Chromalveolata - Chromalveolata - Wikipedia

Chromalveolata
Chromista koláž 2.jpg
Ve směru hodinových ručiček zleva nahoře: a haptofyt (coccolithophore: Emiliania huxleyi ), některé rozsivky, a vodní forma, a kryptomonad, a Makrocystis, a feofyt
Vědecká klasifikace E
Doména:Eukaryota
(bez hodnocení):Bikonta
(bez hodnocení):Chromalveolata
Adl a kol., 2005 (nikoli a monofyletický skupina)[1][2]
Phyla

Chromalveolata byl eukaryot superskupina přítomná v hlavní klasifikaci roku 2005, poté považovaná za jednu ze šesti hlavních skupin v rámci eukaryot.[3] Bylo to zdokonalení království Chromista, nejprve navrhl Thomas Cavalier-Smith v roce 1981. Chromalveolata byla navržena tak, aby představovala organismy pocházející z jediného sekundáru endosymbióza zahrnující a červená řasa a a bikont.[4] The plastidy v těchto organismech jsou ty, které obsahují chlorofyl c.

Nicméně monofilie Chromalveolata byl odmítnut. Takže dva příspěvky publikované v roce 2008 mají fylogenetické stromy, ve kterých jsou chromalveoláty rozděleny,[5][6] a nedávné studie tento názor nadále podporují.[7][8]

Skupiny a klasifikace

A kalifornský řasa les.

Historicky se uvažovalo o mnoha chromalveolátech rostliny, kvůli jejich buněčným stěnám, fotosyntetické schopnosti a v některých případech jejich morfologické podobnosti s suchozemskými rostlinami (Embryophyta ). Když však systém pěti království (navrženo v roce 1969) převzalo převahu nad dichotomií zvířat a rostlin, většina z toho, co dnes nazýváme chromalveoláty, byla dána do království Protista, ale vodní formy a slizové sítě byli vloženi do království Houby, zatímco hnědé řasy zůstal v rostlinné říši. Tyto různé organismy byly později seskupeny a dostaly jméno Chromalveolata od Cavalier-Smith. Věřil jim, že jsou monofyletický skupina, ale není tomu tak.[9]

V roce 2005, v klasifikaci odrážející tehdejší konsenzus, byla Chromalveolata považována za jednu ze šesti hlavních klady eukaryot.[3] Ačkoli v této klasifikaci nebyl dán formální taxonomický status, jinde byla skupina považována za Království.[Citace je zapotřebí ] Chromalveolata byly rozděleny do čtyř hlavních podskupin:

Další skupiny, které mohou být zahrnuty do chromalveolátů nebo s nimi souvisejí, jsou:

Ačkoli několik skupin, jako je náčelníci a vodní formy, většina z nich ztratila schopnost fotosyntézy autotrofní. Používají se všechny fotosyntetické chromalveoláty chlorofyly A a C, a mnoho použití doplňkové pigmenty. Chromalveoláty sdílejí podobné glyceraldehyd-3-fosfátdehydrogenáza bílkoviny.[11]

Již v roce 2005 však byly vyjádřeny pochybnosti o tom, zda je Chromalveolata monofyletická,[9] a přezkum v roce 2006 zaznamenal nedostatek důkazů pro několik z předpokládaných šesti hlavních skupin eukaryot, včetně Chromalveolata.[12] V roce 2012 se objevila shoda, že skupina není monofyletická. Čtyři původní podskupiny spadají do nejméně dvou kategorií: jednu tvoří Stramenopiles a Alveolata, do které Rhizaria jsou nyní obvykle přidány k vytvoření Skupina SAR; druhá zahrnuje kryptophytu a haptophytu.[5][6] Papír z roku 2010 rozděluje Cryptophytu a Haptophytu; první jsou sesterskou skupinou pro skupinu SAR, druhá skupina s Archaeplastida (rostliny v širším slova smyslu). The katablepharids jsou úzce spjaty s kryptofyty a telonemids a centrohelidy mohou souviset s haptophyty.[7]

Pro různé kombinace skupin, o nichž se dříve myslelo, že tvoří Chromalveolatu, byla použita celá řada jmen.

