Archaeplastida - Archaeplastida
![]() | Součásti tohoto článku (související s úvodem) musí být aktualizováno.Leden 2020) ( |
Archaeplastida | |
---|---|
![]() | |
Stromy, trávy a řasy v okolí a kolem Řeka Sprague, Oregon | |
Vědecká klasifikace ![]() | |
Doména: | Eukaryota |
(bez hodnocení): | Diaphoretickes |
(bez hodnocení): | Archaeplastida Adl et al., 2005[1] |
Podskupiny | |
Synonyma | |
|
The Archaeplastida (nebo království Plantae sensu lato ) jsou hlavní skupinou autotrofní eukaryoty, zahrnující červené řasy (Rhodophyta) zelené řasy a suchozemské rostliny, společně s malou skupinou sladkovodních jednobuněčných řas glaukofyty.[4] Archaeplastida chloroplasty které jsou obklopeny dvěma membránami, což naznačuje, že byly získány přímo z endosymbiotikum sinice. Všechny ostatní skupiny kromě améboidu Paulinella chromatophora, mají chloroplasty obklopené třemi nebo čtyřmi membránami, což naznačuje, že byly získány sekundárně z červených nebo zelených řas. Na rozdíl od červených a zelených řas nebyly glaukofyty nikdy zapojeny do sekundárních endosymbiózních událostí.[5]
Buňky archaeplastidy obvykle chybí centrioly a mít mitochondrie s bytem cristae. Obvykle mají buněčná stěna který obsahuje celulóza a jídlo je skladováno ve formě škrob. Tyto vlastnosti jsou však sdíleny i s jinými eukaryoty. Hlavním důkazem toho, že archaeplastida tvoří a monofyletický skupina pochází z genetických studií, které naznačují jejich plastidy pravděpodobně měl jediný původ. Tento důkaz je sporný.[6][7] Na základě dosavadních důkazů není možné potvrdit nebo vyvrátit alternativní evoluční scénáře k jedinému primární endosymbióza.[8] Fotosyntetické organismy s plastidy různého původu (např hnědé řasy ) nepatří do Archaeplastidy.
Archaeplastidani spadají do dvou hlavních evolučních linií. Červené řasy jsou pigmentovány chlorofyl A a fykobiliproteiny jako většina sinic a hromadí škrob mimo chloroplasty. Zelené řasy a suchozemské rostliny - společně známé jako Viridiplantae (Latinsky „zelené rostliny“) nebo chloroplastida - jsou pigmentovány chlorofyly A a b, ale postrádají fykobiliproteiny a uvnitř chloroplastů se hromadí škrob.[9] Tyto glaukofyty mají typické cyanobakteriální pigmenty a jsou neobvyklé v zadržování buněčné stěny v jejich plastidech (tzv. Kyanelách).[1]
Archaeplastida by neměla být zaměňována se starším a zastaralým názvem Archiplastideae, který odkazuje sinice a další skupiny bakterií.[10][11]
Taxonomie
Konsenzus v roce 2005, kdy byla skupina skládající se z glaukofytů a červených a zelených řas a suchozemských rostlin pojmenována „Archaeplastida“,[1] bylo to, že to bylo clade, tj. byl monofyletický. Mnoho studií publikovaných od té doby poskytlo důkazy ve shodě.[12][13][14][15] Jiné studie však naznačují, že skupina je paraphyletic.[16][17][18][7] K dnešnímu dni se situace jeví jako nevyřešená, ale v nedávné studii (s obohacením genů červených řas) byl prokázán silný signál pro monofylii Plantae (Archaeplastida).[19] Zde se vychází z předpokladu, že Archaeplastida je platný clade.
Skupině byla dána různá jména. Někteří autoři tuto skupinu jednoduše označili jako rostliny nebo Plantae.[20][21] Název Plantae je však nejednoznačný, protože se také používá pro méně inkluzivní clades, jako Viridiplantae a embryofyty. Rozlišovat, větší skupina je někdy známá jako Plantae sensu lato („rostliny v širším slova smyslu“).
