Haploskupina Z - Haplogroup Z

Haploskupina Z
Možná doba vzniku21 661,6 [95% CI 13 280,8 <-> 30 042,4] ybp[1]

24 900 [95% CI 15 900 <-> 34 400] ybp[2]

25 300 (95% CI 20 300 <-> 31 200) ybp[3]
Možné místo původuStřední Asie
PředekCZ
Definování mutací152 6752 9090 15784 16185 16260[4]

v lidská mitochondriální genetika, Haploskupina Z je haploskupina lidské mitochondriální DNA (mtDNA).

Frekvenční distribuce mtDNA haploskupiny Z v Eurasii

Původ

Předpokládá se, že haploskupina Z vznikla ve Střední Asii a je jejím potomkem haploskupina CZ.

Rozdělení

Největší rozmanitost kladu haploskupiny Z se nachází v východní Asie a Střední Asie. Jeho největší frekvence se však objevuje u některých národů Rusko, jako Evens z Kamčatka (8/39 Z1a2a, 3/39 Z1a3, 11/39 = 28,2% Z celkem) a od Berezovka, okres Srednekolymsky, republika Sacha (3/15 Z1a3, 1/15 Z1a2a, 4/15 = 26,7% Z celkem) a mezi Saami lidé ze severní Skandinávie. S výjimkou tří Khakassů, kteří patří k Z4,[5] dva Jakutové, kteří patří k Z3a1,[5] dva Yakut, Yakutian Evenk, Buryat a Altai Kizhi, kteří patří do Z3 (xZ3a, Z3c),[5] a přítomnost kladu Z3c mezi populacemi Altajské republiky,[5] téměř všichni členové haploskupiny Z v severní Asii a Evropě patří do podskupin Z1. TMRCA Z1 je podle Sukernika 20 400 [95% CI 7400 <-> 34 000] ybp et al. 2012,[2] 20 400 [95% CI 7 800 <-> 33 800] ybp podle Fedorové et al. 2013,[5] nebo 19 600 [95% CI 12 500 <-> 29 300] ybp podle YFull.[3]

Fedorová et al. 2013 hlásilo nález Z * (xZ1a, Z3, Z4) u 1/388 Turků a 1/491 Kazachů. Tito jedinci by měli patřit k Z1 * (jinde pozorováno v Tofalaru), Z2 (pozorováno v japonštině), Z7 (pozorováno v Himalájích), Z5 (pozorováno v japonštině) nebo bazální Z * (pozorováno v Blang jednotlivec v Severní Thajsko ).[5]

Subclades

Strom

Tento fylogenetický strom podskupin haploskupiny Z je založen na příspěvku Mannisa van Ovena a Manfreda Kaysera Aktualizovaný komplexní fylogenetický strom globální variace lidské mitochondriální DNA[4] a následný publikovaný výzkum.

  • CZ
    • Z
      • Z * - Thajsko (Blang v provincii Čiang Rai)[6]
      • Z5 - Japonsko (Aiči)
      • Z-T152C! (TMRCA 24 300 [95% CI 19 300 <-> 30 300] ybp[3])
        • Z-T152C! * - Hongkong
        • Z1 (TMRCA 18 600 [95% CI 10 900 <-> 29 500] ybp[3])
          • Z1a - Koryak, Buryat, Kalmyk, Khakas, Shor, Altaj Kizhi, kazašský, kyrgyzský, Ujgur, Turek, Arab (Uzbekistán) (TMRCA 7 600 [95% CI 5 100 <-> 10 900] ybp[3])
          • Z1b - Tofalar[11]
        • Z2 - Japonsko (Tokio, Aiči, atd.) (TMRCA 3 900 [95% CI 1450 <-> 8 400] ybp[3])
        • Z3 - Japonsko (Tokio), Jižní Korea, Čína, Singapur, Malajsie, Thajsko (Lao Isan v Chaiyaphum Province[6]), Vietnam, Ujgur, Evenk (Sakha Republic), Buryat, Altaj Kizhi, Kyrgyz, Kazakh, Tajik, Ázerbajdžán, Severní Osetie, Rumunsko, USA (TMRCA 21 000 [95% CI 17 200 <-> 25 300] ybp[3])
        • Z4 - Čína (Suzhou, atd.), Thajsko (Phuan v Provincie Suphan Buri[6]), Filipíny, Uzbekistán, Kazachstán,[3] Kalmyk,[5] Khakas,[5] Karanogai[5] (TMRCA 14 900 [95% CI 9 200 <-> 22 800] ybp[3])
          • Z4a - Čína (Han z Hunanu a Denveru, atd.), Ujgur, Daur, Japonsko (Tokio)
            • Z4a1 - Čína (Han z Wu-chanu)
              • Z4a1a - Čína (Han z Hunanu a Yunnanu), Vietnam
                • Z4a1a1 - Japonsko (Tokio, atd.), Jižní Korea
        • Z7 - Dirang Monpa,[12] Tibet (Tingri,[14] Shannan[16]) (TMRCA 1 750 [95% CI 275 <-> 6 200] ybp[3])

Viz také

Fylogenetický strom haploskupiny lidské mitochondriální DNA (mtDNA)

 Mitochondriální Eva (L )  
L0L1–6 
L1L2 L3  L4L5L6
MN 
CZDEGQ ÓASR JáŽXY
CZBFR0 před JT P U
HVJTK.
HPROTIJT

