Haploskupina L4 (mtDNA) - Haplogroup L4 (mtDNA)
Haploskupina L4 | |
---|---|
Možná doba vzniku | 90–80 kya |
Možné místo původu | východní Afrika |
Předek | L3'4 |
Potomci | L4a, L4b |
Definování mutací | 5460, 16362[1] |
Haploskupina L4 je lidská mitochondriální DNA (mtDNA) haploskupina. Je to malá mateřská clade primárně omezená na Afriku.[2]

Předpokládané rozdělení prostorové frekvence pro haploskupinu L4.

Schematický strom mtDNA haploskupiny L4. Věky (v ka ) jsou uvedeny odhady maximální pravděpodobnosti získané pro celý genom mtDNA.
L4 je důležité v východní Afrika a Africký roh. Nejvyšší frekvence jsou v Tanzanie mezi Hadza na 60-83% a Sandawe na 48%.[3]
Má dvě větve, L4a a L4b. Podskupina L4a se dříve nazývala L7 a považovala se za samostatnou subclade L3'4'7. Byl uznán jako subclade L4, s L3 jako jeho skupina Behar et al. (2008).[4]Mateřská kladu L3'4 se měla objevit při 106–66 kya.[5] L4 není o moc později, než odhaduje Fernandes et al. Na 87 kya. (2015).[6]
Fylogeneze
Následující fylogeneze je založena na van Ovenovi a Kayserovi (2008).[1]
- L3'4
- L4
- L4a (dříve známá jako L7), mutace: 195C, 3357, 5460, 10373, 11253, 11344, 11485, 12414, 13174, 14302, 16260.
- L4a1
- L4a1a
- L4a2
- L4a1
- L4b, mutace: 709, 3918.
- L4b1
- L4b2 (dříve známý jako L3g nebo L4g)
- L4b2a
- L4b2a1
- L4b2a2
- L4b2a2a
- L4b2a2b
- L4b2b
- L4b2a
- L4a (dříve známá jako L7), mutace: 195C, 3357, 5460, 10373, 11253, 11344, 11485, 12414, 13174, 14302, 16260.
- L4
Reference
- ^ A b van Oven, Mannis; Manfred Kayser (13. října 2008). „Aktualizovaný komplexní fylogenetický strom globální variace lidské mitochondriální DNA“. Lidská mutace. 30 (2): E386 – E394. doi:10.1002 / humu.20921. PMID 18853457. S2CID 27566749. Archivovány od originál dne 4. prosince 2012. Citováno 2009-05-20.
- ^ Haploskupiny L4.
- ^ Tishkoff, S. a kol. 2007, Historie populací Afriky mluvících kliknutím Odvozeno od mtDNA a genetické variace chromozomu Y. Molecular Biology and Evolution 2007 24 (10): 2180-2195
- ^ Behar, M .; Villems, R .; Soodyall, H .; Blue-Smith, J .; Pereira, L .; Metspalu, E .; Scozzari, R .; Makkan, H .; Tzur, S .; Comas, D .; Bertranpetit, J .; Quintana-Murci, L .; Tyler-Smith, C .; Wells, R. S .; Rosset, S .; Genographic, C. (květen 2008). „Úsvit lidské matrilineální rozmanitosti“. American Journal of Human Genetics. 82 (5): 1130–1140. doi:10.1016 / j.ajhg.2008.04.002. ISSN 0002-9297. PMC 2427203. PMID 18439549.
- ^ „Oprava pro čištění výběru: Vylepšený doplněk materiálu pro lidské mitochondriální molekulární hodiny (str. 83)“ (PDF). 2009: 89. Archivovány od originál (PDF) dne 29. 12. 2009. Citovat deník vyžaduje
| deník =
(Pomoc) - ^ Fernandes V, Triska P, Pereira JB, Alshamali F, Rito T, Machado A a kol. (2015) Genetická stratigrafie klíčových demografických událostí v Arábii. PLoS ONE 10 (3): e0118625. doi:10.1371 / journal.pone.0118625
externí odkazy
- Iana Logana Stránky mitochondriální DNA
- Mannis van Oven's Phylotree
Fylogenetický strom haploskupiny lidské mitochondriální DNA (mtDNA) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mitochondriální Eva (L ) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
L0 | L1–6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
L1 | L2 | L3 | L4 | L5 | L6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
M | N | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CZ | D | E | G | Q | Ó | A | S | R | Já | Ž | X | Y | |||||||||||||||||||||||||||
C | Z | B | F | R0 | před JT | P | U | ||||||||||||||||||||||||||||||||
HV | JT | K. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
H | PROTI | J | T |
![]() | Tento genetika článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |