Haploskupina E (mtDNA) - Haplogroup E (mtDNA)

Tento článek je o lidské haploskupině mtDNA. Pro haploskupinu lidské Y-DNA viz Haploskupina E-M96.
Haploskupina E.
Možná doba vzniku35,000[1] na 8 000[2] YBP
Možné místo původuvýchodní Sundaland[1] nebo Fujian pobřeží[2]
PředekM9
PotomciE1, E2
Definování mutací3027, 3705, 7598, 13626, 16390[3]

v lidská mitochondriální genetika, haploskupina E. je haploskupina lidské mitochondriální DNA (mtDNA) typické pro Malajské souostroví. Je to podskupina haploskupina M9.

Původ

Byly předloženy dva kontrastní návrhy týkající se umístění a doby vzniku Haploskupiny E. Jedním z názorů je, že klade byl vytvořen před více než 30 000 lety, přibližně v době Poslední ledové maximum, na severovýchodním pobřeží ostrova Sundaland (téměř moderní Borneo V tomto modelu byla haploskupina rozptýlena stoupající hladinou moře během Pozdní ledovec doba.[1][4]

V roce 2014 byla nalezena mitochondriální DNA 8 000 let staré kostry Ostrov Liang, jeden z Matsu ostrovy u jihovýchodního čínského pobřeží, bylo zjištěno, že patří do Haploskupiny E, se dvěma ze čtyř mutací charakteristických pro podskupinu E1. Z toho Ko a kolegové tvrdí, že Haploskupina E vznikla před 8 000 až 11 000 lety poblíž severu Fujian cestoval na Tchaj-wan s neolitickými osadníky před 6000 lety a odtud se rozšířil do námořní jihovýchodní Asie s Austronesian jazyk rozptýlení.[2]Soares et al varují před přílišným zdůrazňováním jediného vzorku a udržují to konstantní molekulární hodiny znamená, že dřívější datum (a jižnější původ) zůstává pravděpodobnější.[5]

Rozdělení

Haploskupina E se vyskytuje v celém textu Námořní jihovýchodní Asie.[4]Téměř chybí v kontinentální východní Asii, kde je běžná její sesterská skupina M9a (také v Japonsku).[4][6]Zejména se vyskytuje mezi mluvčími jazyka Austronéské jazyky, a je vzácné i v jihovýchodní Asii u členů jiných jazykových rodin. Bylo zjištěno v populacích Tchaj-wan, Filipíny, Indonésie, Malajsie (počítaje v to Sabah z Borneo, ale ne Orang Asli poloostrovní Malajsie), pobřežní Papua-Nová Guinea, a to zejména v Chamorros z Mariany.[4][7][8][9][10][11]

Ze čtyř hlavních subclades se E1b a E2a nacházejí hlavně v námořní jihovýchodní Asii, zatímco pouze E1a a E2b se nacházejí také na Tchaj-wanu.[12]E2b má na Tchaj-wanu nízkou rozmanitost, což naznačuje, že tam dorazil asi před 5 000 lety.[12]Nejběžnější subclade E, E1a1a, má nejvyšší rozmanitost na Tchaj-wanu, následovaný Filipínami a Sulawesi. Kromě toho jsou ostatní větve E1a1 z velké části omezeny na Tchaj-wan.[13]

