Amphidinium - Amphidinium
| Amphidinium | |
|---|---|
 | |
| Boční pohled na Amphidinium sulcatum. ahoj., amyloid tělo; chr., chromatofor; ep., přední část buňky před příčnou brázdou; fl.p., bičíkový pór; lf, podélná brázda; n., buněčné jádro; tr.f., příčná brázda (s bičík ); vac., vakuola. | |
| Vědecká klasifikace | |
| Doména: | |
| (bez hodnocení): | |
| (bez hodnocení): | |
| Kmen: | |
| Třída: | |
| Objednat: | |
| Rodina: | |
| Rod: | Amphidinium |
Amphidinium je rod dinoflageláty. Typ rodu je Amphidinium operculatum Claparède & Lachmann. Rod zahrnuje druh Amphidinium carterae který se používá jako modelový organismus.[1]
Jako dinoflageláty Amphidinium spp. mít chloroplasty. The Amphidinium chloroplast genom je neobvyklé v tom, že nemá jediný souvislý kruhový genom.[2][3] Místo toho se chloroplastové geny kódované v chloroplastové DNA nacházejí na četných 2–3 kbp minikruhy,[2][3] analogicky k plazmidy. Většina minikruhů má pouze několik genů kódujících proteiny; mnozí mají jen jeden gen.[2][3] Existují zprávy o minikruzích, které nemají známé přepisy, jako například v Amphidinium carterae genom chloroplastů,[3] ačkoli tyto nebyly nalezeny v EU Symbiodinium sp. Genom chloroplastů Clade C3.[2] Transkripty odvozené od minikruhu lze zpracovat způsoby, které nejsou pro eukaryoty typické, včetně přidání 3 'poly (U) ocasu,[3] na rozdíl od typického poly (A) ocasu odvozeného z polyadenylace eukaryotických přepisů. Rovněž se produkují antisense transkripty odvozené od minikruhu, ale bez 3 'poly (U) ocasů.[3]
Reference
- ^ Nash, E .; Barbrook, A .; Edwards-Stuart, R .; Bernhardt, K .; Howe, C .; Nisbet, R. (2007). „Organizace mitochondriálního genomu v dinoflagelátu Amphidinium carterae“. Molekulární biologie a evoluce. 24 (7): 1528–1536. doi:10,1093 / molbev / msm074. PMID 17440175.
- ^ A b C d Barbrook, Adrian C .; Voolstra, Christian R .; Howe, Christopher J. (2014). „Chloroplastový genom izolátu Symbiodinium sp. Clade C3“. Protist. 165 (1): 1–13. doi:10.1016 / j.protis.2013.09.006. PMID 24316380.
- ^ A b C d E F Dorrell, Richard G .; Nisbet, R. Ellen R .; Barbrook, Adrian C .; Rowden, Stephen J.L .; Howe, Christopher J. (2019). „Integrovaná genomová a transkriptomická analýza peridinin dinoflagelátu Amphidinium carterae Plastid “. Protist. 170 (4): 358–373. doi:10.1016 / j.protis.2019.06.001. PMID 31415953.
Další čtení
- Pagliaraa, Patrizia; Caroppo, Carmela (listopad 2012). „Hodnocení toxicity Amphidinium carterae, Coolia cfr. Monotis a Ostreopsis cfr. Ovata (Dinophyta) izolované ze severního Jónského moře (Středozemní moře)“. Toxicon. 60 (6): 1203–14. doi:10.1016 / j.toxicon.2012.08.005. PMID 22925842.
- Murray, Shauna A .; Garby, Tamsyn; Hoppenrath, Mona; Neilan, Brett A. (4. června 2012). „Genetická rozmanitost, morfologická uniformita a produkce polyketidů v dinoflagelátech (Amphidinium, Dinoflagellata)“. PLOS ONE. 7 (6): e38253. Bibcode:2012PLoSO ... 738253M. doi:10.1371 / journal.pone.0038253. PMC 3366924. PMID 22675531.