N, N-diacetylchitobiosa fosforyláza - N,N-diacetylchitobiose phosphorylase - Wikipedia

N, N'-diacetylchitobiosa fosforyláza
Identifikátory
EC číslo2.4.1.280
Databáze
IntEnzIntEnz pohled
BRENDAVstup BRENDA
EXPASYPohled NiceZyme
KEGGVstup KEGG
MetaCycmetabolická cesta
PRIAMprofil
PDB strukturRCSB PDB PDBe PDBsum

N, N'-diacetylchitobiosa fosforyláza (ES 2.4.1.280, chbP (gen)) je enzym s systematické jméno N, N'-diacetylchitobióza: fosfát N-acetyl-D-glukosaminyltransferáza.[1][2][3] Tento enzym byl nalezen v rodu Vibrio zpočátku, ale nyní bylo zjištěno, že je přijímán Escherichia coli stejně jako mnoho dalších bakterií. Jedna studie to ukazuje Escherichia coli může replikovat na médiu, ze kterého se právě skládá GlcNAc produkt fosforylace N, N'-diacetylchitobiózy jako jediného zdroje uhlíku. Protože E-coli může pokračovat na tomto médiu, je přítomný enzym. Enzym byl také nalezen v mnoha eukaryotických buňkách, zejména v eukaryotech, které produkují chitin a štěpí chitin. Předpokládá se, že N, N'-diacetylchitobióza fosforyláza je nedílnou součástí systému fosfoenolpyruvát: glukóza fosfotransferáza (PTS). Předpokládá se, že je zapojen do enzymového komplexu II PTS a je zapojen do syntézy chitinu.[4]Enzym je specifický pro N, N'-diacetylchitobiózu.

Mechanismus

Tento enzym katalýzy následující chemická reakce

N, N'-diacetylchitobióza + fosfát N-acetyl-D-glukosamin + N-acetyl-alfa-D-glukosamin 1-fosfát

Mechanismus této reakce je následující: enzymatická fosforolýza N, N'-diacetylchitobiosa fosforylázy začíná přímým nukleofilním útokem na glykosidovou vazbu pomocí D492 nebo zbytku kyseliny asparagové 492 aktivního místa enzymu, který daruje proton na glykosidový atom kyslíku a poté pokračuje oxokarbeniovým kationem aktivovaným iontovým přechodovým stavem.[1]

Reference

  1. ^ A b Park JK, Keyhani NO, Roseman S (říjen 2000). „Katabolismus chitinu v mořské bakterii Vibrio furnissii. Identifikace, molekulární klonování a charakterizace A N, N'-diacetylchitobiose fosforylázy“. The Journal of Biological Chemistry. 275 (42): 33077–83. doi:10.1074 / jbc.m001042200. PMID  10913116.
  2. ^ Honda Y, Kitaoka M, Hayashi K (leden 2004). "Reakční mechanismus chitobiosa fosforylázy z Vibrio proteolyticus: identifikace glykosyltransferázy rodiny 36 ve Vibrio". The Biochemical Journal. 377 (Pt 1): 225–32. doi:10.1042 / bj20031171. PMC  1223840. PMID  13678418.
  3. ^ Hidaka M, Honda Y, Kitaoka M, Nirasawa S, Hayashi K, Wakagi T, Shoun H, Fushinobu S (červen 2004). „Chitobiose fosforyláza z Vibrio proteolyticus, člen rodiny glykosyltransferázy 36, má klanovitý záhyb podobný GH-L (alfa / alfa) (6)“. Struktura. 12 (6): 937–47. doi:10.1016 / j.str.2004.03.027. PMID  15274915.
  4. ^ Keyhani NO, Wang LX, Lee YC, Roseman S (říjen 2000). „Chitin disacharid, N, N'-diacetylchitobióza, je katabolizován Escherichia coli a je transportován / fosforylován systémem fosfoenolpyruvát: glykosa fosfotransferáza.“. The Journal of Biological Chemistry. 275 (42): 33084–90. doi:10,1074 / jbc.M001043200. PMID  10913117.

externí odkazy