  • Halvaria Analýzy v letech 2007 a 2008 se shodly na tom, že Stramenopiles a Alveolata byli příbuzní a vytvořili snížený chromalveolátový clade, tzv. Halvaria.[5][6][13]
  • Skupina SAR Rhizaria, které původně nebyly považovány za chromalveoláty, patří v mnoha analýzách mezi Stramenopiles a Alveolata a tvoří Skupina SAR, tj. Halvaria plus Rhizaria.[13][14]
  • Hacrobia Další dvě skupiny původně zahrnuté v Chromalveolata, Haptophyta a Cryptophyta, byly v některých analýzách příbuzné,[5][6] vytvoření clade, který byl povolán Hacrobia. Alternativně se zdálo, že Hacrobia má užší vztah k Archaeplastida (rostliny ve velmi širokém smyslu), přičemž v jedné analýze je sesterskou skupinou,[5] a skutečně vnořené uvnitř této skupiny v jiné.[6] (Dříve, Cavalier-Smith navrhl volaný clade Corticata pro seskupení Všechno chromalveoláty a archaeplastida.) V poslední době, jak je uvedeno výše, byla Hacrobia rozdělena, přičemž Haptophyta byla sestrou skupiny SAR a kryptophyta místo toho souvisela s archaeplastidou.[7]
Viz také: Eukaryote § Phylogeny

Morfologie

Chromalveoláty, na rozdíl od jiných skupin s mnohobuněčnými zástupci, nemají příliš mnoho společných morfologických charakteristik. Každá hlavní podskupina má určité jedinečné vlastnosti, včetně alveol Alveolata, haptonema Haptophyta, vyhazovače Cryptophyta a dvou různých bičíků Heterokontophyta. Žádná z těchto funkcí však není k dispozici ve všech skupinách.

Jedinými běžnými vlastnostmi chromalveolátu jsou tyto:

  • Společný původ chloroplastů, jak je uvedeno výše
  • Přítomnost celulóza ve většině buněčných stěn

Jelikož se jedná o tak různorodou skupinu, je obtížné shrnout sdílené charakteristiky chromalveolátů.

Ekologická role

Rostlina brambor infikovaná Phytophthora infestans.

Mnoho chromalveolátů ovlivňuje náš ekosystém obrovským způsobem.

Některé z těchto organismů mohou být velmi škodlivé. Dinoflageláty vyrobit červené přílivy, které mohou devastovat populace ryb a intoxikovat úrodu ústřic. Apicomplexans jsou jedny z nejúspěšnějších specifických parazitů na zvířatech (včetně rodu Plasmodium, malárie paraziti). Vodní formy způsobují několik chorob rostlin - byla to vodní forma Phytophthora infestans který způsobil Irská bramborová plíseň, která vedla k velkému irskému hladomoru.

Mnoho dalších je však životně důležitých členů našeho ekosystému. Diatomy jsou jedním z hlavních producentů fotosyntézy a jako takoví produkují většinu z kyslík že dýcháme a také přijímáme velkou část oxid uhličitý z atmosféry. Hnědé řasy, konkrétněji řasy, vytvářejí podvodní „lesní“ stanoviště pro mnoho mořských tvorů a poskytují velkou část potravy pobřežních komunit.

Chromalveoláty také poskytují mnoho produktů, které používáme. The algin v hnědých řasách se používá jako zahušťovadlo potravin, nejznámější v zmrzlina. Křemičité skořápky rozsivek mají mnoho využití, například v reflexních barvách, v zubních pastách nebo jako filtry, v tzv. křemelina.

Viry Chromalveolata

Stejně jako jiné organismy mají chromalveolata viry. V případě Emiliania huxleyi (běžný květ řas chromalveolát), virus, o kterém se předpokládá, že je pro něj specifický, způsobuje hromadnou smrt a konec květu.[15]

