Haploskupina K (mtDNA) - Haplogroup K (mtDNA)
![]() | Bylo navrženo, že Haploskupina UK být sloučeny do tohoto článku. (Diskutujte) Navrhováno od února 2020. |
Haploskupina K. | |
---|---|
Možná doba vzniku | Před 26 700 ± 4300 lety[1] |
Možné místo původu | Možná Západní Asie |
Předek | U8b'K |
Potomci | K1, K2 |
Definování mutací | 3480 10550 11299 14798 16224 16311[2] |
Haploskupina K. je lidská mitochondriální DNA (mtDNA) haploskupina. Je definován HVR1 mutace 16224C a 16311C.
Původ
Předpokládá se, že haploskupina K vznikla veSvrchní paleolit před asi 30 000 až 22 000 lety. Je to nejběžnější subclade haploskupina U8b.[3] s odhadovaným věkem cca. 12 000 let BP.[4]
Rozdělení

Haploskupina K se objeví v Střední Evropa, Jižní Evropa, Severní Evropa, Severní Afrika, Africký roh, Jížní Asie a Západní Asie a v populacích s takovými předky.
Haploskupina K se vyskytuje u přibližně 10% původních Evropanů.[5][6]
Celkově se haploskupina K mtDNA vyskytuje asi u 6% populace Evropy a Evropy Blízký východ, ale u některých z těchto populací je častější. Přibližně 16% Druze z Sýrie, Libanon, Izrael, a Jordán, patří do haploskupiny K.[7] Vyskytuje se také mezi 8% Palestinci.[8] Navíc K dosáhne v roce úrovně 17% Kurdistán.[9]
Přibližně 32% lidí s Ashkenazi židovský předci jsou v haploskupině K. Toto vysoké procento bodů na a genetické úzké místo vyskytující se před asi 100 generacemi.[7] Ashkenazi mtDNA K se shlukuje do tří subclades zřídka nalezených v nežidech: K1a1b1a, K1a9 a K2a2a. Je tedy možné detekovat tři jednotlivé předky žen, o nichž se předpokládalo, že pocházejí z hebrejské / levantské mtDNA skupiny, jejichž potomci žili v Evropě.[10] Studie z roku 2013 však naznačuje, že tyto kmeny pocházejí ze západní Evropy.[11]
K se jeví jako nejvyšší v Morbihan (17,5%) a Périgord -Limousin (15,3%) regiony Francie a v Norsko a Bulharsko (13.3%).[12] Úroveň je 12,5% v Belgie, 11% v Gruzie a 10% v Rakousko a Velká Británie.[9]
Haploskupina K se také nachází mezi Gurage (10%),[8] Syřané (9.1%),[8] Zdaleka (6.3%),[8] Zenata Berbeři (4.11%),[13] Reguibovat Sahrawi (3.70%),[13] Oromo (3.3%),[8] Iráčané (2.4%),[8] Saúdové (0%-10.5%),[8] Jemenčané (0%-9.8%),[8] a Alžířané (0%-4.3%).[13]
Mtdna K byla nalezena u 0,9% pekingského Han ve skupině vzorků.[14]
Starověká DNA
Haploskupina K byla nalezena ve zbytcích tří jedinců z Pre-Pottery Neolithic B stránky Řekněte to Ramadovi, Sýrie, pocházející z c. 6000 př. N. L.[15] Klad byl také objeven ve skeletech raných zemědělců ve střední Evropě datovaných kolem 5500-5300 před naším letopočtem, v procentech, která byla téměř dvojnásobná než v současné Evropě. Některé techniky zemědělství spolu s přidruženými rostlinnými a živočišnými plemeny se do Evropy rozšířily z Blízkého východu. Důkazy ze starověké DNA naznačují, že neolitická kultura se šířila lidskou migrací.[16]
Analýza mtDNA z Ötzi, zmrzlá mumie z 3300 př nalezeno na rakouský -italština hranice, ukázal, že Ötzi patří do subkladu K1. Nelze jej zařadit do žádné ze tří moderních větví této subclade (K1a, K1b nebo K1c). Nový subclade byl dočasně pojmenován K1ö pro Ötzi.[17] Studie multiplexního testu dokázala potvrdit, že Icemanova mtDNA patří do nové evropské mtDNA clade s velmi omezenou distribucí mezi moderními datovými soubory.[18]
Žena pohřbila nějaký čas mezi 2650 a 2450 před naším letopočtem Amorite hrobka v Terqa (Tell Ashara), údolí Středního Eufratu, Sýrie nesla Haploskupinu K.[19]
Pramínek vlasů uchovávaný v relikviáři v bazilice Saint-Maximin-la-Sainte Baume ve Francii, který podle místní tradice patří biblické osobnosti Marie Magdaléna, byla také přidělena haploskupině K. Starověké sekvenování DNA kapilární baňky obsahovalo subkladu K1a1b1a, což naznačuje, že pravděpodobně Farizejský mateřský původ.[20]
