Haploskupina F (mtDNA) - Haplogroup F (mtDNA)

Tento článek je o lidské haploskupině mtDNA. Pro haploskupinu lidské Y-DNA viz Haploskupina F-M89.
Haploskupina F
Možná doba vzniku43 400 YBP[1]
Možné místo původuAsie
PředekR9
PotomciF1, F2, F3, F4
Definování mutací249d, 6392, 10310[2]

Haploskupina F je lidská mitochondriální DNA (mtDNA) haploskupina. Clade je nejběžnější v východní Asie a Jihovýchodní Asie.[3][4][5][6][7][8][9][10][11][12][13][14][15][16][17] Nebylo nalezeno mezi Domorodí Američané.[18]

Je to primární odvětví haploskupina R9.

Rozdělení

Haploskupina F je poměrně běžná východní Asie. Vysoké frekvence kladu se nacházejí mezi Lahu z Yunnan (33% - 77%, průměr 52%), Nicobarské ostrovy (50%), Shors z Kemerovská oblast Sibiře (41%) a Arunáčalpradéš, Indie (31%).[19] Důležitá frekvence je také v Tchajwanští domorodci, Khakas, Kets, Han Číňan (a tedy téměř celá Čína), Lombok, Sumba, Thajsko, a Vietnam. Jeho distribuce sahá s nízkou frekvencí do Tharu jižní Nepál a Baškirové jižní Ural.[20][21][22]

Haploskupina F se také vyskytuje na nízkých frekvencích na internetu Komorské ostrovy (<10%).[23]Vyskytuje se také při nízkých frekvencích na Hvar ostrov v Chorvatsku (8,3%).