Viz také

Reference

  1. ^ Laura A Katz; Jessica R Grant (23. prosince 2014), „Fylogenomické analýzy bohaté na taxony řeší eukaryotický strom života a odhalují sílu podvzorkování lokalitami“ (PDF), Systematická biologie, 64 (3): 406–415, doi:10.1093 / SYSBIO / SYU126, ISSN  1063-5157, PMID  25540455, Wikidata  Q28254627
  2. ^ Cavalier-Smith, Thomas; Chao, Ema E .; Lewis, Rhodri (01.12.2015). „Mnohočetný původ Heliozoa od předchůdců bičíkovců: Nový kryptický poddruh Corbihelia, nadtřída Corbistoma a monofilie Haptista, Cryptista, Hacrobia a Chromista“. Molekulární fylogenetika a evoluce. 93: 331–362. doi:10.1016 / j.ympev.2015.07.004. PMID  26234272.
  3. ^ A b Adl, Sina M .; et al. (2005), „Nová vyšší klasifikace eukaryot s důrazem na taxonomii protistů“, Journal of Eukaryotic Microbiology, 52 (5): 399–451, doi:10.1111 / j.1550-7408.2005.00053.x, PMID  16248873, S2CID  8060916
  4. ^ Keeling PJ (2009). „Chromalveoláty a vývoj plastidů sekundární endosymbiózou“. J. Eukaryot. Microbiol. 56 (1): 1–8. doi:10.1111 / j.1550-7408.2008.00371.x. PMID  19335769. S2CID  34259721.
  5. ^ A b C d E Burki, Fabien; Shalchian-Tabrizi, Kamran & Pawlowski, Jan (2008). „Fylogenomika odhaluje novou„ megoskupinu “zahrnující většinu fotosyntetických eukaryot“. Biologické dopisy. 4 (4): 366–369. doi:10.1098 / rsbl.2008.0224. PMC  2610160. PMID  18522922.
  6. ^ A b C d E Kim, E; Graham, LE (červenec 2008). Redfield, Rosemary Jeanne (ed.). „Analýza EEF2 zpochybňuje monofylii Archaeplastida a Chromalveolata“. PLOS ONE. 3 (7): e2621. Bibcode:2008PLoSO ... 3.2621K. doi:10.1371 / journal.pone.0002621. PMC  2440802. PMID  18612431.
  7. ^ A b C Burki, F .; Okamoto, N .; Pombert, J.F. a Keeling, P.J. (2012). „Evoluční historie haptofytů a kryptofytů: fylogenomické důkazy pro samostatný původ“. Proc. Biol. Sci. 279 (1736): 2246–2254. doi:10.1098 / rspb.2011.2301. PMC  3321700. PMID  22298847.
  8. ^ Burki, Fabien; Kaplan, Maia; Tichonenkov, Denis V .; Zlatogursky, Vasily; Minh, Bui Quang; Radaykina, Liudmila V .; Smirnov, Alexey; Mylnikov, Alexander P .; Keeling, Patrick J. (2016-01-27). „Rozpletení rané diverzifikace eukaryot: fylogenomická studie evolučních původů Centrohelida, Haptophyta a Cryptista“. Proc. R. Soc. B. 283 (1823): 20152802. doi:10.1098 / rspb.2015.2802. ISSN  0962-8452. PMC  4795036. PMID  26817772.
  9. ^ A b Harper, J. T., Waanders, E. & Keeling, P. J. 2005. K monofylii chromalveolátů za použití šestiproteinové fylogeneze eukaryot. Int. J. System. Evol. Microbiol., 55, 487-496. „Archivovaná kopie“ (PDF). Archivovány od originál (PDF) dne 17. 12. 2008. Citováno 2010-04-26.CS1 maint: archivovaná kopie jako titul (odkaz)
  10. ^ Shalchian-Tabrizi K, Eikrem W, Klaveness D, Vaulot D, Minge M, Le Gall F, Romari K, Throndsen J, Botnen A, Massana R, Thomsen H, Jakobsen K (2006). „Telonemia, nový kmen protistů s afinitou k chromistickým liniím“. Proc Biol Sci. 273 (1595): 1833–42. doi:10.1098 / rspb.2006.3515. PMC  1634789. PMID  16790418.
  11. ^ Takishita K, Yamaguchi H, Maruyama T, Inagaki Y (2009). Zhang B (ed.). „Hypotéza o vývoji jaderně kódovaných genů glyceraldehyd-3-fosfát dehydrogenázy cílených na plastidy u„ členů chromalveolátu “. PLOS ONE. 4 (3): e4737. Bibcode:2009PLoSO ... 4.4737T. doi:10.1371 / journal.pone.0004737. PMC  2649427. PMID  19270733.
  12. ^ Laura Wegener Parfrey; Erika Barbero; Elyse Lasser; Micah Dunthorn; Debashish Bhattacharya; David J. Patterson; Laura A Katz (Prosinec 2006), „Hodnocení podpory pro současnou klasifikaci eukaryotické rozmanitosti“, Genetika PLOS, 2 (12): e220, doi:10.1371 / JOURNAL.PGEN.0020220, ISSN  1553-7390, PMC  1713255, PMID  17194223, Wikidata  Q21090155
  13. ^ A b Fabien Burki; Kamran Shalchian-Tabrizi; Marianne Minge; Åsmund Skjæveland; Sergej I. Nikolaev; Kjetill S. Jakobsen; Jan Pawlowski (2007). „Fylogenomika přeměňuje eukaryotické superskupiny“. PLOS ONE. 2 (8): e790. Bibcode:2007PLoSO ... 2..790B. doi:10.1371 / journal.pone.0000790. PMC  1949142. PMID  17726520.
  14. ^ Hampl V, Hug L, Leigh JW a kol. (Březen 2009). „Fylogenomické analýzy podporují monofylii Excavata a řeší vztahy mezi eukaryotickými“ superskupinami"". Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 106 (10): 3859–64. Bibcode:2009PNAS..106.3859H. doi:10.1073 / pnas.0807880106. PMC  2656170. PMID  19237557.
  15. ^ Madhusoodanan, Jyoti (24. srpna 2014). „Virová zánik květu řas: Mořské viry mohou být klíčovými hráči ve smrti mohutných květů řas, které se objevují v oceánu, ukazuje studie“. Vědec.

externí odkazy