Karyorelictea - Karyorelictea

Karyorelictea
Loxodes rostrum ze strany 267 „American journal of physiology“ (1898) .jpg
Ilustrace Loxodes rostrum
Vědecká klasifikace E
Clade:SAR
Infrakingdom:Alveolata
Kmen:Ciliophora
Podkmen:Postciliodesmatophora
Třída:Karyorelictea
Corliss, 1974[1]
Objednávky [2]

Karyorelictea je třída z náčelníci v podskupině Postciliodesmatophora. Většina druhů je členy mikrobentos společenství, tj. mikroskopické organismy nalezené v mořském intersticiálním prostředí, ačkoli jeden rod, Loxodes, se nachází ve sladké vodě.

Většina taxonů karyoreliktu nebyla pěstována v laboratoři, i když klonální linie Loxodes byly vyvinuty.

Systematika

Podle Lynna (2008) je třída Karyorelictea rozdělena do tří řádů:[2]

Tyto tři objednávky byly definovány morfologicky, a byly potvrzeny pomocí molekulární fylogenetika.[3]

Další rodina, Wilbertomorphidae, je nejistého přidružení a nebyl přiřazen k objednávce.[4]

Jaderný dimorfismus

Všichni nájemníci, včetně karyorelicteans, mají dva různé druhy jádro, které oddělují funkce genové exprese a sexuální rekombinace. The makronukley nebo somatický jádra, jsou místem transkripce, zatímco menší mikrojader nebo zárodečná linie jádra, jsou aktivní pouze během pohlavního rozmnožování, kde nejprve podstoupí vznik meiózy gametický jádra, která se vymění, když se spojí dvě spojující buňky. Dvě gametická jádra se spojí a vytvoří zygotické jádro, které se dělí mitózou na dvě dceřinná jádra, z nichž jedno se vyvine do nového mikrojádra a druhé do makronukleu; starý makronukle se obvykle rozpadá (viz Hlavní článek ).

U většiny nálevníků se makronukleus může během nepohlavní reprodukce rozdělit a vytvořit nový dceřiný makronukleus prostřednictvím procesu zvaného amitóza. V karyorelicteans však makronuklei nejsou schopni se rozdělit. Místo toho musí být vždy vytvořeny dělením a diferenciací mikrojader, a to i při nepohlavní reprodukci.[5][6]

Kvůli jejich nedělitelným somatickým makronukleům se předpokládalo, že karyoreliktaci představují přechodné evoluční stádium mezi hypotetickým předkem nálevníků, kteří neměli jaderný dualismus, a dalšími „pokročilejšími“ náčelníky, kteří měli jak jaderný dualismus, tak i makronukleá, kteří by se mohli rozdělit amitózou. Název skupiny proto odkazuje na jejich údajně „primitivní“ jádra.[7] Tato teorie byla od té doby nahrazena, protože molekulární fylogeneze ukázaly, že karyoreliktaci nejsou tou „primitivní“ nebo bazálně rozvětvenou skupinou nálevníků.[8]

Ekologie

Téměř všechny druhy karyorelictean, kromě Loxodes, byly popsány z námořnictva intersticiální stanoviště, kde žijí v prostorách pórů a vody mezi zrny sedimentu.[9] Zvířata z těchto stanovišť jsou známá jako meiofauna a karyorelicteans mají mnoho morfologických podobností s meiofaunálními zvířaty, přestože jsou protistmi: většina karyorelicteans je relativně velká (1 mm nebo více na délku), má červovitý (vermiformní) tvar těla s protáhlým ocasem a projevuje tigmotaktické chování.[10] Většina karyorelicteans se živí bakteriemi nebo řasami a dává přednost mikroaerobní podmínky.[11][12][13] Jeden rod však Kentrophoros, postrádá orální aparát a živí se místo toho symbiotikem oxidující síru bakterie, které jsou připojeny k jedné straně buňky.[14][15]

Etymologie

Název třídy Karyorelictea pochází z starořečtina κάρυον (káruon), což znamená „tvrdé skořápky nebo jádro“,[16][17] a z latiny reliktus, což znamená „opuštěný“.[18]

Alternativní genetický kód

Alternativní genetický kód je používán jaderný genom některých karyorelictidových nálevníků (např. Parduczia sp.).[19] Tento kód odpovídá překladová tabulka 27 a zahrnuje přeřazení tří kodonů:

  • UAA do Gln (Q) ;
  • UAG do Gln (Q) ;
  • UGA do Trp (W) nebo Ukončení (*).

