Haploskupina T (mtDNA) - Haplogroup T (mtDNA)

Haploskupina T je lidská mitochondriální DNA (mtDNA) haploskupina. Předpokládá se, že vznikl před 25 100 lety v Blízký východ.

Počátky

Mitochondriální clade T pochází z haploskupiny JT, což také vedlo k vzniku mtDNA haploskupina J. Předpokládá se, že mateřská kladu T pocházela z Blízký východ (Bermisheva 2002 ) chyba harv: žádný cíl: CITEREFBermisheva2002 (Pomoc).

Rozdělení

Předpokládané rozdělení prostorové frekvence pro haploskupinu T.

Bazální haploskupina T * se nachází mezi Alžířané v Oran (1,67%) a Reguibovat Sahrawi (0.93%).^[1] Rovněž je distribuován mezi Soqotri (1.2%).^[2]

Haploskupina T je přítomna v nízkých frekvencích haploskupiny v celé západní a střední Asii a Evropě, s různým stupněm prevalence a určitě mohla být přítomna i v jiných skupinách z okolních oblastí. T se vyskytuje u přibližně 10% původních Evropanů.^[3][4] To je také běžné mezi moderní dobou Íránci. Na základě vzorku více než 400 moderních Íránců (Kivisild a Metspalu 2003 ) chyba harv: žádný cíl: CITEREFKivisild_and_Metspalu2003 (Pomoc)„haploskupina T představuje zhruba 8,3% populace (asi 1 z 12 jedinců), přičemž konkrétnější podtyp T1 tvoří zhruba polovinu z nich. Specifický podtyp T1 má tendenci se nalézat dále na východ a je běžný v Střední Asie a moderní Turkic populace (Lalueza-Fox 2004 ), kteří obývají velkou část stejného území jako starověcí Saka, Sarmatština, Andronovo a další domnělé íránské národy 2. a 1. tisíciletí před naším letopočtem. Lalueza-Fox a kol. (2004) také našli několik sekvencí T a T1 ve starověkých pohřbech, včetně Kurganové, v kazašské stepi mezi 14. – 10. stol. př. n. l., a později do 1. tisíciletí př. n. l. Ty se shodují s druhou částí období Andronova a obdobím Saka v regionu.^[5]

Geografická distribuce v subclade T2 se značně liší podle poměru subhaplogroup T2e k T2b, který se údajně liší 40krát mezi zkoumanými populacemi od minima v Británii a Irsku po maximum v Saúdské Arábii (Bedford 2012 ). V podskupině T2e je mezi sefardskými Židy v Turecku a Bulharsku identifikován velmi vzácný motiv a podezření na konverzace z Nového světa (Bedford 2012 ).

Nalezeno v populaci Svan z Kavkazu (Gruzie) T * 10,4% a T1 4,2%. T1a1a1 je obzvláště běžný v zemích s vysokou úrovní Y-haploskupiny R1a, jako je střední a severovýchodní Evropa. Klad se také vyskytuje všude ve střední Asii a hluboko v severní Asii, jako daleký východ jako Mongolsko.

Zdá se, že T2c a T2d mají v době kolem USA původ z Blízkého východu Poslední ledové maximum (LGM) a novější rozptýlení do Evropy. Většina T2c zahrnuje haploskupinu T2c1. Kromě vrcholu na Kypru je T2c1 nejběžnější v EU Perský záliv region, ale vyskytuje se také v Levantech a ve středomořské Evropě, s mnohem vzdálenější distribucí na velmi nízkých úrovních.^[6]

T2 se také nachází mezi Soqotri (7,7%).^[2]

Archeologie

Wilde a kol. (2014) testovali vzorky mtDNA z Yamna kultura, předpokládaná vlast vlasti Protoindoevropský Řečníci. Našli T2a1b uprostřed Volžský region a Bulharsko a T1a ve středu Ukrajina a Střední Volha. Frekvence T1a a T2 ve vzorcích Yamna byla každý 14,5%, což je procento vyšší než v kterékoli jiné zemi v současnosti a vyskytuje se pouze u podobně vysokých frekvencí mezi Udmurty oblasti Volga-Ural.^[7]

Haploskupina T byla také nalezena mezi Iberomaurusian vzorky pocházející z Epipaleolitické na Afalou prehistorické místo v Alžírsko. Jeden starověký jedinec nesl subclade T2b (1/9; 11%).^[8] Kromě toho byla haploskupina T pozorována staroegyptský mumie vyhloubené u Abusir el-Meleq archeologické naleziště ve středním Egyptě, které pochází z před-Ptolemaic /pozdě Nová říše (T1, T2), Ptolemaic (T1, T2) a římský (nediferencované T, T1) období.^[9] Fosílie vykopané v pozdně neolitické lokalitě Kelif el Boroud v Maroko Bylo také pozorováno, že nese subclade T2 s datem kolem 3 000 př. n. l.^[10] Haploskupina T byla navíc pozorována již ve starověku Guanche fosilie vytěžené v Gran Canaria a Tenerife na Kanárské ostrovy, které byly radiokarbonově datovány do 7. až 11. století n. l. Jednotlivci nesoucí clade byli na místě na Tenerife osídleni, přičemž u jednoho exempláře bylo zjištěno, že patří do subclade T2c1d2 (1/7; 14%).^[11]

Afrika

V Africe se haploskupina T vyskytuje především mezi Afroasijský - mluvící populace, včetně bazálního kladu T *.^[1] Některé non-bazální T clades jsou také běžně vyskytují mezi Niger-Kongo -mluvení Serer v důsledku difúze z Maghrebu, pravděpodobně s rozšířením islámu a městských civilizací.^[12]

Asie

Evropa

Subclades

Schematický strom haploskupiny mtDNA T. Věk (v ka ) jsou uvedeny odhady maximální pravděpodobnosti získané pro celý genom mtDNA.

Strom

Tento fylogenetický strom subcladů haploskupiny I je založen na článku (van Oven 2008 ) chyba harv: žádný cíl: CITEREFvan_Oven2008 (Pomoc) a následný publikovaný výzkum (Behar 2012b ). Pro stručnost, pouze první tři úrovně subclades (větve) jsou zobrazeny.

• T
  • T1
    • T1a
      • T1a1
    • T1b
  • T2
    • T2a
      • T2a1
    • T2b
      • T2b1
      • T2b2
      • T2b3
      • T2b4
      • T2b5
      • T2b6
    • T2c
      • T2c1
    • T2d
    • T2e
      • T2e2
    • T2f
      • T2f1
    • T2g

Zdravotní problémy

Jedna studie prokázala, že haploskupina T je spojena se zvýšeným rizikem ischemická choroba srdeční (Sanger 2007 ) chyba harv: žádný cíl: CITEREFSanger2007 (Pomoc). Některé studie však také ukázaly, že lidé z haploskupiny T jsou méně náchylní k cukrovka (Chinnery 2007 chyba harvnb: žádný cíl: CITEREFChinnery2007 (Pomoc) a González 2012 chyba harvnb: žádný cíl: CITEREFGonzález2012 (Pomoc)).

Několik předběžných lékařských studií prokázalo, že haploskupina T může nabídnout určitou odolnost vůči oběma Parkinsonova choroba a Alzheimerova choroba.^{[Citace je zapotřebí ]}

Jedna studie zjistila, že u španělské populace se hypertrofická kardiomyopatie (HCM), označovaná také jako hypertrofická obstrukční kardiomyopatie nebo HOCM, vyskytuje s větší pravděpodobností u předků T2 než u jiných mateřských haploskupin.^[13] Není známo, zda je to specifické pro tuto subklaudu haploskupiny T, nebo zda jde o rizikový faktor sdílený všemi haploskupinami T. Se statisticky významným rozdílem zjištěným v tak malém vzorku může být vhodné pro ty, které mají známou haploskupinu T aby si toho byli vědomi a při rutinní zkoušce v raném věku nechali svého lékaře zkontrolovat důkazy o tomto stavu. Obvykle je bez příznaků a zvyšuje riziko náhlé srdeční smrti, ke které často dochází u osob v raném věku jako u teenagerů, a může ovlivnit ty, kteří jsou aktivní a nemají žádné další rizikové faktory.^[14]

Některé lékařské studie ukázaly, že mitochondriální haploskupina T je spojena se sníženou pohyblivost spermií u mužů, i když tyto výsledky byly zpochybněny (Mishmar 2002 ) chyba harv: žádný cíl: CITEREFMishmar2002 (Pomoc). Podle Departamento de Bioquimica y Biologica Molecular y Celular, Universidad de Zaragoza, Haplogroup T can predispose to asthenozoospermie (Ruiz-Pesini 2000 ) chyba harv: žádný cíl: CITEREFRuiz-Pesini2000 (Pomoc). Tato zjištění však byla zpochybněna kvůli malé velikosti vzorku ve studii (Mishmar 2002 ) chyba harv: žádný cíl: CITEREFMishmar2002 (Pomoc).

Slavní členové

Během BBC One dokumentární Seznamte se s Izzardy herec a komik Eddie Izzard se dozví, že jeho mitochondriální DNA je z haploskupiny T, konkrétně z subclade T2f1a1.^[15]

Nicholas II Ruska

Poslední ruština Car, Nicholas II, bylo prokázáno, že je z Haplogroup T, konkrétně subclade T2 (Ivanov 1996 ) chyba harv: žádný cíl: CITEREFIvanov1996 (Pomoc). Za předpokladu, že jsou všechny příslušné rodokmeny správné, zahrnuje to všechny potomky ženské linie předka jeho ženské linie Barbory ​​z Celje (1390–1451), manželka Zikmund, císař Svaté říše římské. To zahrnuje velké množství evropských šlechticů, včetně Jiří I. z Velké Británie a Frederick William já Pruska (skrz Electress Sophia of Hanover ), Charles já Anglie, George III Spojeného království, George V. Spojeného království, Charles X Gustav Švédska, Gustav Adolf ze Švédska, Maurice z Nassau, princ z Oranžska, Olav V Norska, a Jiří I. z Řecka.