Aby se zabránilo nejednoznačnosti, byla navržena jiná jména. Primoplantae, která se objevila v roce 2004, se zdá být prvním novým názvem navrhovaným pro tuto skupinu.[3] Další název aplikovaný na tento uzel je Plastida, definovaný jako sdílení kladu „plastidy primárního (přímého prokaryota) původu [jako] v Magnolia virginiana Linné 1753 ".[22]
Ačkoli mnoho studií naznačuje, že archaeplastida tvoří a monofyletický skupina,[23] papír z roku 2009 tvrdí, že ve skutečnosti jsou paraphyletic.[18] Obohacení nových genů červených řas v nedávné studii prokazuje silný signál pro monofylii Plantae (Archaeplastida) a stejně silný signál historie sdílení genů mezi červeno-zelenými řasami a jinými liniemi.[19] Tato studie poskytuje pohled na to, jak jsou bohatá data o genech mezofilních červených řas klíčová pro testování kontroverzních problémů ve vývoji eukaryot a pro pochopení složitých vzorů dědičnosti genů u protistů.
Název Archaeplastida navrhla v roce 2005 velká mezinárodní skupina autorů (Adl et al.), jehož cílem bylo vytvořit klasifikaci pro eukaryoty která brala v úvahu morfologii, biochemii a fylogenetiku a která měla „určitou stabilitu v blízké budoucnosti“. Odmítli použití formálních taxonomických hodností ve prospěch hierarchického uspořádání, kde jména kladu neznamenají hodnost. Název kmene „Glaucophyta“ a název třídy „Rhodophyceae“ se tedy v jejich klasifikaci objevují na stejné úrovni. Divize navržené pro Archaeplastida jsou uvedeny níže v tabulkové i schematický tvar.[1]
Archaeplastida:
- Glaucophyta Skuja, 1954 (Glaucocystophyta Kies & Kremer, 1986) - glaukofyty
- Glaukofyty jsou malá skupina sladkovodních jednobuněčných řas. Jejich chloroplasty volaly kyanel, mít peptidoglykan vrstvy, což je více podobá sinicím než u zbývající Archaeplastidy.
- Rhodophyceae Thuret, 1855, emend. Vychází Rabenhorst, 1863. Adl et al., 2005 (Rhodophyta Wettstein 1901) - červené řasy
- Červené řasy tvoří jednu z největších skupin řas. Většinou jde o mořské řasy, které jsou mnohobuněčné a mořské. Jejich červená barva pochází fykobiliproteiny, použitý jako doplňkové pigmenty v zachycení světla pro fotosyntézu.
- Chloroplastida Adl et al., 2005 (Viridiplantae Cavalier-Smith 1981; Chlorobionta Jeffrey 1982, emend. Bremer 1985, emend. Lewis a McCourt 2004; Chlorobiota Kendrick a Crane 1997)
- Chloroplastida je termín zvolený Adl et al. pro skupinu tvořenou zelenými řasami a suchozemskými rostlinami (embryofyty). Kromě případů, kdy jsou sekundárně ztraceny, mají všechny chloroplasty bez peptidoglykanové vrstvy a postrádají fykobiliproteiny.
- Chlorophyta Pascher, 1914, emend. Lewis & McCourt, 2004 - zelené řasy (část)
- Adl a kol. používají úzkou definici chlorofyty; další zdroje zahrnují Chlordendrales a Prasinophytae, které lze samy kombinovat.
- Ulvophyceae Mattox & Stewart, 1984
- Trebouxiophyceae Friedl, 1995 (Pleurastrophyceae Mattox a kol. 1984; Microthamniales Melkonian 1990)
- Chlorophyceae Christensen, 1994
- Chlorodendrales Fritsch, 1917 - zelené řasy (část)
- Prasinophytae Cavalier-Smith, 1998, emend. Lewis & McCourt, 2004 - zelené řasy (část)
- Mezostigma Lauterborn, 1894, emend. McCourt v Adl et al., 2005 (Mesostigmata Turmel, Otis a Lemieux 2002)
- Charophyta Karol et al., 2001, emend. Lewis & McCourt, 2004 (Charophyceae Smith 1938, vyd. Mattox a Stewart 1984) - zelené řasy (část) a suchozemské rostliny
- Charophyta sensu lato, jak jej používá Adl et al., je monofyletická skupina, kterou tvoří některé zelené řasy, včetně kamenů (Charophyta) sensu stricto), jakož i suchozemské rostliny (embryofyty).
- Subdivize jiné než Streptophytina (níže) nebyly uvedeny Adl et al.
