Labyrinthulomycetes - Labyrinthulomycetes
Labyrinthulomycetes | |
---|---|
Buňka se sítí ektoplazmatických vláken (Aplanochytrium sp.) | |
Vědecká klasifikace | |
Doména: | Eukaryota |
Kmen: | Heterokontophyta |
Třída: | Labyrinthulomycetes Arx, 1970, Dick, 2001 |
Rody | |
| |
Synonyma | |
|
The Labyrinthulomycetes (ICBN ) nebo Labyrinthulea[1] (ICZN ) plocha třída z protistů které vytvářejí síť vlákna nebo trubky,[2] které slouží jako stopy pro buňky klouzat a absorbovat živiny pro ně. Dvě hlavní skupiny jsou: labyrinthulidy (nebo slizové sítě) a thraustochytridy. Většinou jsou námořní, běžně se vyskytuje jako paraziti na řasy a mořské trávy nebo jako rozkladače na mrtvém rostlinném materiálu. Zahrnují také některé parazity mořských bezobratlých.[3]
Vlastnosti
I když jsou mimo buňky, jsou vlákna Labyrinthulomycetes obklopena a membrána. Jsou tvořeny a spojeny s cytoplazmou jedinečnou organelou zvanou sagenogen nebo Bothrosome. Buňky jsou jednojaderný a typicky vejčité a pohybují se tam a zpět podél amorfní síť rychlostí od 5 do 150 μm za minutu. Mezi labyrinthulidy jsou buňky uzavřeny v tubách a mezi thraustochytridy jsou připojeny k jejich stranám.
Klasifikace
Labyrinthulomycetes / Labyrinthulea patřily k zaniklému houbovému kmeni Labyrinthulomycota.[4] Původně byly považovány za neobvyklé slizové formy, i když nejsou příliš podobné ostatním druhům. Struktura jejich zoospory a genetické studie jim ukazují, že jsou primitivní skupinou heterokonty, ale jejich klasifikace a léčba zůstává poněkud nevyřešená.
Tato třída má obvykle dva řády, Labyrinthulales a Thraustochytriales (ICBN), nebo Labyrinthulida a Thraustochytrida (ICZN),[5] ale nedávno byla navržena třetina.[6][7][8]
- Rod Stellarchytrium FioRito & Leander 2016
- Rodina Oblongichytriidae Cavalier-Smith 2012
- Rod Oblongichytrium Yokoyama & Honda 2007
- Objednat Labyrinthulida Doflein 1901
- Rodina Aplanochytriidae Leander ex Cavalier-Smith 2012
- Rod Aplanochytrium Bahnweg & Sparrow 1972 [Labyrinthuloides Perkins 1973]
- Rodina Labyrinthulidae Cienkowski 1867
- Rod Labyrinthomyxa Duboscq 1921
- Rod Pseudoplasmodium Molisch 1925
- Rod Labyrinthula Cienkowski 1864 [Labyrinthodictyon Valkanov 1969; Labyrinthorhiza Chadefaud 1956]
- Rodina Aplanochytriidae Leander ex Cavalier-Smith 2012
- Objednat Amphitremida Gomaa a kol. 2013
- Rodina Diplophryidae Cavalier-Smith 2012
- Rod Diplophrys Barker 1868
- Rodina Amphitrematidae Poche 1913
- Rod Paramphitrema Valkanov 1970
- Rod Archerella Loeblich & Tappan 1961
- Rod Amphitrema Archer 1867
- Rodina Diplophryidae Cavalier-Smith 2012
- Objednat Thraustochytriida Alderman a 1974
- Rod Pyrrhosorus Juel 1901
- Rod Thanatostrea Franc & Arvy 1969
- Rodina Althorniidae Cavalier-Smith 2012
- Rod Althornia Jones & Alderman 1972
- Rodina Sorodiplophryidae Cavalier-Smith 2012
- Rod Sorodiplophrys Olive & Dykstra 1975
- Rodina Amphifilidae Cavalier-Smith 2012
- Rod Amphifila Cavalier-Smith 2012
- Rod Fibrophrys columna Takahashi a kol. 2016
- Rodina Thraustochytriidae Sparrow ex Cejp 1959
- Rod Japonochytrium Kobayasi & Ôkubo 1953
- Rod Monorhizochytrium Doi & Honda 2017
- Rod Sicyoidochytrium Yokoy., Salleh a Honda 2007
- Rod Aurantiochytrium Yokoy. & Honda 2007
- Rod Ulkenia Gaertn. 1977
- Rod Parietichytrium Yokoy., Salleh a Honda 2007
- Rod Botryochytrium Yokoy., Salleh a Honda 2007
- Rod Schizochytrium Goldst. & Belsky emend. Booth & Mill.
