NDUFV1 - NDUFV1
NADH dehydrogenáza [ubichinon] flavoprotein 1, mitochondriální (NDUFV1) je enzym že u lidí je kódován NDUFV1 gen.[5] Gen NDUFV1 kóduje 51-kD podjednotku komplex I (NADH: ubichinon oxidoreduktáza) mitochondrií dýchací řetězec. Poruchy komplexu I jsou častou příčinou mitochondriální dysfunkce. Je spojen nedostatek mitochondriálního komplexu I. myopatie, encefalomyopatie a neurodegenerativní poruchy, jako je Parkinsonova choroba a Leighův syndrom.[6]
Struktura
NDUFV1 se nachází na q rameno z chromozom 11 na pozici 13,2 a má 10 exony.[6] The NDUFV1 Gen produkuje 50,8 kDa protein složený z 464 aminokyseliny.[7][8] NDUFV1, protein kódovaný tímto genem, je členem rodiny podjednotek komplexu I 51 kDa. Tato podjednotka nese NADH -vázací stránky stejně jako flavin mononukleotid (FMN) - a vazebná místa pro Fe-S.[6] Obsahuje také a tranzitní peptid doména a skládá se ze 6 tahů, 14 beta vlákna a 19 alfa šroubovice.[9][10]
Funkce
Komplex I. se skládá ze 45 různých podjednotek. NDUFV1 je složka fragmentu flavoprotein-síra (FP) enzymu.[11] NDUFV1 je oxidoreduktáza a základní podjednotka komplexu I, o které se předpokládá, že je nutná pro montáž a katalýzu. Je to protein periferní membrány nachází se na matice strana mitochondriální vnitřní membrána.[9][10]
Katalytická aktivita
NADH + ubichinon + 5 H + (In) = NAD + + ubichinol + 4 H + (ven).
NADH + akceptor = NAD + + redukovaný akceptor.[9][10]
Klinický význam
Mutace v NDUFV1 geny jsou spojeny s deficitem mitochondriálního komplexu I, což je autosomálně recesivní. Tento nedostatek je nejčastějším enzymatickým defektem oxidační fosforylace poruchy.[12][13] Nedostatek mitochondriálního komplexu I je extrémní genetická heterogenita a mohou být způsobeny mutací v genech kódovaných jaderně nebo v genech kódovaných mitochondriálně. Neexistují žádné zjevné genotyp -fenotyp korelace a odvození podkladu z klinické nebo biochemické prezentace je obtížné, ne-li nemožné.[14] Většina případů je však způsobena mutacemi v genech kódovaných jaderně.[15][16] Způsobuje širokou škálu klinických poruch, od smrtelných novorozeneckých onemocnění až po neurodegenerativní poruchy začínající u dospělých. Fenotypy zahrnují makrocefalie s progresivním leukodystrofie, nespecifické encefalopatie, Hypertrofické kardiomyopatie, myopatie, nemoc jater, Leighův syndrom, Leber dědičná optická neuropatie a některé formy Parkinsonova choroba.[17] Klinické projevy mohou zahrnovat laktátová acidóza, mozková degenerace, oftalmoplegie, ataxie, spasticita, a dystonie vyplývající z mutací v NDUFV1.[18][19]
Interakce
Ukázalo se, že NDUFV1 má 103 binárních interakce protein-protein včetně 97 společných interakcí. Zdá se, že NDUFV1 interaguje s EWSR1, CREB1, NCOR1, a VDAC1.[20]
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000167792 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání Ensembl 89: ENSMUSG00000037916 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ Spencer SR, Taylor JB, Cowell IG, Xia CL, Pemble SE, Ketterer B (prosinec 1992). „Lidská mitochondriální NADH: podjednotka 51-kDa ubichinon oxidoreduktázy mapuje sousedící s genem glutathion S-transferázy P1-1 na chromozomu 11q13.“ Genomika. 14 (4): 1116–8. doi:10.1016 / S0888-7543 (05) 80144-2. PMID 1478657.
- ^ A b C „Entrez Gene: NDUFV1 NADH dehydrogenáza (ubichinon) flavoprotein 1, 51 kDa“.
Tento článek včlení text z tohoto zdroje, který je v veřejná doména. - ^ Jao, Danieli. „Znalostní databáze atlasu srdečních organelárních proteinů (COPaKB) - —proteinové informace“. amino.heartproteome.org. Citováno 2018-08-27.
- ^ Zong NC, Li H, Li H, Lam MP, Jimenez RC, Kim CS, Deng N, Kim AK, Choi JH, Zelaya I, Liem D, Meyer D, Odeberg J, Fang C, Lu HJ, Xu T, Weiss J , Duan H, Uhlen M, Yates JR, Apweiler R, Ge J, Hermjakob H, Ping P (říjen 2013). „Integrace biologie a medicíny srdečních proteomů pomocí specializované znalostní databáze“. Výzkum oběhu. 113 (9): 1043–53. doi:10.1161 / CIRCRESAHA.113.301151. PMC 4076475. PMID 23965338.