Frekvence MtDNA haploskupiny E.
PopulaceFrekvencePočetZdrojPodtypy
Chamorro (85 Guam, 14 Saipan, & 6 Rota )0.924105Vilar et al 2013E2a = 68, E1a2 = 29
Východní indonéština (Sulawesi, vč. 89 Manado, 64 Toraja, 46 Ujung Padang, & 38 Palu )0.266237Hill a kol. 2007E1a = 42, E1b = 9, E2 = 7, E1 (xE1a, E1b) = 5
Filipínský (Mindanao )0.21470Tabbada et al 2010, str. 24E1a1a = 10, E2 (xE2b) = 4, E1b = 1
Filipínský (Visayas )0.214112Tabbada et al 2010, str. 24E1a1a = 18, E2 (xE2b) = 5, E1 (xE1a1a, E1a2, E1b) = 1
Východní indonéština (Ambon )0.16343Hill a kol. 2007E1 (xE1a, E1b) = 3, E1a = 2, E2 = 2
Východní indonéština (Waingapu, Sumba )0.16050Hill a kol. 2007E1b = 6, E1a = 1, E2 = 1
Indonéština (Bangka )0.14734Hill a kol. 2006E = 5
Borneo (89 Banjarmasin & 68 Kota Kinabalu )0.146157Hill a kol. 2007E1a = 14, E2 = 5, E1b = 3, E1 (xE1a, E1b) = 1
Filipínský0.12564Tabbada et al 2010, str. 24E1a1a = 5, E2 (xE2b) = 2, E1a2 = 1
Filipínský (Luzon )0.124177Tabbada et al 2010, str. 24E1a1a = 14, E1b = 5, E2 (xE2b) = 2, E2b = 1
Tchaj-wan (domorodec)0.120640Peng et al 2011E = 77
Východní indonéština (Alor )0.11145Hill a kol. 2007E1a = 3, E1b = 2
Východní indonéština (Mataram, Lombok )0.09144Hill a kol. 2007E1b = 3, E1a = 1
Indonéština (Padang, Sumatra )0.08324Hill a kol. 2006E = 2
Indonéština (Medan, Sumatra )0.07142Hill a kol. 2006E = 3
Indonéština (Pekanbaru, Medan, Bangka, Palembang, & Padang )0.067180Hill a kol. 2007E1a = 6, E1b = 4, E1 (xE1a, E1b) = 1, E2 = 1
Indonéština (Bali )0.06182Hill a kol. 2007E1a = 3, E1b = 1, E1 (xE1a, E1b) = 1
Filipínský (Palawan )0.05020Scholes et al 2011E1a = 1
Indonéština (Palembang, Sumatra )0.03628Hill a kol. 2006E = 1
Tujia (Yanhe County, Guizhou )0.03429Li et al 2007E = 1
Gelao (Daozhen County, Guizhou)0.03231Li et al 2007E = 1
Indonéština (Jáva, vč. 36 od Tengger )0.02246Hill a kol. 2007E1b = 1
Indonéština (Pekanbaru, Sumatra )0.01952Hill a kol. 2006E = 1
Cham (Bình Thuận, Vietnam )0.012168Peng et al 2010E1a1a = 1, E2a = 1
Carolinian (Saipan )0.00017Vilar et al 2013-
Yi (Hezhang County, Guizhou )0.00020Li et al 2007-
Dong (Tianzhu County, Guizhou )0.00028Li et al 2007-
Batek (Malajsie )0.00029Hill a kol. 2006-
Kuně (Hainan )0.00030Peng et al 2011-
Batak (Palawan )0.00031Scholes et al 2011-
Lingao (Hainan )0.00031Peng et al 2011-
Mendriq (Malajsie )0.00032Hill a kol. 2006-
Temuan (Malajsie )0.00033Hill a kol. 2006-
Danga (Hainan )0.00040Peng et al 2011-
Jahai (Malajsie )0.00051Hill a kol. 2006-
Senoi (Malajsie )0.00052Hill a kol. 2006-
Semelai (Malajsie )0.00061Hill a kol. 2006-
Gelao (Daozhen County, Guizhou)0.000102Liu et al 2011-
Li (Hainan )0.000346Peng et al 2011-

Subclades

Tento fylogenetický strom subcladů haploskupiny E je založen na příspěvku Mannisa van Ovena a Manfreda Kaysera Aktualizovaný komplexní fylogenetický strom globální variace lidské mitochondriální DNA[3] a následný publikovaný výzkum.

  • E
    • E1
      • E1a
        • E1a1
          • E1a1a
            • E1a1a1
        • E1a2
      • E1b
        • E1b1
    • E2
      • E2a
      • E2b
        • E2b1
        • E2b2

Viz také

Fylogenetický strom haploskupiny lidské mitochondriální DNA (mtDNA)

 Mitochondriální Eva (L )  
L0L1–6 
L1L2 L3  L4L5L6
MN 
CZDEGQ ÓASR JáŽXY
CZBFR0 před JT P U
HVJTK.
HPROTIJT

Reference

  1. ^ A b C Soares a kol. 2008, str. 1215.
  2. ^ A b C Ko et al 2014.
  3. ^ A b van Oven & Kayser 2008.
  4. ^ A b C d Hill a kol. 2007.
  5. ^ Soares et al 2016.
  6. ^ Trejaut et al 2005.
  7. ^ Tabbada et al 2010, s. 24, 28.
  8. ^ Peng et al 2010.
  9. ^ Hill a kol. 2006.
  10. ^ Vilar et al 2013.
  11. ^ Peng et al 2011.
  12. ^ A b Soares a kol. 2008, str. 1213.
  13. ^ Tabbada et al 2010, str. 29.

externí odkazy