Reference

  1. ^ WoRMS (2009). „Karyorelictea“. Světová databáze Ciliophora. Světový registr mořských druhů. Citováno 21. července 2010.
  2. ^ A b Lynn, Denis (2008-06-24). The Ciliated Protozoa: Characterization, Classification, and Guide to the Literature. Springer Science & Business Media. ISBN  9781402082399.
  3. ^ Ilaria Andreoli; Lara Mangini; Filippo Ferrantini; Giovanni Santangelo; Franco Verni; Giulio Petroni (2009). "Molekulární fylogeneze nekulturní Karyorelictea (Alveolata, Ciliophora)". Zoologica Scripta. 38 (6): 651–662. doi:10.1111 / j.1463-6409.2009.00395.x. S2CID  84951188.
  4. ^ Xu, Yuan; Li, Jiamei; Song, Weibo; Warren, Alan (září 2013). „Fylogeneze a založení nové čeledi čeledi, Wilbertomorphidae fam. Nov. (Ciliophora, Karyorelictea), vysoce specializovaný taxon představovaný Wilbertomorpha colpoda gen. Nov., Spec. Nov.“ The Journal of Eukaryotic Microbiology. 60 (5): 480–489. doi:10.1111 / jeu.12055. ISSN  1550-7408. PMID  23829190. S2CID  37210061.
  5. ^ Yan, Ying; Rogers, Anna J .; Gao, Feng; Katz, Laura A. (2017-05-22). „Neobvyklé rysy nerozdělujících somatických makronukleů v nálevní třídě Karyorelictea“. European Journal of Protistology. 61 (Pt B): 399–408. doi:10.1016 / j.ejop.2017.05.002. ISSN  1618-0429. PMC  5831164. PMID  28673471.
  6. ^ Raikov, I. B. (1985). "Primitivní nikdy se nedělící makronukley některých nižších nálevníků". Int. Reverend Cytol. 95: 297–325.
  7. ^ Corliss, J. O .; Hartwig, E. (1977). „„ Primitivní “intersticiální nálevníci: jejich ekologie, jaderné jedinečnosti a postulované místo v evoluci a systematice kmene Ciliophora“. Mikrofauna Meeresbodens. 61: 65–88.
  8. ^ Gao, Feng; Warren, Alan; Zhang, Qianqian; Gong, červen; Miao, Miao; Slunce, Ping; Xu, Dapeng; Huang, Jie; Yi, Zhenzhen (2016-04-29). „Evoluční hypotéza řasených protistů založená na všech datech s revidovanou klasifikací kmene Ciliophora (Eukaryota, Alveolata)“. Vědecké zprávy. 6 (1): 24874. doi:10.1038 / srep24874. ISSN  2045-2322. PMC  4850378. PMID  27126745.
  9. ^ Foissner, Wilhelm (1998). „Karyorelictids (Protozoa: Ciliophora), jedinečné a záhadné shromáždění mořských, intersticiálních nálevníků: recenze zdůrazňující řasinkové vzorce a evoluci“. In Coombs, G. H .; Vickerman, K .; Sleigh, M. A .; Warren, A. (eds.). Evoluční vztahy mezi prvoky. London: Chapman and Hall. 305–325.
  10. ^ Giere, Olav (2009). Meiobentologie: mikroskopická pohyblivá fauna vodních sedimentů (2. rev. A rozšířené vydání). Berlín: Springer. ISBN  9783540686613. OCLC  310352202.
  11. ^ Fenchel, Tom (1969). „Ekologie mořského mikrobentosu IV. Struktura a funkce bentického ekosystému, jeho chemické a fyzikální faktory a společenstva mikrofaun se zvláštním zřetelem na řasinkaté prvoky“. Ofélie. 6: 1–182. doi:10.1080/00785326.1969.10409647.
  12. ^ Fenchel, Tom; Finlay, Bland (2008-11-01). „Kyslík a prostorová struktura mikrobiálních společenství“. Biologické recenze. 83 (4): 553–569. doi:10.1111 / j.1469-185x.2008.00054.x. ISSN  1469-185X. PMID  18823390. S2CID  21908644.
  13. ^ Fauré-Fremiet, E (1950). „Écologie des ciliés psammophiles littoraux“. Bull Biol Fr Belg. 84 (1): 35–75. PMID  15420543.
  14. ^ Finlay, Bland; Fenchel, Tom (1. července 1989). „Věčný piknik pro prvoky“. Nový vědec: 66–69.
  15. ^ Fenchel, Tom; Finlay, Bland (1989). „Kentrophoros: nálevník bez úst se symbiotickou kuchyňskou zahradou“. Ofélie. 30: 75–93.
  16. ^ Bailly, Anatole (01.01.1981). Abrégé du dictionnaire grec français. Paris: Hachette. ISBN  978-2010035289. OCLC  461974285.
  17. ^ Bailly, Anatole. "Řecko-francouzský slovník online". www.tabularium.be. Citováno 2017-01-24.
  18. ^ Gaffiot, Félix (1934). Slovníček pro ilustraci Latin-Français (francouzsky). Paříž: Librairie Hachette. str. 1278. Citováno 14. října 2017.
  19. ^ Swart, Estienne Carl; Serra, Valentina; Petroni, Giulio; Nowacki, Mariusz (28. července 2016). „Genetické kódy bez vyhrazeného stop kodonu: ukončení závislé na kontextu“. Buňka. 166 (3): 691–702. doi:10.1016 / j.cell.2016.06.020. PMC  4967479. PMID  27426948.