Tabulka frekvencí haploskupiny MtDNA F

Počet obyvatelFrekvencePočetZdrojPodtypy
Lahu (Lancang, Yunnan )0.77135Wen 2004F1a = 18, F (xF1a, F1b, F1c, F2a) = 9
Senoi (Malajsie )0.44252Hill 2006F1a1a = 23
Tujia (Yongshun, Hunan )0.43330Wen 2004F (xF1a, F1b, F1c, F2a) = 6, F1a = 4, F1c = 2, F1b = 1
Shor (Kemerovo )0.41582Derenko 2007F1 = 33, F2a = 1
Lahu (Simao, Yunnan )0.34432Wen 2004F1a = 10, F2a = 1
Lahu (Xishuangbanna, Yunnan )0.33315Wen 2004F1a = 3, F1b = 1, F1c = 1
Pan Yao (Tianlin, Guangxi )0.31332Wen 2005F3 = 2, F1b = 2, F1a1a = 2, F1a1 (xF1a1a) = 2, F1a (xF1a1) = 1, F1c = 1
Yi (Hezhang County, Guizhou )0.30020Li 2007F1b = 4, F1a = 2
Lingao (Hainan )0.29031Peng 2011F (xF1, F2, F3, F4) = 2, F2 = 2, F1 (xF1a) = 1, F1a1 (xF1a1a) = 1, F1a1a = 1, F3 = 1, F4 = 1
Nížina Yao (Fuchuan, Guangxi )0.28642Wen 2005F2a = 4, F1a1 (xF1a1a) = 2, F1a (xF1a1) = 2, F1b = 1, F1c = 1, F1 (xF1a, F1b, F1c) = 1, F3 = 1
Xiban Yao (Fangcheng, Guangxi )0.27311Wen 2005F1b = 1, F1a (xF1a1) = 1, F (xF1, F2a, F3) = 1
Lanten Yao (Tianlin, Guangxi )0.26926Wen 2005F1a (xF1a1) = 5, F1a1 (xF1a1a) = 1, F (xF1, F2a, F3) = 1
Bai (Xishuangbanna, Yunnan )0.26319Wen 2004F1a = 2, F1b = 2, F (xF1a, F1b, F1c, F2a) = 1
Huatou Yao (Fangcheng, Guangxi )0.26319Wen 2005F1a1a = 2, F1a1 (xF1a1a) = 1, F1a (xF1a1) = 1, F (xF1, F2a, F3) = 1
vietnamština0.26242Jin 2009F1a = 10, F (xF1a, F1b, F1c, F2) = 1
Tchaj-wan (domorodci)0.253640Peng 2011F4 = 72, F3 = 54, F1a1 (xF1a1a) = 21, F1a (xF1a1) = 14, F2 = 1
Bai (Dali, Yunnan )0.25068Wen 2004F1a = 6, F1c = 4, F2a = 4, F1b = 2, F (xF1a, F1b, F1c, F2a) = 1
Indonéština (Mataram, Lombok )0.25044Hill 2007F1a1a = 4, F1a (xF1a1, F1a3, F1a4, F1a5) = 4, F1a3 = 1, F1a4 = 1, F (xF1a, F1b, F2, F3a, F3b, F4) = 1
Ujgur (Uzbekistán / Kyrgyzstán)0.25016Comas 2004F = 4
Yi (Xishuangbanna, Yunnan )0.25016Wen 2004F1b = 2, F1a = 1, F2a = 1
Khakassian (Khakassia )0.24657Derenko 2007F1 = 11, F2a = 3
Naxi (Lijiang, Yunnan )0.24445Wen 2004F1a = 8, F1b = 2, F2a = 1
Bunu (Dahua & Tianlin, Guangxi )0.24025Wen 2005F1b = 2, F (xF1, F2a, F3) = 1, F1a1 (xF1a1a) = 1, F1a1a = 1, F3 = 1
Ket0.23738Starikovskaya 2005F = 9
Han (Peking )0.22540Jin 2009F1a = 4, F (xF1a, F1b, F1c, F2) = 3, F1b = 2
Tchajwanský (Taipei, Tchaj-wan )0.22091Umetsu 2005F = 20
Han (Jihozápadní Čína; skupina 44 Sichuan, 34 Chongqing, 33 Yunnan a 26 Guizhou)0.219137Ji 2012F1a = 15, F2 = 8, F3 = 7
Hani (Xishuangbanna, Yunnan )0.21233Wen 2004F1a = 6, F1b = 1
Tibetský (Shigatse, Tibet )0.20729Ji 2012F1a = 5, F1b = 1
Tujia (Yanhe County, Guizhou )0.20729Li 2007F1a = 2, F1c = 1, F2a3 = 1, F2b = 1, F (xF1, F2) = 1
Bapai Yao (Liannan, Guangdong )0.20035Wen 2005F1b = 3, F3 = 2, F1a1a = 1, F1a (xF1a1) = 1
Indonéština (Waingapu, Sumba )0.20050Hill 2007F1a4 = 3, F1a3 = 2, F1a1a = 2, F1a (xF1a1, F1a3, F1a4, F1a5) = 1, F1a1 (xF1a1a) = 1, F3b = 1
Manchurian0.20040Jin 2009F (xF1a, F1b, F1c, F2) = 3, F1a = 2, F1b = 2, F1c = 1
Thai0.20040Jin 2009F1b = 8
Li (Hainan )0.197346Peng 2011F1a1 (xF1a1a) = 30, F2 = 20, F1 (xF1a) = 4, F1a (xF1a1) = 4, F1a1a = 3, F3 = 3, F4 = 3, F (xF1, F2, F3, F4) = 1
Han (Sin-ťiang )0.19147Yao 2004F1a = 2, F3 = 2, F1b = 1, F1c = 1, F2a2 = 1, F2a3 = 1, F4 = 1
Thajsko0.190105Kaewsutthi 2011F1 = 18, F (xF1) = 2
Lisu (Gongshan, Yunnan )0.18937Wen 2004F2a = 4, F1b = 2, F1a = 1
Han (jižní Kalifornie )0.187390Ji 2012F = 73
Oirate Mongol (Sin-ťiang )0.18449Yao 2004F2 (xF2a2, F2a3, F2b) = 3, F1b = 3, F1a = 2, F2b = 1
Dong (Tianzhu County, Guizhou )0.17928Li 2007F1a = 4, F1b = 1
Han (Tchaj-wan )0.1751117Ji 2012F = 196
CHB (Han z Pekingská normální univerzita )0.174121Zheng 2011F = 21
Jino (Xishuangbanna, Yunnan )0.16718Wen 2004F1a = 2, F1b = 1
Nu (Gongshan, Yunnan )0.16730Wen 2004F2a = 5
Gelao (Daozhen County, Guizhou)0.16131Li 2007F1a = 3, F1 (xF1a, F1b, F1c) = 1, F (xF1, F2) = 1
CHD (Han z Denver )0.15173Zheng 2011F = 11
Filipínský (Palawan )0.15020Scholes 2011F3b2 = 3
