ACADVL - ACADVL

ACADVL
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2UXW, 3B96
Identifikátory
Aliasy	ACADVL, acyl-CoA dehydrogenáza, velmi dlouhý řetězec, ACAD6, LCACD, VLCAD, acyl-CoA dehydrogenáza velmi dlouhý řetězec
Externí ID	OMIM: 609575 MGI: 895149 HomoloGene: 5 Genové karty: ACADVL
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 17 (lidský)
Konec	7,225,266 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 11 (myš)
Konec	70,015,411 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita oxidoreduktázy působící na skupinu CH-CH dárců; • aktivita acyl-CoA dehydrogenázy; • aktivita oxidoreduktázy; • vazba flavinadenin dinukleotidů; • aktivita acyl-CoA dehydrogenázy s dlouhým řetězcem; • vazba mastných-acyl-CoA; • aktivita acyl-CoA dehydrogenázy s velmi dlouhým řetězcem;
Buněčná složka	• membrána; • mitochondriální matice; • jádro; • mitochondrie; • mitochondriální vnitřní membrána; • mitochondriální nukleoid; • buněčné jádro; • cytosol; • mitochondriální membrány;
Biologický proces	• diferenciace epiteliálních buněk; • negativní regulace procesu biosyntézy mastných kyselin; • metabolismus lipidů; • negativní regulace oxidace mastných kyselin; • derivace energie oxidací organických sloučenin; • metabolický proces mastných kyselin; • regulace metabolismu cholesterolu; • Rozvinutá proteinová reakce zprostředkovaná IRE1; • beta-oxidace mastných kyselin; • homeostáza teploty; • oxidačně-redukční proces; • katabolický proces mastných kyselin; • reakce na chlad; • beta-oxidace mastných kyselin pomocí acyl-CoA dehydrogenázy;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	37
	11370
	ENSG00000072778
	ENSMUSG00000018574
	P49748
	P50544
	NM_000018; NM_001033859; NM_001270447; NM_001270448
	NM_017366
	NP_000009; NP_001029031; NP_001257376; NP_001257377
	NP_059062
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Specifická acyl-CoA dehydrogenáza s velmi dlouhým řetězcem, mitochondriální (VLCAD) je enzym, který je u lidí kódován ACADVL gen.

Mutace v ACADVL jsou spojeny s nedostatek acyl-koenzymu A dehydrogenázy s velmi dlouhým řetězcem. The protein kódovaný tímto genem je zaměřen na vnitřní mitochondriální membrána, kde katalyzuje první krok beta-oxidační dráhy mitochondriální mastné kyseliny. Tento acyl-koenzym A dehydrogenáza je specifický pro mastné kyseliny s dlouhým řetězcem a velmi dlouhým řetězcem. Nedostatek tohoto genového produktu snižuje beta-oxidaci mastných kyselin myokardu a je s ním spojen kardiomyopatie. Výsledkem alternativního sestřihu je více variant transkriptu kódujících různé izoformy.^[5]

Struktura

Gen ACADVL obsahuje 20 exony,^[6] a je dlouhý přibližně 5,4 kb.^[7] VLCAD má zajímavou genovou strukturu u lidí, která se nachází v přímé struktuře s DLG4 gen zapnutý Chromozom 17 a že transkribované oblasti těchto genů se překrývají. Bylo prokázáno, že léčba DEHP vede k upregulaci minimálním promotorem.^[8] Zatímco DLG4 a VLCAD sdílejí společné regulační prvky, každý z nich má samostatné a odlišné tkáňově specifické prvky, které udělují jejich funkci. U myší jsou tyto dva geny orientovány head-to-head, ale nepřekrývají se.^[7]

Funkce

Enzym VLCAD katalyzuje většinu beta-oxidace mastných kyselin tvorbou trans-dvojné vazby C2-C3 v mastné kyselině. VLCAD je specifický pro mastné kyseliny s velmi dlouhým řetězcem, obvykle C16-acylCoA a delší.^[9] U myší, které mají nedostatek VLCAD, je v játrech málo až žádná hyperacetylace proteinů; to znamená, že protein VLCAD je také nezbytný pro acetylace bílkovin v tomto biologickém systému.^[10]

