TRIM25 - TRIM25
Protein obsahující tripartitní motiv 25 je protein že u lidí je kódován TRIM25 gen.[5][6]
Funkce
Protein kódovaný tímto genem je členem rodiny tripartitních motivů (TRIM) sdružujících více než 70 TRIM. TRIM proteiny primárně fungují jako ubikvitinové ligázy které regulují vrozenou reakci na infekci.[7] TRIM25 se lokalizuje do cytoplazmy. Přítomnost potenciálních domén vázajících DNA a dimerizačně-transaktivačních domén naznačuje, že tento protein může působit jako transkripční faktor, podobně jako několik dalších členů rodiny TRIM. Exprese genu se zvyšuje v reakci na estrogen a předpokládá se, že zprostředkovává působení estrogenu u rakoviny prsu jako primární gen odpovědi.[6]
Architektura domény
TRIM25 má N-koncovou doménu RING, následovanou doménou B-boxu typu 1, doménou B-boxu typu 2, doménou coil-coil (CCD) a C-koncovou doménou SPRY. Doména RING koordinuje dva atomy zinku a je nezbytná pro nábor enzymy konjugující s ubikvitinem. Funkce domén B-boxu není známa. CCD doména se podílí na multimerizaci a dalších interakcích protein-protein.[8] Pro nábor substrátu je vyžadována doména SPRY.[9] Chemické posuny NMR pro páteř domény PRYSPRY TRIM25 jsou přiřazeny na základě experimentů s trojitou rezonancí za použití rovnoměrně izotopově značeného proteinu a sekundární struktura domény PRYSPRY domény TRIM25 předpovězena na základě přiřazení NMR.[10]
Funkce TRIM25
TRIM25 hraje klíčovou roli v RIG-I signální dráha. RIG-I je cytosol receptor pro rozpoznávání vzoru který snímá virovou RNA. Po rozpoznání RNA se doména náboru kaspázy (KARTA) RIG-I podstoupila K (63) -vázaný ubikvitinace podle TRIM25. Domény RING a SPRY TRIM25 zprostředkovávají jeho interakci s RIG-I. Produkce IFN pak následuje intracelulární signální cestou zahrnující IRF3.[11]
Virový útěk
Aby se zabránilo produkci IFN, byl strukturální protein (NS1 ) z chřipka bude interagovat s CCD doménou TRIM25 a blokovat ubikvitinaci RIG-I. Některé studie ukázaly, že delece CCD domény TRIM25 brání vazbě NS1.[12] Bez této ubikvitinace nebude výroba IFN.
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000121060 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000000275 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ Inoue S, Orimo A, Matsuda Y, Inazawa J, Emi M, Nakamura Y, Hori T, Muramatsu M (leden 1995). „Chromozomové mapování lidských (ZNF147) a myších genů pro prstový protein reagující na estrogen (efp), člen rodiny prstů RING“. Genomika. 25 (2): 581–3. doi:10.1016 / 0888-7543 (95) 80064-S. PMID 7789997.
- ^ A b „Entrez Gene: TRIM25 tripartitní motiv obsahující 25“.
- ^ D'Cruz AA, Kershaw NJ, Chiang JJ, Wang MK, Nicola NA, Babon JJ, Gack MU, Nicholson SE (2013). „Krystalová struktura domény TRIM25 B30.2 (PRYSPRY): klíčová součást antivirové signalizace“. The Biochemical Journal. 456 (2): 231–40. doi:10.1042 / BJ20121425. PMC 4012390. PMID 24015671.
- ^ Haik KG (červenec 1985). Msgstr "Vizuální potíže s terminály pro zobrazení videa". Southern Medical Journal. 78 (7): 887–8. doi:10.1097/00007611-198507000-00031. PMID 4012390.
- ^ Pilka L, Trávník P, Dvorák M, Tesarík J, Ventruba P, Krejcí K, Soska J (srpen 1985). "[Dodání po nitroděložním přenosu embryí získané oplodněním a kultivací oocytů in vitro]". Ceskoslovenská Gynekologie. 50 (7): 452–9. PMID 4042170.
- ^ Kong, Chen; Penumutchu, Srinivasa R .; Hung, Kuo-wej; Huang, Huiying; Lin, Tianwei; Yu, Chin (2015-02-22). Msgstr "Přiřazení páteřní rezonance domény PRYSPRY TRIM25". Přiřazení biomolekulárních NMR. 9 (2): 313–315. doi:10.1007 / s12104-015-9599-x. ISSN 1874-2718. PMID 25702035. S2CID 11475584.
- ^ Gack MU, Kirchhofer A, Shin YC, Inn KS, Liang C, Cui S, Myong S, Ha T, Hopfner KP, Jung JU (říjen 2008). "Role RIG-I N-terminální tandemové CARD a spojovací varianty v TRIM25 zprostředkované antivirové signální transdukci". Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 105 (43): 16743–8. doi:10.1073 / pnas.0804947105. PMC 2575490. PMID 18948594.
- ^ Gack MU, Albrecht RA, Urano T, Inn KS, Huang IC, Carnero E, Farzan M, Inoue S, Jung JU, García-Sastre A (květen 2009). „Virus chřipky A NS1 cílí na ubikvitinovou ligázu TRIM25, aby se vyhnul rozpoznání hostitelským virovým RNA senzorem RIG-I“. Mobilní hostitel a mikrob. 5 (5): 439–49. doi:10.1016 / j.chom.2009.04.006. PMC 2737813. PMID 19454348.
