Haploskupina W (mtDNA) - Haplogroup W (mtDNA)

Haploskupina W.
Možná doba vzniku23 900 ybp[1]
Možné místo původuZápadní Asie
PředekN2
PotomciW1, C194T, W3, W4, W5, W6, W7
Definování mutací195 204 207 1243 3505 5460 8251 8994 11947 15884C 16292[2]

Haploskupina W. je lidská mitochondriální DNA (mtDNA) haploskupina.

Původ

Předpokládá se, že haploskupina W vznikla před 23 900 lety v roce Západní Asie.[1] Pochází z haploskupina N2.

Rozdělení

Předpokládané prostorové rozdělení haploskupiny W.

Haploskupina W se nachází v Evropa, Západní Asie, a Jížní Asie.[3] Je široce distribuován na nízkých frekvencích s vysokou koncentrací v severu Pákistán.[4] Haploskupina W se také nachází v Maghrebu mezi Alžířané (1.08%-3.23%)[5] a v Sibiř mezi Jakuti (6/423 = 1.42%[6]).

Kromě toho byl clade pozorován mezi staroegyptský mumie vyhloubené u Abusir el-Meleq archeologické naleziště ve středním Egyptě, které pochází z Ptolemaiovské království.[7]

Subclade W5 byl nalezen ve fosilii spojené s Starčevo kultura (Stránky Lánycsók; 1/1 nebo 100%).[8]

Starověké analýzy DNA zjistily, že středověký jedinec Sungir 6 (730-850 cal BP) patřilo k subclade W3a1.[9]

Subclades

Strom

Fylogenetický strom haploskupin Já (vlevo) a W (vpravo). Kya v levém měřítku stojí před tisíci lety.

Tento fylogenetický strom haploskupin W subclades je založen na příspěvku Mannis van Oven a Manfred Kayser Aktualizovaný komplexní fylogenetický strom globální variace lidské mitochondriální DNA[2] a následný publikovaný výzkum.

  • Ž
    • W1
      • W1a
      • W1b
      • T119C
        • W1c
          • W1c1
      • W1d
      • W1e
      • W1f
      • W1g
      • C194T
        • W3
          • W3a
            • W3a1
              • W3a1a
                • W3a1a1
              • W3a1b
                • T199C
                  • W3a1c
            • W3a2
          • W3b
            • W3b1
        • W4
          • W4a
        • W5
          • W5a
            • W5a1
              • W5a1a
                • W5a1a1
                  • W5a1a1a
            • W5a2
          • W5b
        • W6
          • C16192T
            • W6a
            • W6b
          • W6c
        • W7

Viz také

Fylogenetický strom haploskupiny lidské mitochondriální DNA (mtDNA)

 Mitochondriální Eva (L )  
L0L1–6 
L1L2 L3  L4L5L6
MN 
CZDEGQ ÓASR JáŽXY
CZBFR0 před JT P U
HVJTK.
HPROTIJT

Reference

  1. ^ A b Soares, Pedro; Luca Ermini; Noel Thomson; Maru Mormina; Teresa Rito; Arne Röhl; Antonio Salas; Stephen Oppenheimer; Vincent Macaulay; Martin B. Richards (4. června 2009). „Dodatečná korekce dat pro čištění výběru: Vylepšené lidské mitochondriální molekulární hodiny“. American Journal of Human Genetics. 84 (6): 82–93. doi:10.1016 / j.ajhg.2009.05.001. PMC  2694979. PMID  19500773. Citováno 2009-08-13.
  2. ^ A b van Oven, Mannis; Manfred Kayser (13. října 2008). „Aktualizovaný komplexní fylogenetický strom globální variace lidské mitochondriální DNA“. Lidská mutace. 30 (2): E386 – E394. doi:10.1002 / humu.20921. PMID  18853457. S2CID  27566749. Archivovány od originál dne 4. prosince 2012. Citováno 2009-05-20.
  3. ^ Petraglia, Michael D .; Allchin, Bridget (2007). Vývoj a historie lidských populací v jižní Asii: Interdisciplinární studia v archeologii, biologické antropologii, lingvistice a genetice. Springer Science & Business Media. p. 237. ISBN  978-1-4020-5562-1.
  4. ^ Meit Metspalu a kol., Většina existujících hranic mtDNA v jižní a jihozápadní Asii byla pravděpodobně formována během počátečního osídlení Eurasie anatomicky moderními lidmi. BMC Genetics, 2004
  5. ^ Asmahan Bekada; Lara R. Arauna; Tahria Deba; Francesc Calafell; Soraya Benhamamouch; David Comas (24. září 2015). „Genetická heterogenita u alžírských lidských populací“. PLOS ONE. 10 (9): e0138453. Bibcode:2015PLoSO..1038453B. doi:10.1371 / journal.pone.0138453. PMC  4581715. PMID  26402429.; Tabulka S5
  6. ^ Sardana A Fedorova, Maere Reidla, Ene Metspalu, et al.„Autosomální a uniparentální portréty původních populací Sakha (Jakutsko): důsledky pro osídlení severovýchodní Eurasie.“ BMC Evoluční biologie 2013, 13:127. http://www.biomedcentral.com/1471-2148/13/127
  7. ^ Schuenemann, Verena J .; et al. (2017). „Staroegyptské genomy mumií naznačují nárůst předků subsaharské Afriky v post-římských obdobích“. Příroda komunikace. 8: 15694. Bibcode:2017NatCo ... 815694S. doi:10.1038 / ncomms15694. PMC  5459999. PMID  28556824.
  8. ^ Mark Lipson; et al. (2017). „Paralelní paleogenomické transekty odhalují složitou genetickou historii raných evropských zemědělců“. Příroda. 551 (7680): 368–372. Bibcode:2017Natur.551..368L. doi:10.1038 / příroda24476. PMC  5973800. PMID  29144465. Citováno 18. listopadu 2017.
  9. ^ Sikora, Martin; Seguin-Orlando, Andaine; Sousa, Vitor C .; Albrechtsen, Anders; Korneliussen, Thorfinn; Ko, Amy; Rasmussen, Simon; Dupanloup, Isabelle; Nigst, Philip R .; Bosch, Marjolein D .; Renaud, Gabriel; Allentoft, Morten E .; Margaryan, Ashot; Vasiljev, Sergej V .; Veselovskaya, Elizaveta V .; Borutskaya, Svetlana B .; Deviese, Thibaut; Comeskey, Dan; Higham, Tom; Manica, Andrea; Foley, Robert; Meltzer, David J .; Nielsen, Rasmus; Excoffier, Laurent; Lahr, Marta Mirazon; Orlando, Ludovic; Willerslev, Eske (2017). „Starověké genomy ukazují sociální a reprodukční chování raných mladopaleolitických sekaček“. Věda. 358 (6363): 659–662. Bibcode:2017Sci ... 358..659S. doi:10.1126 / science.aao1807. ISSN  0036-8075. PMID  28982795.

externí odkazy