Indonéština (52 Pekanbaru, 42 Medan, 34 Bangka, 28 Palembang, & 24 Padang )0.150180Hill 2007F1a1a = 9, F1a (xF1a1, F1a3, F1a4, F1a5) = 8, F1a5 = 3, F4 = 3, F1a3 = 2, F1a4 = 2
Kyrgyzština (Uzbekistán / Kyrgyzstán)0.15020Comas 2004F = 3
Yi (Shuangbai, Yunnan )0.15040Wen 2004F (xF1a, F1b, F1c, F2a) = 2, F1a = 2, F1b = 2
mongolský (Ulan Bator )0.14947Jin 2009F1a = 3, F1b = 3, F2a = 1
Borneo (89 Banjarmasin & 68 Kota Kinabalu )0.146157Hill 2007F3b = 9, F (xF1a, F1b, F2, F3a, F3b, F4) = 4, F1a3 = 3, F1a4 = 3, F1a1 (xF1a1a) = 2, F1a (xF1a1, F1a3, F1a4, F1a5) = 1, F1a1a = 1
Indonéština (Bali )0.14682Hill 2007F1a (xF1a1, F1a3, F1a4, F1a5) = 5, F1a1 (xF1a1a) = 4, F1a1a = 2, F (xF1a, F1b, F2, F3a, F3b, F4) = 1
Hmong (Jishou, Hunan )0.146103Wen 2005F1a1 (xF1a1a) = 4, F1a1a = 3, F (xF1, F2a, F3) = 3, F1a (xF1a1) = 2, F1b = 2, F3 = 1
Aini (Xishuangbanna, Yunnan )0.14050Wen 2004F1a = 6, F (xF1a, F1b, F1c, F2a) = 1
Indonéština (Ambon )0.14043Hill 2007F1a3 = 3, F1a4 = 2, F1a1a = 1
Kuně (Hainan )0.13330Peng 2011F4 = 3, F1a1 (xF1a1a) = 1
Hui (Sin-ťiang )0.13345Yao 2004F1b = 2, F1c = 2, F1a = 1, F2a3 = 1
Batak (Palawan )0.12931Scholes 2011F1a3 = 3, F3b2 = 1
Yi (Luxi, Yunnan )0.12931Wen 2004F1b = 3, F (xF1a, F1b, F1c, F2a) = 1
Guoshan Yao (Jianghua, Hunan )0.12524Wen 2005F1a (xF1a1) = 1, F1b = 1, F3 = 1
Tu Yao (Hezhou, Guangxi )0.12241Wen 2005F1a1a = 4, F1a (xF1a1) = 1
Gelao (Daozhen County, Guizhou)0.118102Liu 2011F1a (xF1a1) = 4, F1b = 3, F2 (xF2a, F2b) = 2, F3a = 2, F3 (xF3a) = 1
Tibetský (Nagchu, Tibet )0.11435Ji 2012F = 4
Tibetský (Lhasa, Tibet )0.11444Ji 2012F1a = 2, F2 = 2, F1b = 1
Filipínský (Luzon )0.113177Tabbada 2010F1a3 = 6, F1a4 = 6, F3b = 5, F4b = 2, F1a1a = 1
Indonéština (Alor )0.11145Hill 2007F1a4 = 3, F1a1a = 1, F1a (xF1a1, F1a3, F1a4, F1a5) = 1
Indonéština (Sulawesi, vč. 89 Manado, 64 Toraja, 46 Ujung Padang, & 38 Palu )0.110237Hill 2007F1a4 = 12, F1a3 = 4, F1a (xF1a1, F1a3, F1a4, F1a5) = 4, F1a1a = 3, F1a1 (xF1a1a) = 1, F1a5 = 1, F1b = 1
Tujia (západní Hunan )0.10964Wen 2004F (xF1a, F1b, F1c, F2a) = 2, F1a = 2, F1b = 2, F1c = 1
Cham (Bình Thuận, Vietnam )0.107168Peng 2010F1a1a = 10, F1 (xF1a) = 3, F1a (xF1a1) = 3, F1a1 (xF1a1a) = 2
Tibetský (Shannan, Tibet )0.10519Ji 2012F = 2
Dingban Yao (Mengla, Yunnan )0.10010Wen 2005F1a (xF1a1) = 1
Filipínský (Visayas )0.098112Tabbada 2010F1a4 = 7, F1a3 = 3, F3b = 1
korejština (Jižní Korea )0.097185Jin 2009F1a = 8, F1b = 8, F2 (xF2a) = 2
korejština (Soulská národní univerzitní nemocnice )0.096633Fuku 2007F = 61
Filipínský0.09464Tabbada 2010F1a3 = 3, F1a4 = 3
Vzezření (Shangsi, Guangxi )0.09432Wen 2005F1a1 (xF1a1a) = 2, F1a1a = 1
Tibetský (Tibet )0.093216Ji 2012F1a = 13, F1b = 4, F2 = 3
CHS (Han z Hunan & Fujian )0.09155Zheng 2011F = 5
Burjat0.087126Kong 2003F1b = 6, F1a = 3, F (xF1a, F1b, F1c, F2a) = 2
Tofalar0.08746Starikovskaya 2005F1b = 4
Uzbek (Sin-ťiang )0.08658Yao 2004F2a3 = 2, F4 = 2, F1b = 1
Tuvinian (Tuva )0.086105Derenko 2007F1 = 8, F2a = 1
japonský (Tohoku )0.083336Umetsu 2005F = 28
Mongol (Nový levý banner Barag )0.08348Kong 2003F1a = 2, F1c = 1, F2a = 1
Pumi (Ninglang, Yunnan )0.08336Wen 2004F2a = 2, F1b = 1
Tibetský (Diqing, Yunnan )0.08324Wen 2004F1a = 1, F1b = 1
korejština (severní Čína)0.07851Jin 2009F (xF1a, F1b, F1c, F2) = 1, F1a = 1, F1b = 1, F1c = 1
JPT (japonský z Tokio )0.076118Zheng 2011F = 9
Kazašský (Sin-ťiang )0.07553Yao 2004F1b = 3, F2 (xF2a2, F2a3, F2b) = 1
čínština (Shenyang, Liaoning )0.075160Umetsu 2005F = 12
Danga (Hainan )0.07540Peng 2011F1a1 (xF1a1a) = 1, F2 = 1, F3 = 1
japonský (severní Kjúšú )0.074256Umetsu 2005F = 19
Tibetský (Nyingchi, Tibet )0.07454Ji 2012F1a = 2, F1b = 2
Ujgur0.07355Yao 2004F1b = 2, F1a = 1, F1c = 1
Filipínský (Mindanao )0.07170Tabbada 2010F3b = 2, F1a4 = 2, F1a3 = 1
korejština (Soul & Daejeon, Jižní Korea )0.069261Kim 2008F1 = 12, F (xF1) = 6
Tibetský (Chamdo, Tibet )0.06929Ji 2012F1a = 2
Semelai (Malajsie )0.06661Hill 2006F1a1a = 4
japonský (Hokkaido )0.065217Asari 2007F = 14
Wuzhou Yao (Fuchuan, Guangxi )0.06531Wen 2005F1a1 (xF1a1a) = 1, F3 = 1
korejština (Jižní Korea )0.064203Umetsu 2005F = 13
mongolský (Ulan Bator )0.06447Derenko 2007F1 = 3
Ujgur (Sin-ťiang )0.06447Yao 2004F1b = 2, F1a = 1
Bashkir (Beloretsky, Sterlibashevsky, Ilishevsky, & Perm )0.063221Bermisheva 2002F = 14
Dungan (Uzbekistán / Kyrgyzstán)0.06316Comas 2004F = 1
japonský (Miyazaki )0.060100Uchiyama 2007F1b = 3, F1a = 2, F2a = 1
Tharu (Chitwan, Nepál )0.060133Fornarino 2009F1c = 7, F1 (xF1c, F1d) = 1
japonský (Gifu )0.0591617Fuku 2007F = 96
japonský (Tókai )0.057282Umetsu 2005F = 16
Teleut (Kemerovo )0.05753Derenko 2007F1 = 3
Altaj Kizhi0.05690Derenko 2007F1 = 3, F2a = 2
Kalmyku (Kalmykia )0.055110Derenko 2007F1 = 6
Tibetský (Shannan, Tibet )0.05555Ji 2012F1a = 2, F2 = 1
Tibetský (Qinghai )0.05456Wen 2004F1c = 2, F1a = 1
japonský0.052211Marujama 2003F1b = 9, F1a = 2
Hmong (Wenshan, Yunnan )0.05139Wen 2005F1b = 1, F3 = 1
Kazašský (Kosh-Agach, Altajská republika )0.05198Derenko 2012F1 = 5
Karakalpak (Uzbekistán / Kyrgyzstán)0.05020Comas 2004F = 1
Tharu (Morang, Nepál )0.05040Fornarino 2009F1c = 1, F1d = 1
Turkmenština (Uzbekistán / Kyrgyzstán)0.05020Comas 2004F = 1
korejština (Jižní Korea )0.049103Derenko 2007F1 = 5
Oroqen (Oroqenský autonomní banner )0.04544Kong 2003F1b = 2
Jakut0.043117Kong 2003F2a = 3, F1b = 2
Tuvan0.04295Starikovskaya 2005F (xF1b) = 3, F1b = 1
Kyrgyzština (Talas )0.04248Yao 2004F1a = 1, F1b = 1
Tibetský (Nyingchi, Tibet )0.04224Ji 2012F = 1
Khamnigan (Buryatia )0.04099Derenko 2007F1 = 4
Iu Mien (Mengla, Yunnan )0.03727Wen 2005F (xF1, F2a, F3) = 1
Kazašský0.03655Yao 2004F1b = 2
Barghut (Hulunbuir )0.034149Derenko 2012F1 = 4, F2 = 1
Burjat (Buryatia )0.031295Derenko 2007F1 = 7, F2a = 2
Tibetský (Zhongdian, Yunnan )0.02935Wen 2004F2a = 1
Kim Mun (Malipo, Yunnan )0.02540Wen 2005F1a1 (xF1a1a) = 1
Uzbek (Uzbekistán / Kyrgyzstán)0.02540Comas 2004F = 1
Okinawa0.025326Umetsu 2005F = 8
Evenk (Nový levý banner Barag )0.02147Kong 2003F1c = 1
Ainu0.02051Sato 2009F1b = 1
Evenk (53 Kamenná Tunguska povodí a 18 Tugur-Chumikan )0.01471Starikovskaya 2005F1b = 1
Telenghit (Altajská republika )0.01471Derenko 2007F1 = 1
Tubalar0.01472Starikovskaya 2005F1b = 1
Evenk (Krasnojarsk )0.01473Derenko 2007F1 = 1
Ulči (Stará a Nová Bulava, Ulchsky, Chabarovsk )0.01187Starikovskaya 2005F (xF1b) = 1
Mansi0.01098Starikovskaya 2005F = 1
Khanty0.009106Pimenoff 2008F1 = 1
Chukchi (Anadyr )0.00015Derenko 2007-
Bukharan Arab (Uzbekistán / Kyrgyzstán)0.00020Comas 2004-
Krymský tatar (Uzbekistán / Kyrgyzstán)0.00020Comas 2004-
íránský (Uzbekistán / Kyrgyzstán)0.00020Comas 2004-
Kazašský (Uzbekistán / Kyrgyzstán)0.00020Comas 2004-
Tádžické (Uzbekistán / Kyrgyzstán)0.00020Comas 2004-
Hind (Chitwan, Nepál )0.00024Fornarino 2009-
Nganasan0.00024Starikovskaya 2005-
Burjat (Kušun, Nižněudinsk, Irkutská oblast )0.00025Starikovskaya 2005-
Kurd (severozápadní Írán )0.00025Derenko 2007-
Andhra Pradesh (kmenový )0.00029Fornarino 2009-
Batek (Malajsie )0.00029Hill 2006-
Mendriq (Malajsie )0.00032Hill 2006-
Negativní0.00033Starikovskaya 2005-
Temuan (Malajsie )0.00033Hill 2006-
Jakut (Jakutsko )0.00036Derenko 2007-
Tibetský (Deqin, Yunnan )0.00040Wen 2004-
Tádžické (Tádžikistán )0.00044Derenko 2007-
Daur (Evenk Autonomous Banner )0.00045Kong 2003-
Evenk (Buryatia )0.00045Derenko 2007-
Udege (Gvasiugi, Imeni Lazo, Chabarovsk )0.00046Starikovskaya 2005-
Itelmen0.00047Starikovskaya 2005-
Kyrgyzština (Sary-Tash )0.00047Yao 2004-
korejština (Arun Banner )0.00048Kong 2003-
Jahai (Malajsie )0.00051Hill 2006-
Nivkh (severní Sachalin )0.00056Starikovskaya 2005-
Mansi0.00063Pimenoff 2008-
Chukchi0.00066Starikovskaya 2006-
Sibiřský Eskymák0.00079Starikovskaya 2005-
Peršan (východní Írán )0.00082Derenko 2007-
Koryak0.000155Starikovskaya 2005-

Subclades

F1a mezi zástupci haploskupiny F jasně dominuje Jihovýchodní Asie, ale subclades této haploskupiny byly nalezeny v populacích jako daleký sever jako Buriati a Ulči Sibiře.

F1b má tendenci být častější jako zlomek celkového F v populacích severních částí ostrova východní Asie a Střední Asie, jako Mongolové, Kazachové, Ujgurové, a japonský. Bylo také zjištěno, mezi Lidé. V Gaininsku existují podivné exclaves F1b Baškirové z Permská oblast a Chorvati z Ostrov Hvar.[20][24]

F2 byl nalezen hlavně ve formě F2a, který byl pozorován u více než 10% z několika vzorků Nu a Lisu z Gongshan, Yunnan.[8] F2 byl nalezen s frekvencemi vyššími než 5% u několika dalších populací Jihozápadní Čína, Guangxi, a Hainan, včetně Han většinová populace. Mimo jihozápadní Čínu byl u vzorku F2 nalezen s frekvencí vyšší než 5% Oirate Mongolové z Sin-ťiang a vzorek Khakas z Khakassia, přičemž bývalá populace se v této kladu chlubí obzvláště vysokou rozmanitostí.

F3 je zvláště běžné mezi Austronesian národy z Tchaj-wan a Malajské souostroví, ale také byl nalezen v mnoha populacích Jihozápadní Čína a Jih-střední Čína a ve vzorku Hansi z Sin-ťiang.

F4 byl nalezen hlavně u domorodých populací Tchaj-wan a Hainan, s některými zástupci mezi vzorky Filipínců z Luzon, Indonésané z Sumatra a Hans a Uzbekové z Sin-ťiang.

Strom

Tento fylogenetický strom subcladů haploskupiny F je založen na příspěvku Mannisa van Ovena a Manfreda Kaysera Aktualizovaný komplexní fylogenetický strom globální variace lidské mitochondriální DNA[2] a následný publikovaný výzkum.