Viz také

Genetika

Páteřní strom mtDNA

Reference

Poznámky pod čarou

Citace

• Pike DA, Barton TJ, Bauer SL, Kipp E (2010). „Fylogeneze haploskupiny mtDNA založená na úplných mitochondriálních sekvencích“. Journal of Genetic Genealogy. 6 (1).
• "Molekulární nestabilita mitochondriálních haploskupinových T sekvencí v nukleotidových polohách 16292 a 16296". Citovat deník vyžaduje | deník = (Pomoc)
• Abu-Amero, Khaled K; Larruga, José M; Cabrera, Vicente M; González, Ana M (2008). „Struktura mitochondriální DNA na Arabském poloostrově“. BMC Evoluční biologie. 8: 45. doi:10.1186/1471-2148-8-45. PMC  2268671. PMID  18269758.
• Babalini, Carla; Martínez-Labarga, Cristina; Tolk, Helle-Viivi; Kivisild, Toomas; Giampaolo, Rita; Tarsi, Tiziana; Contini, Irene; Barać, Lovorka; et al. (2005). „Populační historie chorvatské jazykové menšiny Molise (jižní Itálie): pohled matky“. European Journal of Human Genetics. 13 (8): 902–12. doi:10.1038 / sj.ejhg.5201439. PMID  15886710.
• Bedford, Felice L (2012). „Sephardic signature in haplogroup T mitochondrial DNA“. European Journal of Human Genetics. 20 (4): 441–8. doi:10.1038 / ejhg.2011.200. PMC  3306851. PMID  22108605.
• Behar, DM; Metspalu, E; Kivisild, T; Rosset, S; Tzur, S; Hadid, Y; Yudkovsky, G; Rosengarten, D; et al. (2008). MacAulay, Vincent (ed.). „Počítání zakladatelů: Matrilineální genetický původ židovské diaspory“. PLOS ONE. 3 (4): e2062. Bibcode:2008PLoSO ... 3.2062B. doi:10.1371 / journal.pone.0002062. PMC  2323359. PMID  18446216.
• Behar, Doron M .; Van Oven, Mannis; Rosset, Saharon; Metspalu, Mait; Loogväli, Eva-Liis; Silva, Nuno M .; Kivisild, Toomas; Torroni, Antonio; Villems, Richard (2012). „Koperníkovské“ přehodnocení stromu lidské mitochondriální DNA z jeho kořene “. American Journal of Human Genetics. 90 (4): 675–84. doi:10.1016 / j.ajhg.2012.03.002. PMC  3322232. PMID  22482806.
• Belyaeva, Olga; Bermisheva, Marina; Khrunin, Andrey; Slominský, Petr; Bebyakova, Natalia; Khusnutdinova, E. K. (Elza Kamilevna); Mikulich, Aleksei Ignatevich; Limborskaia, S.A. (Svetlana Andreevna) (2003). "Variace mitochondriální DNA v ruské a běloruské populaci". Biologie člověka. 75 (5): 647–60. doi:10.1353 / náboj.2003.0069. PMID  14763602. S2CID  23876546.
• Boattini, Alessio; Castrì, Loredana; Sarno, Stefania; Useli, Antonella; Cioffi, Manuela; Sazzini, Marco; Garagnani, Paolo; De Fanti, Sara; Pettener, Davide; Luiselli, Donata (2013). „Variace MtDNA ve východní Africe odhaluje historii afroasijských skupin“. American Journal of Physical Anthropology. 150 (3): 375–385. doi:10.1002 / ajpa.22212. PMID  23283748.
• Bosch, E .; Calafell, F .; Gonzalez-Neira, A .; Flaiz, C .; Mateu, E .; Scheil, H.-G .; Huckenbeck, W .; Efremovska, L .; et al. (2006). „Otcovské a mateřské linie na Balkáně ukazují homogenní krajinu přes jazykové bariéry, s výjimkou izolovaných Aromunů“. Annals of Human Genetics. 70 (4): 459–87. doi:10.1111 / j.1469-1809.2005.00251.x. PMID  16759179. S2CID  23156886.
• Brandstatter, Anita; Peterson, Christine T .; Irwin, Jodi A .; Mpoke, Solomon; Koech, Davy K .; Parson, Walther; Parsons, Thomas J. (2004). "Sekvence mitochondriální kontrolní oblasti DNA z Nairobi (Keňa): Odvození fylogenetických parametrů pro vytvoření forenzní databáze". International Journal of Legal Medicine. 118 (5): 294–306. doi:10.1007 / s00414-004-0466-z. PMID  15248073. S2CID  19703169.
• Castrì, Loredana; Garagnani, P; Useli, A; Pettener, D; Luiselli, D (2008). „Keňská křižovatka: migrace a tok genů u šesti etnických skupin z východní Afriky“. Journal of Anthropological Sciences. 86: 189–192. PMID  19934476.
• Castrì, Loredana; Tofanelli, Sergio; Garagnani, Paolo; Bini, Carla; Fosella, Xenia; Pelotti, Susi; Paoli, Giorgio; Pettener, Davide; Luiselli, Donata (2009). „Variabilita MtDNA ve dvou populacích hovořících bantusky (Shona a Hutu) z východní Afriky: Důsledky pro osídlení a migrační vzorce v subsaharské Africe“. American Journal of Physical Anthropology. 140 (2): 302–11. doi:10.1002 / ajpa.21070. PMID  19425093.
• Chinnery, P F; Mowbray, C; Patel, SK; Elson, JL; Sampson, M; Hitman, GA; McCarthy, M I; Hattersley, AT; Walker, M (2007). „Haploskupiny mitochondriální DNA a diabetes typu 2: Studie 897 případů a 1010 kontrol“. Journal of Medical Genetics. 44 (6): e80. doi:10.1136 / jmg.2007.048876. PMC  2740896. PMID  17551080.
• Coble, Michael D .; Loreille, Odile M .; Wadhams, Mark J .; Edson, Suni M .; Maynard, Kerry; Meyer, Carna E .; Niederstätter, Harald; Berger, Cordula; et al. (2009). Hofreiter, Michael (ed.). „Vyřešeno tajemství: identifikace dvou pohřešovaných Romanovových dětí pomocí analýzy DNA“. PLOS ONE. 4 (3): e4838. Bibcode:2009PLoSO ... 4.4838C. doi:10,1371 / journal.pone.0004838. PMC  2652717. PMID  19277206.
• Costa, MD; Cherni, L; Fernandes, V; Freitas, F; Ammar El Gaaied, AB; Pereira, L (2009). "Data z kompletního sekvenování mtDNA tuniských stoletých: Testování asociace haploskupin a" zlatá střední cesta "k dlouhověkosti". Mechanismy stárnutí a rozvoje. 130 (4): 222–6. doi:10.1016 / j.mad.2008.12.001. PMID  19133286. S2CID  6102820.
• Cvjetan, S; Tolk, HV; Lauc, LB; Colak, I; Dordević, D; Efremovska, L; Janićijević, B; Kvesić, A; et al. (2004). „Frekvence haploskupin mtDNA v jihovýchodní Evropě - Chorvaté, Bosňané a Hercegovinci, Srbové, Makedonci a makedonští Romové“. Collegium Antropologicum. 28 (1): 193–8. PMID  15636075.
• Derenko, M; Malyarchuk, B; Grzybowski, T; Denisova, G; Dambueva, I; Perkova, M; Dorzhu, C; Luzina, F; et al. (2007). „Fylogeografická analýza mitochondriální DNA v populacích severní Asie“. American Journal of Human Genetics. 81 (5): 1025–41. doi:10.1086/522933. PMC  2265662. PMID  17924343.
• Dubut, Vincent; Chollet, Lionel; Murail, Pascal; Cartault, François; Béraud-Colomb, Eliane; Serre, Myriam; Mogentale-Profizi, Nérina (2003). „Polymorfismy MtDNA v pěti francouzských skupinách: Význam regionálního vzorkování“. European Journal of Human Genetics. 12 (4): 293–300. doi:10.1038 / sj.ejhg.5201145. PMID  14694359.
• Fernandes, Verónica; Alshamali, Farida; Alves, Marco; Costa, Marta D .; Pereira, Joana B .; Silva, Nuno M .; Cherni, Lotfi; Harich, Nourdin; et al. (2012). „Arabská kolébka: mitochondriální relikty prvních kroků podél jižní cesty z Afriky“. American Journal of Human Genetics. 90 (2): 347–355. doi:10.1016 / j.ajhg.2011.12.010. PMC  3276663. PMID  22284828.
• Finnila, JS; Finnila, S; Majamaa, K (2001). „Selekce specifická pro linii v lidské mtDNA: Nedostatek polymorfismů v segmentu genu MTND5 v haploskupině J“. Molekulární biologie a evoluce. 20 (12): 2132–42. doi:10,1093 / molbev / msg230. PMID  12949126.
• Gasparre, G .; Porcelli, A. M .; Bonora, E .; Pennisi, L. F .; Toller, M .; Iommarini, L .; Ghelli, A .; Moretti, M .; et al. (2007). „Rušivé mitochondriální mutace DNA v komplexních podjednotkách I jsou markery onkocytárního fenotypu v nádorech štítné žlázy“. Sborník Národní akademie věd. 104 (21): 9001–9006. Bibcode:2007PNAS..104,9001G. doi:10.1073 / pnas.0703056104. PMC  1885617. PMID  17517629.
• Gonder, M. K .; Mortensen, H. M .; Reed, F. A .; De Sousa, A .; Tishkoff, S.A. (2006). „Analýza sekvence genomu celé mtDNA staroafrických linií“. Molekulární biologie a evoluce. 24 (3): 757–68. doi:10.1093 / molbev / msl209. PMID  17194802.
• González, Ana M .; MacEira, Benito M .; Pérez, Estefanía; Cabrera, Vicente M .; López, Alfonso J .; Larruga, José M. (2012). „Genetika, životní prostředí a konečné onemocnění ledvin související s diabetem na Kanárských ostrovech“. Genetické testování a molekulární biomarkery. 16 (8): 859–64. doi:10.1089 / gtmb.2011.0207. PMC  3422557. PMID  22480375.
• Hartmann, A; Thieme, M; Nanduri, LK; Stempfl, T; Moehle, C; Kivisild, T; Oefner, PJ (2009). „Validace microarray resekvenování 93 celosvětových mitochondriálních genomů“. Lidská mutace. 30 (1): 115–22. doi:10.1002 / humu.20816. PMID  18623076. S2CID  205918494.
• Hassan, Hisham Yousif (2009). „Genetické vzorce variace chromozomu Y a mitochondriální DNA s důsledky pro osídlení Súdánu“ (PDF). Univerzita v Chartúmu.
• Helgason, Agnar; Hickey, Eileen; Goodacre, Sara; Bosnes, Vidar; Stefánsson, Kári; Ward, Ryk; Sykes, Bryan (2001). „mtDNA a ostrovy severního Atlantiku: Odhad podílu severských a gaelských předků“. American Journal of Human Genetics. 68 (3): 206–15. doi:10.1086/318785. PMC  1274484. PMID  11179019.
• Hofreiter, Linea; Lynnerup, Niels; Siegismund, Hans R .; Kivisild, Toomas; Dissing, Jørgen (2010). Hofreiter, Michael (ed.). „Genetická rozmanitost mezi starými severskými populacemi“. PLOS ONE. 5 (7): e11898. Bibcode:2010PLoSO ... 511898M. doi:10.1371 / journal.pone.0011898. PMC  2912848. PMID  20689597. Celkový výskyt haploskupin se nelišil od existujících Skandinávců, nicméně haploskupina I byla významně častější u starověkých Dánů (v průměru 13%) než u existujících Dánů a Skandinávců (~ 2,5%), jakož i u ostatních hlášených vzorků starověké populace. Haploskupina I proto mohla být starověkým jižním skandinávským typem „zředěným“ pozdějšími imigračními událostmi.
