F-ATPáza - F-ATPase
 | Bylo navrženo, aby tento článek byl sloučeny s ATP syntáza. (Diskutujte) Navrhováno od února 2020. |
| F-ATPáza | |
|---|---|
 Zjednodušený model F.ÓF1-ATPase alias ATP syntáza z E-coli. Podjednotky enzymu jsou odpovídajícím způsobem označeny | |
| Identifikátory | |
| Symbol | F-ATPáza |
| TCDB | 3.A.2 |
| OPM nadčeleď | 5 |
| OPM protein | 6fkf |
| Membranome | 227 |
F-ATPáza, také známý jako ATPáza typu F, je ATPáza /syntáza nachází se v bakteriích plazmatické membrány, v mitochondriální vnitřní membrány (v oxidační fosforylace, kde je znám jako Komplex V), a v chloroplast tylakoidní membrány. Používá a proton gradient k řízení syntézy ATP umožněním pasivního toku protonů přes membránu dolů po jejich elektrochemickém gradientu a pomocí energie uvolněné transportní reakcí k uvolnění nově vytvořeného ATP z aktivního místa F-ATPázy. Dohromady s V-ATPázy a A-ATPázy, F-ATPázy patří do nadčeledi příbuzných rotačních ATPázy.
F-ATPáza se skládá ze dvou domén:
- FÓ doména, která je integrální v membráně a skládá se ze 3 různých typů integrálních proteinů klasifikovaných jako a, b a c.[1]
- F1, který je periferní (na straně membrány, do které se protony pohybují). F1 se skládá z 5 polypeptidových jednotek α3β3γδε, které se vážou na povrch FÓ doména.[1]
F-ATPázy obvykle fungují jako ATP syntázy místo ATPáz v celulárních prostředích. To znamená, že obvykle vytváří ATP z protonového gradientu místo toho, aby pracoval v opačném směru, jako to obvykle dělají V-ATPázy. Občas se vracejí jako ATPázy v bakteriích.[2]
Struktura
FÓ-F1 částice jsou převážně tvořeny polypeptidy. F1-částice obsahuje 5 typů polypeptidů s poměrem složení - 3α: 3β: 1δ: 1γ: 1ε. FÓ má složení 1a: 2b: 12c. Společně tvoří rotační motor. Protože se protony vážou na podjednotky FÓ domény, způsobují rotaci jeho částí. Tato rotace se šíří „vačkovým hřídelem“ do polohy F.1 doména. ADP a Pi (anorganický fosfát) se spontánně váží na tři β podjednotky F1 doména, takže pokaždé, když projde rotací o 120 °, se uvolní ATP (rotační katalýza).
FÓ domény leží v membráně a překlenují fosfolipidovou dvojvrstvu, zatímco F1 Doména zasahuje do cytosolu buňky, aby se usnadnilo použití nově syntetizované ATP.
Hovězí mitochondriální F1-ATPase v komplexu s inhibitorový protein If1 je běžně citován v příslušné literatuře. Příklady jeho použití lze nalézt v mnoha buněčných základních metabolických činnostech, jako je acidóza a alkalóza a výměna dýchacích plynů.
O ve FÓ znamená oligomycin, protože oligomycin je schopen inhibovat svou funkci.
N-ATPáza
N-ATPázy jsou skupina ATPáz typu F bez a podjednotka delta / OSCP, nalezený v bakteriích a skupině archea prostřednictvím horizontálního přenosu genů. Transportují sodíkové ionty místo protonů a mají tendenci hydrolyzovat ATP. Tvoří odlišnou skupinu, která je dále na rozdíl od obvyklých F-ATPáz, než A-ATPázy jsou z V-ATPáz.[3]
Reference
- ^ A b Lodish H (2008). Molekulární buněčná biologie (Kindle ed.). W. H. Freeman. str.553.
- ^ Ren Q, Paulsen IT (2009). "Transport, Solute". Encyklopedie mikrobiologie (Třetí vydání.). Akademický tisk. str.529 –544. doi:10.1016 / B978-012373944-5.00107-3. ISBN 978-0-12-373944-5.
- ^ Dibrova, DV; Galperin, MY; Mulkidjanian, AY (15. června 2010). "Charakterizace N-ATPázy, zřetelné, laterálně přenesené Na + -translokační formy bakteriální membránové ATPázy typu F". Bioinformatika (Oxford, Anglie). 26 (12): 1473–6. doi:10.1093 / bioinformatika / btq234. PMID 20472544.