- ^ A b C „NDUFV1 - NADH dehydrogenáza [ubichinon] flavoprotein 1, mitochondriální prekurzor - Homo sapiens (člověk) - gen a protein NDUFV1“. www.uniprot.org. Citováno 2018-08-27.
Tento článek včlení text dostupný pod CC BY 4.0 licence. - ^ A b C „UniProt: univerzální znalostní databáze proteinů“. Výzkum nukleových kyselin. 45 (D1): D158 – D169. Ledna 2017. doi:10.1093 / nar / gkw1099. PMC 5210571. PMID 27899622.
- ^ Murray J, Zhang B, Taylor SW, Oglesbee D, Fahy E, Marusich MF, Ghosh SS, Capaldi RA (duben 2003). „Podjednotkové složení lidské NADH dehydrogenázy získané rychlou jednostupňovou imunopurifikací“. The Journal of Biological Chemistry. 278 (16): 13619–22. doi:10,1074 / jbc.C300064200. PMID 12611891.
- ^ Kirby DM, Salemi R, Sugiana C, Ohtake A, Parry L, Bell KM, Kirk EP, Boneh A, Taylor RW, Dahl HH, Ryan MT, Thorburn DR (září 2004). „NDUFS6 mutace jsou novou příčinou letálního deficitu neonatálního mitochondriálního komplexu I“. The Journal of Clinical Investigation. 114 (6): 837–45. doi:10,1172 / JCI20683. PMC 516258. PMID 15372108.
- ^ McFarland R, Kirby DM, Fowler KJ, Ohtake A, Ryan MT, Amor DJ, Fletcher JM, Dixon JW, Collins FA, Turnbull DM, Taylor RW, Thorburn DR (leden 2004). „De novo mutace v mitochondriálním genu ND3 jako příčina infantilní mitochondriální encefalopatie a deficitu komplexu I.“. Annals of Neurology. 55 (1): 58–64. doi:10,1002 / ana.10787. PMID 14705112. S2CID 21076359.
- ^ Haack TB, Haberberger B, Frisch EM, Wieland T, Iuso A, Gorza M, Strecker V, Graf E, Mayr JA, Herberg U, Hennermann JB, Klopstock T, Kuhn KA, Ahting U, Sperl W, Wilichowski E, Hoffmann GF , Tesarova M, Hansikova H, Zeman J, Plecko B, Zeviani M, Wittig I, Strom TM, Schuelke M, Freisinger P, Meitinger T, Prokisch H (duben 2012). „Molekulární diagnostika u deficitu mitochondriálního komplexu I pomocí sekvenování exomu“ (PDF). Journal of Medical Genetics. 49 (4): 277–83. doi:10.1136 / jmedgenet-2012-100846. PMID 22499348. S2CID 3177674.
- ^ Loeffen JL, Smeitink JA, Trijbels JM, Janssen AJ, Triepels RH, Sengers RC, van den Heuvel LP (2000). „Izolovaný nedostatek komplexu I u dětí: klinické, biochemické a genetické aspekty“. Lidská mutace. 15 (2): 123–34. doi:10.1002 / (SICI) 1098-1004 (200002) 15: 2 <123 :: AID-HUMU1> 3.0.CO; 2-P. PMID 10649489.
- ^ Triepels RH, Van Den Heuvel LP, Trijbels JM, Smeitink JA (2001). "Nedostatek komplexu dýchacích řetězců I". American Journal of Medical Genetics. 106 (1): 37–45. doi:10,1002 / ajmg.1397. PMID 11579423.
- ^ Robinson BH (květen 1998). „Nedostatek lidského komplexu I: klinické spektrum a zapojení volných radikálů kyslíku do patogenity defektu“. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - bioenergetika. 1364 (2): 271–86. doi:10.1016 / s0005-2728 (98) 00033-4. PMID 9593934.
- ^ Zafeiriou DI, Rodenburg RJ, Scheffer H, van den Heuvel LP, Pouwels PJ, Ververi A, Athanasiadou-Piperopoulou F, van der Knaap MS (červen 2008). „MR spektroskopie a sériové zobrazování magnetickou rezonancí u pacienta s mitochondriální cystickou leukoencefalopatií v důsledku nedostatku komplexu I a mutací NDUFV1 a mírného klinického průběhu“. Neuropediatrie. 39 (3): 172–5. doi:10.1055 / s-0028-1093336. PMID 18991197.
