Tetrapeptid - Tetrapeptide - Wikipedia

Tetrapeptid (příklad Val -Gly -Ser -Ala ) s
zelená výrazný amino konec (L-valin ) a
modrý výrazný karboxylový konec (L-alanin ).

A tetrapeptid je peptid, klasifikovaný jako oligopeptid, protože se skládá pouze ze čtyř aminokyseliny připojil se peptidové vazby. Mnoho tetrapeptidů je farmakologicky aktivní, často vykazující afinitu a specificitu pro různé receptory v signalizaci protein-protein. V přírodě jsou přítomny lineární i cyklické tetrapeptidy (CTP), z nichž druhý napodobuje reverzní obraty proteinů, které se často vyskytují na povrchu proteinů a drogových cílů[1][2]. Tetrapeptidy mohou být cyklicky čtvrtou peptidovou vazbou nebo jinou kovalentní vazby.

Příklady tetrapeptidů jsou:

  • Tuftsin (L-threonyl-L-lysyl-L-prolyl-L-arginin) je peptid související primárně s imunitní systém funkce.
  • Rigin (glycyl-L-glutaminyl-L-prolyl-L-arginin) je tetrapeptid s funkcemi podobnými funkcím tuftsinu.
  • Postin (Lys-Pro-Pro-Arg) je N-koncový tetrapeptid z cystatin C. a antagonista tuftsinu.
  • Endomorfin-1 (H-Tyr-Pro-Trp-Phe-NH2) a endomorfin-2 (H-Tyr-Pro-Phe-Phe-NH2) jsou peptidové amidy s nejvyšší známou afinitou a specificitou pro μ opioidní receptor.
  • Morficeptin (H-Tyr-Pro-Phe-Pro-NH2) je kasomorphin peptid izolovaný z β-kasein.
  • Lepek exorfiny A4 (H-Gly-Tyr-Tyr-Pro-OH) a B4 (H-Tyr-Gly-Gly-Trp-OH) jsou peptidy izolované z lepek.
  • Tyrosin-MIF-1 (H-Tyr-Pro-Leu-Gly-NH2) je endogenní opioidní modulátor.
  • Tetragastrin (N- ((fenylmethoxy) karbonyl) -L-tryptofyl-L-methionyl-L-aspartyl-L-fenylalaninamid) je C-koncový tetrapeptid z gastrin. Jedná se o nejmenší peptidový fragment gastrinu, který má stejnou fyziologickou a farmakologickou aktivitu jako gastrin.
  • Kentsin (H-Thr-Pro-Arg-Lys-OH) je antikoncepční peptid nejprve izolovaný z žen křečci.
  • Achatin-I (kyselina glycyl-fenylalanyl-alanyl-asparagová) je neuroexcitační tetrapeptid z obří africký šnek (Achatina fulica).
  • Tentoxin (cyklo (N-methyl-L-alanyl-L-leucyl-N-methyl-trans-dehydrofenyl-alanyl-glycyl)) je přírodní cyklický tetrapeptid produkovaný fytopatogenními houbami rodu Alternaria.
  • Rapastinel (H-Thr-Pro-Pro-Thr-NH2) je částečný agonista z NMDA receptor.
  • HC-toxin, cyklo (D-Pro-L-Ala-D-Ala-L-Aeo), kde Aeo je 2-amino-8-oxo-9,10-epoxydekanová kyselina, je faktorem virulence pro houbu Cochliobolus carbonum na hostiteli, kukuřice.
  • Elamipretid, (D-Arg-dimethylTyr-Lys-Phe-NH2) kandidát na léčivo, který cílí mitochondrie.[3][4]

Viz také


Reference

  1. ^ Sage Arbor & Garland R. Marshall (2009). „Virtuální knihovna omezených cyklických tetrapeptidů, která napodobuje všechny čtyři orientace postranního řetězce pro více než polovinu reverzních obratů v proteinové databázi“. Journal of Computer-aided Molecular Design. 23 (2): 87–95. doi:10.1007 / s10822-008-9241-4. PMID  18797997.
  2. ^ Sage Arbor, Jeff Kao, Yun Wu & Garland R. Marshall (2008). „c [D-pro-Pro-D-pro-N-methyl-Ala] přijímá tuhou konformaci, která slouží jako lešení napodobující reverzní otáčky“. Biopolymery. 90 (3): 384–393. doi:10.1002 / bip.20869. PMID  17941003.CS1 maint: více jmen: seznam autorů (odkaz)
  3. ^ "Elamipretide". AdisInsight. Citováno 24. dubna 2017.
  4. ^ Kloner, RA; Shi, J; Dai, W (únor 2015). „Nové terapie ke snížení post-myokardiální remodelace levé komory“. Annals of Translational Medicine. 3 (2): 20. doi:10.3978 / j.issn.2305-5839.2015.01.13. PMC  4322169. PMID  25738140.