Geotrichum candidum - Geotrichum candidum

Geotrichum candidum
Geotrichum candidum
Geotrichum candidum
Vědecká klasifikace Upravit
Království:Houby
Divize:Ascomycota
Třída:Saccharomycetes
Objednat:Saccharomycetales
Rodina:Dipodascaceae
Rod:Geotrichum
Druh:
G. candidum
Binomické jméno
Geotrichum candidum
Odkaz (1809)
Synonyma
  • Galactomyces candidus

Geotrichum candidum je houba který je členem lidský mikrobiom, zejména spojený s kůží, sputem a výkaly, kde se vyskytuje u 25–30% vzorků.[1][2] Je běžný v půdě a byl izolován z půdy shromážděné po celém světě, na všech kontinentech.[1]

G. candidum je původcem lidské nemoci geotrichóza, nemoc rostlin kyselá hniloba který infikuje citrus ovoce, rajčata, mrkve a další zelenina.[3] Může ovlivnit sklizené ovoce durians jako Durio graveolens.[4]

G. candidum se široce používá při výrobě některých mléčných výrobků, včetně kůrových sýrů, jako je camembert, Saint-Nectaire, Reblochon a další. Houbu lze také nalézt v a Severské jogurt podobný produkt známý jako viili kde je zodpovědný za sametovou strukturu produktu.[5]

Ve studii z roku 2001 G. candidum bylo zjištěno, že konzumovat polykarbonát nalezen v CD.[6] Tento efekt však nebyl reprodukován.

Dějiny

Taxonomie

Rod Geotrichum popsal Johann Heinrich Friedrich Link v roce 1809 k umístění druhu G. candidum našel na rozpadajících se listech. Od té doby bylo v rodu popsáno více než 130 taxonů a byly vygenerovány stovky synonym.[7] Například, G. candidum byl nesprávně klasifikován jako Oidium lactis v hodně rané literatuře.[8] Druhy Geotrichum připomínají rody Trichosporon a Protendomycopsis; nicméně, Geotrichum je z ascomycetous přidružení, zatímco posledně jmenovaní jsou členy Basidiomycota. Druhy Geotrichum jsou občas mylně považovány za rychle rostoucí členy rodu Dipodascus, které se vyznačují nepravidelně rozvětvenými, 10–14 μm širokými hyfy a výroba single-spored asci. Na rozdíl od toho Geotrichum, členové rodu Dipodascus postrádají dichotomické větvení periferních hyf a jejich rychlosti růstu jsou obecně menší než 3 mm denně.[1]

Fylogeneze

Galactomyces candidus, o kterém se dříve myslelo, že je zřetelným taxonem, byl nalezen sexuální stav z G. candidum pomocí metod založených na sekvenci[9][10] Geotrichum candidum v širším smyslu zahrnuje 3 klady, odpovídající druhu G. candidum, G. clavatum a G. fici, o nichž se předpokládá, že mají patogenní potenciál.[5][2][11] Druhy Geotrichum lze odlišit sekvenční analýzou nukleární ribozomální velké podjednotky (18S ribozomální RNA ) nebo interní přepsaný spacer oblast genu nukleární ribozomální RNA.[9]

Morfologie

Anamorph

G. candidum kolonie jsou tenké, rozšiřující se, měkké, krémové a bílé v anamorf Stát.[12] Houba G. candidum je charakterizován hyfami, které se objevují plíživě, většinou ponořené a septatee.[1][13] Barva hyf se zdá být hyalinní nebo slabě pigmentovaný.[14] Když se hyfy stanou ve vzduchu, změní tvar arthroconidia na válcový nebo sudovitý nebo elipsoidní.[1] Chlamydospores jsou subglobózní, osamělí, neseni na nediferencovaných hyfách.[1][13] Blastokonidie někdy se vyvíjejí na hyfách laterálně.[1] Conidia vypadají jako artrosporózní, terminální nebo interkalární, vzdušné na povrchu agaru. The konidie velikost se pohybuje v rozmezí 4,8–12,5 μm x 2,4–2,5 μm.

Teleomorph

G. candidum je považován za homotalický ale většina izolátů je sama sterilní.[1] Sexuální reprodukce byla poprvé pozorována u kmenů izolovaných z půd v roce 2006 Portoriko.[15] Houba produkuje globózní asci, které obsahují jednu silnou zeď, jednojaderný kulovitě oválné askospora měřící 6–7 μm na 7–10 μm.[1] Askospory mají hladkou vnitřní stěnu a zvrásněnou vnější stěnu.[15] Septa jsou perforována mikrospory, uspořádané do kruhové struktury. Zdá se, že kolonie rostou rychleji v sexuálním stádiu než v asexuálním stádiu. Kolonie rostou rychlostí 5–7 mm denně při 24 ° C (75 ° F).[1]

Růst

Geotrichum candidum tvoří rychle rostoucí kolonii, která může za 5 dní dorůst do průměru 5–6 cm Sabouraud-glukóza agar, sladinový agar a syntetická média. Mikroskopicky je růst charakterizován produkcí dichotomicky rozvětvené hyfy, které se podobají ladičky podél okraje kolonií. Kondenzační řetězy jsou vzdušné, vztyčené nebo ležaté a měří 6–12 (−20) x 3–6 (−9) μm. Houba může růst na různých citrusových plodech a způsobit Sour Rot. Má tendenci způsobovat hnilobu u plodů, které jsou skladovány při teplotě 0–5 ° C (32–41 ° F). Konidie jsou bezbarvé a mají slizký povlak.[16] G. candidum je také občas nalezen v lidském střevě, výkaly, sputum a na kůži. Houba roste v půdě, ve vodě, v odpadních vodách, v různých rostlinných substrátech, v pekařském těstě, ve slupkách kvašení, v chlebu, v mléce a v mléčných výrobcích[1] Optimální teplota pro růst je 25 ° C (77 ° F) s rozsahem pH 5,0–5,5.[8] Teplotní rozsah se mění v závislosti na povrchu, na kterém houba roste. Například v rostlinách se optimální teplota pohybuje v rozmezí 25–27 ° C (77–81 ° F). U zvířat se optimální teplota pohybuje v rozmezí 30–31 ° C (86–88 ° F).[17] Maximální teplota pro růst je 35–38 ° C (95–100 ° F).[1][12] Růst hub lze podpořit pomocí D-glukóza, D-manóza, D-xylóza, L-sorbóza, D-fruktóza, D-galaktóza, sacharóza, D-mannitol, SorbitolD-sorbital, ethanol a glycerol. Sporulace často vyžaduje rovnováhu uhlíku a dusíku.[1]

Rozdělení

G. candidum je extrémně běžný v půdě a byl izolován od substrátů v roce 2006 Kanada, Spojené státy, Británie, Německo, Rakousko, Indie, Jižní Afrika, Japonsko, Brazílie a Peru.[1] Rovněž se nalézá jako původce kyselé hniloby v citrusových plodech - měkká hniloba spojená s vydáváním ovocného zápachu.[18] Houba je také známá jako posklizňový prostředek znehodnocení muškátového oříšku, tykve a okurky. Hraje roli v hnilobě rajčat, když je skladován při 0–5 ° C (32–41 ° F).[1]

Jedná se o přirozeně se vyskytujícího kolonistu určitých mléčných výrobků, zejména sýrů, a někdy se používá k naočkování pracích kůží a krvavá kůže sýry.[8][9][19]

Komerční použití

G. candidum lze komerčně použít k naočkování omývací kůže a krvavá kůže sýry.[8][9][19] Kultury lze přidat do mléka, solného roztoku nebo nastříkat na povrch sýra. Optimální rozmezí pH pro růst na sýru se pohybuje od 4,4 do 6,7. Houba v počátečních fázích zrání kolonizuje téměř celý povrch sýra. Nachází se na měkkých sýrech, jako je sýr Camembert a polotvrdý sýr Saint-Nectaire a Reblochon.[8] U sýra Camembert rostou houby na vnější straně sýra a tvoří kůru.[19] Houba je zodpovědná za jednotnou, bílou, sametovou srst Saint-Marcellin sýr.[8] Lipázy a proteázy z G. candidum uvolňují mastné kyseliny a peptidy, které sýru dodávají výrazné aroma. G. candidum snižuje hořkost v camembertském sýru prostřednictvím činnosti aminopeptidázy které hydrolyzují nízkomolekulární hydrofobní peptidy. Aminopeptidázy také přispívají k aroma tradičního Normana Camemberta. Houba také neutralizuje tvaroh katabolizací kyselina mléčná produkovaný bakteriemi. G. candidum připravuje sýr na kolonizaci dalších bakterií citlivých na kyselinu, jako je Brevibacterium. Houba inhibuje růst bakterií Listeria monocytogenes.[20] Komerční kmeny G. candidum jsou k dispozici pro zrání sýrů.[8]

Viz také

  • Organismy rozbíjející plasty

Reference

  1. ^ A b C d E F G h i j k l m n Ó Domsch, K.H .; W. Gams, W .; Andersen, T.H. (1980). Kompendium půdních hub (2. vyd.). Londýn, Velká Británie: Academic Press. ISBN  9780122204029.
  2. ^ A b "Geotrichum spp". Doktor houba. Archivovány od originál dne 1. listopadu 2010. Citováno 27. října 2014.
  3. ^ Thornton, C.R .; Slaughter, C.D .; Davis, R.M. (2010). „Detekce patogenů Sour-Rot Geotrichum candidum v rajčatech, ovoci a šťávě pomocí vysoce specifické metody ELISA založené na monoklonálních protilátkách “. International Journal of Food Microbiology. 143 (3): 166–172. doi:10.1016 / j.ijfoodmicro.2010.08.012. hdl:10871/13974. PMID  20850192.
  4. ^ Sivapalan, A .; Metussin, Rosidah; Harndan, Fuziah; Zain, Rokiah Mohd (prosinec 1998). "Houby spojené s posklizňovou hnilobou ovoce Durio graveolens a D. kutejensis v Bruneji “. Australasian Plant Pathology. 27 (4): 274–277. doi:10.1071 / AP98033. ISSN  1448-6032. OCLC  204773204.
  5. ^ A b Etienne A, Datry A, Gaspar N a kol. (Květen 2008). „Úspěšné zacházení s diseminovanými Geotrichum capitatum Infekce kombinací kaspofunginu a vorikonazolu u pacientů se sníženou imunitou ". Mykózy. 51 (3): 270–2. doi:10.1111 / j.1439-0507.2007.01484.x. PMID  18399909. Archivovány od originál dne 2013-01-23.
  6. ^ Bosch, Xavier (2001-06-27). "Houba jí CD". Zprávy o přírodě. doi:10.1038 / novinky010628-11.
  7. ^ Anonymní. "Geotrichum". MycoBank.
  8. ^ A b C d E F G Boutrou, R; Gueguen, M (2005). "Zájmy v Geotrichum candidum pro sýrovou technologii “. International Journal of Food Microbiology. 102 (1): 1–20. doi:10.1016 / j.ijfoodmicro.2004.12.028. PMID  15924999.
  9. ^ A b C d Alper, já; Michel, F; Labrie, S (2011). „Polymorfismy ribozomální DNA v kvasnicích Geotrichum candidum". Houbová biologie. 115 (12): 1259–1269. doi:10.1016 / j.funbio.2011.09.002. PMID  22115445.
  10. ^ Sybren de Hoog, G; Smith, M. T (2004). "Ribozomální fylogeneze a vymezení druhů v roce 2006" Geotrichum a jeho teleomorfy “. Studie v mykologii. 50: 489–515.
  11. ^

    externí odkazy

    Další čtení

    • Domsch, K.H., W. Gams a T.H. Anderson (1980) Kompendium půdních hub Svazek 1, Academic Press, Londýn, Velká Británie

    [https://web.archive.org/web/20111228202756/http://www.mycology.adelaide.edu.au/Fungal_Descriptions/Hyphomycetes_(hyaline)/Geotrichum/ archivováno 2011-12-28 na Wayback Machine Mykologie online, University of Adelaide, jižní Austrálie ]

  12. ^ A b Cibule, A.H.S .; Allsopp, D .; Eggins, H.O.W. (1981). Smithův úvod do průmyslové mykologie (7. vydání). Londýn, Velká Británie: Arnold. ISBN  978-0-7131-2811-6.
  13. ^ A b Watanabe, Tsuneo. (2010). Obrazový atlas půdních a semenných hub (3. vyd.). Baca Raton, FL: CRC Press. ISBN  9781439804193.
  14. ^ Barron, GL (1968). Rody Hyphomycetes z půdy. Baltimore, MD: Williams & Wilkins. ISBN  9780882750040.
  15. ^ A b Kwon-Chung, K.J .; Bennett, J. E.; Bennett, John E. (1992). Lékařská mykologie. Philadelphia: Lea & Febiger. ISBN  978-0812114638.
  16. ^ Malloch, David (1981). Formy: jejich izolace, kultivace a identifikace. Toronto, ON: University of Toronto Press. ISBN  978-0802024183.
  17. ^ Samson, R.A .; Hoekstra, E.S .; Oorschot, C.A.N (1984). Úvod do potravinářských hub (2. vyd.). Nizozemsko: Centraalbureau voor Schimmelcultures: Ústav Nizozemské královské akademie umění a věd.
  18. ^ Mdaini, N; Gargo, M; Hammami, M; Monser, L; Hamdi, M (2006). "Produkce přírodní ovocné vůně Geotrichum candidum". Aplikovaná biochemie a biotechnologie. 128 (3): 127–136. doi:10,1385 / abab: 128: 3: 227.
  19. ^ A b C Moore-Landecke, Elizabeth (1972). Základy hub. Englewood Cliffs, N.J .: Prentice-Hall Incorporated. ISBN  978-0-13-339267-8.
  20. ^ Marcellino, N; Beuvier, E; Grappin, R; Gueguen, M; Benson, D.R. (2001). "Rozmanitost Geotrichum candidum Kmeny izolované od tradičních výrob sýrů ve Francii “. Aplikovaná a environmentální mikrobiologie. 67 (10): 4752–4759. CiteSeerX  10.1.1.318.3482. doi:10.1128 / aem.67.10.4752-4759.2001. PMC  93228. PMID  11571181.

Pahwa, S; Kaur, S; Jain, R; Roy, N (2010). "Strukturovaný design nových inhibitorů pro histidinol dehydrogenázu z Geotrichum candidum". Bioorg Med Chem Lett. 20: 3972–6. doi:10.1016 / j.bmcl.2010.04.116. PMID  20488699.