  • F
    • F * - Čína, Korea[25]
    • F1
      • F1a'c'f - Thajsko (Kaleun v provincii Nakhon Phanom[26]), Čína, Korea,[25] Kazachstán
        • F1a - Čína, Korea,[25] Ujgur, Thajsko
          • F1a1'4 - Thajsko (Khon Mueang v provincii Chiang Rai[26]), Čína
            • F1a1 - Japonsko, Korea,[25] Čína, Ulchi, Ujgur, Vietnam (vč. Cờ Lao ), Laos, Thajsko, Indonésie, Mexiko
              • F1a1a - Thajsko, Laos, Vietnam, Čína (Zhanjiang, atd.), Tibet, Indonésie
                • F1a1a1 - Vietnam, Laos, Thajsko, Kambodža, Nikobary, Malajština, Indonésie, Čína, Ujgur
              • F1a1b - Japonsko, Korea
              • F1a1c - Zhuang (Bama), Thajsko, Tibet, Buryats (Vnitřní Mongolsko a Irkutská oblast), Japonsko
                • F1a1c1 - Moken
                • F1a1c2 - Japonsko, Xibo, Čína (Šanghaj)
              • F1a1d - Thajsko, Čína, Tchaj-wan (Tsou, Bunun, Rukai), Filipíny
                • F1a1d1 - Tao (Orchid Island)
            • F1a4
              • F1a4a - Thajsko, čínština Han (Denver), Ulchi
                • F1a4a1 - Tchaj-wan (Tsou, Makatao, Bunun, Ami, atd.), Filipíny (Ivatan, Ibaloi, Abaknon, Bugkalot, Kalangoya, Dulag, atd.), Guam, Malajsie (Kelantan Malay ), Sumatra, Vietnam (Dao ), Thajsko (Khon Mueang v provincii Mae Hong Son a provincii Chiang Mai[26]), Jižní Afrika
              • F1a4b - Čína
          • F1a2 - Thajsko, Vietnam (Hmong), Čína (Guizhou)
            • F1a2a - Thajsko (Phutai v provincii Sakon Nakhon, Nyaw v provincii Nakhon Phanom, Mon v provincii Lopburi[26]), Čína (Han in Zhanjiang, Dong, atd.)
          • F1a3 - Thajsko, Ujgur
        • F1c - Japonsko
          • F1c1 - Japonsko
            • F1c1a - Korea, Sin-ťiang, Tibet, Džammú a Kašmír, Thajsko (Palaung v provincii Chiang Mai, Khmu v provincii Nan, Khon Mueang v provincii Lampang)[26])
              • F1c1a1 - Rusko, Čína (Qingdao, atd.), Evenk (New Barag Left Banner), Oroqen, Zhuang (Bama), Tchaj-wan (Minnan)
                • F1c1a1a - Tibet (Shannan, Sherpa, atd.), Yi
                • F1c1a1b - Čína
              • F1c1a2 - Tibet, Thajsko, Čína (Chongqing), Indie
        • F1f - Thajsko, Čína, Lahu, Myanmar, Tibet, Kambodža, Vietnam (Hmong)
      • F1b - Korea[25]
        • F1b1 - Čína, Tibet (Shigatse, atd.), Ladakh, Ujgur (Artux, atd.), Kyrgyzština, Ázerbájdžán, Kurd (Írán), arménština, Turecko, Rusko, Chorvatsko
          • F1b1a - Japonsko, Korea, Ujgur
            • F1b1a1 - Japonsko, Korea
              • F1b1a1a - Japonsko, Korea
                • F1b1a1a1 - Japonsko, Korea
                  • F1b1a1a1a - Japonsko
                • F1b1a1a2 - Japonsko, Korea
                • F1b1a1a3 - Japonsko
            • F1b1a2 - Japonsko, Korea
          • F1b1b - Jakut, Ujgur, Kyrgyz, Turek, Sudý (Sakkyryyr, Tompo ), Korea
          • F1b1c - Čína, Yi, Burjate
          • F1b1d - Japonsko, Korea
          • F1b1e - Ujgur, Kyrgyz, Buryat, Oroqen, ruština (Sverdlovská oblast )
            • F1b1e1 - Yakut
          • F1b1f - Čína, Ujgur, Buryat (Burjatská republika ), Yakut (Namsky District ), Evenk (povodí kamenité Tungusky), Maďarsko (starověké Avars )
      • F1d - Čína, Tchaj-wan (Minnan, atd.), Tibet (Lhasa, atd.), Thajsko (Pondělí v provincii Kanchanaburi[26]), Japonsko, Kyrgyz (Artux), Hezhen, starověký Scythian
        • F1d1 - Tibet, Nepál (Tharu), Myanmar, Thajsko (Pondělí v provincii Kanchanaburi[26]), Čína, Japonsko, Jižní Afrika
      • F1e - Thajsko
        • F1e1 - Čína (Han z Hunanu)
          • F1e1a - Japonsko
        • F1e2 - Čína, Kyrgyz (Tashkurgan)
        • F1e3 - Čína (Shantou, atd.), Laos (Lao ve Vientiane[26]), Thajsko (Phuan v provincii Lopburi a provincii Phichit[26]), Sumatra
      • F1g - Tibet, Thajsko (Phuan v provincii Lopburi, provincii Sukhothai a provincii Phichit[26]), Čína, Kyrgyz (Tashkurgan)
        • F1g1 - Čína (Yunnan, atd.), Vietnam (Hmong, Dao )
    • F2
      • F2 * - Laos (Lao ve Vientiane[26]), Čína, Hongkong, Ujgur (Artux)
      • F2a'b'g
        • F2a - Čína (Han z Pekingu, Sin-ťiang, atd.), Tchaj-wan (Makatao), Korea,[25] Japonsko, Kazachstán
          • F2a1 - Čína (Han ze Shandongu), Naxi, Bai, Nu, Tu (Monguor ),[27] Yi, Tibetský
          • F2a2 - Čína (Han ze Zhanjiang, atd.), Miao (Guizhou), Kinh (Guangxi), Dai a Lisu (Yunnan)[27]
          • F2a3 - Čína (Han z Xinjiang, Yunnan, Qinghai a Shandong), Tu, Hui, Mongolové ve Vnitřním Mongolsku[27]
        • F2b - Čína (Han z Qingdao), Tchaj-wan (Hakka)
          • F2b1 - Thajsko (Lao Isan v provincii Roi Et a provincii Chaiyaphum, Khon Mueang v provincii Lampang[26]), Čína (Han z Pekingu, Sin-ťiang, atd.), Buryat (Irkutsk Oblast), Yakut, Even (NE Sakha Republic),[28] Yukaghir (NE Sakha Republic)[28]
        • F2g - Čína, Ladakh
      • F2c - Čína
        • F2c1 - Čína (Shantou, atd.), Japonsko
        • F2c2 - Čína (Han z Pekingu), Kyrgyzstán (Kyrgyz)
      • F2d - Čína, Ujgur, Thajsko (Khon Mueang v provincii Chiang Mai a provincii Lamphun[26]), Singapur, Japonsko, Kazachstán
      • F2e - Čína, Thajsko (Tai Yuan v provincii Uttaradit, Phuan v provincii Phrae a provincii Lopburi, Khon Mueang v provincii Chiang Mai[26]), Vietnam (Dao )
        • F2e1 - Čína, Barghut (Hulun Buir)
      • F2f - Japonsko, Korea, Čína, Pákistán (Hazara ), Polsko
      • F2h'i - Čína
        • F2h - Čína, Tibet (Lhasa), Tchaj-wan, Thajsko (Tai Dam v provincii Kanchanaburi[26])
        • F2i - Čína, Tchaj-wan (Makatao), Korea
    • F3 (dříve R9a)
      • F3a - Čína (Han z Ili, atd.), Ujgur, Thajsko
        • F3a1 - Čína (Han z Yunnan, Guizhou, Shantou, atd.), Kyrgyz (Tashkurgan), Tchaj-wan (Hakka, atd.), Thajsko (Phuan v provincii Suphan Buri, Shan v provincii Mae Hong Son, Khon Mueang v provincii Chiang Rai, provincii Mae Hong Son, provincii Chiang Mai, provincii Lamphun a provincii Lampang[26]), Vietnam (Hmong, Dao )
      • F3b - Thajsko, Japonsko, Korea,[25] Čína (Han z Qijiang), Yi
        • F3b1 - Filipíny, Komory (Komor z Grande Comore), USA
          • F3b1a - Tchaj-wan (Rukai, Puyuma, Paiwan, Tsou, Makatao, Bunun, Ami, atd.), Filipíny (Maranao )
            • F3b1a1 - Filipíny (Bugkalot), Indonésie
            • F3b1a2 - Tchaj-wan (Puyuma, Bunun, Paiwan, atd.)
          • F3b1b - Madagaskar, Sumatra, Filipíny (Batak z ostrova Palawan)
            • F3b1b1 - Filipíny (Ibaloi, Kankanaey, Ifugao), Španělsko, Dánsko
    • F4
      • F4a - Thajsko / Laos, Čína, Tchaj-wan, Korea[25]
        • F4a1
          • F4a1a - Japonsko, Čína (Ona ), Tchaj-wan
          • F4a1b - Čína, Japonsko
        • F4a2 - Čína, Laos (Lao ve Vientiane a Luang Prabang[26]), Thajsko (Phuan v provincii Lopburi, Nyah Kur v provincii Chaiyaphum, Khon Mueang v provincii Lamphun[26])
      • F4b - Čína (Han z Pekingu), Thajsko (Khon Mueang v provincii Mae Hong Son, Lao Isan v provincii Roi Et[26])
        • F4b1 - Čína, Tchaj-wan (Atayal, Bunun, Saisiyat, Thao, Tsou, Ami, Makatao, atd.), Filipíny, Madagaskar

Viz také

Reference

  1. ^ Soares, P; Ermini, L; Thomson, N; Mormina, M; Rito, T; Röhl, A; Salas, A; Oppenheimer, S; MacAulay, V (2009). „Oprava pro čištění výběru: Vylepšené lidské mitochondriální molekulární hodiny“. American Journal of Human Genetics. 84 (6): 740–59. doi:10.1016 / j.ajhg.2009.05.001. PMC  2694979. PMID  19500773.
  2. ^ A b van Oven, Mannis; Manfred Kayser (13. října 2008). „Aktualizovaný komplexní fylogenetický strom globální variace lidské mitochondriální DNA“. Lidská mutace. 30 (2): E386 – E394. doi:10.1002 / humu.20921. PMID  18853457. S2CID  27566749. Archivovány od originál dne 4. prosince 2012. Citováno 2009-05-20.
  3. ^ Comas, David; Plaza, Stephanie; Wells, R. Spencer; et al. (2004). „Příměs, migrace a rozptýlení ve Střední Asii: důkazy z mateřských linií DNA“. European Journal of Human Genetics. 12 (6): 495–504. doi:10.1038 / sj.ejhg.5201160. PMID  14872198.
  4. ^ Starikovskaya, E. B .; Sukernik, R. I .; Derbeneva, O. A .; Volodko, N. V .; Ruiz-Pesini, E .; Torroni, A .; Brown, M. D .; Lott, M. T .; Hosseini, S. H .; Huoponen, K .; Wallace, D. C. (2005). „Rozmanitost mitochondriální DNA v domorodých populacích jižní části Sibiře a počátky haploskupin domorodých Američanů“. Annals of Human Genetics. 69 (Pt 1): 67–89. doi:10.1046 / j.1529-8817.2003.00127.x. PMC  3905771. PMID  15638829.
  5. ^ Hill, Catherine; Soares, Pedro; Mormina, Maru; et al. (Prosinec 2006). „Fylogeografie a etnogeneze domorodých jihovýchodních Asiatů“. Mol. Biol. Evol. 23 (12): 2480–2491. doi:10.1093 / molbev / msl124. PMID  16982817.
  6. ^ Hill, Catherine; Soares, Pedro; Mormina, Maru; et al. (2007). „Mitochondriální stratigrafie pro ostrov jihovýchodní Asie“. Dopoledne. J. Hum. Genet. 80 (1): 29–43. doi:10.1086/510412. PMC  1876738. PMID  17160892.
  7. ^ Asari, M; et al. (2007). "Využití stanovení haploskupin pro forenzní analýzu mtDNA v japonské populaci". Leg Med. 9 (5): 237–240. doi:10.1016 / j.legalmed.2007.01.007. PMID  17467322.
  8. ^ A b Wen, Bo; Xie, Xuanhua; Gao, Song; et al. (2004). „Analýzy genetické struktury populací Tibeto-Burmana odhalují příměs sexuálně ovlivněnou v jižních Tibeto-Burmanech“. Dopoledne. J. Hum. Genet. 74 (5): 856–865. doi:10.1086/386292. PMC  1181980. PMID  15042512.
  9. ^ Wen, Bo; Li, Hui; Gao, Song; et al. (2005). „Genetická struktura populací mluvících v Hmong-Mien ve východní Asii, jak odhalila linie mtDNA“. Mol. Biol. Evol. 22 (3): 725–734. doi:10.1093 / molbev / msi055. PMID  15548747.
  10. ^ Derenko, M; Malyarchuk, B; Denisova, G; Perkova, M; Rogalla, U; et al. (2012). „Kompletní mitochondriální analýza DNA východoasijských haploskupin zřídka nalezená v populacích severní Asie a východní Evropy“. PLOS ONE. 7 (2): e32179. Bibcode:2012PLoSO ... 732179D. doi:10.1371 / journal.pone.0032179. PMC  3283723. PMID  22363811.
  11. ^ Marujama, Sayaka; Minaguchi, Kiyoshi; Saitou, Naruya (2003). "Sekvenční polymorfismy mitochondriální DNA kontrolní oblasti a fylogenetická analýza linií mtDNA v japonské populaci". Int J Legal Med. 117 (4): 218–225. doi:10.1007 / s00414-003-0379-2. PMID  12845447. S2CID  1224295.
  12. ^ Supannee Kaewsutthi, Nopasak Phasukkijwatana, Yutthana Joyjinda et al.„Pozadí mitochondriální haploskupiny může ovlivnit jihovýchodní Asii G11778A Leber Hereditary Optic Neuropathy“, Investigativní oftalmologie a vizuální věda, Červen 2011, roč. 52, č. 7
  13. ^ Peng, Min-Sheng; Ho Quang, Huy; Pham Dang, Khoa; et al. (2010). „Sledování austronéské stopy v jihovýchodní Asii na pevnině: perspektiva z mitochondriální DNA“. Mol. Biol. Evol. 27 (10): 2417–2430. doi:10.1093 / molbev / msq131. PMID  20513740.
  14. ^ Fuku, Noriyuki; Soo Park, Kyong; Yamada, Yoshiji; et al. (2007). „Mitochondriální haploskupina N9a poskytuje Asijcům odpor proti cukrovce typu 2“. Dopoledne. J. Hum. Genet. 80 (3): 407–415. doi:10.1086/512202. PMC  1821119. PMID  17273962.