Klinický význam

ACADVL je propojen s nedostatek acyl-koenzymu A dehydrogenázy s velmi dlouhým řetězcem (VLCADD), který má mnoho příznaků a obvykle se projevuje jako jeden ze tří fenotypy. První je závažný, s počátkem dětství a vysokou úmrtností; nejčastějším příznakem je tato forma kardiomyopatie. Druhá je dětská forma s pozdním nástupem, s mírnějšími příznaky, které se nejčastěji projevují jako hypoketotická hypoglykemie. Konečná podoba se projevuje v dospělosti a představuje izolované zapojení kosterního svalstva, rhabdomyolýza, a myoglobinurie, který je vyvolán cvičením nebo nalačno.^[11] Onemocnění je obvykle diagnostikováno nejprve provedením tandemová hmotnostní spektrometrie na krevním vzorku pacienta během období stresu a poté provedením molekulárně genetického testování na přítomnost genu ACADVL. Nedostatek je léčen systematicky, ale za určitých podmínek, jako je půst podráždění myokardu, dehydratace a ve snaze zabránit sekundárním komplikacím se vyhýbáme dietám s vysokým obsahem tuku.^[12]

Interakce

Bylo prokázáno, že ACADVL má 75 binárních interakce protein-protein včetně 73 společných interakcí. Zdá se, že ACADVL interaguje s RPSA a GPHN.^[13]

Viz také

Acyl CoA dehydrogenáza

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000072778 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000018574 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ "acyl-CoA dehydrogenáza, velmi dlouhý řetězec".
^ Strauss AW, Powell CK, Hale DE, Anderson MM, Ahuja A, Brackett JC, Sims HF (listopad 1995). „Molekulární podstata deficitu lidské mitochondriální deficience acyl-CoA dehydrogenázy s velmi dlouhým řetězcem způsobující kardiomyopatii a náhlou smrt v dětství“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 92 (23): 10496–500. doi:10.1073 / pnas.92.23.10496. PMC 40638. PMID 7479827.
^ ^A ^b Zhou C, Blumberg B (únor 2003). "Překrývající se genová struktura lidských VLCAD a DLG4". Gen. 305 (2): 161–6. doi:10.1016 / s0378-1119 (02) 01235-0. PMID 12609736.
^ Zhang LF, Ding JH, Yang BZ, He GC, Roe C (prosinec 2003). "Charakterizace oblasti obousměrného promotoru mezi lidskými geny kódujícími VLCAD a PSD-95". Genomika. 82 (6): 660–8. doi:10.1016 / s0888-7543 (03) 00211-8. PMID 14611808.
^ Aoyama T, Souri M, Ushikubo S, Kamijo T, Yamaguchi S, Kelley RI, Rhead WJ, Uetake K, Tanaka K, Hashimoto T (červen 1995). „Čištění lidského acyl-koenzymu A dehydrogenázy s velmi dlouhým řetězcem a charakterizace jejího nedostatku u sedmi pacientů“. The Journal of Clinical Investigation. 95 (6): 2465–73. doi:10,1172 / JCI117947. PMC 295925. PMID 7769092.
^ Pougovkina O, te Brinke H, Ofman R, van Cruchten AG, Kulik W, Wanders RJ, Houten SM, de Boer VC (červenec 2014). „Acetylace mitochondriálních proteinů je řízena acetyl-CoA z oxidace mastných kyselin“. Lidská molekulární genetika. 23 (13): 3513–22. doi:10,1093 / hmg / ddu059. PMID 24516071.
^ Andresen BS, Olpin S, Poorthuis BJ, Scholte HR, Vianey-Saban C, Wanders R, Ijlst L, Morris A, Pourfarzam M, Bartlett K, Baumgartner ER, deKlerk JB, Schroeder LD, Corydon TJ, Lund H, Winter V, Bross P, Bolund L, Gregersen N (únor 1999). „Jasná korelace genotypu s fenotypem choroby u deficitu acyl-CoA dehydrogenázy s velmi dlouhým řetězcem“. American Journal of Human Genetics. 64 (2): 479–94. doi:10.1086/302261. PMC 1377757. PMID 9973285.
^ Leslie, N. D .; Valencia, C. A .; Strauss, A. W .; Zhang, K .; Adam, M. P .; Ardinger, H. H .; Pagon, R. A .; Wallace, S.E .; Fazole LJH; Stephens, K .; Amemiya, A. (1993). „Deficit acyl-koenzymu a dehydrogenázy s velmi dlouhým řetězcem“. PMID 20301763. Citovat deník vyžaduje | deník = (Pomoc)
^ "Pro hledaný výraz ACADVL bylo nalezeno 75 binárních interakcí". Databáze molekulárních interakcí IntAct. EMBL-EBI. Citováno 2018-08-24.