Další čtení
- Horie K, Urano T, Ikeda K, Inoue S (červen 2003). „Prstový protein RING reagující na estrogen reguluje růst rakoviny prsu“. The Journal of Steroid Biochemistry and Molecular Biology. 85 (2–5): 101–4. doi:10.1016 / S0960-0760 (03) 00209-7. PMID 12943693. S2CID 22487508.
- Inoue S, Orimo A, Hosoi T, Kondo S, Toyoshima H, Kondo T, Ikegami A, Ouchi Y, Orimo H, Muramatsu M (prosinec 1993). „Klonování genomového vazebného místa odhaluje gen reagující na estrogen, který kóduje protein prstu RING“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 90 (23): 11117–21. doi:10.1073 / pnas.90.23.11117. PMC 47933. PMID 8248217.
- Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (září 1996). „Normalizace a odčítání: dva přístupy k usnadnění objevování genů“. Výzkum genomu. 6 (9): 791–806. doi:10,1101 / gr. 6.9.791. PMID 8889548.
- Ikeda K, Inoue S, Orimo A, Sano M, Watanabe T, Tsutsumi K, Muramatsu M (červenec 1997). „Více regulačních prvků a vazebných proteinů 5'-ohraničující oblasti genu lidského estrogen-responzivního prstového proteinu (efp)“. Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 236 (3): 765–71. doi:10.1006 / bbrc.1997.7046. PMID 9245730.
- Ikeda K, Orimo A, Higashi Y, Muramatsu M, Inoue S (duben 2000). "Efp jako primární gen reagující na estrogen u lidské rakoviny prsu". FEBS Dopisy. 472 (1): 9–13. doi:10.1016 / S0014-5793 (00) 01421-6. PMID 10781795. S2CID 10570937.
- Reymond A, Meroni G, Fantozzi A, Merla G, Cairo S, Luzi L, Riganelli D, Zanaria E, Messali S, Cainarca S, Guffanti A, Minucci S, Pelicci PG, Ballabio A (květen 2001). „Rodina trojdílných motivů identifikuje buněčné oddíly“. Časopis EMBO. 20 (9): 2140–51. doi:10.1093 / emboj / 20.9.2140. PMC 125245. PMID 11331580.
- Urano T, Saito T, Tsukui T, Fujita M, Hosoi T, Muramatsu M, Ouchi Y, Inoue S (červen 2002). „EFF se zaměřuje na 14-3-3 sigma pro proteolýzu a podporuje růst nádoru prsu“. Příroda. 417 (6891): 871–5. doi:10.1038 / nature00826. PMID 12075357. S2CID 4348545.
- Shimada N, Suzuki T, Inoue S, Kato K, Imatani A, Sekine H, Ohara S, Shimosegawa T, Sasano H (duben 2004). „Systémová distribuce prstového proteinu reagujícího na estrogen (Efp) v lidských tkáních“. Molekulární a buněčná endokrinologie. 218 (1–2): 147–53. doi:10.1016 / j.mce.2003.12.008. PMID 15130519. S2CID 44761828.
- Rush J, Moritz A, Lee KA, Guo A, Goss VL, Spek EJ, Zhang H, Zha XM, Polakiewicz RD, Comb MJ (leden 2005). "Imunoafinitní profil fosforylace tyrosinu v rakovinných buňkách". Přírodní biotechnologie. 23 (1): 94–101. doi:10.1038 / nbt1046. PMID 15592455. S2CID 7200157.
- Suzuki T, Urano T, Tsukui T, Horie-Inoue K, Moriya T, Ishida T, Muramatsu M, Ouchi Y, Sasano H, Inoue S (září 2005). „Prstový protein reagující na estrogen jako nový potenciální biomarker pro rakovinu prsu“. Klinický výzkum rakoviny. 11 (17): 6148–54. doi:10.1158 / 1078-0432.CCR-05-0040. PMID 16144914.
- Nakayama H, Sano T, Motegi A, Oyama T, Nakajima T (listopad 2005). „Zvýšení exprese 14-3-3 sigma s poklesem exprese estrogenového receptoru alfa a exprese prstového proteinu reagujícího na estrogen definuje maligní progresi karcinomu endometria“. Pathology International. 55 (11): 707–15. doi:10.1111 / j.1440-1827.2005.01900.x. PMID 16271083.
- Nakasato N, Ikeda K, Urano T, Horie-Inoue K, Takeda S, Inoue S (prosinec 2006). „Ubikvitin E3 ligáza Efp je up-regulována interferony a konjugována s ISG15“. Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 351 (2): 540–6. doi:10.1016 / j.bbrc.2006.10.061. PMID 17069755.
- Nakajima A, Maruyama S, Bohgaki M, Miyajima N, Tsukiyama T, Sakuragi N, Hatakeyama S (květen 2007). „Na ligandu závislá transkripce estrogenového receptoru alfa je zprostředkována ubikvitin ligázou EFP“. Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 357 (1): 245–51. doi:10.1016 / j.bbrc.2007.03.134. hdl:2115/24261. PMID 17418098.
Tento článek o gen na lidský chromozom 17 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |