Haploskupina A (mtDNA) - Haplogroup A (mtDNA) - Wikipedia

Tento článek je o lidské haploskupině mtDNA. Pro nesouvisející lidskou haploskupinu Y-DNA viz Haploskupina A (Y-DNA).
Haploskupina A
Mapa světa prehistorických lidských migrací.jpg
Možná doba vzniku40 000 ± 10 000 YBP

40 500 (95% CI 37 900 <-> 43 200) ybp[1]
Koalescenční věk18 600 (95% CI 14 200 <-> 23 900) ybp[1]

24 209 (SD 4 906) ybp[2]
Možné místo původuAsie
PředekN
PotomciA3, A4, A5, A7, A8
Definování mutací152, 235, 523-524d, 663, 1736, 4248, 4824, 8794, 16290, 16319[3]

v lidská mitochondriální genetika, Haploskupina A je haploskupina lidské mitochondriální DNA (mtDNA).

Původ

mtDNA - graf možných velkých lidských migrací.

Předpokládá se, že haploskupina A vznikla v Asii přibližně 30 000–50 000 let před přítomností. Jeho rodová haploskupina byla Haploskupina N. Existující rozmanitost mitochondriálních genomů, které patří do haploskupiny A, je však nízká vzhledem k míře odchylky od jejích nejbližších skupin v haploskupině N, což naznačuje, že existující členové haploskupiny A mohou pocházet z populace, která se vynořila z úzké místo přibližně před 20 000 lety.

Jeho nejvyšší frekvence jsou mezi Domorodí Američané, jeho největší celková populace je v východní Asie a jeho největší odrůda (což naznačuje jeho počáteční bod) je v východní Asie. Mohlo tedy pocházet a šířit se z Dálný východ.[4]

Rozdělení

Jeho subclade A2 sdílí mutaci T16362C s subclades A1 (nalezený v Japonsku, Tashkurgan, Velikij Novgorod, Mongolové a Altaians), A6 (nalezený v Tibetu a v povodí řeky Jang-c'-ťiang), A12'23 (nalezený na Sibiři a mezi Uralem a Turkické národy), A13'14 (nachází se na jižní Sibiři, Sin-ťiangu, Ladaku, Číně, Yunnanu, Thajsku a Vietnamu), A15 (nachází se v Číně, Naxi, Ujguru, Japonsku a mezi šerpy Tibetu a Nepálu), A16 (nachází se v Ujguru, Burjat, Turecko), A17 (nachází se v Číně, Miao, Yi, Tibetu, Ladaku, Kyrgyzsku, Thajsku a Vietnamu), A18 (nachází se v Číně), A19 (nachází se v Číně), A20 (nachází se mezi Han Číňané a v Japonsku), A21 (nalezené v Tibetu a Džammú a Kašmíru), A22 (nalezené v Číně), A24 (nalezené v Pekingu a západních Čechách), A25 (nalezeny v Japonsku a Jakutsku) a A26 (nalezeny v Dánsko). A2 se nachází v Chukotko –Kamčatka[5] a je také jednou z pěti haploskupin mtDNA nalezených v domorodé národy Ameriky ostatní jsou B, C, D, a X.[4]

Haploskupina A2 je nejběžnější haploskupina mezi Inuit, Na-Dene, a mnoho Amerind etnické skupiny Severní a Střední Ameriky. Rodokmeny patřící do haploskupiny A2 také tvoří většinu fondu mtDNA Inuitů a jejich sousedů, Čukčové na severovýchodě Sibiře.[5][6][7]

Ostatní větve haploskupiny A jsou méně časté, ale rozšířené mezi ostatními populacemi v Asii.[8][9] Haploskupina A5 je spíše omezena na populace z Koreje a Japonska na jih, i když byla detekována jako singletony ve dvojici velkých vzorků Khamnigans (1/99 = 1,0%) a Buriati (1/295 = 0,3%) z Burjatská republika.[6]

V Asii je A (xA2) obzvláště častý v Tibeto-Burman - mluvící populace Jihozápadní Čína, jako Tibeťané (6/65 = 9.2%,[5] 25/216 = 11.6%,[10] 11/73 = 15.1%[10]). Přibližně 7% až 15% Korejci patří do haploskupiny A.[6][11][12] Přibližně 5% až 12% japonský patří do haploskupiny A (včetně A4, A5 a A (xA4, A5)).[5][13][14][15] Přibližně 4% až 13% Mongolové patří do haploskupiny A, z nichž téměř všechny jsou obsaženy v subkladu A4 (2/47 = 4,3% Mongolů z Ulánbátaru v haploskupině A4,[11] 4/48 = 8,3% Mongolů z Nový levý banner Barag v haploskupině A (xA5),[12] 6/47 = 12,8% Mongolů z Ulánbátaru v haploskupině A4[6]). Přibližně 3% až 9% Číňanů patří do haploskupiny A.[13] Haploskupina A byla také nalezena ve vietnamštině (2/42 = 4,8%, včetně jedné A4 a jedné A5 (xA5a)).[11] Přibližně 4% (3/71) z Tataři z Aznakayevo,[16] 3% (4/126) Tatarů z Buinsk,[16] a 2% z Turečtí lidé patří do haploskupiny A.[17] Haploskupina A4 byla nalezena u 2,4% (2/82) vzorku Peršané z východního Íránu a ve 2,3% (1/44) vzorku Tádžikové z Tádžikistánu.[6] Haploskupina A se mezi nimi nenachází Austronesians.[18]

Tabulka frekvencí haploskupiny MtDNA A

PopulaceFrekvencePočetZdrojPodtypy
Eskymák (Grónsko )0.961385Volodko 2008A2b = 196, A2a = 174
Eskymák (Chaplin )0.90050Volodko 2008A2a = 36, A2b = 9
Eskymák (Kanada)0.87596Volodko 2008A2b = 68, A2a = 16
Sibiřský Eskymák0.77279Starikovskaya 2005A2 = 61 (41/46 Chaplin, 17/25 Sireniki, 3/8 Naukan)
Eskymák (Naukan )0.74439Volodko 2008A2b = 16, A2a = 13
Chukchi (Anadyr, Čukotka )0.73315Derenko 2007A2 = 11
Eskymák (Sireniki)0.70337Volodko 2008A2a = 16, A2b = 10
Chukchi0.68266Starikovskaya 2005A2 = 45
Bella Coola0.65584Malhi 2004A = 55
Apache0.63238Malhi 2003A = 24
Nahua (Cuetzalan, Mexiko)0.61331Malhi 2003A = 19
Navajo0.51664Malhi 2003A = 33
Nuu-Chah-Nulth0.451102Malhi 2004A = 46
Aleut (Aleutské ostrovy )0.344163Volodko 2008A2a = 56
Nu (Gongshan, Yunnan)0.30030Wen 2004A = 9
Lisu (Gongshan, Yunnan)0.29737Wen 2004A = 11
Chuvantsi (Markovo, Čukotka )0.25032Volodko 2008A2a = 6, A2b = 2
Tibetský (Diqing, Yunnan )0.25024Wen 2004A = 6
Yi (Hezhang County, Guizhou )0.25020Li 2007A = 5
Tibetský (Nagchu, Tibet )0.22935Ji 2012A = 8
Tibetský (Qinghai )0.21456Wen 2004A = 12
Tibetský (Shannan, Tibet )0.21119Ji 2012A = 4
Yi (Xishuangbanna, Yunnan )0.18816Wen 2004A = 3
Tibetský (Chamdo, Tibet )0.17229Ji 2012A1 = 5
Zuni0.15426Malhi 2003A = 4
korejština (Arun Banner )0.14648Kong 2003A5 = 4, A (xA5) = 3
Tujia (Západní Hunan)0.14164Wen 2004A = 9
Pumi (Ninglang, Yunnan)0.13936Wen 2004A = 5
Tujia (Yanhe County, Guizhou )0.13829Li 2007A = 4
Tibetský (Lhasa, Tibet )0.13644Ji 2012A1 = 6
mongolský (Ulan Bator )0.12847Derenko 2007A4 (xA2) = 6
Hani (Xishuangbanna, Yunnan)0.12133Wen 2004A = 4
japonský (Miyazaki )0.120100Uchiyama 2007A4 = 4, A5 = 4, A (xA4, A5) = 4
Gelao (Daozhen County, Guizhou )0.118102Liu 2011A = 12
Tibetský (Zhongdian, Yunnan )0.11435Wen 2004A = 4
Tubalar (Turochak & Choysky )0.11172Starikovskaya 2005A (xA2) = 8
Tibetský (Shannan, Tibet )0.10955Ji 2012A1 = 6
Tibetský (Shigatse, Tibet )0.10329Ji 2012A1 = 3
Yi (Shuangbai, Yunnan)0.10040Wen 2004A = 4
Manchurian0.10040Jin 2009A (xA4, A5) = 3, A4 = 1
korejština (severní Čína)0.09851Jin 2009A4 = 4, A5 (xA5a) = 1
Yi (Luxi, Yunnan)0.09731Wen 2004A = 3
Han (Denver )0.09673Zheng 2011A = 7
japonský0.090211Marujama 2003A5 = 11, A (xA5) = 8
Naxi (Lijiang, Yunnan)0.08945Wen 2004A = 4
korejština (Jižní Korea )0.089203Umetsu 2005A = 18
čínština (Shenyang, Liaoning )0.088160Umetsu 2005A = 14
Hmong (Jishou, Hunan )0.087103Wen 2005A (xA6) = 7, A6 = 2
japonský (Tohoku )0.086336Umetsu 2005A = 29
Mongol (Nový levý banner Barag )0.08348Kong 2003A (xA5) = 4
korejština (Jižní Korea )0.081185Jin 2009A4 = 6, A5 (xA5a) = 5, A (xA4, A5) = 3, A5a = 1
Ket0.07938Starikovskaya 2005A (xA2) = 3
Cochimí0.07713Malhi 2003A = 1
korejština (Jižní Korea )0.077261Kim 2008A = 20
Han (Pekingská normální univerzita )0.074121Zheng 2011A = 9
Pai Yuman0.07427Malhi 2003A = 2
Tibetský (Nyingchi, Tibet )0.07454Ji 2012A1 = 4
Han (Jihozápadní Čína, skupina 44 S'-čchuan, 34 Čchung-čching, 33 Yunnan a 26 Guizhou )0.073137Ji 2012A = 10
Han (Hunan a Fujian )0.07355Zheng 2011A = 4
Telengit0.07355Dulik 2012A = 4
korejština (Soulská národní univerzitní nemocnice )0.073633Fuku 2007A = 46
Burjat0.071126Kong 2003A (xA5) = 9
Han (jižní Kalifornie )0.069390Ji 2012A = 27
korejština (Jižní Korea )0.068103Derenko 2007A5 = 4, A4 (xA2) = 3
japonský (Tokio )0.068118Zheng 2011A = 8
Okinawa0.067326Umetsu 2005A = 22
japonský (severní Kjúšú )0.066256Umetsu 2005A = 17
Itelmen0.06447Starikovskaya 2005A (xA2) = 3
japonský (Gifu )0.0631617Fuku 2007A = 102
Zhuang
(Napo County, Guangxi)		0.062130Zhao 2010A = 8
Barghut (Hulun Buir )0.060149Derenko 2012A4 = 8, A8 = 1
japonský (Hokkaido )0.060217Asari 2007A = 13
Bai (Dali, Yunnan)0.05968Wen 2004A = 4
Evenk (Sibiř)0.05671Starikovskaya 2005A (xA2) = 4
Telenghit (Altajská republika )0.05671Derenko 2007A4 (xA2) = 4
Jino (Xishuangbanna, Yunnan)0.05618Wen 2004A = 1
Bai (Xishuangbanna, Yunnan)0.05319Wen 2004A = 1
Koryak0.052155Starikovskaya 2005A2 = 4, A (xA2) = 4
Burjat (Buryatia )0.051295Derenko 2007A4 (xA2) = 13, A5 = 1, A8 = 1
Khamnigan (Buryatia )0.05199Derenko 2007A4 (xA2) = 4, A5 = 1
Tibetský (Deqin, Yunnan )0.05040Wen 2004A = 2
Han (Peking )0.05040Jin 2009A4 = 1, A (xA4, A5) = 1
japonský (Tókai )0.050282Umetsu 2005A = 14
Dai (Xishuangbanna, Yunnan )0.04941Yao 2002A = 2
vietnamština0.04842Jin 2009A4 = 1, A5 (xA5a) = 1
Yakama0.04842Malhi 2004A = 2
Akimal O'odham0.04743Malhi 2003A = 2
Han (Kunming, Yunnan )0.04743Yao 2002A = 2
Dolgan (Anabarsky, Volochanka, Ust-Avam, & Dudinka )0.045154Fedorova 2013A10 = 3, A8 = 2, A4 (xA4b) = 2
Oroqen (Autonomní banner Oroqen )0.04544Kong 2003A (xA5) = 2
Va (Simao, Yunnan )0.04522Qian 2001A = 1
Evenk (Nový levý banner Barag )0.04347Kong 2003A (xA5) = 2
mongolský (Ulan Bator)0.04347Jin 2009A4 = 2
Tatar (Aznakayevo )0.04271Malyarchuk 2010A (xA8b) = 2, A8b = 1
Altai-kizhi0.04248Dulik 2012A = 2
Guoshan Yao (Jianghua, Hunan )0.04224Wen 2005A (xA6) = 1
Evenk (Krasnojarsk )0.04173Derenko 2007A4 (xA2) = 3
Evenk (Ust-Mayský, Oleneksky, Zhigansky )0.040125Fedorova 2013A4 (xA4b) = 3, A4b = 2
Ainu0.03951Sato 2009[19]A = 2
Kalmyku (Kalmykia )0.036110Derenko 2007A4 (xA2) = 3, A8 = 1
Han (Tchajwanský)0.036111Chen 2013A4e1 = 2, A5b = 2
Jakut (Řeka Vilyuy Umyvadlo)0.036111Fedorova 2013A4 (xA4b) = 2, A4b = 1, A8 = 1
Han (Tchaj-wan )0.0361117Ji 2012A = 40
Dong (Tianzhu County, Guizhou )0.03628Li 2007A = 1
Shor0.03628Dulik 2012A = 1
Khakassian (Khakassia )0.03557Derenko 2007A4 (xA2) = 2
Altay Kizhi0.03390Derenko 2007A4 (xA2) = 3
Tchajwanský (Taipei, Tchaj-wan )0.03391Umetsu 2005A = 3
Wuzhou Yao (Fuchuan, Guangxi )0.03231Wen 2005A (xA6) = 1
Tatar (Buinsk )0.032126Malyarchuk 2010A8b = 4
Pan Yao (Tianlin, Guangxi )0.03132Wen 2005A6 = 1
Kazašský (Okres Kosh-Agach )0.03198Derenko 2012A4 = 3
Mansi0.03198Starikovskaya 2005A (xA2) = 3
Altai-kizhi (Altajská republika )0.029276Dulik 2012A = 8
Bapai Yao (Liannan, Guangdong )0.02935Wen 2005A6 = 1
Guangdong0.026546Peng 2011A = 14
Kim Mun (Malipo, Yunnan )0.02540Wen 2005A6 = 1
Peršan (východní Írán )0.02482Derenko 2007A4 (xA2) = 2
Tu Yao (Hezhou, Guangxi )0.02441Wen 2005A6 = 1
Jakut (okolí Jakutsk )0.024164Fedorova 2013A4b = 2, A4 (xA4b) = 1, A8 = 1
Nížina Yao (Fuchuan, Guangxi )0.02442Wen 2005A (xA6) = 1
Tádžické (Tádžikistán )0.02344Derenko 2007A4 (xA2) = 1
Daur (Evenk Autonomous Banner )0.02245Kong 2003A (xA5) = 1
Evenk (Buryatia )0.02245Derenko 2007A4 (xA2) = 1
Tuvan0.02195Starikovskaya 2005A (xA2) = 2
Aini (Xishuangbanna, Yunnan)0.02050Wen 2004A = 1