• Ivanov, Pavel L .; Wadhams, Mark J .; Roby, Rhonda K .; Holland, Mitchell M .; Weedn, Victor W .; Parsons, Thomas J. (1996). „Mitochondriální sekvence DNA heteroplazmy u ruského velkovévody Georgij Romanov potvrzuje pravost ostatků cara Mikuláše II.“. Genetika přírody. 12 (4): 417–20. doi:10.1038 / ng0496-417. PMID  8630496. S2CID  287478.
• Janssen, GM; Neu, A; Hart, LM; Van De Sande, CM; Antonie Maassen, J (2006). „Nové varianty délky mitochondriální DNA a genetická nestabilita v rodině s diabetem a hluchotou“. Experimentální a klinická endokrinologie a cukrovka. 114 (4): 168–74. doi:10.1055 / s-2006-924066. PMID  16705548.
• Keyser, Christine; Bouakaze, Caroline; Crubézy, Eric; Nikolaev, Valery G .; Montagnon, Daniel; Reis, Tatiana; Ludes, Bertrand (2009). „Starověká DNA poskytuje nový pohled na historii jihosibiřských Kurganů“. Genetika člověka. 126 (3): 395–410. doi:10.1007 / s00439-009-0683-0. PMID  19449030. S2CID  21347353.
• Kivisild, T; Reidla, M; Metspalu, E; Rosa, A; Brehm, A; Pennarun, E; Parik, J; Geberhiwot, T; et al. (2004). „Dědictví etiopské mitochondriální DNA: Sledování toku genů napříč a kolem brány slz“. American Journal of Human Genetics. 75 (5): 752–70. doi:10.1086/425161. PMC  1182106. PMID  15457403.
• Rytíř, A; Underhill, PA; Mortensen, HM; Zhivotovsky, LA; Lin, AA; Henn, BM; Louis, D; Ruhlen, M; Mountain, JL (2003). „Africký chromozom Y a divergence mtDNA poskytuje vhled do historie jazyků kliknutí“. Aktuální biologie. 13 (6): 464–73. doi:10.1016 / S0960-9822 (03) 00130-1. PMID  12646128. S2CID  52862939.
• Krings, M; Salem, AE; Bauer, K; Geisert, H; Malek, AK; Chaix, L; Simon, C; Welsby, D; et al. (1999). „Analýza MtDNA populací údolí Nilu: Genetický koridor nebo bariéra migrace?“. American Journal of Human Genetics. 64 (4): 1166–1176. doi:10.1086/302314. PMC  1377841. PMID  10090902.
• Martina Kujanová; Luisa Pereira; Veronica Fernandes; Joana B. Pereira; Viktor Černý (2009). „Blízkovýchodní neolitický genetický vstup v malé oáze egyptské západní pouště“. American Journal of Physical Anthropology. 140 (2): 336–346. doi:10.1002 / ajpa.21078. PMID  19425100.
• Lalueza-Fox, C; Sampietro, ML; Gilbert, MT; Castri, L; Facchini, F; Pettener, D; Bertranpetit, J (2004). „Rozluštění migrací ve stepi: mitochondriální sekvence DNA od starověkých centrálních Asiatů“. Sborník: Biologické vědy. 271 (1542): 941–7. doi:10.1098 / rspb.2004.2698. PMC  1691686. PMID  15255049.
• Maca-Meyer, N; González, AM; Larruga, JM; Flores, C; Cabrera, VM (2001). „Hlavní genomové mitochondriální linie určují časné lidské expanze“. Genetika BMC. 2: 13. doi:10.1186/1471-2156-2-13. PMC  55343. PMID  11553319.
• MacAulay, Vincent; Richards, Martin; Hickey, Eileen; Vega, Emilce; Cruciani, Fulvio; Guida, Valentina; Scozzari, Rosaria; Bonné-Tamir, Batsheva; et al. (1999). „Vznikající strom západoasijských mtDNA: syntéza sekvencí kontrolních oblastí a RFLP“. American Journal of Human Genetics. 64 (1): 232–49. doi:10.1086/302204. PMC  1377722. PMID  9915963.
• Malyarchuk, B. A .; Derenko, M. V. (1999). "Molekulární nestabilita mitochondriálních haploskupinových T sekvencí v nukleotidových pozicích 16292 a 16296". Annals of Human Genetics. 63 (6): 489–497. doi:10.1046 / j.1469-1809.1999.6360489.x. PMID  11246451. S2CID  45007072.
• Malyarchuk, B. A .; Derenko, M. V. (2001). „Variabilita mitochondriální DNA u Rusů a Ukrajinců: důsledky pro původ východních Slovanů“. Annals of Human Genetics. 65 (Pt 1): 63–78. doi:10.1046 / j.1469-1809.2001.6510063.x. PMID  11415523. S2CID  9392520.
• Malyarchuk, BA; Grzybowski, T; Derenko, MV; Czarny, J; Drobnic, K; Miścicka-Sliwka, D (2003). "Variabilita mitochondriální DNA u Bosňanů a Slovinců". Annals of Human Genetics. 67 (Pt 5): 412–25. doi:10.1046 / j.1469-1809.2003.00042.x. PMID  12940915. S2CID  2105448.
• Malyarchuk, B; Derenko, M; Denisova, G; Kravtsova, O (2010). „Mitogenomická rozmanitost u Tatarů z ruské oblasti Volha-Ural“. Molekulární biologie a evoluce. 27 (10): 2220–6. doi:10,1093 / molbev / msq065. PMID  20457583.
• Martinez-Cruz, B .; Harmant, C .; Platt, D. E.; Haak, W .; Manry, J .; Ramos-Luis, E .; Soria-Hernanz, D.F .; Bauduer, F .; et al. (2012). „Důkazy o předrománské kmenové genetické struktuře v baskičtinách z uniparentally zděděných markerů“. Molekulární biologie a evoluce. 29 (9): 2211–22. doi:10,1093 / molbev / mss091. PMID  22411853.
