Rodina glykosidhydrolázy 5 - Glycoside hydrolase family 5

Celuláza (rodina 5 glykosylhydrolázy)
Identifikátory
SymbolCeluláza
PfamPF00150
Pfam klanCL0058
InterProIPR001547
STRÁNKAPDOC00565
SCOP22exo / Rozsah / SUPFAM
OPM nadčeleď117
OPM protein2osx
CAZyGH5
Membranome1365

V molekulární biologii rodina glykosid hydrolázy 5 je rodina z glykosidové hydrolázy.

Glykosidové hydrolázy ES 3.2.1. jsou rozšířenou skupinou enzymů, které hydrolyzovat the glykosidová vazba mezi dvěma nebo více sacharidy nebo mezi sacharidovou a ne-sacharidovou skupinou. Klasifikační systém pro glykosidové hydrolázy, založený na sekvenční podobnosti, vedl k definici> 100 různých rodin.[1][2][3] Tato klasifikace je k dispozici na internetu CAZy webová stránka,[4][5] a také diskutována na CAZypedii, online encyklopedii sacharidově aktivních enzymů.[6][7]

Rodina glykosidhydrolázy 5 CAZY GH_5 obsahuje enzymy s několika známými aktivitami včetně endoglukanáza (ES 3.2.1.4 ); beta-mananáza (ES 3.2.1.78 ); exo-1,3-glukanáza (ES 3.2.1.58 ); endo-1,6-glukanáza (ES 3.2.1.75 ); xylanáza (ES 3.2.1.8 ); endoglykoceramidáza (ES 3.2.1.123 ).

Mikrobiální degradace celulóza a xylany vyžaduje několik druhů enzymů. Houby a bakterie produkuje spektrum celulolytických enzymů (celulas) a xylanáz, které lze na základě sekvenčních podobností zařadit do rodin. Jedna z těchto rodin je známá jako celulasová rodina A.[8] nebo jako rodina glykosylhydroláz 5.[9] Jedna z konzervovaných oblastí v této rodině obsahuje konzervované oblasti kyselina glutamová potenciálně zahrnutý zbytek[10] v katalytickém mechanismu.

V nedávné studii s použitím Molekulární dynamika simulace, značná korelace mezi tepelná stabilita a byla prokázána strukturní tuhost členů rodiny 5 s řešenými strukturami.[11]

externí odkazy

Reference

  1. ^ Henrissat B, Callebaut I, Fabrega S, Lehn P, Mornon JP, Davies G (červenec 1995). „Zachovalý katalytický aparát a předpověď společného záhybu pro několik rodin glykosylových hydroláz“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 92 (15): 7090–4. Bibcode:1995PNAS ... 92.7090H. doi:10.1073 / pnas.92.15.7090. PMC  41477. PMID  7624375.
  2. ^ Davies G, Henrissat B (září 1995). "Struktury a mechanismy glykosylhydroláz". Struktura. 3 (9): 853–9. doi:10.1016 / S0969-2126 (01) 00220-9. PMID  8535779.
  3. ^ Henrissat B, Bairoch A (červen 1996). „Aktualizace klasifikace glykosylhydroláz na základě sekvence“. The Biochemical Journal. 316 (Pt 2): 695–6. doi:10.1042 / bj3160695. PMC  1217404. PMID  8687420.
  4. ^ "Domov". CAZy.org. Citováno 2018-03-06.
  5. ^ Lombard V, Golaconda Ramulu H, Drula E, Coutinho PM, Henrissat B (leden 2014). „Databáze enzymů aktivních ze sacharidů (CAZy) v roce 2013“. Výzkum nukleových kyselin. 42 (Problém s databází): D490-5. doi:10.1093 / nar / gkt1178. PMC  3965031. PMID  24270786.
  6. ^ „Glycoside Hydrolase Family 5“. CAZypedia.org. Citováno 2018-03-06.
  7. ^ Konsorcium CAZypedia (prosinec 2018). „Deset let CAZypedie: živá encyklopedie enzymů aktivních ze sacharidů“ (PDF). Glykobiologie. 28 (1): 3–8. doi:10.1093 / glycob / cwx089. hdl:21.11116 / 0000-0003-B7EB-6. PMID  29040563.
  8. ^ Henrissat B, Claeyssens M, Tomme P, Lemesle L, Mornon JP (září 1989). "Skupiny celuláz odhalené hydrofobní klastrovou analýzou". Gen. 81 (1): 83–95. doi:10.1016/0378-1119(89)90339-9. PMID  2806912.
  9. ^ Henrissat B (prosinec 1991). "Klasifikace glykosylhydroláz na základě podobností aminokyselinových sekvencí". The Biochemical Journal. 280 (2): 309–16. doi:10.1042 / bj2800309. PMC  1130547. PMID  1747104.
  10. ^ Py B, Bortoli-German I, Haiech J, Chippaux M, Barras F (únor 1991). „Cellulasa EGZ z Erwinia chrysanthemi: strukturní organizace a význam zbytků His98 a Glu133 pro katalýzu“. Proteinové inženýrství. 4 (3): 325–33. doi:10.1093 / protein / 4.3.325. PMID  1677466.
  11. ^ Badieyan S, Bevan DR, Zhang C (leden 2012). "Studie a návrh stability v buněčných buňkách GH5". Biotechnologie a bioinženýrství. 109 (1): 31–44. doi:10,1002 / bit. 23280. PMID  21809329. S2CID  29281420.