- Rod Thraustochytrium Vrabec 1936
- Rod Hondaea Amato & Cagnac 2018
- Rod Labyrinthulochytrium Hassett & Gradinger 2018[9]
Genetický kód
Labyrinthulomycete Thraustochytrium aureum je pozoruhodný pro alternativní genetický kód jeho mitochondrie které používají TTA jako stop kodon místo kódování pro Leucin.[10] Tento kód je reprezentován NCBI překladová tabulka 23, Thraustochytrium mitochondriální kód.[11]
Genetický kód | Překlad stůl | Kodon DNA | Kodon RNA | Překlad s tímto kódem | Standardní kód (Překladová tabulka 1) | |||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Thraustochytrium mitochondriální | 23 | TTA | UUA | STOP = Ter (*) | Leu (L) |
Galerie
Aplanochytrium sp. pod světelný mikroskop
Aplanochytrium sp. pod SEM
Aurantiochytrium sp.
Zkouška Amphitrema, a teste améba nedávno zahrnuto ve skupině
Leon Cienkowski, polský botanik, který v roce 1867 popsal Labyrinthula, první rod skupiny[12]
Reference
- ^ Cavalier-Smith, T. (1997). "Sagenista a bigyra, dvě kmeny heterotrofních heterokontových chromistů". Archiv für Protistenkunde. 148 (3): 253–267. doi:10.1016 / S0003-9365 (97) 80006-1.
- ^ Tsui CK, Marshall W, Yokoyama R a kol. (Leden 2009). "Labyrinthulomycetes fylogeneze a její důsledky pro evoluční úbytek chloroplastů a zisk ektoplazmatického klouzání". Mol. Fylogenet. Evol. 50 (1): 129–40. doi:10.1016 / j.ympev.2008.09.027. PMID 18977305.
- ^ Schärer, L .; Knoflach, D .; Vizoso, D. B .; Rieger, G .; Peintner, U. (2007). „Thraustochytridy jako noví parazitičtí protisti mořských volně žijících plochých červů: Thraustochytrium caudivorum sp. listopad. Parazituje na Macrostomum lignano " (PDF). Mořská biologie. 152 (5): 1095. doi:10.1007 / s00227-007-0755-4.
- ^ Bennett, Reuel M; Honda, D; Beakes, Gordon W; Thines, Marco (2017). „Labyrinthulomycota“. Bennett RM, Honda D, Beakes GW, Thines M. (2017) Labyrinthulomycota. In Handbook of the Protists. Archibald, Simpson, Slamovits (eds). Springer. 507-542. p. 507. doi:10.1007/978-3-319-28149-0_25. ISBN 978-3-319-28147-6.
- ^ „www.ncbi.nlm.nih.gov“. Citováno 2009-04-04.
- ^ Gomaa; Mitchell; Lara (2013). „Amphitremida (Poche, 1913) je nový major, všudypřítomný labyrinthulomycete clade“. PLOS ONE. 8 (1): e53046. Bibcode:2013PLoSO ... 853046G. doi:10.1371 / journal.pone.0053046. PMC 3544814. PMID 23341921.
- ^ ANDERSON; CAVALIER-SMITH (2012). „Ultrastruktura Diplophrys parva, nového malého sladkovodního druhu, a revidovaná analýza Labyrinthulea (Heterokonta)“. Acta Protozoologica. 8 (1): 291–304. doi:10.4467 / 16890027AP.12.023.0783. Citováno 2016-04-04.
- ^ FioRito, Rebecca; Leander, Celeste; Leander, Brian (2016). "Charakterizace tří nových druhů Labyrinthulomycota izolovaných z okrových mořských hvězd (Pisaster ochraceus)". Mořská biologie. 163 (8): 170. doi:10.1007 / s00227-016-2944-5.
- ^ Hassett, Brandon T .; Gradinger, Rolf (2018). "Nové druhy saprobní labyrinthule (= labyrinthulomycota) a výstavba gen. Nov. K vyřešení molekulární polyfyly uvnitř aplanochytridů". Journal of Eukaryotic Microbiology. 65 (4): 475–483. doi:10.1111 / jeu.12494. hdl:10037/13570. ISSN 1550-7408.
- ^ Wideman, Jeremy G .; Monier, Adam; Rodríguez-Martínez, Raquel; Leonard, Guy; Cook, Emily; Poirier, Camille; Maguire, Finlay; Milner, David S .; Irwin, Nicholas A. T .; Moore, Karen; Santoro, Alyson E. (2019-11-25). „Neočekávaná rozmanitost mitochondriálního genomu odhalená cílenou jednobuněčnou genomikou heterotrofních bičíkatých protistů“. Přírodní mikrobiologie. 5 (1): 154–165. doi:10.1038 / s41564-019-0605-4. ISSN 2058-5276.
- ^ Elzanowski A, Ostell J, Leipe D, Soussov V. „Genetické kódy“. Prohlížeč taxonomie. National Center for Biotechnology Information (NCBI), USA National Library of Medicine. Citováno 11. srpna 2016.
- ^ Cienkowski, L. (1867). Ueber den Bau und die Entwicklung der Labyrinthuleen. Oblouk. mikr. Anat., 3:274, [1].