• Melchior, Linea; Kivisild, Toomas; Lynnerup, Niels; Dissing, Jørgen (2008). Ahmed, Niyaz (ed.). „Důkazy o autentické DNA z koster dánského vikingského věku nedotčených lidmi po dobu 1000 let“. PLOS ONE. 3 (5): e2214. Bibcode:2008PLoSO ... 3,2214 mil. doi:10.1371 / journal.pone.0002214. PMC  2386972. PMID  18509537.
• Metspalu, Mait; Kivisild, Toomas; Metspalu, Ene; Parik, Jüri; Hudjashov, Georgi; Kaldma, Katrin; Serk, Piia; Karmin, Monika; Behar, Doron M; Gilbert, M Thomas P; Endicott, Phillip; Mastana, Sarabjit; Papiha, Surinder S; Skorecki, Karl; Torroni, Antonio; Villems, Richard (2004). „Většina existujících hranic mtDNA v jižní a jihozápadní Asii byla pravděpodobně formována během počátečního osídlení Eurasie anatomicky moderními lidmi“. Genetika BMC. 5: 26. doi:10.1186/1471-2156-5-26. PMC  516768. PMID  15339343.
• Mikkelsen, Martin; Sørensen, Erik; Rasmussen, Erik Michael; Morling, Niels (2010). "Mitochondriální DNA HV1 a HV2 variace u Dánů". Forensic Science International: Genetics. 4 (4): e87–8. doi:10.1016 / j.fsigen.2009.07.007. PMID  20457038.
• Mishmar, D; Ruiz-Pesini, E; Golik, P; MacAulay, V; Clark, AG; Hosseini, S; Brandon, M; Easley, K; et al. (2003). „Regionální variace mtDNA u lidí ve tvaru přirozeného výběru“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 100 (1): 171–6. Bibcode:2003PNAS..100..171M. doi:10.1073 / pnas.0136972100. PMC  140917. PMID  12509511.
• Musilová, Eliška; Fernandes, Verónica; Silva, Nuno M .; Soares, Pedro; Alshamali, Farida; Harich, Nourdin; Cherni, Lotfi; Gaaied, Amel Ben Ammar El; et al. (2011). „Populační historie Rudého moře - genetické výměny mezi Arabským poloostrovem a východní Afrikou signalizované v mitochondriální DNA HV1 haploskupině“. American Journal of Physical Anthropology. 145 (4): 592–8. doi:10.1002 / ajpa.21522. PMID  21660931.
• Nikitin, Alexey G .; Kočkin, Igor T .; June, Cynthia M .; Willis, Catherine M .; McBain, Ian; Videiko, Mykhailo Y. (2009). „Varianta mitochondriální sekvence DNA v populacích bojka, hutsulu a lemka karpatské vysočiny“. Biologie člověka. 81 (1): 43–58. doi:10.3378/027.081.0104. PMID  19589018. S2CID  45791162.
• Non, Amy L .; Al-Meeri, Ali; Raaum, Ryan L .; Sanchez, Luisa F .; Mulligan, Connie J. (2011). „Mitochondriální DNA odhaluje odlišné evoluční historie židovských populací v Jemenu a Etiopii“. American Journal of Physical Anthropology. 144 (1): 1–10. doi:10.1002 / ajpa.21360. PMID  20623605.
• Palanichamy, MG; Sun, C; Agrawal, S; Bandelt, HJ; Kong, QP; Khan, F; Wang, CY; Chaudhuri, TK; et al. (2004). „Fylogeneze mitochondriální DNA makrohaploskupiny N v Indii, založená na úplném sekvenování: Důsledky pro osídlení jižní Asie“. American Journal of Human Genetics. 75 (6): 966–78. doi:10.1086/425871. PMC  1182158. PMID  15467980.
• Pereira, L; Gonçalves, J; Franco-Duarte, R; Silva, J; Rocha, T; Arnold, C; Richards, M; MacAulay, V (2007). „Žádný důkaz role mtDNA v motilitě spermií: Data z kompletního sekvenování asthenozoospermatických mužů“. Molekulární biologie a evoluce. 24 (3): 868–74. doi:10,1093 / molbev / msm004. PMID  17218641.
• Pericić, M; Barać Lauc, L; Martinović Klarić, I; Janićijević, B; Rudan, P (2005). "Přehled chorvatského genetického dědictví odhaleného mitochondriální DNA a chromozomálními liniemi Y". Chorvatský lékařský deník. 46 (4): 502–13. PMID  16100752.
• Pichler, Irene; Fuchsberger, Christian; Platzer, Christa; Çalişkan, Minal; Marroni, Fabio; Pramstaller, Peter P; Ober, Carole (2010). „Kreslení historie populace hutteritů na genetickou krajinu: závěr z genotypů Y-chromozomu a mtDNA“. European Journal of Human Genetics. 18 (4): 463–70. doi:10.1038 / ejhg.2009.172. PMC  2987252. PMID  19844259.
• Poloni, Estella S .; Naciri, Yamama; Bucho, Rute; Niba, Régine; Kervaire, Barbara; Excoffier, Laurent; Langaney, André; Sanchez-Mazas, Alicia (2009). „Genetické důkazy o složitosti etnické diferenciace a historie ve východní Africe“. Annals of Human Genetics. 73 (6): 582–600. doi:10.1111 / j.1469-1809.2009.00541.x. PMID  19706029. S2CID  2488794.
• Papež, AM; Carr, SM; Smith, KN; Marshall, HD; Marshall, H. D. (2011). „Mitogenomická a mikrosatelitní variace u potomků zakladatelské populace Newfoundlandu: Vysoká genetická rozmanitost v historicky izolované populaci“. Genom. 54 (2): 110–9. doi:10.1139 / G10-102. PMID  21326367.
• Quintana-Murci, Lluís; Chaix, Raphaëlle; Wells, R. Spencer; Behar, Doron M .; Sayar, Hamid; Scozzari, Rosaria; Rengo, Chiara; Al-Zahery, Nadia; et al. (2004). „Where West Meets East: The Complex mtDNA Landscape of the Southwest and Central Asian Corridor“. American Journal of Human Genetics. 74 (5): 827–45. doi:10.1086/383236. PMC  1181978. PMID  15077202.
