TRIM11 - TRIM11

TRIM11
Identifikátory
Aliasy	TRIM11, BIA1, RNF92, trojstranný motiv obsahující 11
Externí ID	OMIM: 607868 MGI: 2137355 HomoloGene: 14225 Genové karty: TRIM11
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 1 (lidský)
Konec	228,406,835 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 11 (myš)
Konec	58,991,458 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita ubikvitin-protein transferázy; • vazba iontů zinku; • vazba transkripčního faktoru; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • specifické vazby na proteinovou doménu; • GO: 1904264, GO: 1904822, GO: 0090622, GO: 0090302 aktivita ubikvitinové proteinové ligázy; • vazba kovových iontů; • aktivita transferázy;
Buněčná složka	• cytoplazma; • intracelulární; • buněčné jádro; • cytosol;
Biologický proces	• negativní regulace neurogeneze; • vrozený imunitní systém; • negativní regulace transkripce, chráněná DNA; • obranná reakce na virus; • ubikvitinace bílkovin; • negativní regulace virové transkripce; • negativní regulace vstupu viru do hostitelské buňky; • pozitivní regulace vstupu viru do hostitelské buňky; • negativní regulace uvolňování viru z hostitelské buňky;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	81559
	94091
	ENSG00000154370
	ENSMUSG00000020455
	Q96F44
	Q99PQ2
	NM_145214
	NM_001290988; NM_053168
	NP_660215
	NP_001277917; NP_444398
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Protein obsahující trojstranný motiv 11 je protein nalezený u lidí, který je kódován TRIM11 gen.^[5]^[6]

Protein kódovaný tímto genem je členem rodina tripartitních motivů (TRIM). Motiv TRIM zahrnuje tři domény vázající zinek, a PRSTEN, a B-box typ 1 a B-box typu 2 a oblast svinuté cívky. Tento protein se lokalizuje do jádro a cytoplazma. Jeho funkce nebyla identifikována.^[6]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000154370 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000020455 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Reymond A, Meroni G, Fantozzi A, Merla G, Cairo S, Luzi L, Riganelli D, Zanaria E, Messali S, Cainarca S, Guffanti A, Minucci S, Pelicci PG, Ballabio A (květen 2001). „Rodina trojdílných motivů identifikuje buněčné oddíly“. EMBO J.. 20 (9): 2140–51. doi:10.1093 / emboj / 20.9.2140. PMC 125245. PMID 11331580.
^ ^A ^b „Entrez Gene: TRIM11 tripartitní motiv obsahující 11“.

Další čtení

Ishikawa H, Tachikawa H, Miura Y, Takahashi N (2006). „TRIM11 se váže a destabilizuje klíčovou složku aktivátorem zprostředkovaného komplexu kofaktorů (ARC105) prostřednictvím systému ubikvitin-proteazom“. FEBS Lett. 580 (20): 4784–92. doi:10.1016 / j.febslet.2006.07.066. PMID 16904669.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T a kol. (2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514.
Cooper ST, Hanson IM (2006). „Screening proteinů, které interagují s PAX6: C-koncové mutace narušují interakci s HOMER3, DNCL1 a TRIM11“. BMC Genet. 6: 43. doi:10.1186/1471-2156-6-43. PMC 1208879. PMID 16098226.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Niikura T, Hashimoto Y, Tajima H a kol. (2003). „Tripartitní motivový protein TRIM11 váže a destabilizuje humanin, neuroprotektivní peptid proti urážkám souvisejícím s Alzheimerovou chorobou“. Eur. J. Neurosci. 17 (6): 1150–8. doi:10.1046 / j.1460-9568.2003.02553.x. PMID 12670303.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.

Tento článek o gen na lidský chromozom 1 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000154370 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000020455 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid11331580-5] Reymond A, Meroni G, Fantozzi A, Merla G, Cairo S, Luzi L, Riganelli D, Zanaria E, Messali S, Cainarca S, Guffanti A, Minucci S, Pelicci PG, Ballabio A (květen 2001). „Rodina trojdílných motivů identifikuje buněčné oddíly“. EMBO J.. 20 (9): 2140–51. doi:10.1093 / emboj / 20.9.2140. PMC 125245. PMID 11331580.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: TRIM11 tripartitní motiv obsahující 11“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]