CTBP1 - CTBP1

CTBP1
6cdf.jpg
Dostupné struktury
PDBHledání ortologu: PDBe RCSB
Identifikátory
AliasyCTBP1, C-terminální vazebný protein 1, BARS, HADDTS
Externí IDOMIM: 602618 MGI: 1201685 HomoloGene: 1015 Genové karty: CTBP1
Umístění genu (člověk)
Chromozom 4 (lidský)
Chr.Chromozom 4 (lidský)[1]
Chromozom 4 (lidský)
Genomic location for CTBP1
Genomic location for CTBP1
Kapela4p16.3Start1,211,448 bp[1]
Konec1,249,953 bp[1]
Exprese RNA vzor
PBB GE CTBP1 213980 s at fs.png

PBB GE CTBP1 212863 x at fs.png

PBB GE CTBP1 203392 s at fs.png
Další údaje o referenčních výrazech
Ortology
DruhČlověkMyš
Entrez

1487

13016

Ensembl

ENSG00000159692

ENSMUSG00000037373

UniProt

Q13363

O88712

RefSeq (mRNA)

NM_001198859
NM_001198860
NM_001198861
NM_013502
NM_001310535

RefSeq (protein)

NP_001185788
NP_001185789
NP_001185790
NP_001297464
NP_038530

Místo (UCSC)Chr 4: 1,21 - 1,25 MbChr 5: 33,25 - 33,27 Mb
PubMed Vyhledávání[3][4]
Wikidata
Zobrazit / upravit člověkaZobrazit / upravit myš

C-terminálně vázající protein 1 také známý jako CtBP1 je protein že u lidí je kódován CTBP1 gen.[5] CtBP1 je jedním ze dvou proteinů CtBP, druhým proteinem je CtBP2.[6]

Funkce

Protein CtBP1 byl původně identifikován jako lidský protein, který vázal motiv PLDLS v C-konec adenovirových proteinů E1A. To a související protein CTBP2 později se ukázalo, že fungují jako transkripční korepresory.[7] To znamená regulační proteiny, které se vážou na sekvenčně specifické proteiny vázající DNA a pomáhají vypnout geny. CtBP to dělají tím, že získávají enzymy modifikující histon, které přidávají represivní histonové značky a odstraňují aktivační značky. CtBP proteiny se mohou také samy asociovat a pravděpodobně spojit genové regulační komplexy.[8]

CtBP1 je široce exprimován z embrya na dospělého, zatímco CtBP2 má poněkud omezenější vzor exprese. CtBP mají více biologických rolí a jeví se jako nejdůležitější při regulaci přechodu z epitelu do mezenchymu a také při ovlivňování metabolismu. Dělají to tak, že přednostně váží NADH na NAD +, čímž snímají Poměr NADH / NAD +. Když je vázán, prochází konformační změnou, která mu umožňuje dimerizovat a asociovat se svými partnerskými proteiny a umlčet specifické geny.

Během vývoje koster a T buněk se CtBP1 a CtBP2 asociují s doménou PLDLSL δEF1, buněčným proteinem homeodomény zinkového prstu, a tím zvyšuje δEF1 indukované umlčování transkripce. CtBP také váže Faktory podobné Kruppelovi rodina proteinů se zinkovým prstem KLF3, KLF8 a KLF12. Kromě toho CtBP komplexuje s CtIP, proteinem 125 kDa, který rozpoznává zřetelně odlišné proteinové motivy od CtBP. CtIP se váže na BRCT repetice v genu BRCA1 pro rakovinu prsu a umožňuje CtBP ovlivňovat aktivitu BRCA1. Oba proteiny mohou také interagovat s komplexem proteinů skupiny polycombů, který se podílí na regulaci genové exprese během vývoje. Alternativní sestřih transkriptů z tohoto genu vede k mnoha variantám transkriptů.[9]

Protein interagující s C-terminálním vazebným proteinem (CtIP) je vazebným partnerem s CtBP, ke kterému přispívá transkripce represe a buněčný cyklus regulace a které mají roli v buněčné reakci na Poškození DNA.[10]

Interakce

Bylo prokázáno, že CTBP1 komunikovat s:

Reference

  1. ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000159692 - Ensembl, Květen 2017
  2. ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000037373 - Ensembl, Květen 2017
  3. ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  4. ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  5. ^ A b Schaeper U, Subramanian T, Lim L, Boyd JM, Chinnadurai G (duben 1998). „Interakce mezi buněčným proteinem, který se váže na C-koncovou oblast adenoviru E1A (CtBP) a novým buněčným proteinem, je narušena E1A prostřednictvím konzervovaného motivu PLDLS“. J. Biol. Chem. 273 (15): 8549–52. doi:10.1074 / jbc.273.15.8549. PMID  9535825.
  6. ^ Ding B, Yuan F, Damle PK, Grossman SR (2020). „CtBP určuje osud buněk rakoviny vaječníků potlačováním receptorů smrti“. Buněčná smrt a nemoc. 11 (4): 286. doi:10.1038 / s41419-020-2455-7. PMC  7181866. PMID  32332713.
  7. ^ A b Turner J, Crossley M (září 1998). „Klonování a charakterizace mCtBP2, corepresoru, který se asociuje se základním faktorem podobným Krüppel a dalšími regulačními transkripčními systémy savců“. EMBO J.. 17 (17): 5129–40. doi:10.1093 / emboj / 17.17.5129. PMC  1170841. PMID  9724649.
  8. ^ Chinnadurai G (2002). "CtBP, nekonvenční transkripční corepressor ve vývoji a onkogenezi". Mol. Buňka. 9 (2): 213–24. doi:10.1016 / S1097-2765 (02) 00443-4. PMID  11864595.
  9. ^ „Entrez Gene: CTBP1 C-terminální vazebný protein 1“.
  10. ^ Bruton RK, Rasti M, Mapp KL, Grand R (2007). „Protein interagující s C-terminálním proteinem se váže přímo na časnou oblast 1A adenoviru prostřednictvím své N-koncové oblasti a konzervované oblasti 3“. Onkogen (deník). 26 (53): 7467–7479. doi:10.1038 / sj.onc.1210551. PMID  17546052.
  11. ^ Oma Y, Nishimori K, Harata M (únor 2003). „Mozkový specifický protein související s aktinem ArpN alfa interaguje s transkripčním ko-represorem CtBP“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 301 (2): 521–8. doi:10.1016 / S0006-291X (02) 03073-5. PMID  12565893.
  12. ^ Paliwal S, Pande S, Kovi RC, Sharpless NE, Bardeesy N, Grossman SR (březen 2006). „Cílení na C-terminální vazebný protein (CtBP) podle výsledků ARF v apoptóze nezávislé na p53“. Mol. Buňka. Biol. 26 (6): 2360–72. doi:10.1128 / MCB.26.6.2360-2372.2006. PMC  1430274. PMID  16508011.
  13. ^ Chakraborty S, Senyuk V, Sitailo S, Chi Y, Nucifora G (listopad 2001). „Interakce EVI1 s cAMP reagujícím na protein vázající protein vázající protein (CBP) a s p300 / CBP asociovaný faktor (P / CAF) vede k reverzibilní acetylaci EVI1 a ke společné lokalizaci v jaderných skvrnách“. J. Biol. Chem. 276 (48): 44936–43. doi:10,1074 / jbc.M106733200. PMID  11568182.
  14. ^ Izutsu K, Kurokawa M, Imai Y, Maki K, Mitani K, Hirai H (květen 2001). „Corepressor CtBP interaguje s Evi-1, aby potlačil signalizaci beta transformujícího růstového faktoru“. Krev. 97 (9): 2815–22. doi:10,1182 / krev. V97.9.2815. PMID  11313276.
  15. ^ Li S, Weidenfeld J, Morrisey EE (leden 2004). „Transkripční a DNA vazebná aktivita rodiny Foxp1 / 2/4 je modulována heterotypickými a homotypickými proteinovými interakcemi“. Mol. Buňka. Biol. 24 (2): 809–22. doi:10.1128 / MCB.24.2.809-822.2004. PMC  343786. PMID  14701752.
  16. ^ Zhang CL, McKinsey TA, Lu JR, Olson EN (leden 2001). „Sdružení proteinu vázajícího se na COOH-terminál (CtBP) a transkripčního represoru interagujícího s MEF2 (MITR) přispívá k transkripční represi transkripčního faktoru MEF2“. J. Biol. Chem. 276 (1): 35–9. doi:10,1074 / jbc.M007364200. PMID  11022042.