• Richards, Martin; MacAulay, Vincent; Hickey, Eileen; Vega, Emilce; Sykes, Bryan; Guida, Valentina; Rengo, Chiara; Sellitto, Daniele; et al. (2000). „Tracing European Founder Lineages in the Near Eastern mtDNA Pool“. American Journal of Human Genetics. 67 (5): 1251–76. doi:10.1016 / S0002-9297 (07) 62954-1. PMC  1288566. PMID  11032788.
• Richards, Martin; Rengo, Chiara; Cruciani, Fulvio; Gratrix, Fiona; Wilson, James F .; Scozzari, Rosaria; MacAulay, Vincent; Torroni, Antonio (2003). „Rozsáhlý tok žen zprostředkovaný genem ze subsaharské Afriky do blízkovýchodních arabských populací“. American Journal of Human Genetics. 72 (4): 1058–64. doi:10.1086/374384. PMC  1180338. PMID  12629598.
• Rogaev, E. I .; Grigorenko, A. P .; Moliaka, Y. K .; Faskhutdinova, G .; Goltsov, A .; Lahti, A .; Hildebrandt, C .; Kittler, E. L. W .; Morozova, I. (2009). „Genomická identifikace v historickém případě královské rodiny Nicholase II.“. Sborník Národní akademie věd. 106 (13): 5258–63. Bibcode:2009PNAS..106.5258R. doi:10.1073 / pnas.0811190106. PMC  2664067. PMID  19251637.
• Ruiz-Pesini, Eduardo; Lapeña, Ana-Cristina; Díez-Sánchez, Carmen; Pérez-Martos, Acisclo; Montoya, Julio; Alvarez, Enrique; Díaz, Miguel; Urriés, Antonio; et al. (2000). „Lidské mtDNA haploskupiny spojené s vysokou nebo sníženou pohyblivostí spermií“. American Journal of Human Genetics. 67 (3): 682–96. doi:10.1086/303040. PMC  1287528. PMID  10936107.
• Shlush, Liran I .; Behar, Doron M .; Yudkovsky, Guennady; Templeton, Alan; Hadid, Yarin; Basis, Fuad; Hammer, Michael; Itzkovitz, Shalev; Skorecki, Karl (2008). Gemmell, Neil John (ed.). „Druze: Populační genetické refugium na Blízkém východě“. PLOS ONE. 3 (5): e2105. Bibcode:2008PLoSO ... 3.2105S. doi:10.1371 / journal.pone.0002105. PMC  2324201. PMID  18461126.
• Soares, P .; Alshamali, F .; Pereira, J. B .; Fernandes, V .; Silva, N.M .; Afonso, C .; Costa, M. D .; Musilova, E .; et al. (2011). „Expanze mtDNA Haplogroup L3 v Africe i mimo ni“. Molekulární biologie a evoluce. 29 (3): 915–27. doi:10,1093 / molbev / msr245. PMID  22096215.
• Stanger, Olaf; Müller, Edith; Zimmermann, Franz; Wiesbauer, Martina; Mayr, Johannes A .; Paulweber, Bernhard; Iglseder, Bernhard; Renner, Wilfried; et al. (2007). „30 mitochondriální haploskupiny T je spojeno s onemocněním věnčitých tepen“. Mitochondrie. 7 (6): 412. doi:10.1016 / j.mito.2007.08.034.
• Stone, AC; Starrs, JE; Stoneking, M (2001). „Mitochondriální DNA analýza předpokládaných ostatků Jesseho Jamese“. Journal of Forensic Sciences. 46 (1): 173–6. doi:10.1520 / JFS14932J. PMID  11210907.
• Terreros, Maria C; Rowold, Diane J; Mirabal, Sheyla; Herrera, Rene J (2011). „Mitochondriální DNA a Y-chromozomální stratifikace v Íránu: Vztah mezi Íránem a Arabským poloostrovem“. Journal of Human Genetics. 56 (3): 235–46. doi:10.1038 / jhg.2010.174. PMID  21326310.
• Thomas, Mark G; Barnes, Ian; Weale, Michael E; Jones, Abigail L; Forster, Peter; Bradman, Neil; Pramstaller, Peter P (2008). „Nové genetické důkazy podporují izolaci a drift v ladinských komunitách v jihotyrolských Alpách, nikoli však starodávný původ na Středním východě“. European Journal of Human Genetics. 16 (1): 124–34. doi:10.1038 / sj.ejhg.5201906. PMID  17712356.
• Tishkoff, S. A .; Gonder, M. K .; Henn, B. M .; Mortensen, H .; Knight, A .; Gignoux, C .; Fernandopulle, N .; Lema, G .; et al. (2007). „Historie populací Afriky mluvících kliknutím odvozených z genetické variace mtDNA a Y chromozomu“. Molekulární biologie a evoluce. 24 (10): 2180–95. doi:10,1093 / molbev / msm155. PMID  17656633.
• Topf, A. L .; Gilbert, MT; Dumbacher, JP; Hoelzel, AR (2005). „Sledování fylogeografie lidských populací v Británii na základě genotypů mtDNA 4. a 11. století“. Molekulární biologie a evoluce. 23 (1): 152–61. doi:10.1093 / molbev / msj013. PMID  16151183.
• Torroni, A; Huoponen, K; Francalacci, P; Petrozzi, M; Morelli, L; Scozzari, R; Obinu, D; Savontaus, ML; Wallace, DC (1996). „Klasifikace evropských mtDNA z analýzy tří evropských populací“. Genetika. 144 (4): 1835–50. PMC  1207732. PMID  8978068.
• van Oven, Mannis; Kayser, Manfred (2009). "Aktualizovaný komplexní fylogenetický strom globální variace lidské mitochondriální DNA". Lidská mutace. 30 (2): E386–94. doi:10.1002 / humu.20921. PMID  18853457. S2CID  27566749.

