

TBL1X
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2XTC, 2XTD, 2XTE
Identifikátory
Aliasy	TBL1X, EBI, SMAP55, TBL1, transducin (beta) podobný 1X vázaný, transducin beta podobný 1X vázaný, transducin beta podobný 1 X vázaný, CHNG8
Externí ID	OMIM: 300196 MGI: 1336172 HomoloGene: 4128 Genové karty: TBL1X
Umístění genu (člověk)
Chr.	X chromozom (lidský)
Konec	9,741,037 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	X chromozom (myš)
Konec	77,662,983 bp
Exprese RNA vzor
	; ; ; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba beta-katenin; • GO: Aktivita transkripčního corepresoru 0001106; • specifické vazby na proteinovou doménu; • histonová vazba; • transkripční faktor vazba; • vazba na C-konec proteinu; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • identická vazba na protein;
Buněčná složka	• komplex histon-deacetylázy; • transkripční represorový komplex; • nukleoplazma; • vřetenová mikrotubule; • buněčné jádro; • mitotické vřeteno;
Biologický proces	• regulace transkripce, DNA-šablony; • negativní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • smyslové vnímání zvuku; • transkripce, chráněná DNA; • proteolýza; • pozitivní regulace transkripce, chráněná DNA; • histonová deacetylace; • pozitivní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • proteazomem zprostředkovaný katabolický proces proteinu závislý na ubikvitinu; • regulace metabolismu lipidů; • pozitivní regulace kanonické signální dráhy Wnt; • stabilizace bílkovin; • regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	6907
	21372
	ENSG00000101849
	ENSMUSG00000025246
	O60907
	Q9QXE7
	NM_001139466; NM_001139467; NM_001139468; NM_005647
	NM_020601
	NP_001132938; NP_001132939; NP_001132940; NP_005638
	NP_065626
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

1krát vázaný na transducin (beta), také známý jako TBL1X, je protein který je u lidí kódován TBL1X gen.^[5]

Funkce

Protein kódovaný tímto genem má sekvenční podobnost s členy WD40 opakovat - obsahující proteinovou rodinu. Skupina WD40 je velká rodina proteinů, které mají regulační funkci. Předpokládá se, že WD40 repetice zprostředkovávají interakce protein-protein a jsou zapojeni členové rodiny signální transdukce, Zpracování RNA, genová regulace vezikulární obchodování, cytoskeletální shromáždění a mohou hrát roli při kontrole cytotypové diferenciace. Tento kódovaný protein se nachází jako podjednotka v corepressor SMRT (tlumič hluku pro receptory retinoidů a štítné žlázy) komplex spolu s histon deacetyláza 3 bílkoviny. Tento gen se nachází v sousedství genu pro oční albinismus a předpokládá se, že se podílí na patogenezi oční albinismus s pozdním nástupem senzorineurální hluchota fenotyp. Tento gen je velmi podobný genu TBL1Y chromozomu Y.^[5]

Interakce

TBL1X bylo prokázáno komunikovat s:

GPS2,^[6] a
HDAC3,^[6]^[7]
NCOA1,^[6]^[7]^[8]^[9] a
NCOA2.^[7]^[8]^[9]^[10]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000101849 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000025246 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ ^A ^b „Entrez Gene: TBL1X transducin (beta) -like 1X-linked“.
^ ^A ^b ^C Zhang J, Kalkum M, Chait BT, Roeder RG (březen 2002). „Komplex nuklepresorových jaderných receptorů N-CoR-HDAC3 inhibuje dráhu JNK přes integrovanou podjednotku GPS2“. Mol. Buňka. 9 (3): 611–23. doi:10.1016 / s1097-2765 (02) 00468-9. PMID 11931768.
^ ^A ^b ^C Guenther MG, Lane WS, Fischle W, Verdin E, Lazar MA, Shiekhattar R (květen 2000). „Jádrový komplex SMRT corepressor obsahující HDAC3 a TBL1, protein WD40-repeat spojený s hluchotou“. Genes Dev. 14 (9): 1048–57. doi:10.1101 / gad.14.9.1048 (neaktivní 10. 9. 2020). PMC 316569. PMID 10809664.CS1 maint: DOI neaktivní od září 2020 (odkaz)
^ ^A ^b Yoon HG, Chan DW, Huang ZQ, Li J, Fondell JD, Qin J, Wong J (březen 2003). „Čištění a funkční charakterizace lidského komplexu N-CoR: role HDAC3, TBL1 a TBLR1“. EMBO J.. 22 (6): 1336–46. doi:10.1093 / emboj / cdg120. PMC 151047. PMID 12628926.
^ ^A ^b Li J, Wang J, Wang J, Nawaz Z, Liu JM, Qin J, Wong J (srpen 2000). „Jak corepresorové proteiny SMRT, tak N-CoR existují ve velkých proteinových komplexech obsahujících HDAC3“. EMBO J.. 19 (16): 4342–50. doi:10.1093 / emboj / 19.16.4342. PMC 302030. PMID 10944117.
^ Guenther MG, Yu J, Kao GD, Yen TJ, Lazar MA (prosinec 2002). „Sestavení represivního komplexu SMRT-histon-deacetyláza 3 vyžaduje kruhový komplex TCP-1“. Genes Dev. 16 (24): 3130–5. doi:10.1101 / gad.1037502. PMC 187500. PMID 12502735.

