Tenascin-R - Tenascin-R

TNR
Identifikátory
Aliasy	TNR, TN-R, tenascin R
Externí ID	OMIM: 601995 MGI: 99516 HomoloGene: 124416 Genové karty: TNR
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 1 (lidský)
Konec	175,743,616 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 1 (myš)
Konec	159,931,729 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny;
Buněčná složka	• extracelulární oblast; • povrch buňky; • membránový vor; • perineuronální síť; • extracelulární matrix obsahující kolagen; • extracelulární matrix; • Schafferův kolaterál - CA1 synapse; • glutamátergická synapse;
Biologický proces	• negativní regulace vývoje projekce neuronů; • pozitivní regulace synaptického přenosu, glutamatergická; • organizace extracelulární matice; • axonové vedení; • organizace synapse; • pozitivní regulace přenosu nervového impulsu; • adheze neuronů mezi buňkami; • negativní regulace adheze buněk k buňkám; • migrace buněk telencephalon; • negativní regulace prodloužení axonu; • lokomotivní průzkumné chování; • dlouhodobá synaptická potenciace; • neuromuskulární proces řídící rovnováhu; • regulace neurogeneze; • negativní regulace prodloužení axonu podílející se na regeneraci; • negativní regulace synaptického přenosu; • modulace chemického synaptického přenosu; • asociativní učení; • buněčná adheze;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	7143
	21960
	ENSG00000116147
	ENSMUSG00000015829
	Q92752
	Q8BYI9
	NM_003285; NM_001328635
	NM_022312
	NP_001315564; NP_003276; NP_003276.3
	NP_071707
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Tenascin-R je protein že u lidí je kódován TNR gen.^[5]^[6]^[7]

Funkce

Tenascin-R (TNR) je extracelulární matrix protein exprimovaný primárně v centrálním nervovém systému. Je členem tenascin (TN) genová rodina, která zahrnuje alespoň 3 geny u savců: TNC (nebo hexabrachion), TNX (TNXB) a TNR.^[8] Geny jsou exprimovány v odlišných tkáních v různých časech během embryonálního vývoje a jsou přítomny v dospělých tkáních. [Dodává OMIM]^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000116147 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání Ensembl 89: ENSMUSG00000015829 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Carnemolla B, Leprini A, Borsi L, Querzé G, Urbini S, Zardi L (duben 1996). "Lidský tenascin-R. Kompletní primární struktura, alternativní sestřih pre-mRNA a lokalizace genů na chromozomu 1q23-q24". The Journal of Biological Chemistry. 271 (14): 8157–60. doi:10.1074 / jbc.271.14.8157. PMID 8626505.
^ Leprini A, Gherzi R, Siri A, Querzé G, Viti F, Zardi L (prosinec 1996). „Lidský gen tenascin-R“. The Journal of Biological Chemistry. 271 (49): 31251–4. doi:10.1074 / jbc.271.49.31251. PMID 8940128.
^ ^A ^b "Entrez Gene: TNR tenascin R (restriktin, janusin)".
^ Erickson HP (říjen 1993). „Tenascin-C, tenascin-R a tenascin-X: rodina talentovaných proteinů při hledání funkcí“. Současný názor na buněčnou biologii. 5 (5): 869–76. doi:10.1016 / 0955-0674 (93) 90037-Q. PMID 7694605.

