OBRÁZEK 9 - TRIM9

OBRÁZEK 9
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2DB8
Identifikátory
Aliasy	OBRÁZEK 9, RNF91, SPRING, tripartitní motiv obsahující 9
Externí ID	OMIM: 606555 MGI: 2137354 HomoloGene: 9045 Genové karty: OBRÁZEK 9
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 14 (lidský)
Konec	51,096,061 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 12 (myš)
Konec	70,347,614 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba kovových iontů; • vazba iontů zinku; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita homodimerizace proteinu; • aktivita transferázy; • specifické vazby na proteinovou doménu; • aktivita ubikvitin-protein transferázy; • SNARE vazba;
Buněčná složka	• cytoplazma; • cytoplazmatický váček; • buněčné spojení; • dendrit; • buněčná projekce; • synapse; • cytoskelet; • synaptický váček; • intracelulární; • cytosol; • presynaptický cytosol;
Biologický proces	• negativní regulace exocytózy závislé na iontech vápníku; • ubikvitinace bílkovin; • negativní regulace sestavy komplexu SNARE; • exocytóza synaptických vezikul; • proteazomem zprostředkovaný katabolický proces proteinu závislý na ubikvitinu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	114088
	94090
	ENSG00000100505
	ENSMUSG00000021071
	Q9C026
	Q8C7M3
	NM_015163; NM_052978
NM_001110202; NM_001110203; NM_001286386; NM_001286387; NM_001286388;
	NM_053167
	NP_055978; NP_443210
NP_001103672; NP_001103673; NP_001273315; NP_001273316; NP_001273317;
	NP_444397
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Protein obsahující trojstranný motiv 9 je protein že u lidí je kódován OBRÁZEK 9 gen.^[5]^[6]^[7]

Protein kódovaný tímto genem je členem rodina tripartitních motivů (TRIM). Motiv TRIM zahrnuje tři domény vázající zinek, RING, B-box typu 1 a B-box typu 2 a oblast stočené cívky. Protein se lokalizuje do cytoplazmatických těl. Jeho funkce nebyla identifikována. Alternativní sestřih tohoto genu generuje dvě varianty transkriptu kódující různé izoformy.^[7]

Interakce

Bylo prokázáno, že TRIM9 komunikovat s SNAP-25.^[6]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000100505 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000021071 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Reymond A, Meroni G, Fantozzi A, Merla G, Cairo S, Luzi L, Riganelli D, Zanaria E, Messali S, Cainarca S, Guffanti A, Minucci S, Pelicci PG, Ballabio A (květen 2001). „Rodina tripartitních motivů identifikuje buněčné oddíly“. EMBO J.. 20 (9): 2140–51. doi:10.1093 / emboj / 20.9.2140. PMC 125245. PMID 11331580.
^ ^A ^b Li Y, Chin LS, Weigel C, Li L (říjen 2001). „Jaro, nový prstový protein RING, který reguluje exocytózu synaptických vezikul“. J Biol Chem. 276 (44): 40824–33. doi:10,1074 / jbc.M106141200. PMID 11524423.
^ ^A ^b „Entrez Gene: TRIM9 tripartitní motiv obsahující 9“.

Další čtení

Nakajima D, Okazaki N, Yamakawa H a kol. (2003). „Konstrukce klonů cDNA připravených na expresi pro geny KIAA: ruční kurace 330 klonů cDNA KIAA“. DNA Res. 9 (3): 99–106. doi:10.1093 / dnares / 9.3.99. PMID 12168954.
Dawson SJ, White LA (1992). „Léčba endokarditidy Haemophilus aphrophilus ciprofloxacinem“. J. Infect. 24 (3): 317–20. doi:10.1016 / S0163-4453 (05) 80037-4. PMID 1602151.
Ohara O, Nagase T, Ishikawa K a kol. (1997). „Konstrukce a charakterizace knihoven cDNA lidského mozku vhodných pro analýzu klonů cDNA kódujících relativně velké proteiny“. DNA Res. 4 (1): 53–9. doi:10.1093 / dnares / 4.1.53. PMID 9179496.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T a kol. (2005). „Směrem k mapě interakční sítě lidský protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514.

Tento článek o gen na lidský chromozom 14 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000100505 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000021071 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid11331580-5] Reymond A, Meroni G, Fantozzi A, Merla G, Cairo S, Luzi L, Riganelli D, Zanaria E, Messali S, Cainarca S, Guffanti A, Minucci S, Pelicci PG, Ballabio A (květen 2001). „Rodina tripartitních motivů identifikuje buněčné oddíly“. EMBO J.. 20 (9): 2140–51. doi:10.1093 / emboj / 20.9.2140. PMC 125245. PMID 11331580.

[pmid11524423-6] A ^b Li Y, Chin LS, Weigel C, Li L (říjen 2001). „Jaro, nový prstový protein RING, který reguluje exocytózu synaptických vezikul“. J Biol Chem. 276 (44): 40824–33. doi:10,1074 / jbc.M106141200. PMID 11524423.

[entrez-7] A ^b „Entrez Gene: TRIM9 tripartitní motiv obsahující 9“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

OBRÁZEK ​​9 - TRIM9

Interakce

Reference

Další čtení

OBRÁZEK 9 - TRIM9