Haploskupina K1 byla rovněž pozorována u exemplářů na pevninském hřbitově v Kulubnarti, Súdán, které pocházejí z raně křesťanského období (550–800 nl).[21]
V roce 2016 vědci extrahovali DNA z holenní kosti dvou jedinců odděleně datovaných do roku 7288-6771 př. N. L. A 7605-7529 př. Jeskyně Theopetra, Řecko, nejstarší známá struktura vytvořená člověkem, a bylo zjištěno, že oba jednotlivci patří do mtDNA Haplogroup K1c.[22]
Haploskupina K byla také pozorována mezi staroegyptský mumie vyhloubené u Abusir el-Meleq archeologické naleziště ve středním Egyptě, které pochází z před-Ptolemaic /pozdě Nová říše a římský období.[23] Fosílie vykopané na místě pozdního neolitu v Kelif el Boroud v Maroko Bylo také pozorováno, že nese subklade K1, které byly datovány kolem 3 000 př. n. l.[24]
Subclades
Strom
Tento fylogenetický strom subcladů haploskupiny K je založen na příspěvku Mannisa van Ovena a Manfreda Kaysera Aktualizovaný komplexní fylogenetický strom globální variace lidské mitochondriální DNA[2] a následný publikovaný výzkum.
mtDNA HG "K" p-strom |
---|
|
Genetické vlastnosti
Studie zahrnující kavkazské pacienty ukázala, že jednotlivci byli klasifikováni jako haploskupina J nebo K prokázaly významné snížení rizika Parkinsonova choroba proti jednotlivcům nejběžnější haploskupina, H.[25]
V populární kultuře
Ve své populární knize Sedm dcer Evy, Bryan Sykes pojmenoval původce této haploskupiny mtDNA Katrine.
Dne 18. Listopadu 2005 vysílal Dnes ukázat, během rozhovoru s Dr. Spencerem Wellsem z The National Geographic Genographic Project, host Katie Couric bylo odhaleno, že patří do haploskupiny K. [1]
Dne 14. srpna 2007, Stephen Colbert řekl genetik Spencer Wells že je členem této haploskupiny během segmentu na Colbertova zpráva.
Henry Louis Gates Jr. tvrdí, že Meryl Streep ve své knize patří Haploskupině K. Tváře Ameriky.[26]
Viz také
- Genealogický test DNA
- Genetická genealogie
- Haploskupina K1a1b1a (mtDNA)
- Lidská mitochondriální genetika
- Populační genetika
- Haploskupina lidské mitochondriální DNA
Fylogenetický strom haploskupiny lidské mitochondriální DNA (mtDNA) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mitochondriální Eva (L ) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
L0 | L1–6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
L1 | L2 | L3 | L4 | L5 | L6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
M | N | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CZ | D | E | G | Q | Ó | A | S | R | Já | Ž | X | Y | |||||||||||||||||||||||||||
C | Z | B | F | R0 | před JT | P | U | ||||||||||||||||||||||||||||||||
HV | JT | K. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
H | PROTI | J | T |
Reference
- ^ Behar a kol. (2012), haplogroup.org
- ^ A b van Oven, Mannis; Manfred Kayser (13. října 2008). „Aktualizovaný komplexní fylogenetický strom globální variace lidské mitochondriální DNA“. Lidská mutace. 30 (2): E386 – E394. doi:10.1002 / humu.20921. PMID 18853457. S2CID 27566749. Archivovány od originál dne 4. prosince 2012. Citováno 2009-05-20.
- ^ González, Ana M (2006). „Mitochondriální linie U8a odhaluje paleolitické osídlení v Baskicku“. BMC Genomics. 7: 124. doi:10.1186/1471-2164-7-124. PMC 1523212. PMID 16719915.
- ^ Richards, M; Macaulay, V; Hickey, E; et al. (Listopad 2000). „Trasování evropských zakladatelských linií v oblasti Blízkého východu mtDNA“. Dopoledne. J. Hum. Genet. 67 (5): 1251–76. doi:10.1016 / S0002-9297 (07) 62954-1. PMC 1288566. PMID 11032788.
- ^ Bryan Sykes (2001). Sedm dcer Evy. Londýn; New York: Bantam Press. ISBN 0393020185.
- ^ „Mateřský původ“. Oxfordští předkové. Archivovány od originál dne 15. července 2017. Citováno 7. února 2013.
