8. NDUFS - NDUFS8

8. NDUFS
Identifikátory
Aliasy8. NDUFS, CI-23k, CI23KD, TYKY, NADH: jádro podjednotky ubichinon oxidoreduktázy S8, MC1DN2
Externí IDOMIM: 602141 MGI: 2385079 HomoloGene: 1867 Genové karty: 8. NDUFS
Umístění genu (člověk)
Chromozom 11 (lidský)
Chr.Chromozom 11 (lidský)[1]
Chromozom 11 (lidský)
Genomické umístění pro NDUFS8
Genomické umístění pro NDUFS8
Kapela11q13.2Start68,030,617 bp[1]
Konec68,036,644 bp[1]
Exprese RNA vzor
PBB GE NDUFS8 203189 s na fs.png

PBB GE NDUFS8 203190 na fs.png
Další údaje o referenčních výrazech
Ortology
DruhČlověkMyš
Entrez

4728

225887

Ensembl

ENSG00000110717

ENSMUSG00000059734

UniProt

O00217

Q8K3J1

RefSeq (mRNA)

NM_002496

NM_001271443
NM_001271444
NM_144870

RefSeq (protein)

NP_002487

NP_001258372
NP_001258373
NP_659119

Místo (UCSC)Chr 11: 68,03 - 68,04 MbChr 19: 3,91 - 3,91 Mb
PubMed Vyhledávání[3][4]
Wikidata
Zobrazit / upravit člověkaZobrazit / upravit myš

NADH dehydrogenáza [ubichinon] protein železo-síra 8, mitochondriální také známý jako NADH-ubichinon oxidoreduktáza 23 kDa podjednotka, komplex I-23kD (CI-23kD), nebo TYKY podjednotka je enzym že u lidí je kódován 8. NDUFS gen.[5][6][7][8] Protein NDUFS8 je podjednotkou NADH dehydrogenáza (ubichinon) také známý jako Komplex I., který se nachází v mitochondriální vnitřní membrána a je největším z pěti komplexů elektronový transportní řetězec.[9] Mutace v tomto genu byly spojeny s Leighův syndrom.[7]

Struktura

NDUFS8 se nachází na q rameno chromozomu 11 v poloze 13.2.[7] Gen NDUFS8 produkuje 23,7 kDa protein složený z 210 aminokyseliny.[10][11] Kódovaný protein TYKY obsahuje dva 4Fe4S ferredoxin konsensuální vzorce o kterých se věří, že jsou klastr železo-síra N-2 vazebná místa.[12] Studie dalších podjednotek komplexu Navrhl jsem, že podjednotky TYKY, PSST, 49 kDa, ND1 a ND5 interagují s klastry železo-síra za vzniku katalytického jádra NADH dehydrogenáza (ubichinon).[13]

Funkce

Tento gen kóduje podjednotku mitochondriálního NADH: ubichinon oxidoreduktázu nebo Komplex I., multimerní enzym z dýchací řetězec zodpovědný za NADH oxidace, ubichinon redukce a vysunutí protonů z mitochondrie. Kódovaný protein se účastní vazby dvou ze šesti až osmi klastrů železa a síry komplexu I a jako takový je vyžadován v procesu přenosu elektronů.[7]

Klinický význam

Byly spojeny mutace v NDUFS8 mitochondriální nemoci, které mohou způsobit kteroukoli z klinicky heterogenních skupin poruch vznikajících v důsledku dysfunkce mitochondriální dýchací řetězec. Fenotypové spektrum sahá od izolovaných onemocnění postihujících jednotlivé orgány až po těžké multisystémové poruchy. Mezi běžné klinické rysy patří ptóza, vnější oftalmoplegie, proximální myopatie a nesnášenlivost cvičení, kardiomyopatie, senzorineurální hluchota, optická atrofie, pigmentová retinopatie, encefalopatie, záchvaty epizody podobné mrtvici, ataxie, spasticita a laktátová acidóza. Mitochondriální poruchy mohou být způsobeny mutacemi mitochondriální DNA nebo nukleární DNA které buď přímo ovlivňují proteiny oxidativní fosforylace, nebo ovlivňují funkci dýchacího řetězce tím, že ovlivňují produkci složitého aparátu potřebného ke spuštění tohoto procesu.[8]

Byly také spojeny mutace NDUFS8 Leighův syndrom. Leighův syndrom je progresivní s časným nástupem neurodegenerativní porucha charakterizovaná přítomností ložiskových, bilaterálních lézí v jedné nebo více oblastech centrální nervový systém včetně mozkový kmen, thalamus, bazální ganglia, mozeček a mícha. Klinické příznaky závisí na tom, které oblasti centrálního nervového systému jsou zahrnuty, a zahrnují subakutní nástup psychomotorická retardace, hypotonie ataxie, slabost, ztráta zraku, abnormality pohybů očí, záchvaty, dysfagie a laktátová acidóza.[8] Jedna kazuistika o patogenní mutaci v NDUFS8 zjistila, že vedla ke komplexnímu mitochondriálnímu deficitu a diagnostice Leighova syndromu. Příznaky pacienta zahrnuty apnoe, cyanóza, hyperkarbia hypotonie, svěží šlachové reflexy, klonus kotníku a nepravidelné záchvaty. Další analýza odhalila zvýšený laktát, mozkové léze a a hypertrofická obstrukční kardiomyopatie.[12]

