Oomycete - Oomycete

Oomycety
Asexuální (A: sporangia, B: zoospores, C: chlamydospores) a sexuální (D: oospores) reprodukční struktury Phytophthora infestans (Peronosporales)
Asexuální (A: sporangia, B: zoospores, C: chlamydospores) a sexuální (D: oospores) reprodukční struktury Phytophthora infestans (Peronosporales )
Vědecká klasifikace E
Clade:SAR
Infrakingdom:Heterokonta
Kmen:Oomycota
Arx, 1967[1]
Třída:Oomycety
G. Winter, 1880
Objednávky a rodiny
Synonyma
  • Oomycety Zima, 1879[2]
  • Peronosporomycetes Dick, 2001[3]

Oomycota nebo oomycety (/ˌoʊəˈmaɪsiːts/[4]) tvoří zřetelný fylogenetické linie z houba -jako eukaryotický mikroorganismy. Oni jsou vláknitý a heterotrofní a může se rozmnožovat sexuálně i asexuálně. Sexuální reprodukce an oospore je výsledkem kontaktu mezi hyfy muže antheridia a žena oogonia; tyto spory mohou přezimovat a jsou známy jako klidové spory.[5] Nepohlavní rozmnožování zahrnuje vznik chlamydospory a sporangie, produkující pohyb zoospory.[5] Oomycety zabírají obojí saprofytický a patogenní životní styl a zahrnují některé z nejznámějších patogenů rostlin, které způsobují ničivé choroby, jako je pozdní plíseň brambor a náhlá dubová smrt. Jeden oomycete, mykoparazit Pythium oligandrum, se používá pro biokontrol, napadající rostlinné patogenní houby.[6] Oomycety jsou také často označovány jako vodní formy (nebo vodní formy), ačkoli příroda preferující vodu, která vedla k tomuto názvu, není pravdivá pro většinu druhů, které jsou suchozemskými patogeny.

Oomycety byly původně seskupeny s houby kvůli podobnosti v morfologii a životním stylu. Molekulární a fylogenetické studie však odhalily významné rozdíly mezi houbami a oomycety, což znamená, že ty jsou nyní seskupeny s stramenopiles (které zahrnují některé typy řasy ). Oomycota mají velmi řídký fosilní záznam; možná oomycete byla popsána od Křídový jantar.[7]

Etymologie

Oomycota pochází z řecký ωόν (oon, 'vejce') a μύκητας (mykitas, 'houba')[8][9], s odkazem na velké kolo oogonia, struktury obsahující ženské gamety, které jsou charakteristické pro oomycety.

Název „vodní plíseň“ označuje jejich dřívější klasifikaci jako houby a jejich preference pro podmínky vysoké vlhkosti a tekoucí povrchové vody, což je charakteristické pro bazální taxony oomycet.

Morfologie

Oomycety mají zřídka septa (viz hypha ), a pokud ano, jsou vzácné,[10] objevující se na základnách sporangií a někdy ve starších částech vláken.[11] Některé jsou jednobuněčné, zatímco jiné jsou vláknité a rozvětvené.[11]

Klasifikace

Zjednodušená fylogeneze.
Nepohlavní struktury (sporangie) v Saprolegniales, Albuginales a Peronosporales
Sexuální struktury (pouze oogonia, antheridia ne zobrazeno ) z Saprolegnia.

Dříve byla skupina uspořádána do šesti objednávek.[11]

  • The Saprolegniales jsou nejrozšířenější. Mnoho lidí rozkládá rozpadající se hmotu; jiní jsou paraziti.
  • The Leptomitales mají zahušťování stěn, které dávají jejich kontinuálnímu tělu buněk vzhled septace. Nosí chitin a často se množí nepohlavně.
  • The Rhipidiales pomocí rhizoidů připevněte thallus k lůžku stojatých nebo znečištěných vodních útvarů.
  • The Albuginales jsou některými autory považovány za rodinu (Albuginaceae) v rámci Peronosporales, ačkoli bylo prokázáno, že jsou fylogeneticky odlišné od tohoto řádu.
  • The Peronosporales také jsou hlavně saprofytické nebo parazitické na rostlinách a mají aseptátovou, rozvětvenou formu. Mnoho z nejvíce škodlivých zemědělských parazitů patří do tohoto řádu.
  • The Lagenidiales jsou nejprimitivnější; některé jsou vláknité, jiné jednobuněčné; jsou obecně parazitní.