Reference

  1. ^ Doron M. Behar, Mannis van Oven, Saharon Rosset, Mait Metspalu, Eva-Liis Loogväli, Nuno M. Silva, Toomas Kivisild, Antonio Torroni a Richard Villems (2012). „„ Koperníkovské “přehodnocení stromu lidské mitochondriální DNA z jeho kořene.“ American Journal of Human Genetics 90, 675–684 (6. dubna 2012). DOI 10.1016 / j.ajhg.2012.03.002.
  2. ^ A b C d E F G h i j k Rem I. Sukernik, Natalia V. Volodko, Ilya O. Mazunin, Nikolai P. Eltsov, Stanislav V. Dryomov a Elena B. Starikovskaya, „Mitochondriální rozmanitost genomu v tubalaru, sudí a Ulči: Příspěvek k pravěku domorodých Sibiřanů a jejich spřízněnost s domorodými Američany. “ American Journal of Physical Anthropology 148: 123–138 (2012). DOI 10.1002 / ajpa.22050
  3. ^ A b C d E F G h i j k l m n Ó p q r s t u proti w X y z aa ab ac inzerát ae af ag ah ai aj YFull MTree 1.01.5396 ke dni 4. dubna 2019.
  4. ^ A b van Oven, Mannis; Manfred Kayser (13. října 2008). „Aktualizovaný komplexní fylogenetický strom globální variace lidské mitochondriální DNA“. Lidská mutace. 30 (2): E386 – E394. doi:10.1002 / humu.20921. PMID  18853457. S2CID  27566749. Archivovány od originál dne 4. prosince 2012. Citováno 2009-05-20.
  5. ^ A b C d E F G h i j k l m n Ó p q r s t u proti w X y z aa ab ac inzerát ae af Sardana A Fedorova, Maere Reidla, Ene Metspalu, et al.„Autosomální a uniparentální portréty původních populací Sakha (Jakutsko): důsledky pro osídlení severovýchodní Eurasie.“ BMC Evoluční biologie 2013, 13:127. http://www.biomedcentral.com/1471-2148/13/127
  6. ^ A b C d E Wibhu Kutanan, Jatupol Kampuansai, Metawee Srikummool, Daoroong Kangwanpong, Silvia Ghirotto, Andrea Brunelli a Mark Stoneking: „Kompletní mitochondriální genomy thajské a laoské populace naznačují starodávný původ austroasiatických skupin a demickou difúzi v šíření tchaj-kadaijských jazyků. " Hum Genet 2016 DOI 10.1007 / s00439-016-1742-r.
  7. ^ A b C d E Max Ingman; Ulf Gyllensten (2007). „Nedávná genetická souvislost mezi Sami a ruskou oblastí Volga-Ural“ (PDF). European Journal of Human Genetics. 15 (1): 115–120. doi:10.1038 / sj.ejhg.5201712. PMID  16985502. S2CID  21483916.
  8. ^ Malyarchuk, B., Litvinov, A., Derenko, M., Skonieczna, K., Grzybowski, T., Grosheva, A., Shneider, Y., Rychkov, S. a Zhukova, O., „Mitogenomická rozmanitost u Rusů a Poláků.“ Forensic Sci Int Genet 30, 51-56 (2017).
  9. ^ A b C d E F G h i j k l m n Duggan AT, Whitten M, Wiebe V, Crawford M, Butthof A, et al. (2013), „Investigation the Prehistory of Tungusic Peoples of Siberia and the Amur-Ussuri Region with Complete mtDNA Genome Sequences and Y-chromosomal Markers.“ PLOS ONE 8 (12): e83570. doi: 10,1371 / journal.pone.0083570
  10. ^ A b Citovat chybu: Pojmenovaná reference Derenko2017 bylo vyvoláno, ale nikdy nebylo definováno (viz stránka nápovědy).
  11. ^ Elena B. Starikovskaya, Rem I. Sukernik, Olga A. Derbeneva, Natalia V. Volodko, Eduardo Ruiz-Pesini, Antonio Torroni, Michael D. Brown, Marie T. Lott, Seyed H. Hosseini, Kirsi Huoponen a Douglas C. Wallace, „Diverzita mitochondriální DNA v domorodých populacích jižní části Sibiře a počátky indiánských haploskupin.“ Annals of Human Genetics (2005) 69, 67–89. doi: 10,1046 / j.1529-8817.2003.00127.x
  12. ^ A b C d E F G h Chandrasekar A, Kumar S, Sreenath J, Sarkar BN, Urade BP, et al. (2009), „Aktualizace fylogeneze mitochondriální DNA Macrohaplogroup M v Indii: Rozptyl moderního člověka v jihoasijském koridoru. PLOS ONE 4 (10): e7447. doi: 10,1371 / journal.pone.0007447
  13. ^ Sebastian Lippold; et al. (2014). "Lidské otcovské a mateřské demografické historie: poznatky z Y chromozomů s vysokým rozlišením a sekvencí mtDNA". bioRxiv  10.1101/001792.
  14. ^ A b Citovat chybu: Pojmenovaná reference Kang2016 bylo vyvoláno, ale nikdy nebylo definováno (viz stránka nápovědy).
  15. ^ Min-Sheng Peng, Weifang Xu, Jiao-Jiao Song, et al. (2017), „Mitochondriální genomy odkrývají mateřskou historii populací Pamíru.“ European Journal of Human Genetics https://doi.org/10.1038/s41431-017-0028-8
  16. ^ Citovat chybu: Pojmenovaná reference Ji2012 bylo vyvoláno, ale nikdy nebylo definováno (viz stránka nápovědy).

externí odkazy