Interakce

Kromě ko-podjednotek komplexu I má NDUFS8 interakce protein-protein MLH1 a GEM.[14][15]

Reference

  1. ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000110717 - Ensembl, Květen 2017
  2. ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000059734 - Ensembl, Květen 2017
  3. ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  4. ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  5. ^ de Sury R, ​​Martinez P, Procaccio V, Lunardi J, Issartel JP (červenec 1998). „Genomická struktura lidského genu NDUFS8 kódujícího podjednotku TYKY železo-síra mitochondriální NADH: ubichinon oxidoreduktáza“. Gen. 215 (1): 1–10. doi:10.1016 / S0378-1119 (98) 00275-3. PMID  9666055.
  6. ^ Procaccio V, Depetris D, Soularue P, Mattei MG, Lunardi J, Issartel JP (březen 1997). „cDNA sekvence a chromozomální lokalizace lidského genu NDUFS8 kódujícího 23 kDa podjednotku mitochondriálního komplexu I“. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - genová struktura a exprese. 1351 (1–2): 37–41. doi:10.1016 / s0167-4781 (97) 00020-1. PMID  9116042.
  7. ^ A b C d „Entrez Gene: NDUFS8 NADH dehydrogenáza (ubichinon) Fe-S protein 8, 23 kDa (NADH-koenzym Q reduktáza)“.
  8. ^ A b C „NDUFS8 - NADH dehydrogenáza [ubichinon] železo-sírový protein 8, mitochondriální prekurzor - Homo sapiens (člověk) - gen a protein NDUFS8“. www.uniprot.org. Citováno 2018-07-19.
  9. ^ Donald Voet; Judith G. Voet; Charlotte W. Pratt (2013). „18“. Základy biochemie: život na molekulární úrovni (4. vydání). Hoboken, NJ: Wiley. str. 581–620. ISBN  9780470547847.
  10. ^ Zong NC, Li H, Li H, Lam MP, Jimenez RC, Kim CS, Deng N, Kim AK, Choi JH, Zelaya I, Liem D, Meyer D, Odeberg J, Fang C, Lu HJ, Xu T, Weiss J , Duan H, Uhlen M, Yates JR, Apweiler R, Ge J, Hermjakob H, Ping P (říjen 2013). „Integrace biologie a medicíny srdečních proteomů pomocí specializované znalostní databáze“. Výzkum oběhu. 113 (9): 1043–53. doi:10.1161 / CIRCRESAHA.113.301151. PMC  4076475. PMID  23965338.
  11. ^ Jao, Danieli. „Znalostní databáze atlasu srdečních organelárních proteinů (COPaKB) - —proteinové informace“. amino.heartproteome.org. Citováno 2018-07-20.
  12. ^ A b Loeffen J, Smeitink J, Triepels R, Smeets R, Schuelke M, Sengers R, Trijbels F, Hamel B, Mullaart R, van den Heuvel L (prosinec 1998). „První nukleárně kódovaná komplexní mutace I u pacienta s Leighovým syndromem“. American Journal of Human Genetics. 63 (6): 1598–608. doi:10.1086/302154. PMC  1377631. PMID  9837812.
  13. ^ Schuler, Franz; Casida, John E. (02.07.2001). "Funkční vazba podjednotek PSST a ND1 v NADH: ubichinon oxidoreduktáza stanovena fotoafinitním značením". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - bioenergetika. 1506 (1): 79–87. doi:10.1016 / S0005-2728 (01) 00183-9. ISSN  0005-2728. PMID  11418099.
  14. ^ „Proteiny cytoskeletálního lešení interagují s proteinem MLH1 spojeným s nesouladem Lynchova syndromu“. IntAct.
  15. ^ „Sada dat interakce proteinů zvýrazněna signálními cestami lidského Ras-MAPK / PI3K“. IntAct.

Další čtení

externí odkazy

  • Přehled všech strukturálních informací dostupných v PDB pro UniProt: O00217 (Lidská NADH dehydrogenáza [ubichinon] železo-sirný protein 8, mitochondriální) na PDBe-KB.
  • Přehled všech strukturálních informací dostupných v PDB pro UniProt: Q8K3J1 (Myší NADH dehydrogenáza [ubichinon] železo-sirný protein 8, mitochondriální) na PDBe-KB.

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.