V poslední době se to však podstatně rozšířilo.[12][13]

Fylogenetické vztahy

Pythium sp. (Peronosporales ), Který způsobuje pythiosis u zvířat pod mikroskopem.
Příznak pozdní plíseň (P. infestans, Peronosporales) na spodní straně bramborového listu.
Albugo candida (Albuginales) na pastýřské kabelce (Capsella bursa-pastoris, Brassicales).

Vnitřní

 
 
 

Haptoglossales

 
 

Eurychasmales

 
 
 
 

Haliphthorales

 
 
 

Olpidiopsidales

 
Oogametia
Saprolegniomycety
 

Atkinsiellales

 
 
 

Saprolegniales

 
 

Leptomitales

 
 
 
Peronosporomycetes s.s.
 

Rhipidiales

 
 
 

Albuginales

 
 

Peronosporales

 
 
 
 
 
 
 

Externí

Tato skupina byla původně zařazena mezi houby (název "oomycota" znamená "vaječná houba") a později zacházeno jako protistů, založený na obecné morfologii a životním stylu.[7] A kladistický analýza založená na moderních objevech o biologii těchto organismů podporuje relativně blízký vztah s některými fotosyntetickými organismy, jako jsou hnědé řasy a rozsivky. Běžný taxonomická klasifikace na základě těchto údajů umístí třída Oomycota spolu s dalšími třídami, jako jsou Phaeophyceae (hnědé řasy) v rámci kmen Heterokonta.

Tento vztah je podporován řadou pozorovaných rozdílů mezi charakteristikami oomycet a hub. Například buněčné stěny oomycetes se skládají z celulóza spíše než chitin[14] a obecně nemají septace. Také ve vegetativním stavu mají diploidní jádra, zatímco houby mají haploidní jádra. Většina oomycet produkuje samohybné zoospory se dvěma bičíky. Jeden bičík má morfologii „whiplash“ a druhý morfologii „pozlátka“. „Pozlátko“ bičík je jedinečné pro království Heterokonta. Spory několika skupin hub, které si uchovávají bičíky (např Chytridiomycetes ) mají pouze jeden bičík bičík.[14] Oomycota a houby mají různé metabolické dráhy pro syntézu lysin a mají řadu enzymů, které se liší.[14] Ultrastruktura je také odlišná, přičemž oomycota má tubulární mitochondriální cristae a houby, které mají zploštělé cristae.[14]

I přes tyto důkazy o opaku, mnoho druh Oomycetes jsou stále popsány nebo uvedeny jako druhy hub a někdy mohou být označovány jako pseudofungi nebo nižší houby.

Biologie

Reprodukce

Životní cyklus Phytophthora infestans (Peronosporales) na brambor.

Většina oomycet produkuje dva odlišné typy spor. Hlavní disperzní spory jsou nepohlavní, samohybné výtrusy volala zoospory, které jsou schopné chemotaxe (pohyb směrem k nebo od chemického signálu, jako jsou signály uvolňované potenciálními zdroji potravy) v povrchových vodách (včetně srážek na povrchu rostlin). Několik oomycet produkuje vzdušné nepohlavní spory, které jsou distribuovány větrem. Produkují také sexuální spory, tzv oospory, což jsou průsvitné, dvoustěnné sférické struktury používané k přežití nepříznivých podmínek prostředí.

Ekologie a patogenita

Neidentifikovaná vodní plíseň na mrtvé larvě jepice.
A kultura z Achlya sp. (Saprolegniales) izolovaný z potoka.
Mořský pstruh trpět UDN se sekundárním Saprolegnia infekce.

Mnoho druhů oomycet je ekonomicky důležitých, agresivních řas a rostlinné patogeny.[15][16] Některé druhy mohou způsobit onemocnění ryb a alespoň jeden je patogenem savců. Většinu rostlinných patogenních druhů lze rozdělit do čtyř skupin, i když existuje více.

Reference

  1. ^ Arx, J.A. von. 1967. Pilzkunde. :1-356
  2. ^ Winter, G. Rabenhorstova kryptogamen-flóra, 2. vyd., Sv. 1, část 1, str. 32, 1880 [1879].
  3. ^ Dick, M. W. (2001). Vytrvalá houba. Dordrecht, Nizozemsko: Kluwer Academic Publishers, str. 289.
  4. ^ "oomycete". Collins anglický slovník. HarperCollins. Citováno 4. června 2014.
  5. ^ A b Agrios, George (2005). Patologie rostlin. Elsevier. str. 409.
  6. ^ Vallance, J .; Le Floch, G .; Deniel, F .; Barbier, G .; Levesque, C. A .; Rey, P. (2009). „Vliv Pythium oligandrum Biocontrol na populační dynamiku hub a oomycete v rhizosféře“. Aplikovaná a environmentální mikrobiologie. 75 (14): 4790–800. doi:10.1128 / AEM.02643-08. PMC  2708430. PMID  19447961.
  7. ^ A b "Úvod do Oomycota". Citováno 2014-07-07.
  8. ^ „ωόν - Βικιλεξικό“. el.wiktionary.org. Citováno 2020-01-22.
  9. ^ "μύκητας - Wikislovník". en.wiktionary.org. Citováno 2020-01-22.
  10. ^ Kortekamp, ​​A. (2005). „Růst, výskyt a vývoj septa v Plasmopara viticola a dalších členech Peronosporaceae pomocí světelné a epifluorescenční mikroskopie“. Mykologický výzkum. 109 (Pt 5): 640–648. doi:10.1017 / S0953756205002418. PMID  16018320.
  11. ^ A b C Sumbali, Geeta; Johri, B. M (leden 2005). Houby. ISBN  978-1-84265-153-7.
  12. ^ Ruggiero; et al. (2015), „Vyšší klasifikace všech živých organismů“, PLOS ONE, 10 (4): e0119248, Bibcode:2015PLoSO..1019248R, doi:10.1371 / journal.pone.0119248, PMC  4418965, PMID  25923521
  13. ^ Silar, Philippe (2016), „Protistes Eucaryotes: Origine, Evolution et Biologie des Microbes Eucaryotes“, Archivy HAL - převody: 1–462
  14. ^ A b C d Van der Auwera G, De Baere R, Van de Peer Y, De Rijk P, Van den Broeck I, De Wachter R (červenec 1995). „Fylogeneze Hyphochytriomycota odvozená z ribosomálních RNA sekvencí Hyphochytrium catenoides“. Mol. Biol. Evol. 12 (4): 671–8. doi:10.1093 / oxfordjournals.molbev.a040245. PMID  7659021.
  15. ^ Agrios, George N. (2005). Patologie rostlin. 5. vyd. Akademický tisk. odkaz.
  16. ^ Schwelm A, Badstöber J, Bulman S, Desoignies N, Etemadi M, Falloon RE, Gachon CM, Legreve A, Lukeš J, Merz U, Nenarokova A, Strittmatter M, Sullivan BK, Neuhauser S (duben 2018). „Ne ve vašich obvyklých Top 10: prváci, kteří infikují rostliny a řasy“. Molekulární rostlinná patologie. 19 (4): 1029–1044. doi:10,1111 / mpp.12580. PMC  5772912. PMID  29024322.
  17. ^ Haas, BJ; Kamoun, S; Zody, MC; Jiang, RH; Handsaker, RE; Cano, LM; Grabherr, M; Kodira, CD; et al. (2009). „Sekvence genomu a analýza irského patogenu bramborového hladomoru Phytophthora infestans“. Příroda. 461 (7262): 393–8. Bibcode:2009 Natur.461..393H. doi:10.1038 / nature08358. PMID  19741609.
  18. ^ Vettraino, A. M .; Morel, O .; Perlerou, C .; Robin, C .; Diamandis, S .; Vannini, A. (2005). "Výskyt a distribuce druhů Phytophthora v evropských kaštanových porostech a jejich souvislost s inkoustovým onemocněním a úbytkem korun". European Journal of Plant Pathology. 111 (2): 169–180. doi:10.1007 / s10658-004-1882-0. S2CID  2041934.

externí odkazy