Další čtení

Bassi MT, Ramesar RS, Caciotti B, Winship IM, De Grandi A, Riboni M, Townes PL, Beighton P, Ballabio A, Borsani G (1999). „X-vázaná senzorineurální hluchota s pozdním nástupem způsobená delecí zahrnující OA1 a nový gen obsahující repetice WD-40“. Dopoledne. J. Hum. Genet. 64 (6): 1604–16. doi:10.1086/302408. PMC 1377903. PMID 10330347.
Guenther MG, Lane WS, Fischle W, Verdin E, Lazar MA, Shiekhattar R (2000). „Jádrový komplex SMRT corepressor obsahující HDAC3 a TBL1, protein WD40-repeat spojený s hluchotou“. Genes Dev. 14 (9): 1048–57. doi:10.1101 / gad.14.9.1048 (neaktivní 10. 9. 2020). PMC 316569. PMID 10809664.CS1 maint: DOI neaktivní od září 2020 (odkaz)
Li J, Wang J, Wang J, Nawaz Z, Liu JM, Qin J, Wong J (2000). „Jak corepresorové proteiny SMRT, tak N-CoR existují ve velkých proteinových komplexech obsahujících HDAC3“. EMBO J.. 19 (16): 4342–50. doi:10.1093 / emboj / 19.16.4342. PMC 302030. PMID 10944117.
Matsuzawa SI, Reed JC (2001). „Siah-1, SIP a Ebi spolupracují na nové cestě degradace beta-kateninu spojené s odpověďmi p53“. Mol. Buňka. 7 (5): 915–26. doi:10.1016 / S1097-2765 (01) 00242-8. PMID 11389839.
Zhang J, Kalkum M, Chait BT, Roeder RG (2002). „Komplex nuklepresorových jaderných receptorů N-CoR-HDAC3 inhibuje dráhu JNK přes integrovanou podjednotku GPS2“. Mol. Buňka. 9 (3): 611–23. doi:10.1016 / S1097-2765 (02) 00468-9. PMID 11931768.
Yoon HG, Chan DW, Huang ZQ, Li J, Fondell JD, Qin J, Wong J (2003). „Čištění a funkční charakterizace lidského komplexu N-CoR: role HDAC3, TBL1 a TBLR1“. EMBO J.. 22 (6): 1336–46. doi:10.1093 / emboj / cdg120. PMC 151047. PMID 12628926.
Yoon HG, Chan DW, Reynolds AB, Qin J, Wong J (2003). „N-CoR zprostředkovává represi závislou na methylaci DNA prostřednictvím proteinu Kaiso vázajícího methyl CpG“. Mol. Buňka. 12 (3): 723–34. doi:10.1016 / j.molcel.2003.08.008. PMID 14527417.
Perissi V, Aggarwal A, Glass CK, Rose DW, Rosenfeld MG (2004). "Výměnný komplex corepresor / koaktivátor požadovaný pro aktivaci transkripce jadernými receptory a dalšími regulovanými transkripčními faktory". Buňka. 116 (4): 511–26. doi:10.1016 / S0092-8674 (04) 00133-3. PMID 14980219. S2CID 18807923.
Yoon HG, Choi Y, Cole PA, Wong J (2005). „Čtení a funkce histonového kódu podílejícího se na cílení komplexů corepressorů pro represi“. Mol. Buňka. Biol. 25 (1): 324–35. doi:10.1128 / MCB.25.1.324-335.2005. PMC 538779. PMID 15601853.
Gerlitz G, Darhin E, Giorgio G, Franco B, Reiner O (2005). „Nové funkční vlastnosti domény Lis-H: role v dimerizaci proteinů, poločasu a lokalizaci buněk“. Buněčný cyklus. 4 (11): 1632–40. doi:10,4161 / cc.4.11.2151. PMID 16258276.

Tento článek o gen na člověka X chromozom a / nebo související protein je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000101849 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000025246 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[entrez-5] A ^b „Entrez Gene: TBL1X transducin (beta) -like 1X-linked“.

[pmid11931768-6] A ^b ^C Zhang J, Kalkum M, Chait BT, Roeder RG (březen 2002). „Komplex nuklepresorových jaderných receptorů N-CoR-HDAC3 inhibuje dráhu JNK přes integrovanou podjednotku GPS2“. Mol. Buňka. 9 (3): 611–23. doi:10.1016 / s1097-2765 (02) 00468-9. PMID 11931768.

[pmid10809664-7] A ^b ^C Guenther MG, Lane WS, Fischle W, Verdin E, Lazar MA, Shiekhattar R (květen 2000). „Jádrový komplex SMRT corepressor obsahující HDAC3 a TBL1, protein WD40-repeat spojený s hluchotou“. Genes Dev. 14 (9): 1048–57. doi:10.1101 / gad.14.9.1048 (neaktivní 10. 9. 2020). PMC 316569. PMID 10809664.CS1 maint: DOI neaktivní od září 2020 (odkaz)

[pmid12628926-8] A ^b Yoon HG, Chan DW, Huang ZQ, Li J, Fondell JD, Qin J, Wong J (březen 2003). „Čištění a funkční charakterizace lidského komplexu N-CoR: role HDAC3, TBL1 a TBLR1“. EMBO J.. 22 (6): 1336–46. doi:10.1093 / emboj / cdg120. PMC 151047. PMID 12628926.

[pmid10944117-9] A ^b Li J, Wang J, Wang J, Nawaz Z, Liu JM, Qin J, Wong J (srpen 2000). „Jak corepresorové proteiny SMRT, tak N-CoR existují ve velkých proteinových komplexech obsahujících HDAC3“. EMBO J.. 19 (16): 4342–50. doi:10.1093 / emboj / 19.16.4342. PMC 302030. PMID 10944117.

[pmid12502735-10] Guenther MG, Yu J, Kao GD, Yen TJ, Lazar MA (prosinec 2002). „Sestavení represivního komplexu SMRT-histon-deacetyláza 3 vyžaduje kruhový komplex TCP-1“. Genes Dev. 16 (24): 3130–5. doi:10.1101 / gad.1037502. PMC 187500. PMID 12502735.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]