  17. ^ A b Melhuish TA, Wotton D (prosinec 2000). „Interakce proteinu vázajícího se na karboxylový konec s Coreadresorem Smad TGIF je narušena holoprosencefální mutací v TGIF“. J. Biol. Chem. 275 (50): 39762–6. doi:10,1074 / jbc.C000416200. PMID  10995736.
  18. ^ Sundqvist A, Sollerbrant K, Svensson C (červen 1998). „Karboxy-koncová oblast adenoviru E1A aktivuje transkripci prostřednictvím zacílení na C-koncový vazebný komplex protein-histon-deacetyláza“. FEBS Lett. 429 (2): 183–8. doi:10.1016 / S0014-5793 (98) 00588-2. PMID  9650586. S2CID  20660291.
  19. ^ Koipally J, Georgopoulos K (červen 2000). „Interakce Ikaros s CtBP odhalují represivní mechanismus, který je nezávislý na aktivitě histon-deacetylázy“. J. Biol. Chem. 275 (26): 19594–602. doi:10,1074 / jbc.M000254200. PMID  10766745.
  20. ^ Perdomo J, Crossley M (prosinec 2002). „Protein rodiny Ekaros Eos se asociuje s proteinovými corepresory vázajícími C-terminál“. Eur. J. Biochem. 269 (23): 5885–92. doi:10.1046 / j.1432-1033.2002.03313.x. PMID  12444977.
  21. ^ van Vliet J, Turner J, Crossley M (květen 2000). „Faktor 8 podobný lidskému Krüppel: protein vázající CACCC-box, který se asociuje s CtBP a potlačuje transkripci“. Nucleic Acids Res. 28 (9): 1955–62. doi:10.1093 / nar / 28.9.1955. PMC  103308. PMID  10756197.
  22. ^ Mirnezami AH, Campbell SJ, Darley M, Primrose JN, Johnson PW, Blaydes JP (červenec 2003). „Hdm2 získává hypoxický citlivý corepressor pro negativní regulaci transkripce závislé na p53“ (PDF). Curr. Biol. 13 (14): 1234–9. doi:10.1016 / S0960-9822 (03) 00454-8. PMID  12867035. S2CID  2451241.
  23. ^ Xia ZB, Anderson M, Diaz MO, Zeleznik-Le NJ (červenec 2003). „MLL represní doména interaguje s histonovými deacetylázami, proteiny skupiny polycombových skupin HPC2 a BMI-1 a proteinem vázajícím C-terminál na jádro“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 100 (14): 8342–7. doi:10.1073 / pnas.1436338100. PMC  166231. PMID  12829790.
  24. ^ Castet A, Boulahtouf A, Versini G, Bonnet S, Augereau P, Vignon F, Khochbin S, Jalaguier S, Cavaillès V (2004). „Více domén proteinu 140 interagujícího s receptory přispívá k inhibici transkripce“. Nucleic Acids Res. 32 (6): 1957–66. doi:10.1093 / nar / gkh524. PMC  390375. PMID  15060175.
  25. ^ Perissi V, Scafoglio C, Zhang J, Ohgi KA, Rose DW, Glass CK, Rosenfeld MG (březen 2008). „Fosforylace TBL1 a TBLR1 na regulovaných promotorech genů překonává kontrolní body duálních CtBP a NCoR / SMRT transkripčních represí“. Mol. Buňka. 29 (6): 755–66. doi:10.1016 / j.molcel.2008.01.020. PMC  2364611. PMID  18374649.
  26. ^ Alpatov R, Munguba GC, Caton P, Joo JH, Shi Y, Shi Y, Hunt ME, Sugrue SP (prosinec 2004). „Protein Pnn / DRS spojený s jadernou skvrnou se váže na transkripční Corepressor CtBP a zmírňuje CtBP zprostředkovanou represi genu E-kadherinu“. Mol. Buňka. Biol. 24 (23): 10223–35. doi:10.1128 / MCB.24.23.10223-10235.2004. PMC  529029. PMID  15542832.
  27. ^ Li S, Chen PL, Subramanian T, Chinnadurai G, Tomlinson G, Osborne CK, Sharp ZD, Lee WH (duben 1999). „Vazba CtIP na BRCT repetice BRCA1 zapojené do regulace transkripce p21 je narušena při poškození DNA“. J. Biol. Chem. 274 (16): 11334–8. doi:10.1074 / jbc.274.16.11334. PMID  10196224.
  28. ^ Snow JW, Kim J, Currie CR, Xu J, Orkin SH (září 2010). „Sumoylace reguluje interakci FOG1 s C-terminálním vazebným proteinem (CTBP)“. The Journal of Biological Chemistry. 285 (36): 28064–75. doi:10.1074 / jbc.M109.096909. PMC  2934671. PMID  20587419.
  29. ^ Katsumura KR, Bresnick EH (duben 2017). „GATA faktorová revoluce v hematologii“. Krev. 129 (15): 2092–2102. doi:10.1182 / krev-2016-09-687871. PMC  5391619. PMID  28179282.

Další čtení

externí odkazy