ACADM - ACADM

ACADM
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1EGC, 1 GRD, 1EGE, 1T9G, 2A1T, 4P13
Identifikátory
Aliasy	ACADM, acyl-CoA dehydrogenáza, C-4 až C-12 s přímým řetězcem, ACAD1, MCAD, MCADH, střední řetězec acyl-CoA dehydrogenázy
Externí ID	OMIM: 607008 MGI: 87867 HomoloGene: 3 Genové karty: ACADM
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 1 (lidský)
Konec	75,787,575 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 3 (myš)
Konec	153,944,632 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita oxidoreduktázy působící na skupinu CH-CH dárců; • aktivita acyl-CoA dehydrogenázy; • identická vazba na protein; • aktivita oxidoreduktázy; • aktivita acyl-CoA dehydrogenázy se středním řetězcem; • vazba flavinadenin dinukleotidů;
Buněčná složka	• axon; • mitochondrie; • extracelulární exosom; • buněčné jádro; • jaderná skvrna; • mitochondriální matice; • mitochondriální membrány;
Biologický proces	• metabolický proces mastných kyselin se středním řetězcem; • metabolismus lipidů; • beta-oxidace mastných kyselin pomocí acyl-CoA dehydrogenázy; • metabolický proces mastných kyselin; • metabolismus; • oxidačně-redukční proces; • proces biosyntézy karnitinu; • katabolický proces mastných kyselin se středním řetězcem; • karnitinový metabolický proces, spojený s CoA; • beta-oxidace mastných kyselin; • regulace metabolismu lipidů;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	34
	11364
	ENSG00000117054
	ENSMUSG00000062908
	P11310
	P45952
	NM_000016; NM_001127328; NM_001286042; NM_001286043; NM_001286044
	NM_007382
	NP_000007; NP_001120800; NP_001272971; NP_001272972; NP_001272973
	NP_031408
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

ACADM (acyl-koenzym A dehydrogenáza, C-4 až C-12 s přímým řetězcem) je gen který poskytuje pokyny pro výrobu enzymu zvaného acyl-koenzym A dehydrogenáza to je důležité pro rozložení (degradaci) určité skupiny tuků zvané mastné kyseliny se středním řetězcem.

Tyto mastné kyseliny se nacházejí v potravinách, jako jsou mléko a jisté oleje a jsou také uloženy v tukové tkáni těla. Mastné kyseliny se středním řetězcem se také produkují, když se odbourávají větší mastné kyseliny.

Acyl-koenzym A dehydrogenáza pro enzym mastných kyselin se středním řetězcem (ACADM) je nezbytný pro přeměnu těchto konkrétních mastných kyselin na energii, zejména během období bez jídla (nalačno). Enzym ACADM funguje v mitochondriích, centrech produkujících energii v buňkách. Nachází se v mitochondrie několika typů tkání, zejména játra.

Gen ACADM se nachází na krátkém (p) rameni chromozom 1 v poloze 31, od základní pár 75 902 302 na základní pár 75 941 203.

Struktura

Protein kódovaný ACADM Gen o velikosti ~ 47 kDa a složený ze 421 aminokyselin.^[5]

Funkce

Enzym LCAD katalyzuje většinu beta-oxidace mastných kyselin tvorbou trans-dvojné vazby C2-C3 v mastné kyselině. MCAD pracuje na mastných kyselinách s dlouhým řetězcem, obvykle mezi C4 a C12-acylCoA.^[6] Ukázalo se, že oxidace mastných kyselin šetří glukózu nalačno a je také nezbytná pro metabolismus aminokyselin, což je nezbytné pro udržení adekvátní produkce glukózy.^[7]

Klinický význam

Nedostatek acyl-koenzymu A dehydrogenázy se středním řetězcem může být způsobeno mutace v genu ACADM. Bylo identifikováno více než 30 mutací genu ACADM, které způsobují nedostatek acyl-koenzym A dehydrogenázy se středním řetězcem.^[8] Mnoho z těchto mutací mění aminokyselinový stavební blok v enzymu ACADM. Nejčastější aminokyselina substituce nahrazuje lysin s kyselina glutamová v pozici 329 v řetězci aminokyselin enzymu (také psaný jako Lys329Glu nebo K329E).^[9] Tato mutace a další substituce aminokyselin mění strukturu enzymu, snižují nebo ruší jeho aktivitu. Jiné mutace odstraňují nebo duplikují část genu ACADM, což vede k nestabilnímu enzymu, který nemůže fungovat.