- ^ A b Skorecki, Karl; Quintana-Murci, Lluis; Pergola, Sergio Della; Kaplan, Matthew; Rosengarten, Dror; David Gurwitz; Richards, Martin; Bonne-Tamir, Batsheva; Villems, Richard; Garrigan, Daniel; Hammer, Michael F .; Behar, Doron M. (1. května 2004). „Důkazy MtDNA o genetickém zúžení v rané historii židovské populace Ashkenazi“. European Journal of Human Genetics. 12 (5): 355–364. doi:10.1038 / sj.ejhg.5201156. PMID 14722586.
- ^ A b C d E F G h Non, Amy. „ANALYZACE GENETICKÝCH ÚDAJŮ V RÁMCI MEZISCIPLINÁRNÍHO ZKOUŠKY K VYŠETŘOVÁNÍ NEDÁVNÉ HISTORIE LIDSKÉ EVOLUČNÍ A KOMPLEXNÍ CHOROBY (PDF). University of Florida. Citováno 17. dubna 2016.
- ^ A b Lucia Simoni, Francesc Calafell, Davide Pettener, Jaume Bertranpetit a Guido Barbujani, Geografické vzory rozmanitosti mtDNA v Evropě, American Journal of Human Genetics, sv. 66 (2000), str. 262–278.
- ^ Behar, DM; Metspalu, E; Kivisild, T; et al. (Březen 2006). „Matrilineální předky aškenázských Židů: portrét nedávné zakladatelské události“. Dopoledne. J. Hum. Genet. 78 (3): 487–97. doi:10.1086/500307. PMC 1380291. PMID 16404693.
- ^ Richards, Martin B .; Pereira, Luísa; Soares, Pedro; Carr, Martin; Macaulay, Vincent; Eng, Ken Khong; Woodward, Scott R .; Hatina, Jiři; Naumova, Oksana; Rychkov, Sergei; Perego, Ugo A .; Achilli, Alessandro; Olivieri, Anna; Fernandes, Verónica; Pala, Maria; Pereira, Joana B .; Costa, Marta D. (8. října 2013). „Podstatný prehistorický evropský původ mezi mateřskými liniemi Ashkenazi“. Příroda komunikace. 4: 2543. Bibcode:2013NatCo ... 4.2543C. doi:10.1038 / ncomms3543. PMC 3806353. PMID 24104924.
- ^ Dubut, Vincent (2003). „polymorfismy mtDNA v pěti francouzských skupinách: význam regionálního vzorkování“. European Journal of Human Genetics. 12 (4): 293–300. doi:10.1038 / sj.ejhg.5201145. PMID 14694359.
- ^ A b C Asmahan Bekada; Lara R. Arauna; Tahria Deba; Francesc Calafell; Soraya Benhamamouch; David Comas (24. září 2015). „Genetická heterogenita u alžírských lidských populací“. PLOS ONE. 10 (9): e0138453. Bibcode:2015PLoSO..1038453B. doi:10.1371 / journal.pone.0138453. PMC 4581715. PMID 26402429.; Tabulka S5
- ^ Rishishwar L, Jordan IK (2017). „Důsledky evoluce člověka a příměsi pro mitochondriální substituční terapii“. BMC Genomics. 18 (1): 140. doi:10.1186 / s12864-017-3539-3. PMC 5299762. PMID 28178941.
- ^ Fernández Domínguez, Eva. „Polimorfismos de DNA mitocondrial en poblaciones antiguas de la cuenca mediterránea“. Universitat de Barcelona. Citováno 19. října 2017.
- ^ W. Haak a kol., „Starodávná DNA od prvních evropských zemědělců na neolitických lokalitách starých 7500 let“, Věda, sv. 310, č. 5750 (2005), str. 1016-1018; B. Bramanti, "Starověká DNA: Genetická analýza aDNA ze šestnácti koster Vedrovic," Anthropologie, sv. 46, l č. 2-3 (2008), str. 153-160; B. Bramanti a kol., „Genetická diskontinuita mezi místními lovci a sběrači a prvními farmáři ve střední Evropě,“ Věda, (publikováno online 3. září 2009).
- ^ Luca Ermini a kol., „Kompletní sekvence mitochondriálního genomu tyrolského Icemana“ Aktuální biologie, sv. 18, č. 21 (30. října 2008), s. 1687-1693.
- ^ Endicott a kol., „Genotypizace starých lidských mtDNA kontrolních a kódujících regionálních polymorfismů pomocí multiplexovaného testu Single-Base-Extension: jedinečná mateřská historie tyrolského Icemana,“ Genetika BMC, sv. 10, č. 29 (19. června 2009).
- ^ J. Tomczyk a kol., "Antropologická analýza osteologického materiálu ze starověké hrobky (starší doby bronzové) z údolí Střední Eufrat, Terqa (Sýrie)," International Journal of Osteoarchaeology, publikováno online před tiskem (2010).
- ^ Lucotte, Gérard (prosinec 2016). „Mitochondriální DNA mitotyp Sainte Marie-Madeleine“ (PDF). International Journal of Sciences. 5 (12). Citováno 16. února 2017.
- ^ Sirak, Kendra; Frenandes, Daniel; Novak, Mario; Van Gerven, Dennis; Pinhasi, Ron (2016). Abstract Book of the IUAES Inter-Congress 2016 - A community split? Odhalení komunitních genomů středověkého Kulubnarti pomocí sekvenování nové generace. IUAES.
- ^ Hofmanová, Zuzana; Kreutzer, Susanne; Hellenthal, Garrett; Sell, Christian; Diekmann, Yoan; Díez-del-Molino, David; van Dorp, Lucy; López, Saioa; Kousathanas, Athanasios; Link, Vivian; Kirsanow, Karola; Cassidy, Lara M .; Martiniano, Rui; Strobel, Melanie; Scheu, Amelie; Kotsakis, Kostas; Halstead, Paul; Triantaphyllou, Sevi; Kyparissi-Apostolika, Nina; Urem-Kotsou, Dushka; Ziota, Christina; Adaktylou, Fotini; Gopalan, Shyamalika; Bobo, Dean M .; Winkelbach, Laura; Blöcher, Jens; Unterländer, Martina; Leuenberger, Christoph; Çilingiroğlu, Çiler; Horejs, Barbara; Gerritsen, Fokke; Shennan, Stephen J .; Bradley, Daniel G .; Currat, Mathias; Veeramah, Krishna R .; Wegmann, Daniel; Thomas, Mark G .; Papageorgopoulou, Christina; Burger, Joachim (2016). „První zemědělci z celé Evropy přímo pocházeli z neolitických Egejských ostrovů“. Sborník Národní akademie věd. 113 (25): 6886–6891. doi:10.1073 / pnas.1523951113. ISSN 0027-8424. PMC 4922144. PMID 27274049.
- ^ Schuenemann, Verena J .; et al. (2017). „Staroegyptské genomy mumií naznačují nárůst předků subsaharské Afriky v post-římských obdobích“. Příroda komunikace. 8: 15694. Bibcode:2017NatCo ... 815694S. doi:10.1038 / ncomms15694. PMC 5459999. PMID 28556824.
- ^ Fregel; et al. (2018). „Starověké genomy ze severní Afriky dokazují prehistorické migrace do Maghrebu jak z Levantu, tak z Evropy“ (PDF). bioRxiv 10.1101/191569.
- ^ van der Walt, Joelle M .; Nicodemus, Kristin K .; Martin, Eden R .; Scott, William K .; Nance, Martha A .; Watts, Ray L .; Hubble, Jean P .; Haines, Jonathan L .; Koller, William C .; Lyons, Kelly; Pahwa, Rajesh; Stern, Matthew B .; Colcher, Amy; Hiner, Bradley C .; Jankovic, Joseph; Ondo, William G .; Allen Jr., Fred H .; Goetz, Christopher G .; Malý, Gary W .; Mastaglia, Frank; Stajich, Jeffrey M .; McLaurin, Adam C .; Middleton, Lefkos T .; Scott, Burton L .; Schmechel, Donald E .; Pericak-Vance, Margaret A .; Vance, Jeffery M. (2003). „Mitochondriální polymorfismy významně snižují riziko Parkinsonovy choroby“. American Journal of Human Genetics. 72 (4): 804–811. doi:10.1086/373937. ISSN 0002-9297. PMC 1180345. PMID 12618962.
- ^ Gates, Henry Louis Jr. (2010). Tváře Ameriky: Jak 12 výjimečných lidí objevilo své minulosti. NYU Press. p.49. ISBN 978-0-8147-3265-6.CS1 maint: ref = harv (odkaz)
- Behar DM, van Owen M, Rosset, Metspalu M a kol. (2012). „„ Koperníkovské “přehodnocení lidského mitochondriálního stromu DNA z jeho kořene“. Jsem J Hum Genet. 90 (4): 675–684. doi:10.1016 / j.ajhg.2012.03.002. PMC 3322232. PMID 22482806.
- Soares, P; Ermini, L; Thomson, N; Mormina, M; Rito, T; Röhl, A; Salas, A; Oppenheimer, S; et al. (2009). „Oprava pro čištění výběru: Vylepšené lidské mitochondriální molekulární hodiny“. American Journal of Human Genetics. 84 (6): 740–59. doi:10.1016 / j.ajhg.2009.05.001. PMC 2694979. PMID 19500773.
externí odkazy
- Všeobecné
- Mannis van Oven's Phylotree
- Haploskupina K.