Propionigenium modestum - Propionigenium modestum
Propionigenium modestum | |
---|---|
Vědecká klasifikace | |
Království: | |
Kmen: | |
Třída: | |
Objednat: | |
Rodina: | |
Rod: | |
Druh: | P. modestum |
Binomické jméno | |
Propionigenium modestum Schink a Pfennig 1983 |
Propionigenium modestum je gramnegativní, přísně anaerobní organismus.[1] Má tvar tyče a velikost přibližně 0,5-0,6 x 0,5-2,0 μm.[1] Je to důležité při objasnění mechanismu ATP syntáza.
Etymologie
Slovo propionigenium pochází z latinského slova acidum propionicum, což znamená kyselinu propionovou a žánr je latina pro výrobu nebo výrobu.[1] Modestus pochází z latinského slova, které znamená skromný, a odkazuje na extrémně skromný typ metabolismu.[1]
Taxonomické informace
Propionigenium modestum aktuální klasifikace je Bacteria, Fusobacteria, Fusobacteria, Fusobacteriales, Fusobacteriaceae, Propionigenium, Modestum. Propionigenium modestum aPropionigenium maris, v současné době jsou jedinými dvěma druhy patřícími do roduPropionigenium.[2] Oba žijí v mořském prostředí.[3] P. modestum bylo zjištěno, že má užší vztah kIlyobacter insetus než to má býtP. maris. P. modestum a I. insetus podíl 97 ± 4 - 98 ± 5% 16S rRNA (ribozomální ribonukleová kyselina), zatímco P. modestum a P. maris podíl pouze 96 ± 5 - 96 ± 8%.[4] Pouze u dvou druhů z čeledi Fusobacteriaceae byly sekvenovány celé jejich genomy; jedna bytost llyobacter polytropus.[5]
Objev
P. skromný byl izolován Bernhardem Schinkem a Norbertem Pfenningem v roce 1982.[1] Poprvé to bylo izolováno z černé, anaerobní bláto z Canale Grande v italských Benátkách a později byl izolován od lidských slin.[1] Původní izolace P. skromný byl získán prostřednictvím sukcinátového média, které bylo použito jako primární zdroj energie. Bylo hlášeno, že na každý mol sukcinátu, který byl fermentován P. sady režimů, bylo z média izolováno mezi 2,1 a 2,4 gramy suché hmotnosti buněk.[1]
Vlastnosti
P. modestum je nesporující a nepohyblivé bakterie.[1] Optimum jeho růstu je pH 7,1-7,7 a teplota 33 ° C.[1] Obsah G + C je 33,9%.[1] Využívá k růstu sukcinát, fumarát, malát, aspartát, oxaloacetát a pyruvát a fermentuje je na propionát (octan) a oxid uhličitý (CO2).[1] Tento organismus optimálně roste ve sladké i slané vodě i v lidských slinách za anaerobních podmínek.[1] Propionigenium modestum převádí sukcinát (stejně jako jiné zdroje energie) na propionát za účelem výroby energie.[6] Konverze má malou změnu volné energie, takže neexistuje žádný elektronový transportní řetězec nebo fosforylace spojená se substrátem.[1]
Důležitost
ATPázy typu F. (Adenylpyrofosfatáza) obvykle používá protony jako jediný vazebný ion, ale F1F0 ATPáza z Propionigenium modestum je první objevený, který používá ionty sodíku (Na+).[7][8]
Objev ATPázy v P. modestum je důležité, protože prokázalo, že chemiosmóza teorie, jak navrhuje Peter D. Mitchell bylo nesprávné. Mitchell navrhl, aby H+ byl spotřebován při syntéze ATP přímou reakcí s O2 převedením na H2O při výrobě ATP z ADP.[9] Místo toho F-typ ATPáza P. modestum používá pouze Na+ řídit reakci, demonstrovat produkci H2O z O2 během syntézy ATP nespotřebovává H+ používaný všemi ostatními známými ATPázami typu F.[7] Tím se prokazuje, že jde o H+ gradient, který řídí ATP syntáza.
Aktivita
ATPáza z P. modestum působí asi 6krát více než bakteriální membrány při 6,6 jednotkách / mg bílkoviny.[10] ATPáza se skládá z podjednotek a, b a c. Bylo zjištěno, že podjednotka c je extrémně stabilní a během SDS (sodná sůl dodecylsulfátu) nedisociuje Gelová elektroforéza do 120 ° C.[10]
Reference
- ^ A b C d E F G h i j k l m Schink, Bernhard; Pfennig, Norbert (1982). „Propionigenium Modestum Gen. Nov. Sp. Nov. a nová přísně anaerobní, nesporující bakterie rostoucí na sukcinátu“ (PDF). Archiv mikrobiologie. 133 (3): 209–216. doi:10.1007 / bf00415003.
- ^ Schink, Bernhard (2006). "Rod Propionigenium". Prokaryotes. 7: 955–959. doi:10.1007/0-387-30747-8_41. ISBN 9780387254975.
- ^ Janssen, Peter H .; Liesack, Werner (1995). „Sukcinátová dekarboxylace Propionigenium maris sp. Nov., Nová anaerobní bakterie bakterie z usazeniny v ústí řeky“. Arch Microbiol. 164 (1): 29–35. doi:10,1007 / s002030050232. PMID 7646317.
- ^ Brune, Andreas; Ludwig, Wolfgang; Kaim, Georg; Schink, Bernhard; Evers, Stephan (2002). „Ilyobacter insuetus Sp. Nov., fermentační bakterie specializovaná na degradaci hydroaromatických sloučenin“. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 52 (2): 429–432. doi:10.1099/00207713-52-2-429. PMID 11931152.
- ^ Sikorski, Johannes; Chertkov, Olga; Lapidus, Alla; ... (2010). "Kompletní sekvence genomu kmene typu Ilyobacter polytropus (CuHbu1T)". Standardy v genomických vědách. 3 (3): 304–314. doi:10,4056 / sigs.1273360. PMC 3035301. PMID 21304735.CS1 maint: číselné názvy: seznam autorů (odkaz)
- ^ Hilpert, Wilhelm; Schink, Bernhard; Dimroth, Peter (1984). „Život novým mechanismem zachování energie závislým na dekarboxylaci s Na + jako vazebným iontem“. Časopis EMBO. 3 (8): 1655–1670. doi:10.1002 / j.1460-2075.1984.tb02030.x. PMC 557580. PMID 16453537.
- ^ A b Laubinger, Werner; Dimroth, Peter (1988). "Charakterizace ATP syntázy Propionigenium modestum jako primární sodíkové pumpy". Biochemie. 27 (19): 7531–7537. doi:10.1021 / bi00419a053. PMID 2905167.
Werner Laubinger a Peter Dimroth
- ^ Kaim, Georg (2001). „Na-translokační F1F0 ATP syntáza propionigenium modestum: mechanochemický pohled na motor F0, který řídí syntézu ATP“. Bioenergetika. 1505 (1): 94–107. doi:10.1016 / s0005-2728 (00) 00280-2. PMID 11248192.
- ^ Mitchell, Peter D. (1974). "Chemiosmotický molekulární mechanismus pro proton-translokační adenosintrifosfatázy". FEBS Lett. Amsterdam: North Holland Publishing Company. 43 (2): 189–94. doi:10.1016 / 0014-5793 (74) 80997-x. PMID 4277328.
- ^ A b Laubinger, Werner; Dimroth, Peter (1988). "Charakterizace ATP syntázy Propionigenium modestum jako primární sodíkové pumpy". Biochemie. 27 (19): 7531–7537. doi:10.1021 / bi00419a053. PMID 2905167.
mitchell febs lett 43 189
Další čtení
- P. Dimroth (Červenec 1992). „ATPázy Propionigenium modestum a Bacillus alcalophilus. Strategie pro syntézu ATP za nízkoenergetických podmínek“. Biochimica et Biophysica Acta. 1101 (2): 236–239. doi:10.1016 / 0005-2728 (92) 90234-s. PMID 1385980.
- Laubinger, Werner; Dimroth, Peter (1989). „Sodný iont translokační adenosintrifosfatáza z Propionigenium modestum pumpuje protony při nízkých koncentracích iontů sodíku“. Biochemie. 28 (18): 7194–7198. doi:10.1021 / bi00444a010. ISSN 0006-2960. PMID 2554965.
- Dimroth, P .; Wang, H .; Grabe, M .; Oster, G. (1999). „Transdukce energie v sodné F-ATPáze Propionigenium modestum“. Sborník Národní akademie věd. 96 (9): 4924–4929. Bibcode:1999PNAS ... 96.4924D. doi:10.1073 / pnas.96.9.4924. ISSN 0027-8424. PMC 21793. PMID 10220395.