TRIM15 - TRIM15

TRIM15
Identifikátory
Aliasy	TRIM15, RNF93, ZNF178, ZNFB7, tripartitní motiv obsahující 15
Externí ID	MGI: 1916347 HomoloGene: 23819 Genové karty: TRIM15
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 6 (lidský)
Konec	30,172,693 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 17 (myš)
Konec	36,867,210 bp
Exprese RNA vzor
	; ; ; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba iontů zinku; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba kovových iontů;
Buněčná složka	• intracelulární;
Biologický proces	• stanovení osudu mezodermální buňky; • pozitivní regulace aktivity sekvenčně specifického transkripčního faktoru vázajícího DNA; • vrozený imunitní systém; • pozitivní regulace signální dráhy RIG-I; • pozitivní regulace aktivity transkripčního faktoru NF-kappaB; • pozitivní regulace produkce interferonu typu I.; • negativní regulace intracelulárního transportu virového materiálu; • negativní regulace uvolňování viru z hostitelské buňky;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	89870
	69097
ENSG00000235960; ENSG00000227147; ENSG00000233599; ENSG00000204610; ENSG00000224145;
	ENSG00000235905; ENSG00000137384; ENSG00000235259
	ENSMUSG00000050747
	Q9C019
	n / a
	NM_033229; NM_052812
	NM_001024134; NM_001177872
	NP_150232
	n / a
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Protein obsahující trojstranný motiv 15 je protein že u lidí je kódován TRIM15 gen.^[5]^[6]^[7]^[8]

Protein kódovaný tímto genem je členem rodina tripartitních motivů (TRIM). Motiv TRIM zahrnuje tři domény vázající zinek, RING, B-box typu 1 a B-box typu 2 a oblast stočené cívky. Protein se lokalizuje do cytoplazmy. Jeho funkce nebyla identifikována. Alternativní sestřih tohoto genu vede ke dvěma variantám transkriptu kódujícím různé izoformy.^[8]

Reference

^ ^A ^b ^C ENSG00000227147, ENSG00000233599, ENSG00000204610, ENSG00000224145, ENSG00000235905, ENSG00000137384, ENSG00000235259 GRCh38: Ensembl uvolnění 89: ENSG00000235960, ENSG00000227147, ENSG00000233599, ENSG00000204610, ENSG00000224145, ENSG00000235905, ENSG00000137384, ENSG00000235259 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000050747 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Reymond A, Meroni G, Fantozzi A, Merla G, Cairo S, Luzi L, Riganelli D, Zanaria E, Messali S, Cainarca S, Guffanti A, Minucci S, Pelicci PG, Ballabio A (květen 2001). „Rodina trojdílných motivů identifikuje buněčné oddíly“. EMBO J.. 20 (9): 2140–51. doi:10.1093 / emboj / 20.9.2140. PMC 125245. PMID 11331580.
^ Goei VL, Parimoo S, Capossela A, Chu TW, Gruen JR (březen 1994). "Izolace nových fragmentů non-HLA genu z hemochromatózové oblasti (6p21.3) pomocí cDNA hybridizační selekce". Jsem J Hum Genet. 54 (2): 244–51. PMC 1918154. PMID 8304341.
^ Gruen JR, Nalabolu SR, Chu TW, Bowlus C, Fan WF, Goei VL, Wei H, Sivakamasundari R, Liu Y, Xu HX, Parimoo S, Nallur G, Ajioka R, Shukla H, Bray-Ward P, Pan J, Weissman SM (únor 1997). "Transkripční mapa regionu hlavní třídy histokompatibilního komplexu (MHC) třídy". Genomika. 36 (1): 70–85. doi:10.1006 / geno.1996.0427. PMID 8812418.
^ ^A ^b „Entrez Gene: TRIM15 tripartitní motiv obsahující 15“.

Další čtení

Shiina T, Ota M, Shimizu S a kol. (2006). „Rychlá evoluce hlavních genů histokompatibility komplexu I. třídy u primátů generuje u lidí stopovou alelu onemocnění prostřednictvím stopové rozmanitosti“. Genetika. 173 (3): 1555–70. doi:10.1534 / genetika.106.057034. PMC 1526686. PMID 16702430.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Sbírka genů savců (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Suzuki Y, Yamashita R, Shirota M a kol. (2004). „Porovnání sekvencí lidských a myších genů odhaluje homologní blokovou strukturu v promotorových regionech“. Genome Res. 14 (9): 1711–8. doi:10,1101 / gr. 2435604. PMC 515316. PMID 15342556.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Harada H, Harada Y, O'Brien DP a kol. (1999). „HERF1, nový prstenový protein RING specifický pro hematopoézu, je vyžadován pro terminální diferenciaci erytroidních buněk“. Mol. Buňka. Biol. 19 (5): 3808–15. doi:10.1128 / MCB.19.5.3808. PMC 84222. PMID 10207104.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C ENSG00000227147, ENSG00000233599, ENSG00000204610, ENSG00000224145, ENSG00000235905, ENSG00000137384, ENSG00000235259 GRCh38: Ensembl uvolnění 89: ENSG00000235960, ENSG00000227147, ENSG00000233599, ENSG00000204610, ENSG00000224145, ENSG00000235905, ENSG00000137384, ENSG00000235259 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000050747 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid11331580-5] Reymond A, Meroni G, Fantozzi A, Merla G, Cairo S, Luzi L, Riganelli D, Zanaria E, Messali S, Cainarca S, Guffanti A, Minucci S, Pelicci PG, Ballabio A (květen 2001). „Rodina trojdílných motivů identifikuje buněčné oddíly“. EMBO J.. 20 (9): 2140–51. doi:10.1093 / emboj / 20.9.2140. PMC 125245. PMID 11331580.

[pmid8304341-6] Goei VL, Parimoo S, Capossela A, Chu TW, Gruen JR (březen 1994). "Izolace nových fragmentů non-HLA genu z hemochromatózové oblasti (6p21.3) pomocí cDNA hybridizační selekce". Jsem J Hum Genet. 54 (2): 244–51. PMC 1918154. PMID 8304341.

[pmid8812418-7] Gruen JR, Nalabolu SR, Chu TW, Bowlus C, Fan WF, Goei VL, Wei H, Sivakamasundari R, Liu Y, Xu HX, Parimoo S, Nallur G, Ajioka R, Shukla H, Bray-Ward P, Pan J, Weissman SM (únor 1997). "Transkripční mapa regionu hlavní třídy histokompatibilního komplexu (MHC) třídy". Genomika. 36 (1): 70–85. doi:10.1006 / geno.1996.0427. PMID 8812418.

[entrez-8] A ^b „Entrez Gene: TRIM15 tripartitní motiv obsahující 15“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]