Při nedostatku (deficitu) funkčního enzymu ACADM nelze mastné kyseliny se středním řetězcem degradovat a zpracovat. Výsledkem je, že tyto tuky nejsou přeměňovány na energii, což může vést k charakteristickým příznakům této poruchy, jako je nedostatek energie (letargie) a nízká hladina cukru v krvi. Hladiny mastných kyselin se středním řetězcem nebo částečně degradovaných mastných kyselin se mohou hromadit v tkáních a mohou poškodit játra a mozek a způsobit vážnější komplikace.^[10]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000117054 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000062908 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ https://www.uniprot.org/uniprot/P11310
^ Matsubara Y, Kraus JP, Yang-Feng TL, Francke U, Rosenberg LE, Tanaka K (září 1986). „Molekulární klonování cDNA kódujících krysí a lidskou acyl-CoA dehydrogenázu se středním řetězcem a přiřazení genu k lidskému chromozomu 1“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 83 (17): 6543–7. doi:10.1073 / pnas.83.17.6543. PMC 386540. PMID 3462713.
^ Goetzman ES, Alcorn JF, Bharathi SS, Uppala R, McHugh KJ, Kosmider B, Chen R, Zuo YY, Beck ME, McKinney RW, Skilling H, Suhrie KR, Karunanidhi A, Yeasted R, Otsubo C, Ellis B, Tyurina YY , Kagan VE, Mallampalli RK, Vockley J (duben 2014). „Nedostatek acyl-CoA dehydrogenázy s dlouhým řetězcem jako příčina dysfunkce plicní povrchově aktivní látky“. The Journal of Biological Chemistry. 289 (15): 10668–79. doi:10,1074 / jbc.M113.540260. PMC 4036448. PMID 24591516.
^ Pagon RA, Bird TD, Dolan CR a kol. (1993). "Nedostatek acyl-koenzymu a dehydrogenázy se středním řetězcem". PMID 20301597. Citovat deník vyžaduje | deník = (Pomoc)
^ Gregersen N, Andresen BS, Bross P, Winter V, Rüdiger N, Engst S, Christensen E, Kelly D, Strauss AW, Kølvraa S (duben 1991). „Molekulární charakterizace deficitu acyl-CoA dehydrogenázy (MCAD) se středním řetězcem: identifikace mutace lys329 na glu v genu MCAD a exprese neaktivního proteinu mutantního enzymu v E. coli“ (PDF). Genetika člověka. 86 (6): 545–51. doi:10.1007 / bf00201539. PMID 1902818.
^ Sturm M, Herebian D, Mueller M, MD Laryea, Spiekerkoetter U (2012). „Funkční účinky různých genotypů acyl-CoA dehydrogenázy se středním řetězcem a identifikace asymptomatických variant“. PLOS ONE. 7 (9): e45110. doi:10.1371 / journal.pone.0045110. PMC 3444485. PMID 23028790.

Další čtení

Gregersen N, Andresen BS, Corydon MJ, Corydon TJ, Olsen RK, Bolund L, Bross P (září 2001). „Mutační analýza v defektech oxidace mitochondriálních mastných kyselin: Zvýrazněna nedostatkem acyl-CoA dehydrogenázy se zvláštním zaměřením na vztah genotyp-fenotyp.“. Lidská mutace. 18 (3): 169–89. doi:10,1002 / humu.1174. PMID 11524729.
Wang SS, Fernhoff PM, Hannon WH, Khoury MJ (1999). „Epidemiologický přehled lidského genomu se středním řetězcem nedostatku acyl-CoA dehydrogenázy“. Genetika v medicíně. 1 (7): 332–9. doi:10.1097/00125817-199911000-00004. PMID 11263545.

externí odkazy

GeneReviews / NIH / NCBI / UW záznam o deficitu acyl-koenzym a dehydrogenázy se středním řetězcem
GeneCard
ACADM v databázi GDB lidského genomu
Člověk ACADM umístění genomu a ACADM stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000117054 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000062908 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[5] ttps://www.uniprot.org/uniprot/P11310

[6] Matsubara Y, Kraus JP, Yang-Feng TL, Francke U, Rosenberg LE, Tanaka K (září 1986). „Molekulární klonování cDNA kódujících krysí a lidskou acyl-CoA dehydrogenázu se středním řetězcem a přiřazení genu k lidskému chromozomu 1“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 83 (17): 6543–7. doi:10.1073 / pnas.83.17.6543. PMC 386540. PMID 3462713.

[7] Goetzman ES, Alcorn JF, Bharathi SS, Uppala R, McHugh KJ, Kosmider B, Chen R, Zuo YY, Beck ME, McKinney RW, Skilling H, Suhrie KR, Karunanidhi A, Yeasted R, Otsubo C, Ellis B, Tyurina YY , Kagan VE, Mallampalli RK, Vockley J (duben 2014). „Nedostatek acyl-CoA dehydrogenázy s dlouhým řetězcem jako příčina dysfunkce plicní povrchově aktivní látky“. The Journal of Biological Chemistry. 289 (15): 10668–79. doi:10,1074 / jbc.M113.540260. PMC 4036448. PMID 24591516.

[8] Pagon RA, Bird TD, Dolan CR a kol. (1993). "Nedostatek acyl-koenzymu a dehydrogenázy se středním řetězcem". PMID 20301597. Citovat deník vyžaduje | deník = (Pomoc)

[9] Gregersen N, Andresen BS, Bross P, Winter V, Rüdiger N, Engst S, Christensen E, Kelly D, Strauss AW, Kølvraa S (duben 1991). „Molekulární charakterizace deficitu acyl-CoA dehydrogenázy (MCAD) se středním řetězcem: identifikace mutace lys329 na glu v genu MCAD a exprese neaktivního proteinu mutantního enzymu v E. coli“ (PDF). Genetika člověka. 86 (6): 545–51. doi:10.1007 / bf00201539. PMID 1902818.

[10] Sturm M, Herebian D, Mueller M, MD Laryea, Spiekerkoetter U (2012). „Funkční účinky různých genotypů acyl-CoA dehydrogenázy se středním řetězcem a identifikace asymptomatických variant“. PLOS ONE. 7 (9): e45110. doi:10.1371 / journal.pone.0045110. PMC 3444485. PMID 23028790.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]