- Mezi další zdroje patří skupiny zelených řas Chlorokybales, Klebsormidiales, Zygnematales a Coleochaetales.[24]
- Streptophytina Lewis & McCourt, 2004 - kameny a suchozemské rostliny
Kladogram
Níže je uvedena konsensuální rekonstrukce vztahů zelených řas, založená hlavně na molekulárních datech.[25][26][27][28][29][30][31][32][33][34] Zatímco Glaucophyta jsou typicky považovány za nejhlubší kořeny Archeaplastida,[35][36][37][38] některé genomové výzkumy poukazují na Rhodophyta jako na bazální, pravděpodobně s Cryptistou a picozoa, které se objevují v Archaeplastidě.[39][40][41][42][43][44][45]
Diaphoretickes |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
V blízkosti kořene Archaeplastida je však spousta sporů, např. zda jsou Glaucophyta nebo Rhodophyta bazální, nebo zda např. Kryptista se objevil v Archaeplastidě. V roce 2014 byl zveřejněn důkladný přezkum těchto nesrovnalostí.[46] Pozice Telonemia a Picozoa nejsou jasné. Také Hacrobia (Haptista + Cryptista) může být zcela spojena s klade SAR. SAR jsou často považovány za hybridy eukaryot-eukaryot, což přispívá ke zmatku v genetických analýzách. Sestra Gloeomargarita lithophora byl pohlcen předkem Archaeplastidy, vedoucí k plastidy které ve většině potomků žijí v permanentní endosymbióze. Protože jak Gloeomargarita, tak příbuzné cyanobakterie žijí kromě nejprimitivnějších archaeplastidů všichni ve sladké vodě, zdá se, že archaeplastida pocházela ze sladké vody a kolonizovala oceány až v pozdním proterozoiku.[47][48]
Morfologie
Všechny archaeplastidany mají plastidy (chloroplasty), které provádějí fotosyntézu a předpokládá se, že jsou odvozeny z endosymbiotických sinic. V glaukopytech, možná nejprimitivnějších členech skupiny, se chloroplast nazývá a cyanelle a sdílí několik rysů s cyanobakteriemi, včetně buněčné stěny peptidoglykanu, které nejsou zachovány u ostatních členů skupiny. Podobnost cyanel s sinicemi podporuje endosymbiotická teorie.
Buňky většiny archaeplastidanů mají stěny, obvykle, ale ne vždy, vyrobené z celulózy.
Archaeplastida se velmi liší stupněm buněčné organizace, od izolovaných buněk přes vlákna po kolonie až po mnohobuněčné organismy. Nejdříve byli jednobuněční a mnoho skupin jimi zůstává dodnes. Mnohobuněčnost se vyvinula samostatně v několika skupinách, včetně červených řas, ulvophyte zelené řasy, a v zelených řasách, které vedly k kamenné a suchozemské rostliny.
Endosymbióza
Protože se předpokládá, že archaeplastidan předků získal své chloroplasty přímo pohlcením sinic, je událost známá jako primární endosymbióza (jak se odráží ve jménu zvoleném pro skupinu „Archaeplastida“, tj. „starověký plastid“). Jeden druh zelených řas, Cymbomonas tetramitiformis v pořadí Pyramimonadales, je mixotrof a je schopen se podporovat prostřednictvím obou fagotrofie a fototrofie. Dosud není známo, zda se jedná o primitivní znak, a proto definuje posledního společného předka Archaeplastidy, který by mohl vysvětlit, jak získal své chloroplasty, nebo zda se jedná o znak znovu získaný horizontální přenos genů.[49]
Důkazy pro primární endosymbózu zahrnují přítomnost dvojité membrány kolem chloroplastů; jedna membrána patřila bakterii a druhá eukaryotům, které ji zachytily. V průběhu doby bylo mnoho genů z chloroplastů přeneseno do jádra hostitelské buňky. Přítomnost těchto genů v jádrech eukaryot bez chloroplastů naznačuje, že k tomuto přenosu došlo na počátku vývoje skupiny.[50]
Zdá se, že ostatní eukaryoty s chloroplasty je získaly tím, že pohltily jednobuněčný archaeplastidan svými vlastními bakteriálně odvozenými chloroplasty. Protože tyto události zahrnují endosymbiózu buněk, které mají své vlastní endosymbionty, nazývá se tento proces sekundární endosymbióza. Chloroplasty takových eukaryot jsou typicky obklopeny více než dvěma membránami, což odráží historii mnohonásobného pohlcení. Chloroplasty z euglenidi, chlorarachniofyty a malá skupina dinoflageláty vypadají jako zachycené zelené řasy,[51] zatímco u zbývajících fotosyntetických eukaryot, jako je např heterokont řasy, kryptofyty, haptophyty a dinoflageláty se zdají být zachycenými červenými řasami.