Kumandin (Turochak District )0.01952Dulik 2012A = 1
Guangxi0.0171111Peng 2011A = 19
Jakut0.017117Kong 2003A (xA5) = 2
Shor (Kemerovo )0.01282Derenko 2007A4 (xA2) = 1
Tuvinian (Tuva )0.010105Derenko 2007A4 (xA2) = 1
Khanty0.009106Pimenoff 2008A = 1
Vietnam0.008392Peng 2011A = 3
Jihovýchodní Yunnan0.006158Peng 2011A = 1
Li (Hainan )0.003346Peng 2011A = 1
Kiliwa0.0007Malhi 2003–
Seri0.0008Malhi 2003–
Dingban Yao (Mengla, Yunnan )0.00010Wen 2005–
Xiban Yao (Fangcheng, Guangxi )0.00011Wen 2005–
Lahu (Xishuangbanna, Yunnan)0.00015Wen 2004–
Yukaghir (Horní Kolyma)0.00018Volodko 2008–
Huatou Yao (Fangcheng, Guangxi )0.00019Wen 2005–
Filipínský (Palawan )0.00020Scholes 2011–
Dai (Xishuangbanna, Yunnan )0.00021Qian 2001–
Yukaghir (Verkhnekolymsky & Nizhnekolymsky )0.00022Fedorova 2013–
Řeka Yuman0.00022Malhi 2003–
Delta Yuman0.00023Malhi 2003–
Hind (Chitwan, Nepál )0.00024Fornarino 2009–
Nganasan0.00024Starikovskaya 2005–
Tibetský (Nyingchi, Tibet )0.00024Ji 2012–
Burjat (Kušun, Nižněudinsk, Irkutsk )0.00025Starikovskaya 2005–
Bunu (Dahua & Tianlin, Guangxi )0.00025Wen 2005–
Kurd (severozápadní Írán )0.00025Derenko 2007–
Lanten Yao (Tianlin, Guangxi )0.00026Wen 2005–
Iu Mien (Mengla, Yunnan )0.00027Wen 2005–
Andhra Pradesh (kmenový )0.00029Fornarino 2009–
Batek (Malajsie )0.00029Hill 2006–
Kuně (Hainan )0.00030Peng 2011–
Tujia (Yongshun, Hunan)0.00030Wen 2004–
Batak (Palawan )0.00031Scholes 2011–
Gelao (Daozhen County, Guizhou )0.00031Li 2007–
Lingao (Hainan )0.00031Peng 2011–
Lahu (Simao, Yunnan )0.00032Wen 2004–
Mendriq (Malajsie )0.00032Hill 2006–
Vzezření (Shangsi, Guangxi )0.00032Wen 2005–
Negativní0.00033Starikovskaya 2005–
Teleut0.00033Dulik 2012–
Temuan (Malajsie )0.00033Hill 2006–
Lahu (Lancang, Yunnan )0.00035Wen 2004–
Aleut (Velitelské ostrovy )0.00036Volodko 2008–
Jemezi0.00036Malhi 2003–
Va (Ximeng & Gengma, Yunnan )0.00036Yao 2002–
Jakut (Jakutsko )0.00036Derenko 2007–
Taono O'odham0.00037Malhi 2003–
Hmong (Wenshan, Yunnan )0.00039Wen 2005–
Nganasan0.00039Volodko 2008–
Thai0.00040Jin 2009–
Tharu (Morang, Nepál )0.00040Fornarino 2009–
Ambon0.00043Hill 2007–
Lombok (Mataram )0.00044Hill 2007–
Alor0.00045Hill 2007–
Tofalar0.00046Starikovskaya 2005–
Udegey0.00046Starikovskaya 2005–
Hind (Nové Dillí, Indie)0.00048Fornarino 2009–
Sumba (Waingapu )0.00050Hill 2007–
Jahai (Malajsie )0.00051Hill 2006–
Senoi (Malajsie )0.00052Hill 2006–
Teleut (Kemerovo )0.00053Derenko 2007–
Nivkh (severní Sachalin )0.00056Starikovskaya 2005–
Filipínský0.00061Hill 2007–
Semelai (Malajsie )0.00061Hill 2006–
Mansi0.00063Pimenoff 2008–
Filipínský0.00064Tabbada 2010–
Filipínský (Mindanao )0.00070Tabbada 2010–
Tubalar (Turochak District )0.00071Dulik 2012–
Bali0.00082Hill 2007–
Yukaghir (Dolní Kolyma-Indigirka)0.00082Volodko 2008–
Ulči0.00087Starikovskaya 2005–
Chelkan (Turochak District )0.00091Dulik 2012–
N. Paiute /Shoshoni0.00094Malhi 2003–
Severní Paiute0.00098Malhi 2004–
Dokonce (Eveno-Bytantaysky & Momsky )0.000105Fedorova 2013–
Tharu (Chitwan, Nepál )0.000133Fornarino 2009–
Jakut (severní Jakutsko )0.000148Fedorova 2013–
Cham (Bình Thuận, Vietnam )0.000168Peng 2010–
Filipínský (Luzon )0.000177Tabbada 2010–
Sumatra0.000180Hill 2006–
Sulawesi0.000237Hill 2007–
Tchajwanský domorodec0.000640Peng 2011–

Subclades

Strom

Tento fylogenetický strom subcladů haploskupiny A je založen na příspěvku Mannisa van Ovena a Manfreda Kaysera Aktualizovaný komplexní fylogenetický strom globální variace lidské mitochondriální DNA[3] a následný publikovaný výzkum.

  • A
    • A (xA5, A8, A10) - Čína (Han z Wu-chanu), Buryat (Vnitřní Mongolsko)
      • A (xA3, A7, A9, A11) - Ujgur, Japonsko, Vietnam (Cờ Lao )
        • A1 [TMRCA 12 800 (95% CI 6 500 <-> 22 700) ybp[1]]
          • A1 * - Japonsko, Korea
          • A1a [TMRCA 7500 (95% CI 4500 <-> 11 800) ybp[1]]
            • A1a * - Japonsko (Aichi), Sarikoli (Tashkurgan), USA, Anglie
            • A1a1 [TMRCA 5 000 (95% CI 2200 <-> 9 800) ybp[1]]
              • A1a1 * - Buryat, Altaj Kizhi
              • A1a1a - Buryat, Mongol (Vnitřní Mongolsko) [TMRCA 1050 (95% CI 75 <-> 5 500) ybp[1]]
            • A1a2 - Rusko (Bashkortostan, Velikij Novgorod), Írán (Turkmen) [TMRCA 1950 (95% CI 100 <-> 10 500) ybp[1]]
            • A1a3 - Řecko (Ioannina), Spojené státy americké (Západní Virginie) [TMRCA 1150 (95% CI 75 <-> 6 000) ybp[1]]
        • A2 - Ache, Waiwai, Zoro, Surui, Waiapi, Poturujara, Kayapo, Katuena, Guarani, Arsario, Cayapa, Dogrib, starověká Kanada, USA (Pensylvánie, Kalifornie), Mexiko (Zapotec), Kuba, Dominikánská republika, Kolumbie, Venezuela, Ekvádor, Peru, Argentina [TMRCA 10 600 (95% CI 9 600 <-> 11 700) ybp[1]]
          • A2a - Eskymák (Grónsko, Čukotka), Čukči
            • A2a1 - Inuit (Kanada), Selkup[20]
            • A2a2 - Eskymák (Čukotka), Čukot
            • A2a3 - Eskimo (Grónsko, Kanada, Chukotka), Chukchi
            • A2a4 - USA (Nové Mexiko, Arizona), Mexiko (Chihuahua)
            • A2a5 - Apache, USA (Kalifornie, Arizona, Nové Mexiko, Texas), Kanada (Cree, Shuswap)
          • A2b - Chukchi
            • A2b1 - Chukchi, Koryak, Eskimo (Chukotka, Kanada, Grónsko)
          • A2c
          • A2d - USA (mexické, hispánské)
            • A2d1 - USA (mexické)
              • A2d1a - USA (hispánský)
            • A2d2 - USA (hispánský)
          • A2e'ao
            • A2e
            • A2ao
              • A2ao1
          • A2f
            • A2f1 - Newfoundland
              • A2f1a - Kanada, USA (domorodý Američan)
            • A2f2 - USA (mexické, hispánské), Mexiko
            • A2f3 - USA (mexické, hispánské)
          • A2g - USA (mexické, hispánské), Mexiko, Pyrenejský poloostrov
            • A2g1 - USA (mexické, hispánské), Latinská Amerika
          • A2h - Kolumbie (Cocama of Amazonas, Arhuaco), Yanomama, Kogui
            • A2h1 - USA (mexické, hispánské), Mexiko, Latinská Amerika
          • A2i - USA (hispánský, atd.), Kanada (Ojibwa, Ostrov prince Edwarda, Pabos v Quebecu)
          • A2j - USA (hispánský)
            • A2j1 - USA (hispánský)
          • A2k - USA (hispánský)
            • A2k1 - Ekvádor, Wayuu, Mexiko
              • A2k1a - Venezuela, Kolumbie (Pasto of Putumayo), USA (hispánský)
          • A2l'm'n'o'ai'aj
            • A2l
            • A2m
            • A2n - Kanada
            • A2o
            • A2ai
            • A2aj
          • A2p'am
            • A2p
              • A2p1
              • A2p2
            • A2am - USA (Portoriko, hispánský), Venezuela
          • A2q
            • A2q1
          • A2r - USA (hispánský, mexický), Kuba
            • A2r1 - Mexiko, USA (mexické)
          • A2s
          • A2t - USA (mexické)
          • A2u
            • A2u1
            • A2u2
          • A2v
            • A2v1 - USA (mexické, hispánské), Mexiko (La Mixteca )
              • A2v1a - Guatemala, USA (mexická)
              • A2v1b - Mexiko
          • A2w - Kolumbie (Kogi, Guambiano of Putumayo), Arsario, USA (mexická, hispánská)
            • A2w1 - Mexiko, Kajmanské ostrovy, Guatemala (La Tinta), Panama (Guaymi), Kolumbie
          • A2x
          • A2y
          • A2z - USA (hispánský, Portoriko)
          • A2aa
          • A2ab
          • A2ac
            • A2ac1
          • A2ad
            • A2ad1
            • A2ad2
          • A2ae
          • A2af
            • A2af1
              • A2af1a
                • A2af1a1
                • A2af1a2
              • A2af1b
                • A2af1b1
                  • A2af1b1a
                  • A2af1b1b
                • A2af1b2
            • A2af2
          • A2ag
          • A2ah
          • A2ak
          • A2al
          • A2an
          • A2ap
          • A2aq
        • A6 [TMRCA 12 000 (95% CI 8 600 <-> 16 100) ybp[1]]
          • A6 * - Deng
          • A6a - Čína [TMRCA 9 600 (95% CI 5 500 <-> 15 500) ybp[1]]
            • A6a * - čínština Han (Wuhan, atd.)
            • A6a1 - Tujia
          • A6b - Tibet [TMRCA 5 000 (95% CI 2 700 <-> 8 300) ybp[1]]
            • A6b * - Tibet (Chamdo, Ladakh)
            • A6b1 - Tibet (Šerpa)
          • A6c - Tibet (Lhoba, Monpa)
        • A12'23 - Rakousko, Rumunsko, Polsko, Rusko, případně nalezené mezi Udmurty a Komis[20]
          • A12 - Česká republika, Německo [TMRCA 11 800 (95% CI 6 500 <-> 19 700) ybp[1]]
            • A12a - Irsko, Velká Británie, Nový Zéland, USA, Nenets,[20] Selkup[20] [TMRCA 4700 (95% CI 2700 <-> 7600) ybp[1]]
              • A12a * - Mansi, Yakut (povodí řeky Vilyuy),[21] Kyrgyz (Kyrgyzstán)[22]
              • A12a1 - Kyordyughen Site (Ymyiakhtakh Culture, Yakutia),[23] Maďarsko (Debrecen) [TMRCA 2 800 (95% CI 1 450 <-> 4 900) ybp[1]]
              • A12a2 - Evenk (Krasnojarsk Krai,[6] Kamenné povodí řeky Tunguska[21]) [TMRCA 1250 (95% CI 100 <-> 6 600) ybp[1]]
            • A12b - Buryat,[6] Karos -Eperjesszög (období maďarského dobyvatele)[24] [TMRCA 3 000 (95% CI 425 <-> 10 700) ybp[1]]
          • A23 - Mongol (Vnitřní Mongolsko),[25] Burjat,[6] Ket,[20] Qashqai (Írán),[26] starověký Scythian (Chylenski) [TMRCA 6 200 (95% CI 3 300 <-> 10 600) ybp[1]]
        • A13'14 - Rusko (Buryat, Khamnigan), Čína (Shiyan, Tu Ujgur, atd.), Ladakh, Thajsko, Vietnam (Mang ), Korea, Japonsko, Paraguay (Alto Parana[27][1]), Irsko
        • A15 - Ujgur
          • A15a - Čína (Han v Pekingu, atd.), Tibet (Tingri ), Ujgur, Japonsko
          • A15b - Čína, Japonsko (Ehime)
          • A15c - Čína
            • A15c1 - Naxi, Tibet (Šerpa), Nepál (Šerpa)
        • A16 - Buryat, Ujgur, Turek
        • A17 - Čína (Han z Pekingu, atd.), Miao, Yi, Tibet (Lhoba, Monpa, Tingri ), Ladakh, Kyrgyz (Tashkurgan), Thajsko (Lawa z provincie Chiang Mai a provincie Mae Hong Son,[28] Blang z provincie Chiang Rai,[28] Pondělí z provincie Ratchaburi[28]), Vietnam (Phù Lá, Hà Nhì )
        • A18 - Japonsko, Čína (Han z Fujian, Han z Pekingu), Rumunsko
        • A19 - Čína (Han z Pekingu, atd.)
        • A20 - Japonsko, čínština Han (Denver)
        • A21 - Tibet (Šerpa, Deng, atd.), Džammú a Kašmír
        • A22 - Čína, čínština Han (Denver)
        • A24 - Čína (Han v Pekingu), Turecko, Česká republika (západní Čechy)
        • A25 - Japonsko (Chiba), Čína, Yakut (povodí řeky Vilyuy)
        • A26 - Dánsko
      • A3 - Japonsko (Tokio, atd.), Korea [TMRCA 6 800 (95% CI 3 200 <-> 12 600) ybp[1]]
        • A3a - Japonsko (Aiči, atd.) [TMRCA 4300 (95% CI 1400 <-> 9800) ybp[1]]
      • A7 [TMRCA 8 800 (95% CI 5 400 <1300) ybp[1]]
        • A7 * - Čína
        • A7a - Tibet [TMRCA 7 000 (95% CI 3 900 <-> 11 700) ybp[1]]
          • A7a * - Lhoba
          • A7a1 - Lhoba
          • A7a2 - Lhoba, Monpa
        • A7b - Japonsko (Tokio, atd.) [TMRCA 6300 (95% CI 2100 <-> 14 700) ybp[1]]
      • A9
      • A11 - Nepál, Rusko [TMRCA 14 500 (95% CI 9 700 <-> 20 800) ybp[1]]
        • A11a - Tibet (Lhasa, Nyingchi, Tingri Šerpa, Lhoba, atd.), Ladakh
        • A11b - Tibet (Tingri, Chamdo, atd.), Naxi, Han (Yunnan)
    • A5 - Čína (včetně Hongkongu), Japonsko [TMRCA 16 200 (95% CI 11 100 <-> 22 800) ybp]
      • A5a - Japonsko (Tokio, Aiči, atd.), Jižní Korea, Čína [TMRCA 5 500 (95% CI 3 800 <-> 7 600) ybp[1]]
        • A5a1
          • A5a1a - Japonsko (Tokio, atd.), Korea
            • A5a1a1 - Japonsko (Tokio, Čiba, Aiči, atd.), Korea[30]
              • A5a1a1a - Japonsko (Tokio, atd.)
              • A5a1a1b - Japonsko (Tokio, Chiba, atd.)
            • A5a1a2 - Japonsko, Korea
              • A5a1a2a - Japonsko (Aiči)
          • A5a1b - Japonsko (Tokio, Aiči)
        • A5a2 - Japonsko (Tokio, Aiči, atd.)
        • A5a3
          • A5a3 * - Korea, USA (African American)
          • A5a3a
            • A5a3a * - Japonsko (Tokio)
            • A5a3a1 - Japonsko (Tokio, Aiči, atd.)
        • A5a4 - Japonsko
        • A5a5 - Japonsko, Jižní Korea (Soul), Ujgur
      • A5b - Čína (Tujia, Hui, atd.) [TMRCA 12 800 ybp (95% CI 8 400 <-> 18 800) ybp[1]]
        • A5b1 - Čína (Han z Pekingu, atd.), Japonsko, Korea, Ujgur, Thajsko, Vietnam (Tay ), Singapur [TMRCA 8 600 (95% CI 6 600 <-> 11 100) ybp[1]]
          • A5b1 * - Ujgur
          • A5b1a - Japonsko (Tokio, atd.) [TMRCA 6 700 (95% CI 3 700 <-> 11 300) ybp[1]]
          • A5b1b - Čína (Han z Fujian, Miao, atd.), Ujgur [TMRCA 7 300 (95% CI 5 600 <-> 9 400) ybp[1]]
            • A5b1b * - čínština Han
            • A5b1b1
              • A5b1b1 * - Miao
              • A5b1b1a - Čína
              • A5b1b1b - Čína
            • A5b1b2 - Ujgur
          • A5b1c - Han Chinese (Denver) [TMRCA 7 600 (95% CI 3100 <-> 15 500) ybp[1]]
            • A5b1c1 - Tchaj-wan (Hakka, Bunun, Paiwan) [TMRCA 5 400 (95% CI 1 800 <-> 12 600) ybp[1]]
          • A5b1d [TMRCA 7 300 (95% CI 3 700 <-> 13 000) ybp[1]]
            • A5b1d * - Čína
            • A5b1d1 - siamská (střední Thajsko), Tay (Vietnam)
        • A5b2 - Čína (Tujia, atd.)
      • A5c - Japonsko (Aiči, atd.), Korea,[31] Khamnigan, Buryat [TMRCA 6100 (95% CI 2700 <-> 11 800) ybp[1]]
        • A5c1 - Japonsko (Tokio, Čiba, Aiči, atd.)
    • A8 - Ujgur [TMRCA 14 000 (95% CI 9500 <-> 19 800) ybp[1]]
      • A8a - Okunevská kultura, Ket, Selkup,[20] Pákistán, Polsko, Itálie [TMRCA 11 000 (95% CI 8 000 <-> 14 800) ybp[1]]
        • A8a * - čínština Han (Guizhou)
        • A8a1 - Buryat, Yakut,[21] Ujgur, Polsko (Podhale ), Maďarsko, Albánie, USA [TMRCA 5 300 (95% CI 3 500 <-> 7 800) ybp[1]]
        • A8a2 - sady (Kellog, atd.), Tofalar (Alygdzher ) [TMRCA 6 700 (95% CI 2700 <-> 13 600) ybp[1]]
        • A8a3 - Tuvan (Bay-Tal ), Polsko
      • A8b - Koryak [TMRCA 375 (95% CI 50 <-> 1150) ybp[1]]
    • A10 - Čína (Ujgur), Afghánistán (Hazara, Uzbek), Rusko (Mansi, Volga Tatars, atd.), Francie, Kanada, New York, Chumash Indians California [TMRCA 9 200 (95% CI 4 900 <-> 15 600) ybp[1]]

Populární kultura

Maminka "Juanita Bylo prokázáno, že „Peru“, nazývané také „Ice Maiden“, patří do mitochondriální haploskupiny A.[32][33]

Ve své populární knize Sedm dcer Evy, Bryan Sykes pojmenoval původce této haploskupiny mtDNA Aiyana.

Eva Longoria, americká herečka mexického původu, patří do Haplogroup A2.

Viz také

Fylogenetický strom haploskupiny lidské mitochondriální DNA (mtDNA)

 Mitochondriální Eva (L )  
L0L1–6 
L1L2 L3  L4L5L6
MN 
CZDEGQ ÓASR JáŽXY
CZBFR0 před JT P U
HVJTK.
HPROTIJT

Reference

  1. ^ A b C d E F G h i j k l m n Ó str q r s t u proti w X y z aa ab ac inzerát ae af ag ah ai aj ak al dopoledne an ao ap vod ar tak jako YFull MTree 1.01.5539
  2. ^ Behar a kol., 2012b
  3. ^ A b van Oven, Mannis; Manfred Kayser (13. října 2008). „Aktualizovaný komplexní fylogenetický strom globální variace lidské mitochondriální DNA“. Lidská mutace. 30 (2): E386 – E394. doi:10.1002 / humu.20921. PMID  18853457. S2CID  27566749. Archivovány od originál dne 4. prosince 2012. Citováno 2009-05-20.
  4. ^ A b Fagundes, Nelson J.R .; Ricardo Kanitz; Roberta Eckert; Ana C.S. Valls; Mauricio R. Bogo; Francisco M. Salzano; David Glenn Smith; Wilson A. Silva; Marco A. Zago; Andrea K. Ribeiro-dos-Santos; Sidney E.B. Santos; Maria Luiza Petzl-Erler; Sandro L. Bonatto (2008). „Mitochondriální populační genomika podporuje jediný původ před Clovis s pobřežní cestou pro osídlení Ameriky“ (PDF). American Journal of Human Genetics. 82 (3): 583–592. doi:10.1016 / j.ajhg.2007.11.013. PMC  2427228. PMID  18313026. Archivovány od originál (PDF) dne 25.03.2009. Citováno 2009-11-19.
  5. ^ A b C d Tanaka, Masashi; et al. (2004). „Variace mitochondriálního genomu ve východní Asii a osídlení Japonska“. Výzkum genomu. 14 (10A): 1832–1850. doi:10,1101 / gr. 2286304. PMC  524407. PMID  15466285.
  6. ^ A b C d E F G h Miroslava Derenko, Boris Malyarchuk, Tomasz Grzybowski et al.„Fylogeografická analýza mitochondriální DNA u severoasijských populací“, Dopoledne. J. Hum. Genet. 2007; 81: 1025–1041. DOI: 10,1086 / 522933
  7. ^ Natalia V. Volodko, Elena B. Starikovskaya, Ilya O. Mazunin et al.„„ Rozmanitost mitochondriálních genomů u arktických Sibiřanů, se zvláštním odkazem na evoluční historii Beringie a pleistocénního osídlení Ameriky “, American Journal of Human Genetics 82, 1084–1100, květen 2008. DOI 10.1016 / j.ajhg.2008.03.019.
  8. ^ Ville N Pimenoff, David Comas, Jukka U Palo et al., „Severozápadní Sibiřský Chanty a Mansi ve spojení západoevropských a euroasijských genových fondů, jak odhalují uniparentální markery“, European Journal of Human Genetics (2008) 16, 1254–1264; doi: 10.1038 / ejhg.2008.101
  9. ^ Noriyuki Fuku, Kyong Soo Park, Yoshiji Yamada et al.„Mitochondriální haploskupina N9a propůjčuje u Asiatů odpor proti cukrovce typu 2“, Dopoledne. J. Hum. Genet. 2007; 80: 407–415. DOI: 10,1086 / 512202
  10. ^ A b Fuyun Ji, Mark S. Sharpley, Olga Derbeneva et al.„Varianta mitochondriální DNA spojená s dědičnou optickou neuropatií Leber a Tibeťany ve vysokých nadmořských výškách“, PNAS (8. května 2012), sv. 109, č. 19, 7391–7396. doi: 10,1073 / pnas.1202484109
  11. ^ A b C Han-Jun Jin, Chris Tyler-Smith a Wook Kim, „Obyvatelstvo Koreje odhaleno analýzami mitochondriální DNA a Y-chromozomálních markerů“ PLOS ONE (2009)
  12. ^ A b Qing-Peng Kong, Yong-Gang Yao, Mu Liu et al.„Polymorfismy sekvence mitochondriální DNA pěti etnických populací ze severní Číny“, Hum Genet (2003) 113 : 391–405. doi:10.1007 / s00439-003-1004-7
  13. ^ A b Kazuo Umetsu, Masashi Tanaka, Isao Yuasa et al.„Multiplexní amplifikovaná polymorfní analýza délky produktu u 36 mitochondriálních jedno-nukleotidových polymorfismů pro haploskupinu východoasijských populací“, Elektroforéza (2005), 26, 91–98. DOI 10.1002 / elps.200406129
  14. ^ Asari M. et al.„Využití stanovení haploskupin pro forenzní analýzu mtDNA v japonské populaci“, Leg Med (2007), doi: 10,1016 / j.legalmed.2007.01.007
  15. ^ Zheng H-X, Yan S, Qin Z-D, Wang Y, Tan J-Z a kol. 2011 Významná populační expanze východoasijských obyvatel začala před neolitickým časem: důkazy o genech mtDNA. PLoS ONE 6 (10): e25835. doi:10.1371 / journal.pone.0025835
  16. ^ A b Boris Malyarchuk, Miroslava Derenko, Galina Denisova a Olga Kravtsova, "Mitogenomická rozmanitost v Tatarech z ruského Volha-Uralu", Mol. Biol. Evol. 27 (10): 2220–2226. (2010) doi: 10,1093 / molbev / msq065
  17. ^ Marchani, EE; Watkins, WS; Bulayeva, K; Harpending, HC; Jorde, LB (2008). „Kultura vytváří na Kavkaze genetickou strukturu: autozomální, mitochondriální a Y-chromozomální variace v Daghestanu“. Genetika BMC. 9: 47. doi:10.1186/1471-2156-9-47. PMC  2488347. PMID  18637195.
  18. ^ Kristina A. Tabbada, Jean Trejaut, Jun-Hun Loo et al.„Rozmanitost filipínské mitochondriální DNA: osídlený viadukt mezi Tchaj-wanem a Indonésií?“, Mol. Biol. Evol. 27 (1): 21–31. (2010) doi: 10,1093 / molbev / msp215
  19. ^ Takehiro SATO, Tetsuya AMANO, Hiroko ONO et al.„Mitochondriální DNA haploskupina Okhotských lidí založená na analýze starověké DNA: meziprodukt toku genů z kontinentálního lidu Sachalin do Ainu“, Antropologická věda Sv. 117 (3), 171–180, 2009.
  20. ^ A b C d E F Kristiina Tambets, Bayazit Yunusbayev, Georgi Hudjashov, et al. (2018), „Geny odhalují stopy běžné nedávné demografické historie pro většinu uralsky mluvících populací.“ Genome Biology (2018) 19:139. https://doi.org/10.1186/s13059-018-1522-1
  21. ^ A b C Duggan AT, Whitten M, Wiebe V, Crawford M, Butthof A, et al. (2013), „Vyšetřování pravěku tunguzických národů Sibiře a regionu Amur-Ussuri s úplnými sekvencemi genomu mtDNA a Y-chromozomálními markery.“ PLOS ONE 8 (12): e83570. doi: 10,1371 / journal.pone.0083570
  22. ^ Marchi, N., Hegay, T., Mennecier, P., Georges, M., Laurent, R., Whitten, M., Endicott, P., Aldashev, A., Dorzhu, C., Nasyrova, F., Chichlo, B., Segurel, L. a Heyer, E., „Pohlavně specifická genetická rozmanitost je utvářena kulturními faktory ve vnitřních asijských lidských populacích.“ Dopoledne. J. Phys. Anthropol. (2017)
  23. ^ Kilinc, GM, Kashuba, N., Yaka, R., Sumer, AP, Yuncu, E., Shergin, D., Ivanov, GL, Kichigin, D., Pestereva, K., Volkov, D., Mandryka, P Kharinskii, A., Tishkin, A., Ineshin, E., Kovychev, E., Stepanov, A., Alekseev, A., Fedoseeva, SA, Somel, M., Jakobsson, M., Krzewinska, M. , Stora, J. a Gotherstrom, A., „Vyšetřování historie lidské populace holocénu v severní Asii pomocí starověkých mitogenomů.“ Sci Rep 8 (1), 8969 (2018)
  24. ^ Endre Neparáczki, Klaudia Kocsy, Gábor Endre Tóth, Zoltán Maróti, Tibor Kalmár, Péter Bihari, István Nagy, György Pálfi, Erika Molnár, István Raskó a Tibor Török, „Revize mtDNA haplotypů starých maďarských dobyvatelů“. PLOS ONE 12 (4): e0174886. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0174886
  25. ^ Lippold, Sebastian; Xu, Hongyang; Ko, Albert; Li, Mingkun; Renaud, Gabriel; Butthof, Anne; Schröder, Roland; Stoneking, Mark (2014). „Lidské otcovské a mateřské demografické historie: poznatky z Y chromozomů a sekvencí mtDNA s vysokým rozlišením“. Investigativní genetika. 5 (1): 13. doi:10.1186/2041-2223-5-13. ISSN  2041-2223. PMC  4174254. PMID  25254093.
  26. ^ Derenko M, Malyarchuk B, Bahmanimehr A, Denisova G, Perkova M, et al. (2013), „Complete Mitochondrial DNA Diversity in Iranians.“ PLOS ONE 8 (11): e80673. doi: 10,1371 / journal.pone.0080673
  27. ^ Filipa Simão, Christina Strobl, Carlos Vullo, et al.„Mateřská dědičnost Alto Paraná odhalena úplnými sekvencemi mitogenomu.“ FSI Genetics Svazek 39, P66-72, 1. března 2019. Publikováno online 19. prosince 2018. DOI:https://doi.org/10.1016/j.fsigen.2018.12.007
  28. ^ A b C d E Wibhu Kutanan, Jatupol Kampuansai, Metawee Srikummool, Daoroong Kangwanpong, Silvia Ghirotto, Andrea Brunelli a Mark Stoneking: „Kompletní mitochondriální genomy thajské a laoské populace naznačují starodávný původ austroasiatických skupin a demickou difúzi v šíření tchaj-kadaijských jazyků. " Hum Genet 2016 DOI 10.1007 / s00439-016-1742-r.
  29. ^ A b Wibhu Kutanan, Rasmi Shoocongdej, Metawee Srikummool, et al. (2020), „Kulturní variace ovlivňují otcovské a mateřské genetické linie skupin Hmong-Mien a Sino-Tibetan z Thajska.“ European Journal of Human Genetics. https://doi.org/10.1038/s41431-020-0693-x
  30. ^ Qing-Peng Kong, Hans-Jürgen Bandelt, Chang Sun, et al.„Aktualizace východoasijské fylogeneze mtDNA: předpoklad pro identifikaci patogenních mutací.“ Lidská molekulární genetika2006, sv. 15, č. 13 2076–2086. doi: 10,1093 / hmg / ddl130
  31. ^ Hwan Young Lee, Ji-Eun Yoo, Myung Jin Park, Ukhee Chung, Chong-Youl Kim a Kyoung-Jin Shin, „Východoasijské stanovení haploskupiny mtDNA u Korejců: SNP analýza kódující oblasti na úrovni haploskupiny a sekvence kontrolní oblasti na úrovni podskupiny analýza." Elektroforéza (2006). DOI 10.1002 / elps.200600151.
  32. ^ „Populace Ameriky: Genetický původ ovlivňuje zdraví“. Scientific American.
  33. ^ „První Američané vydrželi 20 000 let mezipřistání - Jennifer Viegas, Discovery News“. Archivovány od originál dne 13.03.2012. Citováno 2009-11-18.

externí odkazy