  15. ^ Kim, W; Yoo, T-K; Shin, D-J; Rho, H-W; Jin, H-J; et al. (2008). „Analýza haploskupiny mitochondriální DNA neodhalila žádnou souvislost mezi běžnými genetickými liniemi a rakovinou prostaty v korejské populaci“. PLOS ONE. 3 (5): e2211. Bibcode:2008PLoSO ... 3,2211 tis. doi:10.1371 / journal.pone.0002211. PMC  2376063. PMID  18493608.
  16. ^ Uchiyama, Taketo; Hisazumi, Rinnosuke; Shimizu, Kenshi; et al. (2007). „Variace sekvence mitochondriální DNA a fylogenetická analýza u japonských jedinců z prefektury Miyazaki“. Japonský žurnál forenzní vědy a technologie. 12 (1): 83–96. doi:10.3408 / jafst.12.83.
  17. ^ Tabbada, Kristina A .; Trejaut, Jean; Loo, Jun-Hun; et al. (2010). „Rozmanitost filipínské mitochondriální DNA: osídlený viadukt mezi Tchaj-wanem a Indonésií?“. Mol. Biol. Evol. 27 (1): 21–31. doi:10,1093 / molbev / msp215. PMID  19755666.
  18. ^ Haploskupina F.
  19. ^ Derenko, Miroslava (2007). „Fylogeografická analýza mitochondriální DNA u populací v severní Asii“. American Journal of Human Genetics. 81 (5): 1025–1041. doi:10.1086/522933. PMC  2265662. PMID  17924343.
  20. ^ A b M. A. Bermisheva, K. Tambets, R. Villems a E. K. Khusnutdinova, „Rozmanitost haploskupin mitochondriální DNA v etnických populacích regionu Volha – Ural“, Molekulární biologie Sv. 36, č. 6, 2002, str. 802–812. Přeloženo z Molekulyarnaya Biologiya, Sv. 36, č. 6, 2002, s. 990–1001.
  21. ^ Fornarino, Simona; Pala, Maria; Battaglia, Vincenza; et al. (2009). „Diverzita mitochondrií a chromozomů Y u Tharus (Nepál): rezervoár genetických variací“. BMC Evoluční biologie. 9: 154. doi:10.1186/1471-2148-9-154. PMC  2720951. PMID  19573232.
  22. ^ Pimenoff, Ville N; Comas, David; Palo, Jukka U; et al. (2008). „Severozápadní Sibiřský Chanty a Mansij ve spojení západoevropských a euroasijských genových fondů, jak odhalují uniparentální markery“. European Journal of Human Genetics. 16 (10): 1254–1264. doi:10.1038 / ejhg.2008.101. PMID  18506205. S2CID  19488203.
  23. ^ Msaidie, Said; et al. (2011). „Genetická rozmanitost na Komorských ostrovech ukazuje, že raná plavba jako hlavní determinant bioculturního vývoje člověka v západním Indickém oceánu“ (PDF). European Journal of Human Genetics. 19 (1): 89–94. doi:10.1038 / ejhg.2010.128. PMC  3039498. PMID  20700146. Citováno 1. října 2016.
  24. ^ Tolk, Helle-Viivi; Barac, Lovorka; Pericic, Marijana; et al. (2001). „Důkazy mtDNA haploskupiny F v evropské populaci a její etnohistorické důsledky“. European Journal of Human Genetics. 9 (9): 717–723. doi:10.1038 / sj.ejhg.5200709. PMID  11571562.
  25. ^ A b C d E F G h Hwan Young Lee, Ji-Eun Yoo, Myung Jin Park, Ukhee Chung, Chong-Youl Kim a Kyoung-Jin Shin, „Východoasijské stanovení haploskupiny mtDNA u Korejců: SNP analýza kódující oblasti na úrovni haploskupiny a sekvence kontrolní oblasti na úrovni podskupiny analýza." Elektroforéza (2006). DOI 10.1002 / elps.200600151.
  26. ^ A b C d E F G h i j k l m n Ó p q r s Wibhu Kutanan, Jatupol Kampuansai, Metawee Srikummool, Daoroong Kangwanpong, Silvia Ghirotto, Andrea Brunelli a Mark Stoneking: „Kompletní mitochondriální genomy thajské a laoské populace naznačují starodávný původ austroasiatických skupin a demickou difúzi v šíření tchaj-kadaijských jazyků. " Hum Genet 2016 DOI 10.1007 / s00439-016-1742-r.
  27. ^ A b C Citovat chybu: Pojmenovaná reference Kong, QP, Yao, YG, Sun, C., Zhu, CL, Zhong, L., Wang, CY, Cai, WW, Xu, XM, Xu, AL a Zhang, YP, 2004. Fylogeografická analýza haploskupiny mitochondriální DNA F2 v Číně odhaluje, že T12338C v iniciačním kodonu genu ND5 není patogenní. Journal of human genetics, 49 (8), s. 414. bylo vyvoláno, ale nikdy nebylo definováno (viz stránka nápovědy).
  28. ^ A b Sardana A Fedorova, Maere Reidla, Ene Metspalu, et al.„Autosomální a uniparentální portréty původních populací Sakha (Jakutsko): důsledky pro osídlení severovýchodní Eurasie.“ BMC Evoluční biologie 2013, 13:127. http://www.biomedcentral.com/1471-2148/13/127

externí odkazy

Fylogenetický strom haploskupiny lidské mitochondriální DNA (mtDNA)

 Mitochondriální Eva (L )  
L0L1–6 
L1L2 L3  L4L5L6
MN 
CZDEGQ ÓASR JáŽXY
CZBFR0 před JT P U
HVJTK.
HPROTIJT