Monofilie - Monophyly

Viz také: Crown skupina

A fylogenetický strom: jsou modrá i červená skupina monofyletický. Zelená skupina je paraphyletic protože chybí monofyletická skupina (modrá skupina), která sdílí společného předka - nejnižší zelený vertikální kmen.
Cladogram primáti, zobrazující a monofyletický taxon: opičí (žlutě); A paraphyletic taxon: prosimians (v azurové, včetně červené skvrny); a a polyfyletický skupina: noční aktivní primáti, tj lorises a tarsiers (v červené)
Cladogram obratlovců ukazující fylogenetické skupiny. A monofyletický taxon (žlutě): skupina „plazů a ptáků“, obsahuje jeho posledního společného předka a všechny potomky tohoto předka. A paraphyletic taxon (v azurové): skupina plazů, obsahuje svého posledního společného předka, ale neobsahuje všechny potomky (jmenovitě Aves) tohoto předka. A polyfyletický „skupina“ (červeně): skupina všechna teplokrevná zvířata (Aves a Mammalia), neobsahuje nejnovějšího společného předka všech svých členů; tato skupina není považována za taxonomickou jednotku a není moderní považována za taxon systematici.

v kladistika pro skupinu organismy, monofilie je podmínkou být a clade —To je skupina taxony složený pouze z a společný předek (nebo přesněji rodový populace ) a všichni jeho přímí potomci. Monofyletické skupiny jsou obvykle charakterizovány sdílenými odvozenými vlastnostmi (synapomorfie ), které odlišují organismy v kladu od jiných organismů. Ekvivalentní termín je holofyly.[1]

Slovo „mono-phyly“ znamená v řečtině „jeden kmen“.

Monophyly je v kontrastu s parafylově a polyfyly jak ukazuje druhý diagram. A parafyletická skupina Skládá se ze všech potomků společného předka bez jedné nebo více monofyletických skupin. A polyfyletická skupina je charakterizováno konvergentní rysy nebo zvyky vědeckého zájmu (například primáty aktivní v noci, ovocné stromy, vodní hmyz). Vlastnosti, kterými se polyfyletická skupina odlišuje od ostatních, nejsou zděděny od společného předka.

Přijetí těchto definic nějakou dobu trvalo. Když se v 60. letech stala myšlenková škola kladistiky hlavním proudem, používalo se několik alternativních definic. Vskutku, taxonomists někdy používané termíny bez jejich definice, což vede k nejasnostem v rané literatuře,[2] zmatek, který přetrvává.[3]

První diagram ukazuje a fylogenetický strom se dvěma monofyletickými skupinami. Několik skupin a podskupin je zvláště umístěno jako větve stromu, které označují uspořádané přímé vztahy mezi všemi zobrazenými organismy. Jakoukoli skupinu lze (ale nemusí) považovat za taxon moderní systematičnost, v závislosti na výběru jejích členů ve vztahu k jejich společným předkům; viz druhý a třetí diagram.

Etymologie

Termín monofilienebo monofyletický, pochází z těchto dvou Starořečtina slova μόνος (mónos), což znamená „pouze, jediný, jedinečný“ a φῦλον (phûlon), což znamená „rod, druh“,[4][5] a odkazuje na skutečnost, že monofyletická skupina zahrnuje organismy (např. rody, druhy) skládající se ze všech potomků unikátní společný předek.

Naopak termín polyfyly nebo polyfyletický, navazuje na starogréckou předponu πολύς (polús), což znamená „mnoho, hodně“,[4][5] a týká se skutečnosti, že polyphyletická skupina zahrnuje organismy vznikající z násobek zdroje předků.

Pro srovnání, termín parafylově nebo paraphyletic, používá starořeckou předponu παρά (pará), což znamená „vedle, blízko“,[4][5] a označuje situaci, ve které je jedna nebo několik monofyletických podskupin ponechány od sebe od všech ostatních potomků jedinečného společného předka. To znamená, že parafyletická skupina je téměř monofyletický, proto předpona pará.

Definice

V nejširším měřítku spadají definice do dvou skupin.