Fosilní záznam
Snad nejstarší pozůstatky Archaeplastidy jsou domnělé červené řasy (Rafatazmia ) v rámci stromatolity v 1600 Ma (před miliony let) horniny v Indii.[52] O něco novější jsou mikrofosílie ze skupiny Roper v severní Austrálii. Struktura těchto jednobuněčných fosilií připomíná moderní zelené řasy. Datují se do Mezoproterozoikum Éra, asi 1500 až 1300 Ma.[53] Tyto fosílie jsou v souladu s a molekulární hodiny studie, která počítala s tím, že se tato clade rozcházela asi 1 500 Ma.[54] Nejstarší fosilií, kterou lze přiřadit ke konkrétní moderní skupině, je červená řasa Bangiomorpha, od 1200 Ma.[55]
Pozdě Neoproterozoikum Doba, fosilní řasy se staly četnějšími a rozmanitějšími. Nakonec v Paleozoikum Éra, rostliny se vynořily na pevninu a pokračovaly v rozkvětu až do současnosti.
Reference
- ^ A b C d Adl, S.M .; et al. (2005). „Nová vyšší klasifikace eukaryot s důrazem na taxonomii protistů“. Journal of Eukaryotic Microbiology. 52 (5): 399–451. doi:10.1111 / j.1550-7408.2005.00053.x. PMID 16248873. S2CID 8060916.
- ^ Cavalier-Smith, T. (1981). „Království Eukaryote: Sedm nebo devět?"". BioSystems. 14 (3–4): 461–481. doi:10.1016/0303-2647(81)90050-2. PMID 7337818.
- ^ A b Palmer, Jeffrey D .; Soltis, Douglas E .; Chase, Mark W. (2004). „Rostlinný strom života: přehled a některé úhly pohledu“. American Journal of Botany. 91 (10): 1437–1445. doi:10,3732 / ajb.91.10.1437. PMID 21652302.
- ^ Ball S, Colleoni C, Cenci U, Raj JN, Tirtiaux C (leden 2011). „Vývoj glykogenu a metabolismu škrobu u eukaryot dává molekulární stopy k pochopení vzniku plastidové endosymbiózy.“. Journal of Experimental Botany. 62 (6): 1775–1801. doi:10.1093 / jxb / erq411. PMID 21220783.
- ^ Příručka mořských řas: Biotechnologické pokroky
- ^ Parfrey. L. W .; Barbero, E .; Lasser, E; et al. (Prosinec 2006). „Hodnocení podpory pro současnou klasifikaci eukaryotické rozmanitosti“. Genetika PLOS. 2 (12): e220. doi:10.1371 / journal.pgen.0020220. PMC 1713255. PMID 17194223.
- ^ A b Kim, E; Graham, L. E. (červenec 2008). Redfield, Rosemary Jeanne (ed.). „Analýza EEF2 zpochybňuje monofylii Archaeplastida a Chromalveolata“. PLOS ONE. 3 (7): e2621. Bibcode:2008PLoSO ... 3.2621K. doi:10.1371 / journal.pone.0002621. PMC 2440802. PMID 18612431.
- ^ Mackiewicz, P .; Gagat, P. (2014). „Monofilie superskupiny Archaeplastida a vztahy mezi jejími liniemi ve světle fylogenetických a fylogenomických studií. Jsme blízko konsensu?“. Acta Societatis Botanicorum Poloniae. 83 (4): 263–280. doi:10.5586 / asbp.2014.044.
- ^ Viola, R .; Nyvall, P .; Pedersén, M (2001). „Jedinečné vlastnosti metabolismu škrobu v červených řasách“. Sborník Královské společnosti B: Biologické vědy. 268 (1474): 1417–1422. doi:10.1098 / rspb.2001.1644. PMC 1088757. PMID 11429143.
- ^ Copeland, H. F. (1956). Klasifikace nižších organismů. Palo Alto: Pacific Books, str. 29, [1].
- ^ Bessey, C. E. (1907). "Souhrn rostlinné fyly". Univ. Nebraska studia. 7: 275–358.
- ^ Burki, Fabien; Kamran Shalchian-Tabrizi; Marianne Minge; Åsmund Skjæveland; Sergej I. Nikolaev; Kjetill S. Jakobsen; Jan Pawlowski (2007). Butler, Geraldine (ed.). „Fylogenomika přeměňuje eukaryotické superskupiny“. PLOS ONE. 2 (8): e790. Bibcode:2007PLoSO ... 2..790B. doi:10.1371 / journal.pone.0000790. PMC 1949142. PMID 17726520.
- ^ Burki, F .; Inagaki, Y .; Brate, J .; Archibald, J. M .; Keeling, P. J .; Cavalier-Smith, T .; et al. (2009). „Rozsáhlé fylogenomické analýzy ukazují, že dvě záhadné protistické linie, Telonemia a Centroheliozoa, souvisí s fotosyntetickými chromalveoláty“. Biologie genomu a evoluce. 1: 231–238. doi:10.1093 / gbe / evp022. PMC 2817417. PMID 20333193.
- ^ Cavalier-Smith, Thomas (2009). „Kingdom Protozoa and Chromista and the eozoan root of the eukaryotic tree“. Biologické dopisy. 6 (3): 342–345. doi:10.1098 / rsbl.2009.0948. PMC 2880060. PMID 20031978.
- ^ Rogozin, I. B .; Basu, M. K .; Csürös, M. & Koonin, E. V. (2009). „Analýza vzácných genomových změn nepodporuje fylogenezi Unikont – Bikont a naznačuje sinicózu sinic jako bod primárního záření eukaryot“. Biologie genomu a evoluce. 1: 99–113. doi:10.1093 / gbe / evp011. PMC 2817406. PMID 20333181.
- ^ Baldauf, S.L., Roger, A.J., Wenk-Siefert, I., Doolittle, W.F. 2000. Fylogeneze eukaryot na úrovni království založená na kombinovaných údajích o bílkovinách. Science 290: 972-977 (researchgate.net)
- ^ Lipscomb, Diana. 1991. Široká klasifikace: království a prvoky. In: Parasitic Protozoa, sv. 1, 2. vydání, J.P. Kreier, J.R. Baker (eds.), Str. 81-136. Academic Press, San Diego.
- ^ A b Nozaki, H .; Marujama, S .; Matsuzaki, M .; Nakada, T .; Kato, S .; Misawa, K. (prosinec 2009). "Fylogenetické polohy Glaucophyta, zelených rostlin (Archaeplastida) a Haptophyta (Chromalveolata), jak je odvozeno z pomalu se vyvíjejících jaderných genů". Molekulární fylogenetika a evoluce. 53 (3): 872–80. doi:10.1016 / j.ympev.2009.08.015. PMID 19698794.
- ^ A b Chan, C. X .; Yang, E. C .; Banerjee, T .; Yoon, H. S .; Martone, P. T .; Estevez, J. M .; Bhattacharya, D. (2011). „Monofylie červené a zelené řasy a rozsáhlé sdílení genů nalezené v bohatém repertoáru genů červených řas“. Aktuální biologie. 21 (4): 328–333. doi:10.1016 / j.cub.2011.01.037. PMID 21315598. S2CID 7162977.
- ^ T. Cavalier-Smith (1981). „Eukaryote Kingdoms: Seven or Nine?“. BioSystems. 14 (3–4): 461–481. doi:10.1016/0303-2647(81)90050-2. PMID 7337818.
- ^ Bhattacharya, Debashish; Yoon, Hwan Su; Hackett, Jeremiah (2003). „Fotosyntetická eukaryota se spojují: tečky spojuje endosymbióza“. BioEssays. 26 (1): 50–60. doi:10.1002 / bies.10376. PMID 14696040.
- ^ Simpson, A. G. B. (2004). "Taxony nejvyšší úrovně v eukaryotech". První mezinárodní setkání s fylogenetickou nomenklaturou. Paříž, 6. – 9. Července.
- ^ Vinogradov S. N .; Fernández, I .; Hoogewijs, D .; Arredondo-Peter, R. (říjen 2010). "Fylogenetické vztahy 3/3 a 2/2 hemoglobinů v genomu archaeplastidy k bakteriálním a jiným eukaryotickým hemoglobinům". Molekulární rostlina. 4 (1): 42–58. doi:10,1093 / mp / ssq040. PMID 20952597. Archivovány od originál dne 2012-12-09. Citováno 2011-01-08.
- ^ Turmel, M .; Otis, C .; Lemieux, C. (2005). „Kompletní chloroplastové sekvence DNA zelených řas charophycean Staurastrum a Zygnema odhalují, že chloroplastový genom prošel během evoluce Zygnematales rozsáhlými změnami “. Biologie BMC. 3: 22. doi:10.1186/1741-7007-3-22. PMC 1277820. PMID 16236178.
- ^ Leliaert, Frederik; Smith, David R .; Moreau, Hervé; Herron, Matthew D .; Verbruggen, Heroen; Delwiche, Charles F .; De Clerck, Olivier (2012). „Fylogeneze a molekulární evoluce zelených řas“ (PDF). Kritické recenze v rostlinných vědách. 31: 1–46. doi:10.1080/07352689.2011.615705. S2CID 17603352.
- ^ Marin, Birger (2012). „Vnořeno do třídy Chlorellales nebo do nezávislé třídy? Fylogeneze a klasifikace Pedinophyceae (Viridiplantae) odhalená molekulárními fylogenetickými analýzami kompletních operonů rRNA kódovaných nukleárními a plastidy“. Protist. 163 (5): 778–805. doi:10.1016 / j.protis.2011.11.004. PMID 22192529.
- ^ Laurin-Lemay, Simon; Brinkmann, Henner; Philippe, Hervé (2012). „Původ suchozemských rostlin se vrátil ve světle sekvenční kontaminace a chybějících údajů“. Aktuální biologie. 22 (15): R593 – R594. doi:10.1016 / j.cub.2012.06.013. PMID 22877776.
- ^ Leliaert, Frederik; Tronholm, Ana; Lemieux, Claude; Turmel, Monique; DePriest, Michael S .; Bhattacharya, Debashish; Karol, Kenneth G .; Fredericq, Suzanne; Zechman, Frederick W. (05.05.2016). „Fylogenomické analýzy chloroplastů odhalily nejhlubší větev větví linie Chlorophyta, Palmophyllophyceae. Nov.“. Vědecké zprávy. 6: 25367. Bibcode:2016NatSR ... 625367L. doi:10.1038 / srep25367. ISSN 2045-2322. PMC 4860620. PMID 27157793.
- ^ Cook, Martha E .; Graham, Linda E. (2017). Archibald, John M .; Simpson, Alastair G. B .; Slamovits, Claudio H. (eds.). Příručka protistů. Springer International Publishing. 185–204. doi:10.1007/978-3-319-28149-0_36. ISBN 9783319281476.
- ^ Lewis, Louise A .; Richard M. McCourt (2004). „Zelené řasy a původ suchozemských rostlin“ (abstraktní). American Journal of Botany. 91 (10): 1535–1556. doi:10,3732 / ajb.91.10.1535. PMID 21652308.
- ^ Ruhfel, Brad R .; Gitzendanner, Matthew A .; Soltis, Pamela S .; Soltis, Douglas E .; Burleigh, J. Gordon (2014-02-17). „Od řas k krytosemenným rostlinám - z 360 plastidových genomů lze odvodit fylogenezi zelených rostlin (Viridiplantae)“. BMC Evoluční biologie. 14: 23. doi:10.1186/1471-2148-14-23. ISSN 1471-2148. PMC 3933183. PMID 24533922.
- ^ Adl, Sina M .; Simpson, Alastair G. B .; Lane, Christopher E .; Lukeš, Julius; Bass, David; Bowser, Samuel S .; Brown, Matthew W .; Burki, Fabien; Dunthorn, Micah (01.09.2012). „Revidovaná klasifikace eukaryot“. Journal of Eukaryotic Microbiology. 59 (5): 429–514. doi:10.1111 / j.1550-7408.2012.00644.x. ISSN 1550-7408. PMC 3483872. PMID 23020233.
- ^ Lemieux, Claude; Otis, Christian; Turmel, Monique (01.01.2007). „Klad spojující zelené řasy Mesostigma viride a Chlorokybus atmophyticus představuje nejhlubší větev Streptophyta ve fylogenezích založených na genomu chloroplastů“. Biologie BMC. 5: 2. doi:10.1186/1741-7007-5-2. ISSN 1741-7007. PMC 1781420. PMID 17222354.
- ^ Umen, James G. (01.11.2014). „Zelené řasy a počátky mnohobuněčnosti v rostlinné říši“. Perspektivy Cold Spring Harbor v biologii. 6 (11): a016170. doi:10.1101 / cshperspect.a016170. ISSN 1943-0264. PMC 4413236. PMID 25324214.
- ^ Vries, Jan de; Gould, Sven B. (01.01.2017). „Monoplastidové úzké hrdlo v oblasti řas a vývoje rostlin“. J Cell Sci. 131 (2): jcs.203414. doi:10.1242 / jcs.203414. ISSN 0021-9533. PMID 28893840.
- ^ Ponce-Toledo, Rafael I .; Deschamps, Philippe; López-García, Purificación; Zivanovic, Yvan; Benzerara, Karim; Moreira, David (2017). „Raně se rozvětvující sladkovodní sinice na počátku plastidů“. Aktuální biologie. 27 (3): 386–391. doi:10.1016 / j.cub.2016.11.056. PMC 5650054. PMID 28132810.
- ^ Dittami, Simon M .; Heesch, Svenja; Olsen, Jeanine L .; Collén, Jonas (01.08.2017). „Přechody mezi mořským a sladkovodním prostředím poskytují nové informace o původu mnohobuněčných rostlin a řas“ (PDF). Journal of Phycology. 53 (4): 731–745. doi:10.1111 / jpy.12547. ISSN 1529-8817. PMID 28509401. S2CID 43325392.
- ^ Smith, David R. (2018). „Lost in the Light: Plastid Genome Evolution in Nonphotosynthetic Algae“. Evoluce plastidového genomu. Pokroky v botanickém výzkumu. 85. str. 29–53. doi:10.1016 / bs.abr.2017.10.001. ISBN 9780128134573.
- ^ Burki, Fabien; Kaplan, Maia; Tichonenkov, Denis V .; Zlatogursky, Vasily; Minh, Bui Quang; Radaykina, Liudmila V .; Smirnov, Alexey; Mylnikov, Alexander P .; Keeling, Patrick J. (2016-01-27). „Rozpletení rané diverzifikace eukaryot: fylogenomická studie evolučních počátků Centrohelida, Haptophyta a Cryptista“. Proc. R. Soc. B. 283 (1823): 20152802. doi:10.1098 / rspb.2015.2802. ISSN 0962-8452. PMC 4795036. PMID 26817772.
- ^ Brown, Matthew W .; Heiss, Aaron; Kamikawa, Ryoma; Inagaki, Yuji; Yabuki, Akinori; Tice, Alexander K .; Shiratori, Takashi; Ishida, Ken; Hashimoto, Tetsuo (03.12.2017). „Fylogenomika umisťuje osiřelé linie protistánu do nové eukaryotické nadskupiny“. Genome Biol Evol. 10 (2): 427–433. doi:10.1093 / gbe / evy014. PMC 5793813. PMID 29360967.
- ^ Lee, JunMo; Cho, Chung Hyun; Park, Seung In; Choi, Ji Won; Song, Hyun Suk; West, John A .; Bhattacharya, Debashish; Yoon, Hwan Su (02.09.2016). „Paralelní vývoj vysoce konzervované architektury plastidového genomu u červených mořských řas a semenných rostlin“. Biologie BMC. 14: 75. doi:10.1186 / s12915-016-0299-5. ISSN 1741-7007. PMC 5010701. PMID 27589960.
- ^ Bodył, Andrzej (2018). „Vyvíjely se některé plastidy odvozené od červených řas kleptoplastidií? Hypotéza“. Biologické recenze. 93 (1): 201–222. doi:10.1111 / brv.12340. ISSN 1464-7931. PMID 28544184. S2CID 24613863.
- ^ Gitzendanner, Matthew A .; Soltis, Pamela S .; Wong, Gane K.-S .; Ruhfel, Brad R .; Soltis, Douglas E. (2018). „Plastidová fylogenomická analýza zelených rostlin: miliarda let evoluční historie“. American Journal of Botany. 105 (3): 291–301. doi:10.1002 / ajb2.1048. ISSN 0002-9122. PMID 29603143.
- ^ Strassert, Jürgen F. H .; Jamy, Mahwash; Mylnikov, Alexander P .; Tichonenkov, Denis V .; Burki, Fabien (2018-08-30). „Nová fylogenomická analýza záhadného kmene Telonemia dále řeší eukaryotický strom života“. bioRxiv: 403329. doi:10.1101/403329.
- ^ Gawryluk, Ryan M. R .; Tichonenkov, Denis V .; Hehenberger, Elisabeth; Husnik, Filip; Mylnikov, Alexander P .; Keeling, Patrick J. (08.09.2019). „Nefotosyntetičtí dravci jsou sestrou červených řas“. Příroda. 572 (7768): 240–243. doi:10.1038 / s41586-019-1398-6. ISSN 0028-0836. PMID 31316212. S2CID 197542583.
- ^ Mackiewicz, Paweł; Gagat, Przemysław (2014-12-31). „Monofilie superskupiny Archaeplastida a vztahy mezi jejími liniemi ve světle fylogenetických a fylogenomických studií. Jsme blízko konsensu?“. Acta Societatis Botanicorum Poloniae. 83 (4): 263–280. doi:10.5586 / asbp.2014.044. ISSN 2083-9480.
- ^ de Vries, Jan; Archibald, John M. (2017). „Endosymbióza: Vyvinuli se plastidy ze sladkovodních sinic?“. Aktuální biologie. 27 (3): R103 – R105. doi:10.1016 / j.cub.2016.12.006. PMID 28171752.
- ^ Lewis, L. A. (2017). „Hold the salt: Freshwater origin of primary plastids“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 114 (37): 9759–9760. doi:10.1073 / pnas.1712956114. PMC 5604047. PMID 28860199.
- ^ Raven, John A. (2013). „Buňky uvnitř buněk: Symbióza a pokračující fagotrofie“. Aktuální biologie. 23 (12): R530 – R531. doi:10.1016 / j.cub.2013.05.006. PMID 23787050.
- ^ Andersson, Jan O .; Roger, Andrew J. (2002). „Cyanobakteriální gen u nefotosyntetických protistů - časná akvizice chloroplastů u eukaryot?“. Aktuální biologie. 12 (2): 115–119. doi:10.1016 / S0960-9822 (01) 00649-2. PMID 11818061. S2CID 18809784.
- ^ Keeling, Patrick J. (2010). „Endosymbiotický původ, diverzifikace a osud plastidů“. Filozofické transakce Královské společnosti B: Biologické vědy. 365 (1541): 729–748. doi:10.1098 / rstb.2009.0103. PMC 2817223. PMID 20124341.
- ^ Bengtson, Stefan; Sallstedt, Therese; Belivanova, Veneta; Whitehouse, Martin (2017). „Trojrozměrná konzervace buněčných a subcelulárních struktur naznačuje 1,6 miliardy let staré červené řasy korunní skupiny“. PLOS Biology. 15 (3): e2000735. doi:10.1371 / journal.pbio.2000735. PMC 5349422. PMID 28291791.
- ^ Javaux, Emmanuelle J .; Knoll, Andrew H .; Walter, Malcolm R. (2004). „Důkaz TEM pro eukaryotickou diverzitu ve středních prvohorách“. Geobiologie. 2 (3): 121–132. doi:10.1111 / j.1472-4677.2004.00027.x. S2CID 53600639.
- ^ Yoon, Hwan Su; Hackett, Jeremiah D .; Ciniglia, Claudia; Pinto, Gabriele; Bhattacharya, Debashish (2004). „Molekulární časová osa pro vznik fotosyntetických eukaryot“. Molekulární biologie a evoluce. 21 (5): 809–818. doi:10,1093 / molbev / msh075. PMID 14963099.
- ^ Butterfield, Nicholas J. (2000). "Bangiomorpha pubescens n. gen., n. sp .: implikace pro vývoj pohlaví, mnohobuněčnosti a mezoproterozoického / neoproterozoického záření eukaryot “. Paleobiologie. 26 (3): 386–404. doi:10.1666 / 0094-8373 (2000) 026 <0386: BPNGNS> 2.0.CO; 2.