TRIM3 - TRIM3

TRIM3
Identifikátory
Aliasy	TRIM3, BERP, HAC1, RNF22, RNF97, tripartitní motiv obsahující 3
Externí ID	OMIM: 605493 MGI: 1860040 HomoloGene: 21290 Genové karty: TRIM3
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 11 (lidský)
Konec	6,474,459 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 7 (myš)
Konec	105,633,571 bp
Exprese RNA vzor
	; ; ; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba iontů zinku; • vazba na C-konec proteinu; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba kovových iontů; • GO: 1904264, GO: 1904822, GO: 0090622, GO: 0090302 aktivita ubikvitinové proteinové ligázy; • aktivita ubikvitin-protein transferázy;
Buněčná složka	• cytoplazma; • endosom; • časný endosom; • intracelulární; • Golgiho aparát; • dendrit; • buněčná projekce;
Biologický proces	• transport bílkovin; • ubikvitinace bílkovin; • vývoj nervového systému; • polyubikvitinace bílkovin; • proteazomem zprostředkovaný katabolický proces proteinu závislý na ubikvitinu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	10612
	55992
	ENSG00000110171
	ENSMUSG00000036989
	O75382
	Q9R1R2
	NM_001248006; NM_001248007; NM_006458; NM_033278
	NM_001285870; NM_001285871; NM_001285873; NM_018880; NM_001360425
	NP_001234935; NP_001234936; NP_006449; NP_150594
	NP_001272799; NP_001272800; NP_001272802; NP_061368; NP_001347354
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Protein obsahující trojstranný motiv 3 je protein že u lidí je kódován TRIM3 gen.^[5]^[6]

Protein kódovaný tímto genem je členem rodiny tripartitních motivů (TRIM), nazývané také podskupina prstenových proteinů RING „RING-B-box-coiled-coil“ (RBCC). Motiv TRIM zahrnuje tři domény vázající zinek, RING, B-box typu 1 a B-box typu 2 a oblast stočené cívky. Tento protein se lokalizuje do cytoplazmatických vláken. Je to podobné jako u krysího proteinu, který je specifickým partnerem pro ocasní doménu myosinu V, což je třída myosinů, které se podílejí na cíleném transportu organel. Krysí protein může také interagovat s alfa-aktininem-4. Navrhuje se tedy, že tento lidský protein může hrát roli v přepravě nákladu zprostředkovanou myosinem V. Alternativně byly identifikovány sestřihové varianty transkriptu kódující stejnou izoformu.^[6]

Interakce

Bylo prokázáno, že TRIM3 komunikovat s Aktinin alfa 4.^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000110171 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání Ensembl 89: ENSMUSG00000036989 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ El-Husseini AE, Vincent SR (červenec 1999). „Klonování a charakterizace nového prstového proteinu RING, který interaguje s myosiny třídy V“. The Journal of Biological Chemistry. 274 (28): 19771–7. doi:10.1074 / jbc.274.28.19771. PMID 10391919.
^ ^A ^b „Entrez Gene: TRIM3 tripartitní motiv obsahující 3“.
^ El-Husseini AE, Kwasnicka D, Yamada T, Hirohashi S, Vincent SR (leden 2000). „BERP, nový protein prstového prstu, se váže na alfa-aktinin-4“. Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 267 (3): 906–11. doi:10.1006 / bbrc.1999.2045. PMID 10673389.

Další čtení

El-Husseini AE, Kwasnicka D, Yamada T, Hirohashi S, Vincent SR (leden 2000). „BERP, nový protein prstového prstu, se váže na alfa-aktinin-4“. Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 267 (3): 906–11. doi:10.1006 / bbrc.1999.2045. PMID 10673389.
El-Husseini AE, Fretier P, Vincent SR (únor 2001). „Klonování a charakterizace genu (RNF22) kódujícího nový mozek exprimovaný protein prstového prstu (BERP), který se mapuje na lidský chromozom 11p15.5“. Genomika. 71 (3): 363–7. doi:10,1006 / geno.2000.6452. PMID 11170753.
Reymond A, Meroni G, Fantozzi A, Merla G, Cairo S, Luzi L, Riganelli D, Zanaria E, Messali S, Cainarca S, Guffanti A, Minucci S, Pelicci PG, Ballabio A (květen 2001). „Rodina tripartitních motivů identifikuje buněčné oddíly“. Časopis EMBO. 20 (9): 2140–51. doi:10.1093 / emboj / 20.9.2140. PMC 125245. PMID 11331580.
Lee SJ, Choi JY, Sung YM, Park H, Rhim H, Kang S (srpen 2001). „E3 ligázová aktivita proteinů prstu RING, které interagují s Hip-2, lidským enzymem konjugujícím s ubikvitinem“. FEBS Dopisy. 503 (1): 61–4. doi:10.1016 / S0014-5793 (01) 02689-8. PMID 11513855. S2CID 42977319.
Yan Q, Sun W, Kujala P, Lotfi Y, Vida TA, Bean AJ (květen 2005). „KOŠÍK: pro účinnou recyklaci receptorů je vyžadován proteinový komplex Hrs / aktinin-4 / BERP / myosin V“. Molekulární biologie buňky. 16 (5): 2470–82. doi:10,1091 / mbc.E04-11-1014. PMC 1087250. PMID 15772161.
Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, Macek B, Kumar C, Mortensen P, Mann M (listopad 2006). „Globální, in vivo a místně specifická dynamika fosforylace v signálních sítích“. Buňka. 127 (3): 635–48. doi:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID 17081983. S2CID 7827573.

Tento článek o gen na lidský chromozom 11 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000110171 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání Ensembl 89: ENSMUSG00000036989 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid10391919-5] El-Husseini AE, Vincent SR (červenec 1999). „Klonování a charakterizace nového prstového proteinu RING, který interaguje s myosiny třídy V“. The Journal of Biological Chemistry. 274 (28): 19771–7. doi:10.1074 / jbc.274.28.19771. PMID 10391919.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: TRIM3 tripartitní motiv obsahující 3“.

[pmid10673389-7] El-Husseini AE, Kwasnicka D, Yamada T, Hirohashi S, Vincent SR (leden 2000). „BERP, nový protein prstového prstu, se váže na alfa-aktinin-4“. Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 267 (3): 906–11. doi:10.1006 / bbrc.1999.2045. PMID 10673389.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]