Další čtení

Erickson HP (říjen 1993). „Tenascin-C, tenascin-R a tenascin-X: rodina talentovaných proteinů při hledání funkcí“. Současný názor na buněčnou biologii. 5 (5): 869–76. doi:10.1016 / 0955-0674 (93) 90037-Q. PMID 7694605.
Xiao ZC, Taylor J, Montag D, Rougon G, Schachner M (duben 1996). „Výrazné účinky rekombinantních domén tenascinu-R na funkce neuronových buněk a identifikace domény interagující s neuronální rozpoznávací molekulou F3 / 11“. Evropský žurnál neurovědy. 8 (4): 766–82. doi:10.1111 / j.1460-9568.1996.tb01262.x. PMID 9081628.
Aspberg A, Miura R, Bourdoulous S, Shimonaka M, Heinegârd D, Schachner M, Ruoslahti E, Yamaguchi Y (září 1997). „Lektinové domény lektikanu typu C, rodina agregujících proteoglykanů chondroitinsulfátu, váží tenascin-R prostřednictvím interakcí protein-protein nezávisle na sacharidové části.“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 94 (19): 10116–21. doi:10.1073 / pnas.94.19.10116. PMC 23322. PMID 9294172.
Xiao ZC, Hillenbrand R, Schachner M, Thermes S, Rougon G, Gomez S (září 1997). "Signální události po interakci neuronové adhezní molekuly F3 s N-terminální doménou tenascinu-R". Journal of Neuroscience Research. 49 (6): 698–709. doi:10.1002 / (SICI) 1097-4547 (19970915) 49: 6 <698 :: AID-JNR4> 3.0.CO; 2-2. PMID 9335257.
Arrigo G, Gherzi R, Bonaglia MC, Leprini A, Zuffardi O, Zardi L (1997). „Přiřazení genu pro tenascin-R (Tnr) k pásmu E2 myšího chromozomu 4 pomocí fluorescenční in situ hybridizace; upřesnění polohy lidského TNR na chromozom 1q24“. Cytogenetika a genetika buněk. 78 (2): 145–6. doi:10.1159/000134650. PMID 9371410.
Volkmer H, Zacharias U, Nörenberg U, Rathjen FG (srpen 1998). „Disekce komplexních molekulárních interakcí neurofascinu s axoninem-1, F11 a tenascinem-R, které podporují připojení a tvorbu neuritů tektálních buněk“. The Journal of Cell Biology. 142 (4): 1083–93. doi:10.1083 / jcb.142.4.1083. PMC 2132869. PMID 9722619.
Zamze S, Harvey DJ, Pesheva P, Mattu TS, Schachner M, Dwek RA, Wing DR (srpen 1999). „Glykosylaci CNS specifického extracelulárního glykoproteinu matrix, tenascinu-R, dominují O-vázané sialylované glykany a„ mozkové “neutrální N-glykany“. Glykobiologie. 9 (8): 823–31. doi:10.1093 / glycob / 9.8.823. PMID 10406848.
Olin AI, Mörgelin M, Sasaki T, Timpl R, Heinegård D, Aspberg A (leden 2001). „Proteoglykany agrekan a Versican vytvářejí sítě s fibulinem-2 prostřednictvím vazby na lektinovou doménu“. The Journal of Biological Chemistry. 276 (2): 1253–61. doi:10,1074 / jbc.M006783200. PMID 11038354.
Xu XR, Huang J, Xu ZG, Qian BZ, Zhu ZD, Yan Q, Cai T, Zhang X, Xiao HS, Qu J, Liu F, Huang QH, Cheng ZH, Li NG, Du JJ, Hu W, Shen KT , Lu G, Fu G, Zhong M, Xu SH, Gu WY, Huang W, Zhao XT, Hu GX, Gu JR, Chen Z, Han ZG (prosinec 2001). „Pohled na hepatocelulární karcinogenezi na úrovni transkriptomu porovnáním profilů genové exprese hepatocelulárního karcinomu s profily odpovídajících nerakovinných jater“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 98 (26): 15089–94. doi:10.1073 / pnas.241522398. PMC 64988. PMID 11752456.
Woodworth A, Pesheva P, Fiete D, Baenziger JU (březen 2004). "Neuronově specifická syntéza a glykosylace tenascinu-R". The Journal of Biological Chemistry. 279 (11): 10413–21. doi:10,1074 / jbc.M312466200. PMID 14681222.
Bukalo O, Schachner M, Dityatev A (květen 2007). „Hipokampální metaplasticita vyvolaná nedostatkem extracelulární matrix glykoproteinu tenascin-R“. The Journal of Neuroscience. 27 (22): 6019–28. doi:10.1523 / JNEUROSCI.1022-07.2007. PMID 17537973.

Tento článek o gen na lidský chromozom 1 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000116147 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání Ensembl 89: ENSMUSG00000015829 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid8626505-5] Carnemolla B, Leprini A, Borsi L, Querzé G, Urbini S, Zardi L (duben 1996). "Lidský tenascin-R. Kompletní primární struktura, alternativní sestřih pre-mRNA a lokalizace genů na chromozomu 1q23-q24". The Journal of Biological Chemistry. 271 (14): 8157–60. doi:10.1074 / jbc.271.14.8157. PMID 8626505.

[pmid8940128-6] Leprini A, Gherzi R, Siri A, Querzé G, Viti F, Zardi L (prosinec 1996). „Lidský gen tenascin-R“. The Journal of Biological Chemistry. 271 (49): 31251–4. doi:10.1074 / jbc.271.49.31251. PMID 8940128.

[entrez-7] A ^b "Entrez Gene: TNR tenascin R (restriktin, janusin)".

[pmid7694605-8] Erickson HP (říjen 1993). „Tenascin-C, tenascin-R a tenascin-X: rodina talentovaných proteinů při hledání funkcí“. Současný názor na buněčnou biologii. 5 (5): 869–76. doi:10.1016 / 0955-0674 (93) 90037-Q. PMID 7694605.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]