  • Willi Hennig (1966: 148) definovali monofylii jako skupiny založené na synapomorfie (na rozdíl od parafyletických skupin na základě symplesiomorphy a polyfyletické skupiny, založené na konvergence ). Někteří autoři se snažili definovat monofylii tak, aby zahrnovala parafylii jako dvě nebo více skupin sdílejících společného předka.[3][6][7][8] Tato širší definice však zahrnuje jak monofyletické, tak parafyletické skupiny, jak jsou definovány výše. Proto dnes většina vědců omezuje termín „monofyletický“ na skupiny skládající se ze všech potomků jednoho (hypotetického) společného předka.[2] Pokud však vezmeme v úvahu taxonomické skupiny, jako jsou rody a druhy, nejvhodnější povaha jejich společného předka je nejasná. Za předpokladu, že by šlo o jednoho jedince nebo pářící se pár, je nerealistické pro sexuálně se množící druhy, které jsou ze své podstaty křížit se.[9]
  • Monophyly (také, holofyly) a související výrazy jsou omezeny na diskuzi o taxonomech a nemusí být nutně přesné, pokud se používají k popisu toho, co Hennig nazval tokogenetické vztahy - nyní označované jako genealogie. Někteří argumentují, že použití širší definice, jako je druh a všichni jeho potomci, ve skutečnosti nefunguje k definování rodu.[9] Volná definice také nedokáže rozpoznat vztahy všech organismů.[10] Podle D. M. Stamose je uspokojivá kladistická definice druhu nebo rodu nemožná, protože mnoho druhů (a dokonce i rodů) může vzniknout „pučením“ ze stávajícího druhu a ponechat rodičovský druh parafyletický; nebo druh nebo rod může být výsledkem hybridní speciace.[11]
  • Navíc pojmy monofilie, parafylově, a polyfyly byly použity k odvození klíčových genů pro čárové kódy rozmanité skupiny druhů.[12]

Viz také

Reference

  1. ^ Allaby, Michael (2015). Slovník ekologie (5. vyd.). Oxford: Oxford University Press. ISBN  9780191793158.
  2. ^ A b Hennig, Willi; Davis, D. (překladatel); Zangerl, R. (Translator) (1999) [1966]. Fylogenetická systematika (Illinois Reissue ed.). Správní rada University of Illinois. 72–77. ISBN  978-0-252-06814-0.
  3. ^ A b Aubert, D. 2015. Formální analýza fylogenetické terminologie: Směrem k přehodnocení současného paradigmatu v systematice. Fytoneuron 2015-66:1–54.
  4. ^ A b C Bailly, Anatole (1. ledna 1981). Abrégé du dictionnaire grec français. Paris: Hachette. ISBN  978-2010035289. OCLC  461974285.
  5. ^ A b C Bailly, Anatole. "Řecko-francouzský slovník online". www.tabularium.be. Citováno 7. března 2018.
  6. ^ Colless, Donald H. (březen 1972). „Monofilie“. Systematická zoologie. 21 (1): 126–128. doi:10.2307/2412266. JSTOR  2412266.
  7. ^ Envall, Mats (2008). „O rozdílu mezi mono-, holo- a parafyletickými skupinami: důsledné rozlišení procesu a vzoru“. Biologický žurnál společnosti Linnean. 94: 217–220. doi:10.1111 / j.1095-8312.2008.00984.x.
  8. ^ Ashlock, Peter D. (březen 1971). "Monofilie a související pojmy". Systematická zoologie. 20 (1): 63–69. doi:10.2307/2412223. JSTOR  2412223.
  9. ^ A b Simpson, George (1961). Principy živočišné taxonomie. New York: Columbia University Press. ISBN  978-0-231-02427-3.
  10. ^ Carr, Dr. Steven M. „Monofyletické, polyfyletické a parafyletové taxony“. www.mun.ca. Citováno 23. února 2018.
  11. ^ Stamos, D.N. (2003). Druhový problém: biologické druhy, ontologie a metafyzika biologie. Lanham, MD [USA]: Lexington Books. 261–268. ISBN  978-0739105030.
  12. ^ Parhi J., Tripathy P.S., Priyadarshi, H., Mandal S.C., Pandey P.K. (2019). "Diagnóza mitogenomu pro robustní fylogenezi: Případ skupiny ryb Cypriniformes". Gen. 713: 143967. doi:10.1016 / j.gene.2019.143967. PMID  31279710.CS1 maint: více jmen: seznam autorů (odkaz)

externí odkazy