Další čtení

Costa CG, Dorland L, de Almeida IT, Jakobs C, Duran M, Poll-The BT (červen 1998). „Vliv půstu, zatížení triglyceridů s dlouhým řetězcem a zatížení karnitinu na plazmatické hladiny acylkarnitinu s dlouhým řetězcem u deficitu mitochondrií s velmi dlouhým řetězcem acyl-CoA dehydrogenázy. Journal of Inherited Metabolic Disease. 21 (4): 391–9. doi:10.1023 / A: 1005354624735. PMID 9700596. S2CID 2198523.

externí odkazy

GeneReviews / NCBI / NIH / UW vstup na deficit acyl-koenzym A dehydrogenázy s velmi dlouhým řetězcem
Člověk ACADVL umístění genomu a ACADVL stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000072778 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000018574 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[entrez-5] "acyl-CoA dehydrogenáza, velmi dlouhý řetězec".

[6] Strauss AW, Powell CK, Hale DE, Anderson MM, Ahuja A, Brackett JC, Sims HF (listopad 1995). „Molekulární podstata deficitu lidské mitochondriální deficience acyl-CoA dehydrogenázy s velmi dlouhým řetězcem způsobující kardiomyopatii a náhlou smrt v dětství“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 92 (23): 10496–500. doi:10.1073 / pnas.92.23.10496. PMC 40638. PMID 7479827.

[Zhou_2003-7] A ^b Zhou C, Blumberg B (únor 2003). "Překrývající se genová struktura lidských VLCAD a DLG4". Gen. 305 (2): 161–6. doi:10.1016 / s0378-1119 (02) 01235-0. PMID 12609736.

[8] Zhang LF, Ding JH, Yang BZ, He GC, Roe C (prosinec 2003). "Charakterizace oblasti obousměrného promotoru mezi lidskými geny kódujícími VLCAD a PSD-95". Genomika. 82 (6): 660–8. doi:10.1016 / s0888-7543 (03) 00211-8. PMID 14611808.

[9] Aoyama T, Souri M, Ushikubo S, Kamijo T, Yamaguchi S, Kelley RI, Rhead WJ, Uetake K, Tanaka K, Hashimoto T (červen 1995). „Čištění lidského acyl-koenzymu A dehydrogenázy s velmi dlouhým řetězcem a charakterizace jejího nedostatku u sedmi pacientů“. The Journal of Clinical Investigation. 95 (6): 2465–73. doi:10,1172 / JCI117947. PMC 295925. PMID 7769092.

[10] Pougovkina O, te Brinke H, Ofman R, van Cruchten AG, Kulik W, Wanders RJ, Houten SM, de Boer VC (červenec 2014). „Acetylace mitochondriálních proteinů je řízena acetyl-CoA z oxidace mastných kyselin“. Lidská molekulární genetika. 23 (13): 3513–22. doi:10,1093 / hmg / ddu059. PMID 24516071.

[11] Andresen BS, Olpin S, Poorthuis BJ, Scholte HR, Vianey-Saban C, Wanders R, Ijlst L, Morris A, Pourfarzam M, Bartlett K, Baumgartner ER, deKlerk JB, Schroeder LD, Corydon TJ, Lund H, Winter V, Bross P, Bolund L, Gregersen N (únor 1999). „Jasná korelace genotypu s fenotypem choroby u deficitu acyl-CoA dehydrogenázy s velmi dlouhým řetězcem“. American Journal of Human Genetics. 64 (2): 479–94. doi:10.1086/302261. PMC 1377757. PMID 9973285.

[12] Leslie, N. D .; Valencia, C. A .; Strauss, A. W .; Zhang, K .; Adam, M. P .; Ardinger, H. H .; Pagon, R. A .; Wallace, S.E .; Fazole LJH; Stephens, K .; Amemiya, A. (1993). „Deficit acyl-koenzymu a dehydrogenázy s velmi dlouhým řetězcem“. PMID 20301763. Citovat deník vyžaduje | deník = (Pomoc)

[13] "Pro hledaný výraz ACADVL bylo nalezeno 75 binárních interakcí". Databáze molekulárních interakcí IntAct. EMBL-EBI. Citováno 2018-08-24.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]