TRIM63 - TRIM63

TRIM63
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	3DDT, 4M3L, 2D8U
Identifikátory
Aliasy	TRIM63, IRF, MURF1, MURF2, RNF28, SMRZ, trojstranný motiv obsahující 63
Externí ID	OMIM: 606131 MGI: 2447992 HomoloGene: 41878 Genové karty: TRIM63
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 1 (lidský)
Konec	26,068,436 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 4 (myš)
Konec	134,329,629 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba iontů zinku; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba titinu; • aktivita převodníku signálu; • vazba kovových iontů; • aktivita ubikvitin-protein transferázy; • aktivita transferázy;
Buněčná složka	• cytoplazma; • M pásmo; • kontraktilní vlákno; • Z disk; • mikrotubuly; • buněčné jádro; • intracelulární;
Biologický proces	• atrofie kosterního svalstva; • svalová kontrakce; • reakce na glukokortikoidy; • reakce na interleukin-1; • ubikvitinace bílkovin; • reakce na elektrický stimul zapojený do regulace svalové adaptace; • signální transdukce; • negativní regulace hypertrofie srdečního svalu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	84676
	433766
	ENSG00000158022
	ENSMUSG00000028834
	Q969Q1
	Q38HM4
	NM_032588
	NM_001039048; NM_001369245
	NP_115977
	n / a
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

E3 ubikvitin-protein ligáza TRIM63, také známý jako "MuRF1" je enzym že u lidí je kódován TRIM63 gen.^[5]^[6]^[7]

Tento gen kóduje člena rodiny proteinů RING se zinkovým prstem, který se nachází ve pruhovaném svalu a duhovce. Produkt tohoto genu je lokalizován do mřížek Z-linie a M-linie myofibril, kde se titanové N-koncové a C-koncové oblasti vážou na sarkomeru. Studie vazby in vitro ukázaly, že tento protein se také váže přímo na titin v blízkosti oblasti kinázové aktivity obsahující titin. Další člen této rodiny proteinů se váže na mikrotubuly. Protože tito členové rodiny mohou tvořit heterodimery, naznačuje to, že tyto proteiny mohou sloužit jako spojovací článek mezi titinkinázou a signálními cestami závislými na mikrotubulech ve svalu.^[7]

Protein kódovaný genem Trim63 se také nazývá MuRF1. MuRF1 je název nejčastěji používaný v literatuře a znamená „Muscle RING Finger 1.“ Strukturálně existují dva úzce související MuRF, MuRF2 a MuRF3. Mají také kódy TRIM: MuRF2 je TRIM55; MuRF3 je TRIM54.

Interakce

Ukázalo se, že Trim63 / MuRF1 je E3 ubikvitinová ligáza. Jeho hlavním substrátem je Myosin Heavy Chain. MuRF1 je nadměrně regulován během atrofie kosterního svalstva - a tedy degradace těžkého řetězce myosinu, který je hlavní složkou sarkoméra, je důležitým mechanismem při rozpadu kosterního svalstva za atrofických podmínek. Ukázalo se, že MuRF1 je nadregulován během denervace, podávání glukokortikoidů, imobilizace a odlévání (pokud je na končetinu aplikován odlitek, aby došlo k jeho znehybnění). Všechny tyto léčby způsobují atrofii kosterního svalstva.

Ukázalo se, že TRIM63 komunikovat s Titin,^[5] GMEB1^[8] a SUMO2.^[6]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000158022 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000028834 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ ^A ^b Centner T, Yano J, Kimura E, McElhinny AS, Pelin K, Witt CC, Bang ML, Trombitas K, Granzier H, Gregorio CC, Sorimachi H, Labeit S (březen 2001). "Identifikace proteinů prstence specifických pro svaly jako potenciálních regulátorů domény titin kinázy". J Mol Biol. 306 (4): 717–26. doi:10.1006 / jmbi.2001.4448. PMID 11243782.
^ ^A ^b Dai KS, Liew CC (červen 2001). „Nový lidský pruhovaný protein RING se zinkovým prstem, SMRZ, interaguje s SMT3b prostřednictvím své domény RING“. J Biol Chem. 276 (26): 23992–9. doi:10,1074 / jbc.M011208200. PMID 11283016.
^ ^A ^b „Entrez Gene: TRIM63 tripartitní motiv obsahující 63“.
^ McElhinny AS, Kakinuma K, Sorimachi H, Labeit S, Gregorio CC (duben 2002). „Svalově specifický prsten RING-1 interaguje s titinem, aby reguloval sarkomickou M-linii a strukturu tlustého vlákna a může mít jaderné funkce prostřednictvím své interakce s glukokortikoidovým modulačním prvkem vázajícím protein-1“. J. Cell Biol. 157 (1): 125–36. doi:10.1083 / jcb.20010808989. PMC 2173255. PMID 11927605.