Webové stránky

• Behar; DNA rodokmenu (2012). „komunita mtDNA“.

Další čtení

• Černý, Viktor; Pereira, Luísa; Kujanová, Martina; VašÍková, Alžběta; Hájek, Martin; Morris, Miranda; Mulligan, Connie J. (2009). „Z Arábie - osídlení ostrova Sokotra, jak vyplývá z genetické rozmanitosti mitochondrií a chromozomu Y“. American Journal of Physical Anthropology. 138 (4): 439–47. doi:10.1002 / ajpa.20960. PMID  19012329.
• Kitchen, A .; Ehret, C .; Assefa, S .; Mulligan, C. J. (2009). „Bayesovská fylogenetická analýza semitských jazyků identifikuje původ semitské rasy doby bronzové na Blízkém východě“. Sborník Královské společnosti B: Biologické vědy. 276 (1668): 2703–10. doi:10.1098 / rspb.2009.0408. PMC  2839953. PMID  19403539.
• Petit-Maire, Nicole; Bouysse, Philippe (2000). „Geologické záznamy nedávné minulosti, klíč k prostředí blízké budoucnosti“ (PDF). Epizody. 23 (4): 230–246. doi:10.18814 / epiiugs / 2000 / v23i4 / 001.

externí odkazy

• Všeobecné
  • Iana Logana Stránky mitochondriální DNA
  • Mannis van Oven's Phylotree
  • Genografický projekt, veřejná účast, mitochondriální DNA databáze
• Haploskupina T
  • Seznam diskusí na RootsWeb
  • Šíření haploskupiny T., z národní geografie
  • Genetic Genealogy: A Personal Perspective on Tara, Karelians and Kent, England
  • Analýza sekvence haploskupiny T (T5 / T2)
  • Fylogenetické sítě pro lidskou mtDNA Haploskupina T
  • mtDNA Haploskupina T - Výzkumný projekt Full Genomic Sequence
  • Fylogenetické sítě pro lidskou mtDNA Haploskupina T