Rodina trojstranných motivů - Tripartite motif family
The rodina tripartitních motivů (TRIM) je protein rodina.[1]
Funkce
Mnoho proteinů TRIM je indukováno interferony, které jsou důležitou složkou rezistence na patogeny a je známo, že je zapotřebí několik proteinů TRIM pro omezení infekce lentiviry. TRIM proteiny se podílejí na rozpoznávání patogenů a regulaci transkripčních drah v obraně hostitele.[2]
Struktura
Trojstranný motiv je vždy přítomen na N-konec proteinů TRIM. Motiv TRIM zahrnuje následující tři domény:[1]
- (1) a Prsteník doména
- (2) jeden nebo dva B-box zinkový prst domén
- když je přítomen pouze jeden B-box, je to vždy B-box typu 2
- jsou-li přítomny dva B-boxy, B-Box typu 1 vždy předchází B-boxu typu 2
- (3) svinutá cívka kraj
The C-konec proteinů TRIM obsahuje buď:
- Proteiny skupiny 1: C-terminální doména vybraná z následujícího seznamu:
- NHL a IGFLMN domény, ať už ve spojení nebo samostatně
- Doména PHD spojené s a bromodoména
- MATH doména (např. TRIM37 )
- Doména ARF (např. TRIM23 )
- Doména EXOIII (např. TRIM19 ) nebo
- Skupina 2 proteiny: SPRY C-koncová doména
- např. TRIM21
Členové rodiny
Rodina TRIM je rozdělena do dvou skupin, které se liší strukturou domény a genomickou organizací:[3]
- Členové skupiny 1 mají různé druhy C-terminál domény a jsou zastoupeny jak u obratlovců, tak u bezobratlých
- Skupina 2 chybí u bezobratlých, má C-koncovou SPRY doménu[4]
Členové rodiny zahrnují:
- Skupina 1
- Doména PHD-BROMO obsahující: TRIM24 (TIF1α), TRIM28 (TIF1β), TRIM33 (TIF1γ) - působí jako korepresory
- 1-10: TRIM1, TRIM2, TRIM3, OBRÁZEK 8, OBRÁZEK 9
- 11-20: TRIM12, TRIM13, TRIM14, TRIM16, TRIM18, TRIM19
- 21-30: TRIM23, TRIM25, TRIM29, TRIM30
- 31-40: TRIM32, TRIM36, TRIM37
- 41-50: TRIM42, TRIM44, TRIM45, TRIM46, TRIM47
- 51-60: TRIM51, TRIM53, 54, TRIM55, 56, TRIM57, TRIM59
- 61-70: TRIM62, TRIM63, 65, TRIM66, TRIM67, TRIM69, TRIM70
- 71-75: TRIM71
- Skupina 2
- 1-10: TRIM4, TRIM5, TRIM6, OBRÁZEK 7, 10. TRIM
- 11-20: TRIM11, TRIM12, TRIM15, TRIM17, TRIM20
- 21-30: TRIM21, TRIM22, TRIM26, TRIM27, TRIM30
- 31-40: TRIM31, TRIM34, TRIM35, TRIM38, TRIM39, TRIM40
- 41-50: TRIM41, TRIM43, 48, TRIM49, TRIM50
- 51-60: TRIM51, TRIM52, TRIM53, TRIM57, TRIM58, TRIM60
- 61-70: TRIM61, TRIM64, TRIM68, TRIM69, TRIM70
- 71-75: TRIM72, TRIM73, TRIM74, TRIM75
Reference
- ^ A b Reymond A, Meroni G, Fantozzi A, Merla G, Cairo S, Luzi L, Riganelli D, Zanaria E, Messali S, Cainarca S, Guffanti A, Minucci S, Pelicci PG, Ballabio A (květen 2001). „Rodina trojdílných motivů identifikuje buněčné oddíly“. EMBO J.. 20 (9): 2140–51. doi:10.1093 / emboj / 20.9.2140. PMC 125245. PMID 11331580.
- ^ Ozato K, Shin DM, Chang TH, Morse HC (listopad 2008). „Proteiny rodiny TRIM a jejich vznikající role ve vrozené imunitě“. Nat. Rev. Immunol. 8 (11): 849–60. doi:10.1038 / nri2413. PMC 3433745. PMID 18836477.
- ^ Sardiello M, Cairo S, Fontanella B, Ballabio A, Meroni G (2008). „Genomická analýza rodiny TRIM odhaluje dvě skupiny genů s odlišnými evolučními vlastnostmi“. BMC Evol. Biol. 8: 225. doi:10.1186/1471-2148-8-225. PMC 2533329. PMID 18673550.
- ^ Ponting C, Schultz J, Bork P (červen 1997). "SPRY domény v ryanodinových receptorech (Ca (2 +) - uvolňující kanály)". Trends Biochem. Sci. 22 (6): 193–4. doi:10.1016 / S0968-0004 (97) 01049-9. PMID 9204703.
 | Tento protein související článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |