Kolagen, typ VI, alfa 3 - Collagen, type VI, alpha 3
Kolagenový alfa-3 (VI) řetězec je protein že u lidí je kódován COL6A3 gen.[5][6][7] Tento protein je alfa řetězcem kolagenu typu VI, který pomáhá při tvorbě mikrofibril.[8] Jako součást kolagenu typu VI byl tento protein zapojen do Bethlemovy myopatie, Ullrichova vrozená svalová dystrofie (UCMD) a dalších nemocí souvisejících se svalovou a pojivovou tkání.[7][9][10]
Struktura
Tento gen kóduje řetězec alfa 3, jeden ze tří řetězců alfa kolagenu typu VI, kolagen s vlákny s korálky, který se nachází ve většině pojivových tkání. Řetězec alfa 3 kolagenu typu VI je mnohem větší než řetězce alfa 1 a 2. Tento rozdíl ve velikosti je do značné míry způsoben zvýšením počtu subdomén, podobných doménám typu von Willebrand Factor typu A, které se nacházejí v aminoterminální globulární doméně všech alfa řetězců. Kromě transkriptu celé délky byly identifikovány čtyři varianty transkriptu, které kódují proteiny s N-koncovými globulárními doménami různých velikostí.[7]
Funkce
Ukázalo se, že řetězec alfa 3 typu VI váže proteiny extracelulární matrice, což je interakce, která vysvětluje význam tohoto kolagenu při organizování složek matrice.[7] Tvorba mikrofibril byla sledována k interakcím mezi její N-koncovou subdoménou N5 a její C-koncovou doménou C5 v sousedních kolagenových monomerech typu VI.[8]
Klinický význam
Mutace v genech kolagenu typu VI jsou spojeny s Bethlemovou myopatií a Ullrichova vrozená svalová dystrofie (UCMD).[7][9] Pacienti s bethlemovou myopatií i autozomálně recesivní pacienti s UCMD jsou typicky heterozygotní pro mutace ve třech alfa řetězcích kolagenu typu VI, ale pouze první vykazují příznaky. Ze tří alfa řetězců přispívají mutace COL6A3 pouze k 18% případů myopatie Bethlem a UCMD.[9] Studie mutací UCMD od Zhang et al našla pouze jednu nepatogenní mutaci v COL6A3.[10] Knock mutantní COL6A3 v pacientských fibroblastových buňkách pomocí siRNA nicméně úspěšně zlepšil buněčnou depozici kolagenu typu VI v autosomálně dominantní UCMD a může se pro ni stát slibnou léčbou.[9]Ačkoli vysoké hladiny exprese COL6A3 korelovaly s obezitou a diabetem u myší, tento vztah nebyl u lidí pozorován.[11]Mezi další poruchy zahrnující svaly a pojivové tkáně patří slabost, laxnost kloubů a kontraktury a abnormální kůže.[9]
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000163359 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000048126 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ Zanussi S, Doliana R, Segat D, Bonaldo P, Colombatti A (listopad 1992). "Gen lidského kolagenu typu VI. Varianty mRNA a proteinu řetězce alfa 3 generované alternativním sestřihem dalšího exonu na 5 koncích". The Journal of Biological Chemistry. 267 (33): 24082–9. PMID 1339440.
- ^ Demir E, Sabatelli P, Allamand V, Ferreiro A, Moghadaszadeh B, Makrelouf M, Topaloglu H, Echenne B, Merlini L, Guicheney P (červen 2002). „Mutace v COL6A3 způsobují závažné a mírné fenotypy Ullrichovy vrozené svalové dystrofie“. American Journal of Human Genetics. 70 (6): 1446–58. doi:10.1086/340608. PMC 419991. PMID 11992252.
- ^ A b C d E „Entrez Gene: COL6A3 kolagen, typ VI, alfa 3“.
- ^ A b Lamandé SR, Mörgelin M, Adams NE, Selan C, Allen JM (červen 2006). „Doména C5 řetězce kolagenu VI alfa3 (VI) je zásadní pro tvorbu extracelulárních mikrofibril a je přítomna v extracelulární matrici kultivovaných buněk“. The Journal of Biological Chemistry. 281 (24): 16607–14. doi:10,1074 / jbc.M510192200. PMID 16613849.
- ^ A b C d E Bushby KM, Collins J, Hicks D (2014). "Myopatie kolagenu typu VI". Pokroky v experimentální medicíně a biologii. 802: 185–99. doi:10.1007/978-94-007-7893-1_12. ISBN 978-94-007-7892-4. PMID 24443028.
- ^ A b Zhang YZ, Zhao DH, Yang HP, Liu AJ, Chang XZ, Hong DJ, Bonnemann C, Yuan Y, Wu XR, Xiong H (květen 2014). "Nové mutace kolagenu VI identifikované u čínských pacientů s vrozenou svalovou dystrofií Ullrich". World Journal of Pediatrics. 10 (2): 126–32. doi:10.1007 / s12519-014-0481-1. PMID 24801232. S2CID 38175712.
- ^ McCulloch LJ, Rawling TJ, Sjöholm K, Franck N, Dankel SN, Price EJ, Knight B, Liversedge NH, Mellgren G, Nystrom F, Carlsson LM, Kos K (leden 2015). „COL6A3 je regulován leptinem v lidské tukové tkáni a redukován u obezity“. Endokrinologie. 156 (1): 134–46. doi:10.1210 / en.2014-1042. PMID 25337653.
Další čtení
- Lampe AK, Bushby KM (září 2005). „Svalové poruchy související s kolagenem VI“. Journal of Medical Genetics. 42 (9): 673–85. doi:10.1136 / jmg.2002.002311. PMC 1736127. PMID 16141002.
- Chu ML, Zhang RZ, Pan TC, Stokes D, Conway D, Kuo HJ, Glanville R, Mayer U, Mann K, Deutzmann R (únor 1990). „Mozaiková struktura globulárních domén v řetězci alfa 3 kolagenu lidského typu VI: podobnost s von Willebrandovým faktorem, fibronektinem, aktinem, slinnými proteiny a inhibitory proteázy aprotininového typu“. Časopis EMBO. 9 (2): 385–93. doi:10.1002 / j.1460-2075.1990.tb08122.x. PMC 551678. PMID 1689238.
- Chu ML, Conway D, Pan TC, Baldwin C, Mann K, Deutzmann R, Timpl R (prosinec 1988). "Aminokyselinová sekvence trojšnekové domény lidského kolagenu typu VI". The Journal of Biological Chemistry. 263 (35): 18601–6. PMID 3198591.
- Weil D, Mattei MG, Passage E, N'Guyen VC, Pribula-Conway D, Mann K, Deutzmann R, Timpl R, Chu ML (březen 1988). „Klonování a chromozomální lokalizace lidských genů kódujících tři řetězce kolagenu typu VI“. American Journal of Human Genetics. 42 (3): 435–45. PMC 1715162. PMID 3348212.
- Chu ML, Mann K, Deutzmann R, Pribula-Conway D, Hsu-Chen CC, Bernard MP, Timpl R (říjen 1987). "Charakterizace tří základních řetězců kolagenu typu VI peptidovými sekvencemi a klony cDNA". European Journal of Biochemistry / FEBS. 168 (2): 309–17. doi:10.1111 / j.1432-1033.1987.tb13422.x. PMID 3665927.
- Arnoux B, Mérigeau K, Saludjian P, Norris F, Norris K, Bjørn S, Olsen O, Petersen L, Ducruix A (březen 1995). "1.6 Struktura domény Kunitzova typu z řetězce alfa 3 lidského kolagenu typu VI". Journal of Molecular Biology. 246 (5): 609–17. doi:10.1016 / S0022-2836 (05) 80110-X. PMID 7533217.
- Pfaff M, Aumailley M, Specks U, Knolle J, Zerwes HG, Timpl R (květen 1993). „Integrin a Arg-Gly-Asp závislost buněčné adheze na nativní a rozvinutou trojitou šroubovici kolagenu typu VI“. Experimentální výzkum buněk. 206 (1): 167–76. doi:10.1006 / excr.1993.1134. PMID 8387021.
- Jöbsis GJ, Keizers H, Vreijling JP, de Visser M, Speer MC, Wolterman RA, Baas F, Bolhuis PA (září 1996). "Mutace kolagenu typu VI v bethlemské myopatii, autozomálně dominantní myopatii se kontrakturami". Genetika přírody. 14 (1): 113–5. doi:10.1038 / ng0996-113. PMID 8782832. S2CID 26173341.
- Zweckstetter M, Czisch M, Mayer U, Chu ML, Zinth W, Timpl R, Holak TA (únor 1996). „Struktura a vícenásobné konformace domény typu kunitz z řetězce alfa3 (VI) kolagenu lidského typu VI v roztoku“. Struktura. 4 (2): 195–209. doi:10.1016 / S0969-2126 (96) 00022-6. PMID 8805527.
- Myint E, Brown DJ, Ljubimov AV, Kyaw M, Kenney MC (září 1996). "Štěpení lidského rohovkového kolagenu typu VI alfa 3 řetězce matricovou metaloproteinázou-2". Rohovka. 15 (5): 490–6. doi:10.1097/00003226-199609000-00009. PMID 8862926.
- Sorensen MD, Bjorn S, Norris K, Olsen O, Petersen L, James TL, Led JJ (srpen 1997). "Struktura řešení a dynamika páteře lidské alfa3 řetězce typu VI kolagenu C-terminální Kunitz doména". Biochemie. 36 (34): 10439–50. doi:10.1021 / bi9705570. PMID 9265624.
- Lamandé SR, Sigalas E, Pan TC, Chu ML, Dziadek M, Timpl R, Bateman JF (březen 1998). „Úloha řetězce alfa3 (VI) v sestavě kolagenu VI. Exprese řetězce alfa3 (VI) bez N-koncových modulů N10-N7 obnovuje sestavu, sekreci a depozici matrice v buňce s nedostatkem alfa3 (VI). čára". The Journal of Biological Chemistry. 273 (13): 7423–30. doi:10.1074 / jbc.273.13.7423. PMID 9516440.
- Klewer SE, Krob SL, Kolker SJ, Kitten GT (březen 1998). "Exprese kolagenu typu VI ve vyvíjejícím se myším srdci". Dynamika vývoje. 211 (3): 248–55. doi:10.1002 / (SICI) 1097-0177 (199803) 211: 3 <248 :: AID-AJA6> 3.0.CO; 2-H. PMID 9520112.
- Pan TC, Zhang RZ, Pericak-Vance MA, Tandan R, Fries T, Stajich JM, Viles K, Vance JM, Chu ML, Speer MC (květen 1998). „Missense mutace v doméně von Willebrandova faktoru typu A v genu pro kolagen alfa 3 (VI) (COL6A3) v rodině s betopatickou myopatií“. Lidská molekulární genetika. 7 (5): 807–12. doi:10,1093 / hmg / 7,5,807. PMID 9536084.
- Aigner T, Hambach L, Söder S, Schlötzer-Schrehardt U, Pöschl E (leden 2002). „Doména C5 Col6A3 je odštěpena z fibril Col6 ihned po sekreci“. Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 290 (2): 743–8. doi:10.1006 / bbrc.2001.6227. PMID 11785962.
- Mercuri E, Yuva Y, Brown SC, Brockington M, Kinali M, Jungbluth H, Feng L, Sewry CA, Muntoni F (květen 2002). „Zapojení kolagenu VI do Ullrichova syndromu: klinická, genetická a imunohistochemická studie“. Neurologie. 58 (9): 1354–9. doi:10.1212 / 588.9.1354. PMID 12011280. S2CID 36063361.
- Arnoux B, Ducruix A, Prangé T (červenec 2002). „Anisotropní chování C-koncové domény Kunitzova typu řetězce alfa3 lidského kolagenu typu VI při atomovém rozlišení (0,9 A)“. Acta Crystallographica oddíl D. 58 (Pt 7): 1252–4. doi:10.1107 / S0907444902007333. PMID 12077460.