Další čtení

Bodine SC, Latres E, Baumhueter S, et al. (2001). "Identifikace ubikvitinových ligáz potřebných pro atrofii kosterního svalstva". Věda. 294 (5547): 1704–8. doi:10.1126 / science.1065874. PMID 11679633.
McElhinny AS, Kakinuma K, Sorimachi H a kol. (2002). „Svalově specifický prsten RING-1 interaguje s titinem, aby reguloval sarkomickou M-linii a strukturu tlustého vlákna a může mít jaderné funkce prostřednictvím své interakce s glukokortikoidovým modulačním prvkem vázajícím protein-1“. J. Cell Biol. 157 (1): 125–36. doi:10.1083 / jcb.20010808989. PMC 2173255. PMID 11927605.
Wistow G, Bernstein SL, Ray S a kol. (2002). „Exprimovaná analýza sekvenční značky dospělé lidské duhovky pro projekt NEIBank: faktory reakce na steroidy a podobnosti s pigmentovým epitelem sítnice“. Mol. Vis. 8: 185–95. PMID 12107412.
Pizon V, Iakovenko A, Van Der Ven PF a kol. (2003). „Přechodná asociace titinu a myosinu s mikrotubuly v rodících se myofibrilách řízená proteinem MURF2 RING-finger“. J. Cell Sci. 115 (Pt 23): 4469–82. doi:10.1242 / jcs.00131. PMID 12414993.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Kedar V, McDonough H, Arya R a kol. (2005). „Prstový prsten 1 specifický pro svaly je biko fidní ubikvitinová ligáza, která degraduje srdeční troponin I.“ Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 101 (52): 18135–40. doi:10.1073 / pnas.0404341102. PMC 539735. PMID 15601779.
Witt SH, Granzier H, Witt CC, Labeit S (2005). „MURF-1 a MURF-2 se zaměřují na specifickou podskupinu myofibrilárních proteinů redundantně: směrem k porozumění ubikvitinaci svalů závislé na MURF“. J. Mol. Biol. 350 (4): 713–22. doi:10.1016 / j.jmb.2005.05.021. PMID 15967462.
Gregory SG, Barlow KF, McLay KE a kol. (2006). „Sekvence DNA a biologická anotace lidského chromozomu 1“. Příroda. 441 (7091): 315–21. doi:10.1038 / nature04727. PMID 16710414.
Doucet M, Russell AP, Léger B a kol. (2007). „Svalová atrofie a signalizace hypertrofie u pacientů s chronickou obstrukční plicní nemocí“. Dopoledne. J. Respir. Krit. Care Med. 176 (3): 261–9. doi:10,1164 / rccm. 200605-704OC. PMID 17478621.

Tento článek o gen na lidský chromozom 1 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000158022 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000028834 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid11243782-5] A ^b Centner T, Yano J, Kimura E, McElhinny AS, Pelin K, Witt CC, Bang ML, Trombitas K, Granzier H, Gregorio CC, Sorimachi H, Labeit S (březen 2001). "Identifikace proteinů prstence specifických pro svaly jako potenciálních regulátorů domény titin kinázy". J Mol Biol. 306 (4): 717–26. doi:10.1006 / jmbi.2001.4448. PMID 11243782.

[pmid11283016-6] A ^b Dai KS, Liew CC (červen 2001). „Nový lidský pruhovaný protein RING se zinkovým prstem, SMRZ, interaguje s SMT3b prostřednictvím své domény RING“. J Biol Chem. 276 (26): 23992–9. doi:10,1074 / jbc.M011208200. PMID 11283016.

[entrez-7] A ^b „Entrez Gene: TRIM63 tripartitní motiv obsahující 63“.

[pmid11927605-8] McElhinny AS, Kakinuma K, Sorimachi H, Labeit S, Gregorio CC (duben 2002). „Svalově specifický prsten RING-1 interaguje s titinem, aby reguloval sarkomickou M-linii a strukturu tlustého vlákna a může mít jaderné funkce prostřednictvím své interakce s glukokortikoidovým modulačním prvkem vázajícím protein-1“. J. Cell Biol. 157 (1): 125–36. doi:10.1083 / jcb.20010808989. PMC 2173255. PMID 11927605.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]