- ^ Laugel V, This-Bernd V, Cormier-Daire V, Speeg-Schatz C, de Saint-Martin A, Fischbach M (leden 2007). „Časný nástup oftalmoplegie u Leighova syndromu v důsledku mutací NDUFV1“. Dětská neurologie. 36 (1): 54–7. doi:10.1016 / j.pediatrneurol.2006.08.007. PMID 17162199.
- ^ „Bylo nalezeno 103 binárních interakcí pro hledaný výraz NDUFV1“. Databáze molekulárních interakcí IntAct. EMBL-EBI. Citováno 2018-08-27.
Tento článek včlení text z tohoto zdroje, který je v 
Další čtení
- Maruyama K, Sugano S (leden 1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
- Ali ST, Duncan AM, Schappert K, Heng HH, Tsui LC, Chow W, Robinson BH (listopad 1993). „Chromozomální lokalizace lidského genu kódujícího 51-kDa podjednotku mitochondriálního komplexu I (NDUFV1) na 11q13“. Genomika. 18 (2): 435–9. doi:10.1006 / geno.1993.1493. PMID 8288251.
- Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (říjen 1997). "Konstrukce a charakterizace knihovny cDNA obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
- Schuelke M, Loeffen J, Mariman E, Smeitink J, van den Heuvel L (duben 1998). „Klonování lidské mitochondriální podjednotky 51 kDa (NDUFV1) odhaluje 100% antisense homologii jeho 3'UTR s 5'UTR prekurzoru proteinu indukovatelného gama-interferonem (IP-30): jedná se o vazbu mezi mitochondriální myopatií a zánět?". Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 245 (2): 599–606. doi:10.1006 / bbrc.1998.8486. PMID 9571201.
- Loeffen JL, Triepels RH, van den Heuvel LP, Schuelke M, Buskens CA, Smeets RJ, Trijbels JM, Smeitink JA (prosinec 1998). "cDNA osmi nukleárních kódovaných podjednotek NADH: ubichinon oxidoreduktáza: charakterizace cDNA lidského komplexu dokončena". Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 253 (2): 415–22. doi:10.1006 / bbrc.1998.9786. PMID 9878551.
- de Coo RF, Buddiger PA, Smeets HJ, van Oost BA (leden 1999). „Struktura lidského genu NDUFV1 kódujícího 51-kDa podjednotku mitochondriálního komplexu I“. Savčí genom. 10 (1): 49–53. doi:10,1007 / s003359900941. PMID 9892733. S2CID 6513411.
- Schuelke M, Smeitink J, Mariman E, Loeffen J, Plecko B, Trijbels F, Stöckler-Ipsiroglu S, van den Heuvel L (březen 1999). „Mutantní podjednotka NDUFV1 mitochondriálního komplexu I způsobuje leukodystrofii a myoklonickou epilepsii“. Genetika přírody. 21 (3): 260–1. doi:10.1038/6772. PMID 10080174. S2CID 8603556.
- Hu RM, Han ZG, Song HD, Peng YD, Huang QH, Ren SX, Gu YJ, Huang CH, Li YB, Jiang CL, Fu G, Zhang QH, Gu BW, Dai M, Mao YF, Gao GF, Rong R Ye M, Zhou J, Xu SH, Gu J, Shi JX, Jin WR, Zhang CK, Wu TM, Huang GY, Chen Z, Chen MD, Chen JL (srpen 2000). "Profilování genové exprese v ose lidského hypotalamu - hypofýzy - nadledvin a klonování cDNA plné délky". Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 97 (17): 9543–8. Bibcode:2000PNAS ... 97,9543H. doi:10.1073 / pnas.160270997. PMC 16901. PMID 10931946.
- Triepels RH, Hanson BJ, van den Heuvel LP, Sundell L, Marusich MF, Smeitink JA, Capaldi RA (březen 2001). „Defekty lidského komplexu I lze vyřešit analýzou monoklonálních protilátek do odlišných vzorů sestavy podjednotky“. The Journal of Biological Chemistry. 276 (12): 8892–7. doi:10,1074 / jbc.M009903200. PMID 11112787.
- Brenner M, Johnson AB, Boespflug-Tanguy O, Rodriguez D, Goldman JE, Messing A (leden 2001). „Mutace v GFAP, kódující gliální fibrilární kyselý protein, jsou spojeny s Alexanderovou chorobou“. Genetika přírody. 27 (1): 117–20. doi:10.1038/83679. PMID 11138011. S2CID 10159452.
- Bénit P, Chretien D, Kadhom N, de Lonlay-Debeney P, Cormier-Daire V, Cabral A, Peudenier S, Rustin P, Munnich A, Rötig A (červen 2001). „Rozsáhlá delece a bodové mutace jaderných genů NDUFV1 a NDUFS1 v deficitu mitochondriálního komplexu I“. American Journal of Human Genetics. 68 (6): 1344–52. doi:10.1086/320603. PMC 1226121. PMID 11349233.
- Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (říjen 2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Natur.437.1173R. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.
